src/jalview/datamodel/features/FeatureSource.java

   1 package jalview.datamodel.features;
   2
   3 import java.util.HashMap;
   4 import java.util.Map;
   5
   6 /**
   7  * A class to model one source of feature data, including metadata about
   8  * attributes of features
   9  *
  10  * @author gmcarstairs
  11  *
  12  */
  13 public class FeatureSource implements FeatureSourceI
  14 {
  15   private String name;
  16
  17   private Map<String, String> attributeNames;
  18
  19   private Map<String, FeatureAttributeType> attributeTypes;
  20
  21   /**
  22    * Constructor
  23    *
  24    * @param theName
  25    */
  26   public FeatureSource(String theName)
  27   {
  28     this.name = theName;
  29     attributeNames = new HashMap<>();
  30     attributeTypes = new HashMap<>();
  31   }
  32
  33   /**
  34    * {@inheritDoc}
  35    */
  36   @Override
  37   public String getName()
  38   {
  39     return name;
  40   }
  41
  42   /**
  43    * {@inheritDoc}
  44    */
  45   @Override
  46   public String getAttributeName(String attributeId)
  47   {
  48     return attributeNames.get(attributeId);
  49   }
  50
  51   /**
  52    * {@inheritDoc}
  53    */
  54   @Override
  55   public FeatureAttributeType getAttributeType(String attributeId)
  56   {
  57     return attributeTypes.get(attributeId);
  58   }
  59
  60   /**
  61    * {@inheritDoc}
  62    */
  63   @Override
  64   public void setAttributeName(String id, String attName)
  65   {
  66     attributeNames.put(id, attName);
  67   }
  68
  69   /**
  70    * {@inheritDoc}
  71    */
  72   @Override
  73   public void setAttributeType(String id, FeatureAttributeType type)
  74   {
  75     attributeTypes.put(id, type);
  76   }
  77
  78 }