src/jalview/fts/core/GFTSPanel.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21
  22 package jalview.fts.core;
  23
  24 import jalview.fts.api.FTSDataColumnI;
  25 import jalview.fts.api.GFTSPanelI;
  26 import jalview.fts.core.FTSDataColumnPreferences.PreferenceSource;
  27 import jalview.gui.Desktop;
  28 import jalview.gui.IProgressIndicator;
  29 import jalview.gui.JvSwingUtils;
  30 import jalview.gui.SequenceFetcher;
  31 import jalview.io.cache.JvCacheableInputBox;
  32 import jalview.util.MessageManager;
  33
  34 import java.awt.BorderLayout;
  35 import java.awt.CardLayout;
  36 import java.awt.Dimension;
  37 import java.awt.event.ActionEvent;
  38 import java.awt.event.ActionListener;
  39 import java.awt.event.FocusAdapter;
  40 import java.awt.event.FocusEvent;
  41 import java.awt.event.FocusListener;
  42 import java.awt.event.ItemEvent;
  43 import java.awt.event.ItemListener;
  44 import java.awt.event.KeyAdapter;
  45 import java.awt.event.KeyEvent;
  46 import java.awt.event.MouseAdapter;
  47 import java.awt.event.MouseEvent;
  48 import java.text.DecimalFormat;
  49 import java.util.ArrayList;
  50 import java.util.Arrays;
  51 import java.util.Collection;
  52 import java.util.Collections;
  53 import java.util.Comparator;
  54 import java.util.HashSet;
  55 import java.util.List;
  56
  57 import javax.swing.ImageIcon;
  58 import javax.swing.JButton;
  59 import javax.swing.JComboBox;
  60 import javax.swing.JFrame;
  61 import javax.swing.JInternalFrame;
  62 import javax.swing.JLabel;
  63 import javax.swing.JPanel;
  64 import javax.swing.JScrollPane;
  65 import javax.swing.JTabbedPane;
  66 import javax.swing.JTable;
  67 import javax.swing.Timer;
  68 import javax.swing.event.ChangeEvent;
  69 import javax.swing.event.ChangeListener;
  70 import javax.swing.event.DocumentEvent;
  71 import javax.swing.event.DocumentListener;
  72 import javax.swing.event.InternalFrameEvent;
  73 import javax.swing.table.DefaultTableModel;
  74 import javax.swing.table.TableColumn;
  75 import javax.swing.text.JTextComponent;
  76
  77 /**
  78  * This class provides the swing GUI layout for FTS Panel and implements most of
  79  * the contracts defined in GFSPanelI
  80  *
  81  * @author tcnofoegbu
  82  *
  83  */
  84
  85 @SuppressWarnings("serial")
  86 public abstract class GFTSPanel extends JPanel implements GFTSPanelI
  87 {
  88   protected JInternalFrame mainFrame = new JInternalFrame(
  89           getFTSFrameTitle());
  90
  91   protected IProgressIndicator progressIndicator;
  92
  93   protected JComboBox<FTSDataColumnI> cmb_searchTarget = new JComboBox<FTSDataColumnI>();
  94
  95   protected JButton btn_ok = new JButton();
  96
  97   protected JButton btn_back = new JButton();
  98
  99   protected JButton btn_cancel = new JButton();
 100
 101   protected JvCacheableInputBox<String> txt_search;
 102
 103   protected SequenceFetcher seqFetcher;
 104
 105   protected Collection<FTSDataColumnI> wantedFields;
 106
 107   private String lastSearchTerm = "";
 108
 109   protected JButton btn_next_page = new JButton();
 110
 111   protected JButton btn_prev_page = new JButton();
 112
 113   protected StringBuilder errorWarning = new StringBuilder();
 114
 115   protected ImageIcon warningImage = new ImageIcon(getClass().getResource(
 116           "/images/warning.gif"));
 117
 118   protected ImageIcon loadingImage = new ImageIcon(getClass().getResource(
 119           "/images/loading.gif"));
