src/jalview/ext/cipres/CipresJobResults.java

   1 package jalview.ext.cipres;
   2
   3 import java.io.File;
   4 import java.io.IOException;
   5 import java.util.Collection;
   6 import java.util.Date;
   7 import java.util.Map;
   8
   9 import org.ngbw.directclient.CiCipresException;
  10 import org.ngbw.directclient.CiJob;
  11 import org.ngbw.directclient.CiResultFile;
  12
  13 public class CipresJobResults
  14 {
  15   private final CiJob job;
  16
  17   protected CipresJobResults(CiJob jobResults)
  18   {
  19     job = jobResults;
  20   }
  21
  22   public void show(boolean message)
  23   {
  24     job.show(message);
  25   }
  26
  27   public CipresJobResults update() throws CiCipresException
  28   {
  29     return new CipresJobResults(job.update());
  30   }
  31
  32   public void delete() throws CiCipresException
  33   {
  34     job.delete();
  35   }
  36
  37   protected Collection<CiResultFile> listResults(boolean finalResults)
  38           throws CiCipresException
  39   {
  40     return job.listResults(finalResults);
  41   }
  42
  43   public void getNewickTree(boolean finalResults)
  44           throws CiCipresException      {
  45     Collection<CiResultFile> results = job.listResults(finalResults);
  46
  47     for (CiResultFile result : results)
  48     {
  49       System.out.println(result.getName());
  50
  51     }
  52
  53   }
  54
  55   public void downloadResults(File location, boolean finalResults)
  56           throws CiCipresException, IOException
  57   {
  58     job.downloadResults(location, finalResults);
  59   }
  60
  61   public boolean isDone()
  62   {
  63     return job.isDone();
  64   }
  65
  66   public boolean isError()
  67   {
  68     return job.isError();
  69   }
  70
  71   public String getJobHandle()
  72   {
  73     return job.getJobHandle();
  74   }
  75
  76   public Date getDateSubmitted()
  77   {
  78     return job.getDateSubmitted();
  79   }
  80
  81   public String getJobStage()
  82   {
  83     return job.getJobStage();
  84   }
  85
  86   public Map<String, String> getMetadata()
  87   {
  88     return job.getMetadata();
  89   }
  90
  91   /**
  92    * @see CiJob#getClientJobID()
  93    *
  94    */
  95   public String getClientJobID()
  96   {
  97     return job.getClientJobID();
  98   }
  99
 100   /**
 101    *
 102    * @see CiJob#getClientJobName()
 103    */
 104   public String getClientJobName()
 105   {
 106     return job.getClientJobName();
 107   }
 108
 109 }