src/jalview/datamodel/features/FeatureSourceI.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.datamodel.features;
  22
  23 public interface FeatureSourceI
  24 {
  25   /**
  26    * Answers a name for the feature source (not necessarily unique)
  27    *
  28    * @return
  29    */
  30   String getName();
  31
  32   /**
  33    * Answers the 'long name' of an attribute given its id (short name or
  34    * abbreviation), or null if not known
  35    *
  36    * @param attributeId
  37    * @return
  38    */
  39   String getAttributeName(String attributeId);
  40
  41   /**
  42    * Sets the 'long name' of an attribute given its id (short name or
  43    * abbreviation).
  44    *
  45    * @param id
  46    * @param name
  47    */
  48   void setAttributeName(String id, String name);
  49
  50   /**
  51    * Answers the datatype of the attribute with given id, or null if not known
  52    *
  53    * @param attributeId
  54    * @return
  55    */
  56   FeatureAttributeType getAttributeType(String attributeId);
  57
  58   /**
  59    * Sets the datatype of the attribute with given id
  60    *
  61    * @param id
  62    * @param type
  63    */
  64   void setAttributeType(String id, FeatureAttributeType type);
  65 }