 120
 121   protected ImageIcon balnkPlaceholderImage = new ImageIcon(getClass()
 122           .getResource("/images/blank_16x16_placeholder.png"));
 123
 124   protected JLabel lbl_warning = new JLabel(warningImage);
 125
 126   protected JLabel lbl_loading = new JLabel(loadingImage);
 127
 128   protected JLabel lbl_blank = new JLabel(balnkPlaceholderImage);
 129
 130   private JTabbedPane tabbedPane = new JTabbedPane();
 131
 132   private JPanel pnl_actions = new JPanel();
 133
 134   private JPanel pnl_results = new JPanel(new CardLayout());
 135
 136   private JPanel pnl_inputs = new JPanel();
 137
 138   private BorderLayout mainLayout = new BorderLayout();
 139
 140   protected Object[] previousWantedFields;
 141
 142   protected int resultSetCount;
 143
 144   protected int totalResultSetCount;
 145
 146   protected int offSet;
 147
 148   protected int pageLimit;
 149
 150   protected HashSet<String> paginatorCart = new HashSet<String>();
 151
 152   private static final int MIN_WIDTH = 670;
 153
 154   private static final int MIN_HEIGHT = 300;
 155
 156   protected static final DecimalFormat totalNumberformatter = new DecimalFormat(
 157           "###,###");
 158
 159   private JTable tbl_summary = new JTable()
 160   {
 161     private boolean inLayout;
 162
 163     @Override
 164     public boolean getScrollableTracksViewportWidth()
 165     {
 166       return hasExcessWidth();
 167
 168     }
 169
 170     @Override
 171     public void doLayout()
 172     {
 173       if (hasExcessWidth())
 174       {
 175         autoResizeMode = AUTO_RESIZE_SUBSEQUENT_COLUMNS;
 176       }
 177       inLayout = true;
 178       super.doLayout();
 179       inLayout = false;
 180       autoResizeMode = AUTO_RESIZE_OFF;
 181     }
 182
 183     protected boolean hasExcessWidth()
 184     {
 185       return getPreferredSize().width < getParent().getWidth();
 186     }
 187
 188     @Override
 189     public void columnMarginChanged(ChangeEvent e)
 190     {
 191       if (isEditing())
 192       {
 193         removeEditor();
 194       }
 195       TableColumn resizingColumn = getTableHeader().getResizingColumn();
 196       // Need to do this here, before the parent's
 197       // layout manager calls getPreferredSize().
 198       if (resizingColumn != null && autoResizeMode == AUTO_RESIZE_OFF
 199               && !inLayout)
 200       {
 201         resizingColumn.setPreferredWidth(resizingColumn.getWidth());
 202         String colHeader = resizingColumn.getHeaderValue().toString();
 203         getTempUserPrefs().put(colHeader, resizingColumn.getWidth());
 204       }
 205       resizeAndRepaint();
 206     }
 207
 208     @Override
 209     public String getToolTipText(MouseEvent evt)
 210     {
 211       String toolTipText = null;
 212       java.awt.Point pnt = evt.getPoint();
 213       int rowIndex = rowAtPoint(pnt);
 214       int colIndex = columnAtPoint(pnt);
 215
 216       try
 217       {
 218         if (getValueAt(rowIndex, colIndex) == null)
 219         {
 220           return null;
 221         }
 222         toolTipText = getValueAt(rowIndex, colIndex).toString();
 223
 224       } catch (Exception e)
 225       {
 226         e.printStackTrace();
 227       }
 228       toolTipText = (toolTipText == null ? null
 229               : (toolTipText.length() > 500 ? JvSwingUtils.wrapTooltip(
 230                       true, toolTipText.subSequence(0, 500) + "...")
