src/jalview/binding/JalviewModelSequence2.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with\r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 package jalview.binding;\r
   8 \r
   9 import org.exolab.castor.xml.MarshalException;\r
  10 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
  11 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
  12 import org.exolab.castor.xml.ValidationException;\r
  13 \r
  14 import org.xml.sax.ContentHandler;\r
  15 \r
  16 //---------------------------------/\r
  17 //- Imported classes and packages -/\r
  18 //---------------------------------/\r
  19 import java.io.IOException;\r
  20 import java.io.Reader;\r
  21 import java.io.Serializable;\r
  22 import java.io.Writer;\r
  23 \r
  24 import java.util.Enumeration;\r
  25 import java.util.Vector;\r
  26 \r
  27 \r
  28 /**\r
  29  * Class JalviewModelSequence2.\r
  30  *\r
  31  * @version $Revision$ $Date$\r
  32  */\r
  33 public class JalviewModelSequence2 implements java.io.Serializable\r
  34 {\r
  35     //--------------------------/\r
  36     //- Class/Member Variables -/\r
  37     //--------------------------/\r
  38 \r
  39     /**\r
  40      * Field _items\r
  41      */\r
  42     private java.util.Vector _items;\r
  43 \r
  44     //----------------/\r
  45     //- Constructors -/\r
  46     //----------------/\r
  47     public JalviewModelSequence2()\r
  48     {\r
  49         super();\r
  50         _items = new Vector();\r
  51     }\r
  52 \r
  53     //-- jalview.binding.JalviewModelSequence2()\r
  54     //-----------/\r
  55 \r
  56     /**\r
  57      * DOCUMENT ME!\r
  58      *\r
  59      * @param vJalviewModelSequence2Item DOCUMENT ME!\r
  60      *\r
  61      * @throws java.lang.IndexOutOfBoundsException DOCUMENT ME!\r
  62      */\r
  63     public void addJalviewModelSequence2Item(\r
  64         jalview.binding.JalviewModelSequence2Item vJalviewModelSequence2Item)\r
  65         throws java.lang.IndexOutOfBoundsException\r
  66     {\r
  67         _items.addElement(vJalviewModelSequence2Item);\r
  68     }\r
  69 \r
  70     //-- void addJalviewModelSequence2Item(jalview.binding.JalviewModelSequence2Item) \r
  71 \r
  72     /**\r
  73      * Method addJalviewModelSequence2Item\r
  74      *\r
  75      *\r
  76      *\r
  77      * @param index\r
  78      * @param vJalviewModelSequence2Item\r
  79      */\r
  80     public void addJalviewModelSequence2Item(int index,\r
  81         jalview.binding.JalviewModelSequence2Item vJalviewModelSequence2Item)\r
  82         throws java.lang.IndexOutOfBoundsException\r
  83     {\r
  84         _items.insertElementAt(vJalviewModelSequence2Item, index);\r
  85     }\r
  86 \r
  87     //-- void addJalviewModelSequence2Item(int, jalview.binding.JalviewModelSequence2Item) \r
  88 \r
  89     /**\r
  90      * Method enumerateJalviewModelSequence2Item\r
  91      *\r
  92      *\r
  93      *\r
  94      * @return Enumeration\r
  95      */\r
  96     public java.util.Enumeration enumerateJalviewModelSequence2Item()\r
  97     {\r
  98         return _items.elements();\r
  99     }\r
 100 \r
 101     //-- java.util.Enumeration enumerateJalviewModelSequence2Item() \r
 102 \r
 103     /**\r
 104      * Method getJalviewModelSequence2Item\r
 105      *\r
 106      *\r
 107      *\r
 108      * @param index\r
 109      * @return JalviewModelSequence2Item\r
 110      */\r
 111     public jalview.binding.JalviewModelSequence2Item getJalviewModelSequence2Item(\r
 112         int index) throws java.lang.IndexOutOfBoundsException\r
 113     {\r
 114         //-- check bounds for index\r
 115         if ((index < 0) || (index > _items.size()))\r
 116         {\r
 117             throw new IndexOutOfBoundsException();\r
 118         }\r
 119 \r
 120         return (jalview.binding.JalviewModelSequence2Item) _items.elementAt(index);\r
 121     }\r
 122 \r
 123     //-- jalview.binding.JalviewModelSequence2Item getJalviewModelSequence2Item(int) \r
 124 \r
 125     /**\r
 126      * Method getJalviewModelSequence2Item\r
 127      *\r
 128      *\r
 129      *\r
 130      * @return JalviewModelSequence2Item\r
 131      */\r
 132     public jalview.binding.JalviewModelSequence2Item[] getJalviewModelSequence2Item()\r
 133     {\r
 134         int size = _items.size();\r
 135         jalview.binding.JalviewModelSequence2Item[] mArray = new jalview.binding.JalviewModelSequence2Item[size];\r
 136 \r
 137         for (int index = 0; index < size; index++)\r
 138         {\r
 139             mArray[index] = (jalview.binding.JalviewModelSequence2Item) _items.elementAt(index);\r
 140         }\r
 141 \r
 142         return mArray;\r
 143     }\r
 144 \r
 145     //-- jalview.binding.JalviewModelSequence2Item[] getJalviewModelSequence2Item() \r
 146 \r
 147     /**\r
 148      * Method getJalviewModelSequence2ItemCount\r
 149      *\r
 150      *\r
 151      *\r
 152      * @return int\r
 153      */\r
 154     public int getJalviewModelSequence2ItemCount()\r
 155     {\r
 156         return _items.size();\r
