src/jalview/datamodel/xdb/embl/EmblFeatureLocElement.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
   8  * of the License, or (at your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13  * GNU General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  18  */
  19 package jalview.datamodel.xdb.embl;
  20
  21 public class EmblFeatureLocElement
  22 {
  23   String type;
  24
  25   String accession;
  26
  27   String version;
  28
  29   boolean complement;
  30
  31   BasePosition basePositions[];
  32
  33   /**
  34    * @return the accession
  35    */
  36   public String getAccession()
  37   {
  38     return accession;
  39   }
  40
  41   /**
  42    * @param accession
  43    *                the accession to set
  44    */
  45   public void setAccession(String accession)
  46   {
  47     this.accession = accession;
  48   }
  49
  50   /**
  51    * @return the basePositions
  52    */
  53   public BasePosition[] getBasePositions()
  54   {
  55     return basePositions;
  56   }
  57
  58   /**
  59    * @param basePositions
  60    *                the basePositions to set
  61    */
  62   public void setBasePositions(BasePosition[] basePositions)
  63   {
  64     this.basePositions = basePositions;
  65   }
  66
  67   /**
  68    * @return the complement
  69    */
  70   public boolean isComplement()
  71   {
  72     return complement;
  73   }
  74
  75   /**
  76    * @param complement
  77    *                the complement to set
  78    */
  79   public void setComplement(boolean complement)
  80   {
  81     this.complement = complement;
  82   }
  83
  84   /**
  85    * @return the type
  86    */
  87   public String getType()
  88   {
  89     return type;
  90   }
  91
  92   /**
  93    * @param type
  94    *                the type to set
  95    */
  96   public void setType(String type)
  97   {
  98     this.type = type;
  99   }
 100
 101   /**
 102    * @return the version
 103    */
 104   public String getVersion()
 105   {
 106     return version;
 107   }
 108
 109   /**
 110    * @param version
 111    *                the version to set
 112    */
 113   public void setVersion(String version)
 114   {
 115     this.version = version;
 116   }
 117 }