 231                       : JvSwingUtils.wrapTooltip(true, toolTipText)));
 232
 233       return toolTipText;
 234     }
 235   };
 236
 237   protected JScrollPane scrl_searchResult = new JScrollPane(tbl_summary);
 238
 239   public GFTSPanel()
 240   {
 241     try
 242     {
 243       jbInit();
 244       mainFrame.setMinimumSize(new Dimension(MIN_WIDTH, MIN_HEIGHT));
 245       mainFrame.addFocusListener(new FocusAdapter()
 246       {
 247         @Override
 248         public void focusGained(FocusEvent e)
 249         {
 250           txt_search.requestFocusInWindow();
 251         }
 252       });
 253       mainFrame.invalidate();
 254       mainFrame.pack();
 255     } catch (Exception e)
 256     {
 257       e.printStackTrace();
 258     }
 259   }
 260
 261   /**
 262    * Initializes the GUI default properties
 263    *
 264    * @throws Exception
 265    */
 266   private void jbInit() throws Exception
 267   {
 268
 269     txt_search = new JvCacheableInputBox<String>(getCacheKey());
 270     populateCmbSearchTargetOptions();
 271     Integer width = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.width") == null ? 800
 272             : getTempUserPrefs().get("FTSPanel.width");
 273     Integer height = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.height") == null ? 400
 274             : getTempUserPrefs().get("FTSPanel.height");
 275     lbl_warning.setVisible(false);
 276     lbl_warning.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 277     lbl_loading.setVisible(false);
 278     lbl_loading.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 279     lbl_blank.setVisible(true);
 280     lbl_blank.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 281
 282     tbl_summary.setAutoCreateRowSorter(true);
 283     tbl_summary.getTableHeader().setReorderingAllowed(false);
 284     tbl_summary.addMouseListener(new MouseAdapter()
 285     {
 286       @Override
 287       public void mouseClicked(MouseEvent e)
 288       {
 289         validateSelection();
 290       }
 291
 292       @Override
 293       public void mouseReleased(MouseEvent e)
 294       {
 295         validateSelection();
 296       }
 297     });
 298     tbl_summary.addKeyListener(new KeyAdapter()
 299     {
 300       @Override
 301       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 302       {
 303         validateSelection();
 304         switch (evt.getKeyCode())
 305         {
 306         case KeyEvent.VK_ESCAPE: // escape key
 307           btn_back_ActionPerformed();
 308           break;
 309         case KeyEvent.VK_ENTER: // enter key
 310           if (btn_ok.isEnabled())
 311           {
 312             okAction();
 313           }
 314           evt.consume();
 315           break;
 316         case KeyEvent.VK_TAB: // tab key
 317           if (evt.isShiftDown())
 318           {
 319             tabbedPane.requestFocus();
 320           }
 321           else
 322           {
 323             btn_back.requestFocus();
 324           }
 325           evt.consume();
 326           break;
 327         default:
 328           return;
 329         }
 330       }
 331     });
 332
 333     btn_back.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 334     btn_back.setText(MessageManager.getString("action.back"));
 335     btn_back.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 336     {
 337       @Override
 338       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 339       {
 340         btn_back_ActionPerformed();
 341       }
 342     });
 343     btn_back.addKeyListener(new KeyAdapter()
 344     {
 345       @Override
 346       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 347       {
 348         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 349         {
 350           btn_back_ActionPerformed();
 351         }
 352       }
 353     });
 354
 355     btn_ok.setEnabled(false);
 356     btn_ok.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 357     btn_ok.setText(MessageManager.getString("action.ok"));
 358     btn_ok.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 359     {
 360       @Override
 361       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 362       {
 363         okAction();
 364       }
 365     });
 366     btn_ok.addKeyListener(new KeyAdapter()
 367     {
 368       @Override
 369       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 370       {
 371         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 372         {
 373           okAction();
 374         }
 375       }
 376     });
 377     btn_next_page.setEnabled(false);
 378     btn_next_page.setToolTipText(MessageManager
 379             .getString("label.next_page_tooltip"));
