src/jalview/datamodel/xdb/embl/EmblFeature.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
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  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.datamodel.xdb.embl;
  22
  23 import jalview.datamodel.DBRefEntry;
  24
  25 import java.util.Vector;
  26
  27 /**
  28  * Data model for a &lt;feature&gt; element returned from an EMBL query reply
  29  *
  30  * @see embl_mapping.xml
  31  */
  32 public class EmblFeature
  33 {
  34   String name;
  35
  36   Vector<DBRefEntry> dbRefs;
  37
  38   Vector<Qualifier> qualifiers;
  39
  40   Vector<EmblFeatureLocations> locations;
  41
  42   /**
  43    * @return the dbRefs
  44    */
  45   public Vector<DBRefEntry> getDbRefs()
  46   {
  47     return dbRefs;
  48   }
  49
  50   /**
  51    * @param dbRefs
  52    *          the dbRefs to set
  53    */
  54   public void setDbRefs(Vector<DBRefEntry> dbRefs)
  55   {
  56     this.dbRefs = dbRefs;
  57   }
  58
  59   /**
  60    * @return the locations
  61    */
  62   public Vector<EmblFeatureLocations> getLocations()
  63   {
  64     return locations;
  65   }
  66
  67   /**
  68    * @param locations
  69    *          the locations to set
  70    */
  71   public void setLocations(Vector<EmblFeatureLocations> locations)
  72   {
  73     this.locations = locations;
  74   }
  75
  76   /**
  77    * @return the name
  78    */
  79   public String getName()
  80   {
  81     return name;
  82   }
  83
  84   /**
  85    * @param name
  86    *          the name to set
  87    */
  88   public void setName(String name)
  89   {
  90     this.name = name;
  91   }
  92
  93   /**
  94    * @return the qualifiers
  95    */
  96   public Vector<Qualifier> getQualifiers()
  97   {
  98     return qualifiers;
  99   }
 100
 101   /**
 102    * @param qualifiers
 103    *          the qualifiers to set
 104    */
 105   public void setQualifiers(Vector<Qualifier> qualifiers)
 106   {
 107     this.qualifiers = qualifiers;
 108   }
 109 }