src/jalview/datamodel/SequenceCollectionI.java

   1 /*
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  18  */
  19 package jalview.datamodel;
  20
  21 import java.util.List;
  22 import java.util.Map;
  23
  24 public interface SequenceCollectionI
  25 {
  26   List<SequenceI> getSequences();
  27
  28   List<SequenceI> getSequences(
  29           Map<SequenceI, SequenceCollectionI> hiddenReps);
  30
  31   int getWidth();
  32
  33   /**
  34   * @return the first column included in this collection. Runs from 0<=i<N_cols
  35   */
  36   int getStartRes();
  37
  38
  39   /**
  40    *
  41    * @return the last column in this collection. Runs from 0<=i<N_cols
  42    */
  43   int getEndRes();
  44
  45 }