 157     }\r
 158 \r
 159     //-- int getJalviewModelSequence2ItemCount() \r
 160 \r
 161     /**\r
 162      * Method isValid\r
 163      *\r
 164      *\r
 165      *\r
 166      * @return boolean\r
 167      */\r
 168     public boolean isValid()\r
 169     {\r
 170         try\r
 171         {\r
 172             validate();\r
 173         }\r
 174         catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex)\r
 175         {\r
 176             return false;\r
 177         }\r
 178 \r
 179         return true;\r
 180     }\r
 181 \r
 182     //-- boolean isValid() \r
 183 \r
 184     /**\r
 185      * Method marshal\r
 186      *\r
 187      *\r
 188      *\r
 189      * @param out\r
 190      */\r
 191     public void marshal(java.io.Writer out)\r
 192         throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, \r
 193             org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 194     {\r
 195         Marshaller.marshal(this, out);\r
 196     }\r
 197 \r
 198     //-- void marshal(java.io.Writer) \r
 199 \r
 200     /**\r
 201      * Method marshal\r
 202      *\r
 203      *\r
 204      *\r
 205      * @param handler\r
 206      */\r
 207     public void marshal(org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
 208         throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, \r
 209             org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 210     {\r
 211         Marshaller.marshal(this, handler);\r
 212     }\r
 213 \r
 214     //-- void marshal(org.xml.sax.ContentHandler) \r
 215 \r
 216     /**\r
 217      * Method removeAllJalviewModelSequence2Item\r
 218      *\r
 219      */\r
 220     public void removeAllJalviewModelSequence2Item()\r
 221     {\r
 222         _items.removeAllElements();\r
 223     }\r
 224 \r
 225     //-- void removeAllJalviewModelSequence2Item() \r
 226 \r
 227     /**\r
 228      * Method removeJalviewModelSequence2Item\r
 229      *\r
 230      *\r
 231      *\r
 232      * @param index\r
 233      * @return JalviewModelSequence2Item\r
 234      */\r
 235     public jalview.binding.JalviewModelSequence2Item removeJalviewModelSequence2Item(\r
 236         int index)\r
 237     {\r
 238         java.lang.Object obj = _items.elementAt(index);\r
 239         _items.removeElementAt(index);\r
 240 \r
 241         return (jalview.binding.JalviewModelSequence2Item) obj;\r
 242     }\r
 243 \r
 244     //-- jalview.binding.JalviewModelSequence2Item removeJalviewModelSequence2Item(int) \r
 245 \r
 246     /**\r
 247      * Method setJalviewModelSequence2Item\r
 248      *\r
 249      *\r
 250      *\r
 251      * @param index\r
 252      * @param vJalviewModelSequence2Item\r
 253      */\r
 254     public void setJalviewModelSequence2Item(int index,\r
 255         jalview.binding.JalviewModelSequence2Item vJalviewModelSequence2Item)\r
 256         throws java.lang.IndexOutOfBoundsException\r
 257     {\r
 258         //-- check bounds for index\r
 259         if ((index < 0) || (index > _items.size()))\r
 260         {\r
 261             throw new IndexOutOfBoundsException();\r
 262         }\r
 263 \r
 264         _items.setElementAt(vJalviewModelSequence2Item, index);\r
 265     }\r
 266 \r
 267     //-- void setJalviewModelSequence2Item(int, jalview.binding.JalviewModelSequence2Item) \r
 268 \r
 269     /**\r
 270      * Method setJalviewModelSequence2Item\r
 271      *\r
 272      *\r
 273      *\r
 274      * @param jalviewModelSequence2ItemArray\r
 275      */\r
 276     public void setJalviewModelSequence2Item(\r
 277         jalview.binding.JalviewModelSequence2Item[] jalviewModelSequence2ItemArray)\r
 278     {\r
 279         //-- copy array\r
 280         _items.removeAllElements();\r
 281 \r
 282         for (int i = 0; i < jalviewModelSequence2ItemArray.length; i++)\r
 283         {\r
 284             _items.addElement(jalviewModelSequence2ItemArray[i]);\r
 285         }\r
 286     }\r
 287 \r
 288     //-- void setJalviewModelSequence2Item(jalview.binding.JalviewModelSequence2Item) \r
 289 \r
 290     /**\r
 291      * Method unmarshal\r
 292      *\r
 293      *\r
 294      *\r
 295      * @param reader\r
 296      * @return Object\r
 297      */\r
 298     public static java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader reader)\r
 299         throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, \r
 300             org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 301     {\r
 302         return (jalview.binding.JalviewModelSequence2) Unmarshaller.unmarshal(jalview.binding.JalviewModelSequence2.class,\r
 303             reader);\r
 304     }\r
 305 \r
 306     //-- java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader) \r
 307 \r
 308     /**\r
 309      * Method validate\r
 310      *\r
 311      */\r
 312     public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 313     {\r
 314         org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
 315         validator.validate(this);\r
 316     }\r
 317 \r
 318     //-- void validate() \r
 319 }\r