src/jalview/datamodel/UniprotEntry.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  */
  18 package jalview.datamodel;
  19
  20 import java.util.*;
  21
  22 public class UniprotEntry
  23 {
  24
  25   UniprotSequence sequence;
  26
  27   Vector name;
  28
  29   Vector accession;
  30
  31   Vector feature;
  32
  33   Vector dbrefs;
  34
  35   UniprotProteinName protName;
  36
  37   public void setAccession(Vector items)
  38   {
  39     accession = items;
  40   }
  41
  42   public void setFeature(Vector items)
  43   {
  44     feature = items;
  45   }
  46
  47   public Vector getFeature()
  48   {
  49     return feature;
  50   }
  51
  52   public Vector getAccession()
  53   {
  54     return accession;
  55   }
  56
  57   public void setProtein(UniprotProteinName names)
  58   {
  59     protName = names;
  60   }
  61
  62   public UniprotProteinName getProtein()
  63   {
  64     return protName;
  65   }
  66
  67   public void setName(Vector na)
  68   {
  69     name = na;
  70   }
  71
  72   public Vector getName()
  73   {
  74     return name;
  75   }
  76
  77   public UniprotSequence getUniprotSequence()
  78   {
  79     return sequence;
  80   }
  81
  82   public void setUniprotSequence(UniprotSequence seq)
  83   {
  84     sequence = seq;
  85   }
  86
  87   public Vector getDbReference()
  88   {
  89     return dbrefs;
  90   }
  91
  92   public void setDbReference(Vector dbref)
  93   {
  94     this.dbrefs = dbref;
  95   }
  96
  97 }