 380     btn_next_page.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 381     btn_next_page.setText(MessageManager.getString("action.next_page"));
 382     btn_next_page.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 383     {
 384       @Override
 385       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 386       {
 387         nextPageAction();
 388       }
 389     });
 390     btn_next_page.addKeyListener(new KeyAdapter()
 391     {
 392       @Override
 393       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 394       {
 395         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 396         {
 397           nextPageAction();
 398         }
 399       }
 400     });
 401
 402     btn_prev_page.setEnabled(false);
 403     btn_prev_page.setToolTipText(MessageManager
 404             .getString("label.prev_page_tooltip"));
 405     btn_prev_page.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 406     btn_prev_page.setText(MessageManager.getString("action.prev_page"));
 407     btn_prev_page.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 408     {
 409       @Override
 410       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 411       {
 412         prevPageAction();
 413       }
 414     });
 415     btn_prev_page.addKeyListener(new KeyAdapter()
 416     {
 417       @Override
 418       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 419       {
 420         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 421         {
 422           prevPageAction();
 423         }
 424       }
 425     });
 426
 427     if (isPaginationEnabled())
 428     {
 429       btn_prev_page.setVisible(true);
 430       btn_next_page.setVisible(true);
 431     }
 432     else
 433     {
 434       btn_prev_page.setVisible(false);
 435       btn_next_page.setVisible(false);
 436     }
 437
 438     btn_cancel.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 439     btn_cancel.setText(MessageManager.getString("action.cancel"));
 440     btn_cancel.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 441     {
 442       @Override
 443       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 444       {
 445         btn_cancel_ActionPerformed();
 446       }
 447     });
 448     btn_cancel.addKeyListener(new KeyAdapter()
 449     {
 450       @Override
 451       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 452       {
 453         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 454         {
 455           btn_cancel_ActionPerformed();
 456         }
 457       }
 458     });
 459     scrl_searchResult.setPreferredSize(new Dimension(width, height));
 460
 461     cmb_searchTarget.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 462     cmb_searchTarget.addItemListener(new ItemListener()
 463     {
 464       @Override
 465       public void itemStateChanged(ItemEvent e)
 466       {
 467         if (e.getStateChange() == ItemEvent.SELECTED)
 468         {
 469           String tooltipText;
 470           if ("all".equalsIgnoreCase(getCmbSearchTarget().getSelectedItem()
 471                   .toString()))
 472           {
 473             tooltipText = MessageManager.getString("label.search_all");
 474           }
 475           else if ("pdb id".equalsIgnoreCase(getCmbSearchTarget()
 476                   .getSelectedItem().toString()))
 477           {
 478             tooltipText = MessageManager
 479                     .getString("label.separate_multiple_accession_ids");
 480           }
 481           else
 482           {
 483             tooltipText = MessageManager.formatMessage(
 484                     "label.separate_multiple_query_values",
 485                     new Object[] { getCmbSearchTarget().getSelectedItem()
 486                             .toString() });
 487           }
 488           txt_search.setToolTipText(JvSwingUtils.wrapTooltip(true,
 489                   tooltipText));
 490           searchAction(true);
 491         }
 492       }
 493     });
 494
 495
 496     txt_search.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 497
 498     txt_search.getEditor().getEditorComponent()
 499             .addKeyListener(new KeyAdapter()
 500     {
 501       @Override
 502       public void keyPressed(KeyEvent e)
 503       {
 504         if (e.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 505         {
 506           if (getTypedText() == null || getTypedText().isEmpty())
 507           {
 508             return;
 509           }
 510           String primaryKeyName = getFTSRestClient().getPrimaryKeyColumn()
 511                   .getName();
 512           if (primaryKeyName.equalsIgnoreCase(getCmbSearchTarget()
 513                   .getSelectedItem().toString()))
 514           {
 515             transferToSequenceFetcher(getTypedText());
