src/jalview/binding/SequenceType.java

   1 /*******************************************************************************
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
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  17  *******************************************************************************/
  18 /*
  19  * This class was automatically generated with
  20  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
  21  * Schema.
  22  * $Id$
  23  */
  24
  25 package jalview.binding;
  26
  27   //---------------------------------/
  28  //- Imported classes and packages -/
  29 //---------------------------------/
  30
  31 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;
  32 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;
  33
  34 /**
  35  * Class SequenceType.
  36  *
  37  * @version $Revision$ $Date$
  38  */
  39 public class SequenceType implements java.io.Serializable {
  40
  41
  42       //--------------------------/
  43      //- Class/Member Variables -/
  44     //--------------------------/
  45
  46     /**
  47      * Field _id.
  48      */
  49     private java.lang.String _id;
  50
  51     /**
  52      * Field _sequence.
  53      */
  54     private java.lang.String _sequence;
  55
  56     /**
  57      * Field _name.
  58      */
  59     private java.lang.String _name;
  60
  61
  62       //----------------/
  63      //- Constructors -/
  64     //----------------/
  65
  66     public SequenceType() {
  67         super();
  68     }
  69
  70
  71       //-----------/
  72      //- Methods -/
  73     //-----------/
  74
  75     /**
  76      * Returns the value of field 'id'.
  77      *
  78      * @return the value of field 'Id'.
  79      */
  80     public java.lang.String getId(
  81     ) {
  82         return this._id;
  83     }
  84
  85     /**
  86      * Returns the value of field 'name'.
  87      *
  88      * @return the value of field 'Name'.
  89      */
  90     public java.lang.String getName(
  91     ) {
  92         return this._name;
  93     }
  94
  95     /**
  96      * Returns the value of field 'sequence'.
  97      *
  98      * @return the value of field 'Sequence'.
  99      */
 100     public java.lang.String getSequence(
 101     ) {
 102         return this._sequence;
 103     }
 104
 105     /**
 106      * Method isValid.
 107      *
 108      * @return true if this object is valid according to the schema
 109      */
 110     public boolean isValid(
 111     ) {
 112         try {
 113             validate();
 114         } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {
 115             return false;
 116         }
 117         return true;
 118     }
 119
 120     /**
 121      *
 122      *
 123      * @param out
 124      * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is
 125      * null or if any SAXException is thrown during marshaling
 126      * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this
 127      * object is an invalid instance according to the schema
 128      */
 129     public void marshal(
 130             final java.io.Writer out)
 131     throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {
 132         Marshaller.marshal(this, out);
 133     }
 134
 135     /**
 136      *
 137      *
 138      * @param handler
 139      * @throws java.io.IOException if an IOException occurs during
 140      * marshaling
 141      * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this
 142      * object is an invalid instance according to the schema
 143      * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is
 144      * null or if any SAXException is thrown during marshaling
 145      */
 146     public void marshal(
 147             final org.xml.sax.ContentHandler handler)
 148     throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {
 149         Marshaller.marshal(this, handler);
 150     }
 151
 152     /**
 153      * Sets the value of field 'id'.
 154      *
 155      * @param id the value of field 'id'.
 156      */
 157     public void setId(
 158             final java.lang.String id) {
 159         this._id = id;
 160     }
 161
 162     /**
 163      * Sets the value of field 'name'.
 164      *
 165      * @param name the value of field 'name'.
 166      */
 167     public void setName(
 168             final java.lang.String name) {
 169         this._name = name;
 170     }
 171
 172     /**
 173      * Sets the value of field 'sequence'.
 174      *
 175      * @param sequence the value of field 'sequence'.
 176      */
 177     public void setSequence(
 178             final java.lang.String sequence) {
 179         this._sequence = sequence;
 180     }
 181
 182     /**
 183      * Method unmarshal.
 184      *
 185      * @param reader
 186      * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is
 187      * null or if any SAXException is thrown during marshaling
 188      * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this
 189      * object is an invalid instance according to the schema
 190      * @return the unmarshaled jalview.binding.SequenceType
 191      */
 192     public static jalview.binding.SequenceType unmarshal(
 193             final java.io.Reader reader)
 194     throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {
 195         return (jalview.binding.SequenceType) Unmarshaller.unmarshal(jalview.binding.SequenceType.class, reader);
 196     }
 197
 198     /**
 199      *
 200      *
 201      * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this
 202      * object is an invalid instance according to the schema
 203      */
 204     public void validate(
 205     )
 206     throws org.exolab.castor.xml.ValidationException {
 207         org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();
 208         validator.validate(this);
 209     }
 210
 211 }