src/jalview/datamodel/ContactRange.java

   1 package jalview.datamodel;
   2
   3
   4 /**
   5  * bean for max/min positions for a given range
   6  *
   7  * @author jprocter
   8  *
   9  */
  10 public class ContactRange
  11 {
  12   int minPos;
  13
  14   double min;
  15
  16   int maxPos;
  17
  18   double max;
  19
  20   int from_column, to_column;
  21
  22   private double mean;
  23
  24   /**
  25    * update the bean with given values
  26    *
  27    * @param from_column
  28    * @param to_column
  29    * @param minPos
  30    * @param min
  31    * @param maxPos
  32    * @param max
  33    */
  34   public void update(int from_column, int to_column, int minPos,
  35           double min, int maxPos, double max, double mean)
  36   {
  37     this.from_column = from_column;
  38     this.to_column = to_column;
  39     this.minPos = minPos;
  40     this.min = min;
  41     this.maxPos = maxPos;
  42     this.max = max;
  43     this.mean = mean;
  44   }
  45
  46   /**
  47    * @return the minPos
  48    */
  49   public int getMinPos()
  50   {
  51     return minPos;
  52   }
  53
  54   /**
  55    * @param minPos
  56    *          the minPos to set
  57    */
  58   public void setMinPos(int minPos)
  59   {
  60     this.minPos = minPos;
  61   }
  62
  63   /**
  64    * @return the min
  65    */
  66   public double getMin()
  67   {
  68     return min;
  69   }
  70
  71   /**
  72    * @param min
  73    *          the min to set
  74    */
  75   public void setMin(double min)
  76   {
  77     this.min = min;
  78   }
  79
  80   /**
  81    * @return the maxPos
  82    */
  83   public int getMaxPos()
  84   {
  85     return maxPos;
  86   }
  87
  88   /**
  89    * @param maxPos
  90    *          the maxPos to set
  91    */
  92   public void setMaxPos(int maxPos)
  93   {
  94     this.maxPos = maxPos;
  95   }
  96
  97   /**
  98    * @return the max
  99    */
 100   public double getMax()
 101   {
 102     return max;
 103   }
 104
 105   /**
 106    * @param max
 107    *          the max to set
 108    */
 109   public void setMax(double max)
 110   {
 111     this.max = max;
 112   }
 113
 114   /**
 115    * @return the mean
 116    */
 117   public double getMean()
 118   {
 119     return mean;
 120   }
 121
 122   /**
 123    * @param mean
 124    *          the mean to set
 125    */
 126   public void setMean(double mean)
 127   {
 128     this.mean = mean;
 129   }
 130
 131   /**
 132    * @return the from_column
 133    */
 134   public int getFrom_column()
 135   {
 136     return from_column;
 137   }
 138
 139   /**
 140    * @param from_column
 141    *          the from_column to set
 142    */
 143   public void setFrom_column(int from_column)
 144   {
 145     this.from_column = from_column;
 146   }
 147
 148   /**
 149    * @return the to_column
 150    */
 151   public int getTo_column()
 152   {
 153     return to_column;
 154   }
 155
 156   /**
 157    * @param to_column
 158    *          the to_column to set
 159    */
 160   public void setTo_column(int to_column)
 161   {
 162     this.to_column = to_column;
 163   }
 164 }