 516           }
 517         }
 518       }
 519     });
 520     final DeferredTextInputListener listener = new DeferredTextInputListener(
 521             1500, new ActionListener()
 522             {
 523               @Override
 524               public void actionPerformed(ActionEvent e)
 525               {
 526                 String typed = getTypedText();
 527                 if (!typed.equalsIgnoreCase(lastSearchTerm))
 528                 {
 529                   searchAction(true);
 530                   paginatorCart.clear();
 531                   lastSearchTerm = typed;
 532                 }
 533               }
 534             }, false);
 535     ((JTextComponent) txt_search.getEditor().getEditorComponent())
 536             .getDocument().addDocumentListener(listener);
 537
 538     txt_search.addFocusListener(new FocusListener()
 539     {
 540       @Override
 541       public void focusGained(FocusEvent e)
 542       {
 543         listener.start();
 544       }
 545
 546       @Override
 547       public void focusLost(FocusEvent e)
 548       {
 549         // listener.stop();
 550       }
 551     });
 552
 553     final String searchTabTitle = MessageManager
 554             .getString("label.search_result");
 555     final String configureCols = MessageManager
 556             .getString("label.configure_displayed_columns");
 557     ChangeListener changeListener = new ChangeListener()
 558     {
 559       @Override
 560       public void stateChanged(ChangeEvent changeEvent)
 561       {
 562         JTabbedPane sourceTabbedPane = (JTabbedPane) changeEvent
 563                 .getSource();
 564         int index = sourceTabbedPane.getSelectedIndex();
 565
 566         btn_back.setVisible(true);
 567         btn_cancel.setVisible(true);
 568         btn_ok.setVisible(true);
 569         if (sourceTabbedPane.getTitleAt(index).equals(configureCols))
 570         {
 571           btn_back.setVisible(false);
 572           btn_cancel.setVisible(false);
 573           btn_ok.setVisible(false);
 574           btn_back.setEnabled(false);
 575           btn_cancel.setEnabled(false);
 576           btn_ok.setEnabled(false);
 577           btn_next_page.setEnabled(false);
 578           btn_prev_page.setEnabled(false);
 579           txt_search.setEnabled(false);
 580           cmb_searchTarget.setEnabled(false);
 581           previousWantedFields = getFTSRestClient()
 582                   .getAllDefaultDisplayedFTSDataColumns().toArray(
 583                           new Object[0]);
 584         }
 585         if (sourceTabbedPane.getTitleAt(index).equals(searchTabTitle))
 586         {
 587           btn_back.setEnabled(true);
 588           btn_cancel.setEnabled(true);
 589           refreshPaginatorState();
 590           txt_search.setEnabled(true);
 591           cmb_searchTarget.setEnabled(true);
 592           if (wantedFieldsUpdated())
 593           {
 594             searchAction(true);
 595             paginatorCart.clear();
 596           }
 597           else
 598           {
 599             validateSelection();
 600           }
 601         }
 602       }
 603     };
 604     tabbedPane.addChangeListener(changeListener);
 605     tabbedPane.setPreferredSize(new Dimension(width, height));
 606     tabbedPane.add(searchTabTitle, scrl_searchResult);
 607     tabbedPane.add(configureCols, new FTSDataColumnPreferences(
 608             PreferenceSource.SEARCH_SUMMARY, getFTSRestClient()));
 609
 610     pnl_actions.add(btn_back);
 611     pnl_actions.add(btn_ok);
 612     pnl_actions.add(btn_cancel);
 613
 614     pnl_results.add(tabbedPane);
 615     pnl_inputs.add(cmb_searchTarget);
 616     pnl_inputs.add(txt_search);
 617     pnl_inputs.add(lbl_loading);
 618     pnl_inputs.add(lbl_warning);
 619     pnl_inputs.add(lbl_blank);
 620     pnl_inputs.add(btn_prev_page);
 621     pnl_inputs.add(btn_next_page);
 622
 623     this.setLayout(mainLayout);
 624     this.add(pnl_inputs, java.awt.BorderLayout.NORTH);
 625     this.add(pnl_results, java.awt.BorderLayout.CENTER);
 626     this.add(pnl_actions, java.awt.BorderLayout.SOUTH);
 627     mainFrame.setVisible(true);
 628     mainFrame.setContentPane(this);
 629     mainFrame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DISPOSE_ON_CLOSE);
 630     mainFrame
 631             .addInternalFrameListener(new javax.swing.event.InternalFrameAdapter()
 632             {
 633               @Override
 634               public void internalFrameClosing(InternalFrameEvent e)
 635               {
 636                 closeAction();
 637               }
 638             });
 639     mainFrame.setVisible(true);
 640     mainFrame.setContentPane(this);
 641     mainFrame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DISPOSE_ON_CLOSE);
