src/jalview/binding/Sequence.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with\r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 /*\r
   8 * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   9 * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
  10 *\r
  11 * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
  12 * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
  13 * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
  14 * of the License, or (at your option) any later version.\r
  15 *\r
  16 * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  17 * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  18 * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  19 * GNU General Public License for more details.\r
  20 *\r
  21 * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  22 * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  23 * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  24 */\r
  25 package jalview.binding;\r
  26 \r
  27 import org.exolab.castor.xml.MarshalException;\r
  28 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
  29 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
  30 import org.exolab.castor.xml.ValidationException;\r
  31 \r
  32 import org.xml.sax.ContentHandler;\r
  33 \r
  34 //---------------------------------/\r
  35 //- Imported classes and packages -/\r
  36 //---------------------------------/\r
  37 import java.io.IOException;\r
  38 import java.io.Reader;\r
  39 import java.io.Serializable;\r
  40 import java.io.Writer;\r
  41 \r
  42 \r
  43 /**\r
  44  * Class Sequence.\r
  45  *\r
  46  * @version $Revision$ $Date$\r
  47  */\r
  48 public class Sequence extends SequenceType implements java.io.Serializable {\r
  49     //----------------/\r
  50     //- Constructors -/\r
  51     //----------------/\r
  52     public Sequence() {\r
  53         super();\r
  54     }\r
  55      //-- jalview.binding.Sequence()\r
  56  //-----------/\r
  57 \r
  58     public boolean isValid() {\r
  59         try {\r
  60             validate();\r
  61         } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
  62             return false;\r
  63         }\r
  64 \r
  65         return true;\r
  66     }\r
  67      //-- boolean isValid()\r
  68 \r
  69     /**\r
  70      * Method marshal\r
  71      *\r
  72      *\r
  73      *\r
  74      * @param out\r
  75      */\r
  76     public void marshal(java.io.Writer out)\r
  77         throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, \r
  78             org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
  79         Marshaller.marshal(this, out);\r
  80     }\r
  81      //-- void marshal(java.io.Writer)\r
  82 \r
  83     /**\r
  84      * Method marshal\r
  85      *\r
  86      *\r
  87      *\r
  88      * @param handler\r
  89      */\r
  90     public void marshal(org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
  91         throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, \r
  92             org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
  93         Marshaller.marshal(this, handler);\r
  94     }\r
  95      //-- void marshal(org.xml.sax.ContentHandler)\r
  96 \r
  97     /**\r
  98      * Method unmarshal\r
  99      *\r
 100      *\r
 101      *\r
 102      * @param reader\r
 103      * @return Object\r
 104      */\r
 105     public static java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader reader)\r
 106         throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, \r
 107             org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
 108         return (jalview.binding.Sequence) Unmarshaller.unmarshal(jalview.binding.Sequence.class,\r
 109             reader);\r
 110     }\r
 111      //-- java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader)\r
 112 \r
 113     /**\r
 114      * Method validate\r
 115      *\r
 116      */\r
 117     public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
 118         org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
 119         validator.validate(this);\r
 120     }\r
 121      //-- void validate()\r
 122 }\r