src/jalview/appletgui/UserDefinedColours.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 \r
  20 package jalview.appletgui;\r
  21 \r
  22 import java.io.*;\r
  23 import java.util.*;\r
  24 \r
  25 import java.awt.*;\r
  26 import java.awt.event.*;\r
  27 \r
  28 import jalview.datamodel.*;\r
  29 import jalview.jbappletgui.*;\r
  30 import jalview.schemes.*;\r
  31 \r
  32 public class UserDefinedColours\r
  33     extends GUserDefinedColours\r
  34 {\r
  35 \r
  36   AlignmentPanel ap;\r
  37   SequenceGroup seqGroup;\r
  38   Button selectedButton;\r
  39   Vector oldColours = new Vector();\r
  40   ColourSchemeI oldColourScheme;\r
  41   Frame frame;\r
  42 \r
  43   int R = 0, G = 0, B = 0;\r
  44 \r
  45   public ColourSchemeI loadDefaultColours()\r
  46   {\r
  47     // NOT IMPLEMENTED YET IN APPLET VERSION\r
  48     return null;\r
  49   }\r
  50 \r
  51   public UserDefinedColours(AlignmentPanel ap, SequenceGroup sg)\r
  52   {\r
  53     super();\r
  54     frame = new Frame();\r
  55     frame.add(this);\r
  56     jalview.bin.JalviewLite.addFrame(frame, "User defined colours", 420, 345);\r
  57 \r
  58     if (sg != null)\r
  59     {\r
  60       frame.setTitle(frame.getTitle() + " (" + sg.getName() + ")");\r
  61     }\r
  62 \r
  63     this.ap = ap;\r
  64     seqGroup = sg;\r
  65 \r
  66     if (seqGroup != null)\r
  67     {\r
  68       oldColourScheme = seqGroup.cs;\r
  69     }\r
  70     else\r
  71     {\r
  72       oldColourScheme = ap.av.getGlobalColourScheme();\r
  73     }\r
  74 \r
  75     for (int i = 0; i < 20; i++)\r
  76     {\r
  77       makeButton(ResidueProperties.aa2Triplet.get(ResidueProperties.aa[i]) +\r
  78                  "", ResidueProperties.aa[i]);\r
  79     }\r
  80 \r
  81     makeButton("B", "B");\r
  82     makeButton("Z", "Z");\r
  83     makeButton("X", "X");\r
  84     makeButton("Gap", "'.','-',' '");\r
  85 \r
  86   }\r
  87 \r
  88   protected void rText_actionPerformed(ActionEvent e)\r
  89   {\r
  90     try\r
  91     {\r
  92       int i = Integer.parseInt(rText.getText());\r
  93       rScroller.setValue(i);\r
  94     }\r
  95     catch (NumberFormatException ex)\r
  96     {}\r
  97   }\r
  98 \r
  99   protected void gText_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 100   {\r
 101     try\r
 102     {\r
 103       int i = Integer.parseInt(gText.getText());\r
 104       gScroller.setValue(i);\r
 105     }\r
 106     catch (NumberFormatException ex)\r
 107     {}\r
 108 \r
 109   }\r
 110 \r
 111   protected void bText_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 112   {\r
 113     try\r
 114     {\r
 115       int i = Integer.parseInt(bText.getText());\r
 116       bScroller.setValue(i);\r
 117     }\r
 118     catch (NumberFormatException ex)\r
 119     {}\r
 120 \r
 121   }\r
 122 \r
 123   protected void rScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e)\r
 124   {\r
 125     R = rScroller.getValue();\r
 126     rText.setText(R + "");\r
 127     colourChanged();\r
 128   }\r
 129 \r
 130   protected void gScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e)\r
 131   {\r
 132     G = gScroller.getValue();\r
 133     gText.setText(G + "");\r
 134     colourChanged();\r
 135   }\r
 136 \r
 137   protected void bScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e)\r
 138   {\r
 139     B = bScroller.getValue();\r
 140     bText.setText(B + "");\r
 141     colourChanged();\r
 142   }\r
 143 \r
 144   public void colourChanged()\r
 145   {\r
 146     Color col = new Color(R, G, B);\r
 147     target.setBackground(col);\r
 148 \r
 149     if (selectedButton != null)\r
 150     {\r
 151       selectedButton.setBackground(col);\r
 152     }\r
