src/jalview/bin/Launcher.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.bin;
  22
  23 import java.io.File;
  24 import java.io.IOException;
  25 import java.lang.management.ManagementFactory;
  26 import java.util.ArrayList;
  27 import java.util.List;
  28
  29 import jalview.util.ChannelProperties;
  30
  31 /**
  32  * A Launcher class for Jalview. This class is used to launch Jalview from the
  33  * shadowJar when Getdown is not used or available. It attempts to take all the
  34  * command line arguments to pass on to the jalview.bin.Jalview class, but to
  35  * insert a -Xmx memory setting to a sensible default, using the -jvmmempc and
  36  * -jvmmemmax application arguments if specified. If not specified then system
  37  * properties will be looked for by jalview.bin.MemorySetting. If the user has
  38  * provided the JVM with a -Xmx setting directly and not set -jvmmempc or
  39  * -jvmmemmax then this setting will be used and system properties ignored. If
  40  * -Xmx is set as well as -jvmmempc or -jvmmemmax as argument(s) then the -Xmx
  41  * argument will NOT be passed on to the main application launch.
  42  *
  43  * @author bsoares
  44  *
  45  */
  46 public class Launcher
  47 {
  48   private final static String startClass = "jalview.bin.Jalview";
  49
  50   private final static String dockIconPath = ChannelProperties
  51           .getProperty("logo.512");
  52
  53   /**
  54    * main method for jalview.bin.Launcher. This restarts the same JRE's JVM with
  55    * the same arguments but with memory adjusted based on extracted -jvmmempc
  56    * and -jvmmemmax application arguments. If on a Mac then extra dock:icon and
  57    * dock:name arguments are also set.
  58    *
  59    * @param args
  60    */
  61   public static void main(String[] args)
  62   {
  63     final String javaBin = System.getProperty("java.home") + File.separator
  64             + "bin" + File.separator + "java";
  65
  66     List<String> command = new ArrayList<>();
  67     command.add(javaBin);
  68
  69     String memSetting = null;
  70
  71     boolean isAMac = System.getProperty("os.name").indexOf("Mac") > -1;
  72
  73     for (String jvmArg : ManagementFactory.getRuntimeMXBean()
  74             .getInputArguments())
  75     {
  76       command.add(jvmArg);
  77     }
  78     command.add("-cp");
  79     command.add(ManagementFactory.getRuntimeMXBean().getClassPath());
  80
  81     String jvmmempc = null;
  82     String jvmmemmax = null;
  83     ArrayList<String> arguments = new ArrayList<>();
  84     for (String arg : args)
  85     {
  86       // jvmmempc and jvmmemmax args used to set memory and are not passed on to
  87       // startClass
  88       if (arg.startsWith(
  89               "-" + MemorySetting.MAX_HEAPSIZE_PERCENT_PROPERTY_NAME + "="))
  90       {
  91         jvmmempc = arg.substring(
  92                 MemorySetting.MAX_HEAPSIZE_PERCENT_PROPERTY_NAME.length()
  93                         + 2);
  94       }
  95       else if (arg.startsWith(
  96               "-" + MemorySetting.MAX_HEAPSIZE_PROPERTY_NAME + "="))
  97       {
  98         jvmmemmax = arg.substring(
  99                 MemorySetting.MAX_HEAPSIZE_PROPERTY_NAME.length() + 2);
 100       }
 101       else
 102       {
 103         arguments.add(arg);
 104       }
 105     }
 106
 107     // add memory setting if not specified
 108     boolean memSet = false;
 109     boolean dockIcon = false;
 110     boolean dockName = false;
 111     for (int i = 0; i < command.size(); i++)
 112     {
 113       String arg = command.get(i);
 114       if (arg.startsWith("-Xmx"))
 115       {
 116         // only use -Xmx if jvmmemmax and jvmmempc have not been set
 117         if (jvmmempc == null && jvmmemmax == null)
 118         {
 119           memSetting = arg;
 120           memSet = true;
 121         }
 122       }
 123       else if (arg.startsWith("-Xdock:icon"))
 124       {
 125         dockIcon = true;
 126       }
 127       else if (arg.startsWith("-Xdock:name"))
 128       {
 129         dockName = true;
 130       }
 131     }
 132
 133     if (!memSet)
 134     {
 135       long maxMemLong = MemorySetting.getMemorySetting(jvmmemmax, jvmmempc);
 136
 137       if (maxMemLong > 0)
 138       {
 139         memSetting = "-Xmx" + Long.toString(maxMemLong);
 140         memSet = true;
 141         command.add(memSetting);
 142       }
 143     }
 144
 145     if (isAMac)
 146     {
 147       if (!dockIcon)
 148       {
 149         command.add("-Xdock:icon=" + dockIconPath);
 150       }
 151       if (!dockName)
 152       {
 153         // -Xdock:name=... doesn't actually work :(
 154         // Leaving it in in case it gets fixed
 155         command.add(
 156                 "-Xdock:name=" + ChannelProperties.getProperty("app_name"));
 157       }
 158     }
 159
 160     String scalePropertyArg = HiDPISetting.getScalePropertyArg();
 161     if (scalePropertyArg != null)
 162     {
 163       command.add(scalePropertyArg);
 164     }
 165
 166     command.add(startClass);
 167     command.addAll(arguments);
 168
 169     final ProcessBuilder builder = new ProcessBuilder(command);
 170
 171     if (Boolean.parseBoolean(System.getProperty("launcherprint", "false")))
 172     {
 173       System.out.println(
 174               "LAUNCHER COMMAND: " + String.join(" ", builder.command()));
 175     }
 176     System.out.println("Running " + startClass + " with "
 177             + (memSetting == null ? "no memory setting" : memSetting));
 178
 179     if (Boolean.parseBoolean(System.getProperty("launcherstop", "false")))
 180     {
 181       System.exit(0);
 182     }
 183     try
 184     {
 185       builder.inheritIO();
 186       Process process = builder.start();
 187       process.waitFor();
 188     } catch (IOException e)
 189     {
 190       if (e.getMessage().toLowerCase().contains("memory"))
 191       {
 192         System.out.println("Caught a memory exception: " + e.getMessage());
 193         // Probably the "Cannot allocate memory" error, try without the memory
 194         // setting
 195         ArrayList<String> commandNoMem = new ArrayList<>();
 196         for (int i = 0; i < command.size(); i++)
 197         {
 198           if (!command.get(i).startsWith("-Xmx"))
 199           {
 200             commandNoMem.add(command.get(i));
 201           }
 202         }
 203         final ProcessBuilder builderNoMem = new ProcessBuilder(
 204                 commandNoMem);
 205         System.out.println("Command without memory setting: "
 206                 + String.join(" ", builderNoMem.command()));
 207         try
 208         {
 209           builderNoMem.inheritIO();
 210           Process processNoMem = builderNoMem.start();
 211           processNoMem.waitFor();
 212         } catch (Exception ex)
 213         {
 214           ex.printStackTrace();
 215         }
 216       }
 217       else
 218       {
 219         e.printStackTrace();
 220       }
 221     } catch (Exception e)
 222     {
 223       e.printStackTrace();
 224     }
 225     // System.exit(0);
 226
 227   }
 228
 229 }