src/jalview/binding/VamsasModel.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
   8  * of the License, or (at your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13  * GNU General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  18  */
  19 package jalview.binding;
  20
  21 // ---------------------------------/
  22 // - Imported classes and packages -/
  23 // ---------------------------------/
  24
  25 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;
  26 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;
  27
  28 /**
  29  * Class VamsasModel.
  30  *
  31  * @version $Revision$ $Date$
  32  */
  33 public class VamsasModel extends VAMSAS implements java.io.Serializable
  34 {
  35
  36   // ----------------/
  37   // - Constructors -/
  38   // ----------------/
  39
  40   public VamsasModel()
  41   {
  42     super();
  43   }
  44
  45   // -----------/
  46   // - Methods -/
  47   // -----------/
  48
  49   /**
  50    * Method isValid.
  51    *
  52    * @return true if this object is valid according to the schema
  53    */
  54   public boolean isValid()
  55   {
  56     try
  57     {
  58       validate();
  59     } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex)
  60     {
  61       return false;
  62     }
  63     return true;
  64   }
  65
  66   /**
  67    *
  68    *
  69    * @param out
  70    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
  71    *                 if object is null or if any SAXException is thrown during
  72    *                 marshaling
  73    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
  74    *                 if this object is an invalid instance according to the
  75    *                 schema
  76    */
  77   public void marshal(final java.io.Writer out)
  78           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
  79           org.exolab.castor.xml.ValidationException
  80   {
  81     Marshaller.marshal(this, out);
  82   }
  83
  84   /**
  85    *
  86    *
  87    * @param handler
  88    * @throws java.io.IOException
  89    *                 if an IOException occurs during marshaling
  90    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
  91    *                 if this object is an invalid instance according to the
  92    *                 schema
  93    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
  94    *                 if object is null or if any SAXException is thrown during
  95    *                 marshaling
  96    */
  97   public void marshal(final org.xml.sax.ContentHandler handler)
  98           throws java.io.IOException,
  99           org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 100           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 101   {
 102     Marshaller.marshal(this, handler);
 103   }
 104
 105   /**
 106    * Method unmarshal.
 107    *
 108    * @param reader
 109    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 110    *                 if object is null or if any SAXException is thrown during
 111    *                 marshaling
 112    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 113    *                 if this object is an invalid instance according to the
 114    *                 schema
 115    * @return the unmarshaled jalview.binding.VAMSAS
 116    */
 117   public static jalview.binding.VAMSAS unmarshal(final java.io.Reader reader)
 118           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 119           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 120   {
 121     return (jalview.binding.VAMSAS) Unmarshaller.unmarshal(
 122             jalview.binding.VamsasModel.class, reader);
 123   }
 124
 125   /**
 126    *
 127    *
 128    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 129    *                 if this object is an invalid instance according to the
 130    *                 schema
 131    */
 132   public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 133   {
 134     org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();
 135     validator.validate(this);
 136   }
 137
 138 }