 153   }\r
 154 \r
 155   public void colourButtonPressed(MouseEvent e)\r
 156   {\r
 157     selectedButton = (Button) e.getSource();\r
 158     Color col = selectedButton.getBackground();\r
 159     R = col.getRed();\r
 160     G = col.getGreen();\r
 161     B = col.getBlue();\r
 162     rScroller.setValue(R);\r
 163     gScroller.setValue(G);\r
 164     bScroller.setValue(B);\r
 165     rText.setText(R + "");\r
 166     gText.setText(G + "");\r
 167     bText.setText(B + "");\r
 168 \r
 169     colourChanged();\r
 170   }\r
 171 \r
 172   void makeButton(String label, String aa)\r
 173   {\r
 174     final Button button = new Button();\r
 175     Color col = Color.white;\r
 176 \r
 177     try\r
 178     {\r
 179       col = oldColourScheme.findColour(aa, -1);\r
 180     }\r
 181     catch (Exception ex)\r
 182     {}\r
 183 \r
 184     button.setBackground(col);\r
 185     oldColours.addElement(col);\r
 186     button.setLabel(label);\r
 187     button.setForeground(col.darker().darker().darker());\r
 188     button.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 1, 10));\r
 189     button.addMouseListener(new java.awt.event.MouseAdapter()\r
 190     {\r
 191       public void mouseClicked(MouseEvent e)\r
 192       {\r
 193         colourButtonPressed(e);\r
 194       }\r
 195     });\r
 196 \r
 197     buttonPanel.add(button, null);\r
 198   }\r
 199 \r
 200   protected void okButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 201   {\r
 202     applyButton_actionPerformed(null);\r
 203     frame.setVisible(false);\r
 204   }\r
 205 \r
 206   protected void applyButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 207   {\r
 208 \r
 209     Color[] newColours = new Color[24];\r
 210     for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 211     {\r
 212       Button button = (Button) buttonPanel.getComponent(i);\r
 213       newColours[i] = button.getBackground();\r
 214     }\r
 215 \r
 216     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 217     ucs.setThreshold(0);\r
 218 \r
 219     if (seqGroup != null)\r
 220     {\r
 221       seqGroup.cs = ucs;\r
 222     }\r
 223     else\r
 224     {\r
 225       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 226     }\r
 227 \r
 228     ap.repaint();\r
 229   }\r
 230 \r
 231   public static UserColourScheme loadDefaultColours(String file)\r
 232   {\r
 233     UserColourScheme ucs = null;\r
 234     try\r
 235     {\r
 236       BufferedReader in = new BufferedReader(new FileReader(file));\r
 237       Color[] newColours = new Color[24];\r
 238       for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 239       {\r
 240         newColours[i] = new Color(Integer.parseInt(in.readLine()));\r
 241       }\r
 242 \r
 243       ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 244       ucs.setThreshold(0);\r
 245 \r
 246     }\r
 247     catch (Exception ex)\r
 248     {}\r
 249 \r
 250     return ucs;\r
 251   }\r
 252 \r
 253   protected void cancelButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 254   {\r
 255 \r
 256     Color[] newColours = new Color[24];\r
 257     for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 258     {\r
 259       newColours[i] = (Color) oldColours.elementAt(i);\r
 260       buttonPanel.getComponent(i).setBackground(newColours[i]);\r
 261     }\r
 262 \r
 263     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 264 \r
 265     if (seqGroup != null)\r
 266     {\r
 267       seqGroup.cs = ucs;\r
 268     }\r
 269     else\r
 270     {\r
 271       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 272     }\r
 273 \r
 274     ap.repaint();\r
 275 \r
 276     frame.setVisible(false);\r
 277   }\r
 278 \r
 279 }\r