src/jalview/datamodel/CigarSimple.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)\r
   3  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This file is part of Jalview.\r
   6  * \r
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
  10  * \r
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
  15  * \r
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
  17  */\r
  18 package jalview.datamodel;\r
  19 \r
  20 /**\r
  21  * <p>\r
  22  * Title:\r
  23  * </p>\r
  24  * \r
  25  * <p>\r
  26  * Description:\r
  27  * </p>\r
  28  * \r
  29  * <p>\r
  30  * Copyright: Copyright (c) 2004\r
  31  * </p>\r
  32  * \r
  33  * <p>\r
  34  * Company: Dundee University\r
  35  * </p>\r
  36  * \r
  37  * @author not attributable\r
  38  * @version 1.0\r
  39  */\r
  40 public abstract class CigarSimple extends CigarBase\r
  41 {\r
  42   /**\r
  43    * Return a symbol sequence with edits (gaps, insertions and deletions)\r
  44    * applied\r
  45    * \r
  46    * @param GapChar\r
  47    *          char\r
  48    * @return String\r
  49    */\r
  50   public abstract String getSequenceString(char GapChar);\r
  51 \r
  52 }\r