 642     Integer x = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.x");
 643     Integer y = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.y");
 644     if (x != null && y != null)
 645     {
 646       mainFrame.setLocation(x, y);
 647     }
 648     Desktop.addInternalFrame(mainFrame, getFTSFrameTitle(), width, height);
 649   }
 650
 651   protected void closeAction()
 652   {
 653     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.width", this.getWidth());
 654     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.height", pnl_results.getHeight());
 655     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.x", mainFrame.getX());
 656     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.y", mainFrame.getY());
 657     mainFrame.dispose();
 658     txt_search.persistCache();
 659   }
 660
 661   public class DeferredTextInputListener implements DocumentListener
 662   {
 663     private final Timer swingTimer;
 664
 665     public DeferredTextInputListener(int timeOut, ActionListener listener,
 666             boolean repeats)
 667     {
 668       swingTimer = new Timer(timeOut, listener);
 669       swingTimer.setRepeats(repeats);
 670     }
 671
 672     public void start()
 673     {
 674       swingTimer.start();
 675     }
 676
 677     public void stop()
 678     {
 679       swingTimer.stop();
 680     }
 681
 682     @Override
 683     public void insertUpdate(DocumentEvent e)
 684     {
 685       swingTimer.restart();
 686     }
 687
 688     @Override
 689     public void removeUpdate(DocumentEvent e)
 690     {
 691       swingTimer.restart();
 692     }
 693
 694     @Override
 695     public void changedUpdate(DocumentEvent e)
 696     {
 697       swingTimer.restart();
 698     }
 699
 700   }
 701
 702   public boolean wantedFieldsUpdated()
 703   {
 704     if (previousWantedFields == null)
 705     {
 706       return false;
 707     }
 708
 709     return Arrays.equals(getFTSRestClient()
 710             .getAllDefaultDisplayedFTSDataColumns().toArray(new Object[0]),
 711             previousWantedFields) ? false : true;
 712
 713   }
 714
 715   public void validateSelection()
 716   {
 717     if (tbl_summary.getSelectedRows().length > 0
 718             || !paginatorCart.isEmpty())
 719     {
 720       btn_ok.setEnabled(true);
 721     }
 722     else
 723     {
 724       btn_ok.setEnabled(false);
 725     }
 726   }
 727
 728   public JComboBox<FTSDataColumnI> getCmbSearchTarget()
 729   {
 730     return cmb_searchTarget;
 731   }
 732
 733   public JComboBox<String> getTxtSearch()
 734   {
 735     return txt_search;
 736   }
 737
 738   public JInternalFrame getMainFrame()
 739   {
 740     return mainFrame;
 741   }
 742
 743   protected void delayAndEnableActionButtons()
 744   {
 745     new Thread()
 746     {
 747       @Override
 748       public void run()
 749       {
 750         try
 751         {
 752           Thread.sleep(1500);
 753         } catch (InterruptedException e)
 754         {
 755           e.printStackTrace();
 756         }
 757         btn_ok.setEnabled(true);
 758         btn_back.setEnabled(true);
 759         btn_cancel.setEnabled(true);
 760       }
 761     }.start();
 762   }
 763
 764   protected void checkForErrors()
 765   {
 766     lbl_warning.setVisible(false);
 767     lbl_blank.setVisible(true);
 768     if (errorWarning.length() > 0)
 769     {
 770       lbl_loading.setVisible(false);
 771       lbl_blank.setVisible(false);
 772       lbl_warning.setToolTipText(JvSwingUtils.wrapTooltip(true,
 773               errorWarning.toString()));
 774       lbl_warning.setVisible(true);
 775     }
 776   }
 777
 778   protected void btn_back_ActionPerformed()
 779   {
 780     closeAction();
 781     new SequenceFetcher(progressIndicator);
 782   }
 783
 784   protected void disableActionButtons()
 785   {
 786     btn_ok.setEnabled(false);
 787     btn_back.setEnabled(false);
 788     btn_cancel.setEnabled(false);
 789   }
 790
 791   protected void btn_cancel_ActionPerformed()
 792   {
 793     closeAction();
 794   }
 795
 796   /**
 797    * Populates search target combo-box options
 798    */
 799   public void populateCmbSearchTargetOptions()
 800   {
 801     List<FTSDataColumnI> searchableTargets = new ArrayList<FTSDataColumnI>();
 802     try
 803     {
 804       Collection<FTSDataColumnI> foundFTSTargets = getFTSRestClient()
 805               .getSearchableDataColumns();
 806       searchableTargets.addAll(foundFTSTargets);
 807     } catch (Exception e)
 808     {
 809       e.printStackTrace();
 810     }
 811
 812     Collections.sort(searchableTargets, new Comparator<FTSDataColumnI>()
 813     {
 814       @Override
 815       public int compare(FTSDataColumnI o1, FTSDataColumnI o2)
