src/jalview/datamodel/ContiguousI.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
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  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.datamodel;
  22
  23 import java.util.Collection;
  24
  25 public interface ContiguousI
  26 {
  27   int getBegin(); // todo want long for genomic positions?
  28
  29   int getEnd();
  30
  31   public static int[] toStartEndArray(Collection<? extends ContiguousI> ranges)
  32   {
  33     int[] startend = new int[ranges.size() * 2];
  34     int i = 0;
  35     for (var range : ranges)
  36     {
  37       startend[i++] = range.getBegin();
  38       startend[i++] = range.getEnd();
  39     }
  40     return startend;
  41   }
  42 }