src/jalview/ext/rbvi/chimera/ChimeraXManager.java

   1 package jalview.ext.rbvi.chimera;
   2
   3 import java.util.List;
   4
   5 import ext.edu.ucsf.rbvi.strucviz2.ChimeraManager;
   6 import ext.edu.ucsf.rbvi.strucviz2.StructureManager;
   7
   8 /**
   9  * A class to help Jalview start, stop and send commands to ChimeraX.
  10  * <p>
  11  * Much of the functionality is common with Chimera, so for convenience we
  12  * extend ChimeraManager, however note this class is <em>not</em> based on the
  13  * Cytoscape class at
  14  * {@code https://github.com/RBVI/structureVizX/blob/master/src/main/java/edu/ucsf/rbvi/structureVizX/internal/model/ChimeraManager.java}.
  15  *
  16  * @author gmcarstairs
  17  *
  18  */
  19 public class ChimeraXManager extends ChimeraManager
  20 {
  21
  22   public ChimeraXManager(StructureManager structureManager)
  23   {
  24     super(structureManager);
  25   }
  26
  27   public boolean isChimeraX()
  28   {
  29     return true;
  30   }
  31
  32   /**
  33    * Returns "POST" as the HTTP request method to use for REST service calls to
  34    * ChimeraX
  35    *
  36    * @return
  37    */
  38   protected String getHttpRequestMethod()
  39   {
  40     return "GET";
  41   }
  42
  43   /**
  44    * Adds command-line arguments to start the REST server
  45    */
  46   protected void addLaunchArguments(List<String> args)
  47   {
  48     args.add("--cmd");
  49     args.add("remote rest start");
  50   }
  51
  52 }