 816       {
 817         return o1.getName().compareTo(o2.getName());
 818       }
 819     });
 820
 821     for (FTSDataColumnI searchTarget : searchableTargets)
 822     {
 823       cmb_searchTarget.addItem(searchTarget);
 824     }
 825   }
 826
 827   public void transferToSequenceFetcher(String ids)
 828   {
 829     seqFetcher.getTextArea().setText(ids);
 830     Thread worker = new Thread(seqFetcher);
 831     worker.start();
 832   }
 833
 834   @Override
 835   public String getTypedText()
 836   {
 837     return txt_search.getUserInput();
 838   }
 839
 840   @Override
 841   public JTable getResultTable()
 842   {
 843     return tbl_summary;
 844   }
 845
 846   public void reset()
 847   {
 848     lbl_loading.setVisible(false);
 849     errorWarning.setLength(0);
 850     lbl_warning.setVisible(false);
 851     lbl_blank.setVisible(true);
 852     btn_ok.setEnabled(false);
 853     mainFrame.setTitle(getFTSFrameTitle());
 854     referesh();
 855     tbl_summary.setModel(new DefaultTableModel());
 856     tbl_summary.setVisible(false);
 857   }
 858
 859   @Override
 860   public void setPrevPageButtonEnabled(boolean isEnabled)
 861   {
 862     btn_prev_page.setEnabled(isEnabled);
 863   }
 864
 865   @Override
 866   public void setNextPageButtonEnabled(boolean isEnabled)
 867   {
 868     btn_next_page.setEnabled(isEnabled);
 869   }
 870
 871   @Override
 872   public void setErrorMessage(String message)
 873   {
 874     errorWarning.append(message);
 875   }
 876
 877   @Override
 878   public void updateSearchFrameTitle(String title)
 879   {
 880     mainFrame.setTitle(title);
 881   }
 882
 883   @Override
 884   public void setSearchInProgress(Boolean isSearchInProgress)
 885   {
 886     lbl_blank.setVisible(!isSearchInProgress);
 887     lbl_loading.setVisible(isSearchInProgress);
 888     txt_search.setEditable(!isSearchInProgress);
 889   }
 890
 891   @Override
 892   public void prevPageAction()
 893   {
 894     updatePaginatorCart();
 895     if (offSet >= pageLimit)
 896     {
 897       offSet = offSet - pageLimit;
 898       searchAction(false);
 899     }
 900     else
 901     {
 902       refreshPaginatorState();
 903     }
 904   }
 905
 906   @Override
 907   public void nextPageAction()
 908   {
 909     updatePaginatorCart();
 910     offSet = offSet + pageLimit;
 911     searchAction(false);
 912   }
 913
 914   public void updatePaginatorCart()
 915   {
 916     int primaryKeyColIndex = 0;
 917     JTable resultTable = getResultTable();
 918     int totalRows = resultTable.getRowCount();
 919     try
 920     {
 921       primaryKeyColIndex = getFTSRestClient().getPrimaryKeyColumIndex(
 922               wantedFields, false);
 923     } catch (Exception e)
 924     {
 925       e.printStackTrace();
 926     }
 927
 928     for (int row = 0; row < totalRows; row++)
 929     {
 930       String id = (String) resultTable.getValueAt(row, primaryKeyColIndex);
 931       if (paginatorCart.contains(id))
 932       {
 933         paginatorCart.remove(id);
 934       }
 935     }
 936     int[] selectedRows = resultTable.getSelectedRows();
 937     for (int summaryRow : selectedRows)
 938     {
 939       String idStr = resultTable.getValueAt(summaryRow, primaryKeyColIndex)
 940               .toString();
 941       paginatorCart.add(idStr);
 942     }
 943   }
 944
 945   public void updateSummaryTableSelections()
 946   {
 947     JTable resultTable = getResultTable();
 948     if (paginatorCart.isEmpty())
 949     {
 950       return;
 951     }
 952     int primaryKeyColIndex = 0;
 953     try
 954     {
 955       primaryKeyColIndex = getFTSRestClient().getPrimaryKeyColumIndex(
 956               wantedFields, false);
 957     } catch (Exception e)
 958     {
 959       e.printStackTrace();
 960     }
 961     int totalRows = resultTable.getRowCount();
 962     for (int row = 0; row < totalRows; row++)
 963     {
 964       String id = (String) resultTable.getValueAt(row, primaryKeyColIndex);
 965       if (paginatorCart.contains(id))
 966       {
 967         resultTable.addRowSelectionInterval(row, row);
 968       }
 969     }
 970     validateSelection();
 971   }
 972
 973   public void refreshPaginatorState()
 974   {
 975     setPrevPageButtonEnabled(false);
 976     setNextPageButtonEnabled(false);
 977     if (resultSetCount == 0 && pageLimit == 0)
 978     {
 979       return;
 980     }
 981     if (resultSetCount >= pageLimit)
 982     {
 983       setNextPageButtonEnabled(true);
 984     }
 985     if (offSet >= pageLimit)
 986     {
 987       setPrevPageButtonEnabled(true);
 988     }
 989   }
 990
 991   public void referesh()
 992   {
 993     mainFrame.setTitle(getFTSFrameTitle());
 994   }
 995
 996
 997 }