src/jalview/binding/SequenceType.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with \r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package jalview.binding;\r
   9 \r
  10   //---------------------------------/\r
  11  //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import java.io.IOException;\r
  15 import java.io.Reader;\r
  16 import java.io.Serializable;\r
  17 import java.io.Writer;\r
  18 import org.exolab.castor.xml.MarshalException;\r
  19 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
  20 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
  21 import org.exolab.castor.xml.ValidationException;\r
  22 import org.xml.sax.ContentHandler;\r
  23 \r
  24 /**\r
  25  * Class SequenceType.\r
  26  * \r
  27  * @version $Revision$ $Date$\r
  28  */\r
  29 public class SequenceType implements java.io.Serializable {\r
  30 \r
  31 \r
  32       //--------------------------/\r
  33      //- Class/Member Variables -/\r
  34     //--------------------------/\r
  35 \r
  36     /**\r
  37      * Field _id\r
  38      */\r
  39     private java.lang.String _id;\r
  40 \r
  41     /**\r
  42      * Field _description\r
  43      */\r
  44     private java.lang.String _description;\r
  45 \r
  46     /**\r
  47      * Field _sequence\r
  48      */\r
  49     private java.lang.String _sequence;\r
  50 \r
  51     /**\r
  52      * Field _name\r
  53      */\r
  54     private java.lang.String _name;\r
  55 \r
  56 \r
  57       //----------------/\r
  58      //- Constructors -/\r
  59     //----------------/\r
  60 \r
  61     public SequenceType() {\r
  62         super();\r
  63     } //-- jalview.binding.SequenceType()\r
  64 \r
  65 \r
  66       //-----------/\r
  67      //- Methods -/\r
  68     //-----------/\r
  69 \r
  70     /**\r
  71      * Returns the value of field 'description'.\r
  72      * \r
  73      * @return String\r
  74      * @return the value of field 'description'.\r
  75      */\r
  76     public java.lang.String getDescription()\r
  77     {\r
  78         return this._description;\r
  79     } //-- java.lang.String getDescription() \r
  80 \r
  81     /**\r
  82      * Returns the value of field 'id'.\r
  83      * \r
  84      * @return String\r
  85      * @return the value of field 'id'.\r
  86      */\r
  87     public java.lang.String getId()\r
  88     {\r
  89         return this._id;\r
  90     } //-- java.lang.String getId() \r
  91 \r
  92     /**\r
  93      * Returns the value of field 'name'.\r
  94      * \r
  95      * @return String\r
  96      * @return the value of field 'name'.\r
  97      */\r
  98     public java.lang.String getName()\r
  99     {\r
 100         return this._name;\r
 101     } //-- java.lang.String getName() \r
 102 \r
 103     /**\r
 104      * Returns the value of field 'sequence'.\r
 105      * \r
 106      * @return String\r
 107      * @return the value of field 'sequence'.\r
 108      */\r
 109     public java.lang.String getSequence()\r
 110     {\r
 111         return this._sequence;\r
 112     } //-- java.lang.String getSequence() \r
 113 \r
 114     /**\r
 115      * Method isValid\r
 116      * \r
 117      * \r
 118      * \r
 119      * @return boolean\r
 120      */\r
 121     public boolean isValid()\r
 122     {\r
 123         try {\r
 124             validate();\r
 125         }\r
 126         catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
 127             return false;\r
 128         }\r
 129         return true;\r
 130     } //-- boolean isValid() \r
 131 \r
 132     /**\r
 133      * Method marshal\r
 134      * \r
 135      * \r
 136      * \r
 137      * @param out\r
 138      */\r
 139     public void marshal(java.io.Writer out)\r
 140         throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 141     {\r
 142         \r
 143         Marshaller.marshal(this, out);\r
 144     } //-- void marshal(java.io.Writer) \r
 145 \r
 146     /**\r
 147      * Method marshal\r
 148      * \r
 149      * \r
 150      * \r
 151      * @param handler\r
 152      */\r
 153     public void marshal(org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
 154         throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 155     {\r
 156         \r
 157         Marshaller.marshal(this, handler);\r
 158     } //-- void marshal(org.xml.sax.ContentHandler) \r
 159 \r
 160     /**\r
 161      * Sets the value of field 'description'.\r
 162      * \r
 163      * @param description the value of field 'description'.\r
 164      */\r
 165     public void setDescription(java.lang.String description)\r
 166     {\r
 167         this._description = description;\r
 168     } //-- void setDescription(java.lang.String) \r
 169 \r
 170     /**\r
 171      * Sets the value of field 'id'.\r
 172      * \r
 173      * @param id the value of field 'id'.\r
 174      */\r
 175     public void setId(java.lang.String id)\r
 176     {\r
 177         this._id = id;\r
 178     } //-- void setId(java.lang.String) \r
 179 \r
 180     /**\r
 181      * Sets the value of field 'name'.\r
 182      * \r
 183      * @param name the value of field 'name'.\r
 184      */\r
 185     public void setName(java.lang.String name)\r
 186     {\r
 187         this._name = name;\r
 188     } //-- void setName(java.lang.String) \r
 189 \r
 190     /**\r
 191      * Sets the value of field 'sequence'.\r
 192      * \r
 193      * @param sequence the value of field 'sequence'.\r
 194      */\r
 195     public void setSequence(java.lang.String sequence)\r
 196     {\r
 197         this._sequence = sequence;\r
 198     } //-- void setSequence(java.lang.String) \r
 199 \r
 200     /**\r
 201      * Method unmarshal\r
 202      * \r
 203      * \r
 204      * \r
 205      * @param reader\r
 206      * @return Object\r
 207      */\r
 208     public static java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader reader)\r
 209         throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 210     {\r
 211         return (jalview.binding.SequenceType) Unmarshaller.unmarshal(jalview.binding.SequenceType.class, reader);\r
 212     } //-- java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader) \r
 213 \r
 214     /**\r
 215      * Method validate\r
 216      * \r
 217      */\r
 218     public void validate()\r
 219         throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 220     {\r
 221         org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
 222         validator.validate(this);\r
 223     } //-- void validate() \r
 224 \r
 225 }\r