src/jalview/datamodel/xdb/embl/EmblFeatureLocElement.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  */
  18 package jalview.datamodel.xdb.embl;
  19
  20 public class EmblFeatureLocElement
  21 {
  22   String type;
  23
  24   String accession;
  25
  26   String version;
  27
  28   boolean complement;
  29
  30   BasePosition basePositions[];
  31
  32   /**
  33    * @return the accession
  34    */
  35   public String getAccession()
  36   {
  37     return accession;
  38   }
  39
  40   /**
  41    * @param accession
  42    *          the accession to set
  43    */
  44   public void setAccession(String accession)
  45   {
  46     this.accession = accession;
  47   }
  48
  49   /**
  50    * @return the basePositions
  51    */
  52   public BasePosition[] getBasePositions()
  53   {
  54     return basePositions;
  55   }
  56
  57   /**
  58    * @param basePositions
  59    *          the basePositions to set
  60    */
  61   public void setBasePositions(BasePosition[] basePositions)
  62   {
  63     this.basePositions = basePositions;
  64   }
  65
  66   /**
  67    * @return the complement
  68    */
  69   public boolean isComplement()
  70   {
  71     return complement;
  72   }
  73
  74   /**
  75    * @param complement
  76    *          the complement to set
  77    */
  78   public void setComplement(boolean complement)
  79   {
  80     this.complement = complement;
  81   }
  82
  83   /**
  84    * @return the type
  85    */
  86   public String getType()
  87   {
  88     return type;
  89   }
  90
  91   /**
  92    * @param type
  93    *          the type to set
  94    */
  95   public void setType(String type)
  96   {
  97     this.type = type;
  98   }
  99
 100   /**
 101    * @return the version
 102    */
 103   public String getVersion()
 104   {
 105     return version;
 106   }
 107
 108   /**
 109    * @param version
 110    *          the version to set
 111    */
 112   public void setVersion(String version)
 113   {
 114     this.version = version;
 115   }
 116 }