src/jalview/fts/core/GFTSPanel.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21
  22 package jalview.fts.core;
  23
  24 import jalview.fts.api.FTSDataColumnI;
  25 import jalview.fts.api.GFTSPanelI;
  26 import jalview.fts.core.FTSDataColumnPreferences.PreferenceSource;
  27 import jalview.gui.Desktop;
  28 import jalview.gui.IProgressIndicator;
  29 import jalview.gui.JvSwingUtils;
  30 import jalview.gui.SequenceFetcher;
  31 import jalview.io.cache.JvCacheableInputBox;
  32 import jalview.util.MessageManager;
  33
  34 import java.awt.BorderLayout;
  35 import java.awt.CardLayout;
  36 import java.awt.Dimension;
  37 import java.awt.event.ActionEvent;
  38 import java.awt.event.ActionListener;
  39 import java.awt.event.FocusAdapter;
  40 import java.awt.event.FocusEvent;
  41 import java.awt.event.FocusListener;
  42 import java.awt.event.ItemEvent;
  43 import java.awt.event.ItemListener;
  44 import java.awt.event.KeyAdapter;
  45 import java.awt.event.KeyEvent;
  46 import java.awt.event.MouseAdapter;
  47 import java.awt.event.MouseEvent;
  48 import java.text.DecimalFormat;
  49 import java.util.ArrayList;
  50 import java.util.Arrays;
  51 import java.util.Collection;
  52 import java.util.Collections;
  53 import java.util.Comparator;
  54 import java.util.HashSet;
  55 import java.util.List;
  56
  57 import javax.swing.ImageIcon;
  58 import javax.swing.JButton;
  59 import javax.swing.JComboBox;
  60 import javax.swing.JFrame;
  61 import javax.swing.JInternalFrame;
  62 import javax.swing.JLabel;
  63 import javax.swing.JPanel;
  64 import javax.swing.JScrollPane;
  65 import javax.swing.JTabbedPane;
  66 import javax.swing.JTable;
  67 import javax.swing.Timer;
  68 import javax.swing.event.ChangeEvent;
  69 import javax.swing.event.ChangeListener;
  70 import javax.swing.event.DocumentEvent;
  71 import javax.swing.event.DocumentListener;
  72 import javax.swing.event.InternalFrameEvent;
  73 import javax.swing.table.DefaultTableModel;
  74 import javax.swing.table.TableColumn;
  75 import javax.swing.text.JTextComponent;
  76
  77 /**
  78  * This class provides the swing GUI layout for FTS Panel and implements most of
  79  * the contracts defined in GFSPanelI
  80  *
  81  * @author tcnofoegbu
  82  *
  83  */
  84
  85 @SuppressWarnings("serial")
  86 public abstract class GFTSPanel extends JPanel implements GFTSPanelI
  87 {
  88   protected JInternalFrame mainFrame = new JInternalFrame(
  89           getFTSFrameTitle());
  90
  91   protected IProgressIndicator progressIndicator;
  92
  93   protected JComboBox<FTSDataColumnI> cmb_searchTarget = new JComboBox<FTSDataColumnI>();
  94
  95   protected JButton btn_ok = new JButton();
  96
  97   protected JButton btn_back = new JButton();
  98
  99   protected JButton btn_cancel = new JButton();
 100
 101   protected JvCacheableInputBox<String> txt_search;
 102
 103   protected SequenceFetcher seqFetcher;
 104
 105   protected Collection<FTSDataColumnI> wantedFields;
 106
 107   private String lastSearchTerm = "";
 108
 109   protected JButton btn_next_page = new JButton();
 110
 111   protected JButton btn_prev_page = new JButton();
 112
 113   protected StringBuilder errorWarning = new StringBuilder();
 114
 115   protected ImageIcon warningImage = new ImageIcon(getClass().getResource(
 116           "/images/warning.gif"));
 117
 118   protected ImageIcon loadingImage = new ImageIcon(getClass().getResource(
 119           "/images/loading.gif"));
 120
 121   protected ImageIcon balnkPlaceholderImage = new ImageIcon(getClass()
 122           .getResource("/images/blank_16x16_placeholder.png"));
 123
 124   protected JLabel lbl_warning = new JLabel(warningImage);
 125
 126   protected JLabel lbl_loading = new JLabel(loadingImage);
 127
 128   protected JLabel lbl_blank = new JLabel(balnkPlaceholderImage);
 129
 130   private JTabbedPane tabbedPane = new JTabbedPane();
 131
 132   private JPanel pnl_actions = new JPanel();
 133
 134   private JPanel pnl_results = new JPanel(new CardLayout());
 135
 136   private JPanel pnl_inputs = new JPanel();
 137
 138   private BorderLayout mainLayout = new BorderLayout();
 139
 140   protected Object[] previousWantedFields;
 141
 142   protected int resultSetCount;
 143
 144   protected int totalResultSetCount;
 145
 146   protected int offSet;
 147
 148   protected int pageLimit;
 149
 150   protected HashSet<String> paginatorCart = new HashSet<String>();
 151
 152   protected static final DecimalFormat totalNumberformatter = new DecimalFormat(
 153           "###,###");
 154
 155   private JTable tbl_summary = new JTable()
 156   {
 157     private boolean inLayout;
 158
 159     @Override
 160     public boolean getScrollableTracksViewportWidth()
 161     {
 162       return hasExcessWidth();
 163
 164     }
 165
 166     @Override
 167     public void doLayout()
 168     {
 169       if (hasExcessWidth())
 170       {
 171         autoResizeMode = AUTO_RESIZE_SUBSEQUENT_COLUMNS;
 172       }
 173       inLayout = true;
 174       super.doLayout();
 175       inLayout = false;
 176       autoResizeMode = AUTO_RESIZE_OFF;
 177     }
 178
 179     protected boolean hasExcessWidth()
 180     {
 181       return getPreferredSize().width < getParent().getWidth();
 182     }
 183
 184     @Override
 185     public void columnMarginChanged(ChangeEvent e)
 186     {
 187       if (isEditing())
 188       {
 189         removeEditor();
 190       }
 191       TableColumn resizingColumn = getTableHeader().getResizingColumn();
 192       // Need to do this here, before the parent's
 193       // layout manager calls getPreferredSize().
 194       if (resizingColumn != null && autoResizeMode == AUTO_RESIZE_OFF
 195               && !inLayout)
 196       {
 197         resizingColumn.setPreferredWidth(resizingColumn.getWidth());
 198         String colHeader = resizingColumn.getHeaderValue().toString();
 199         getTempUserPrefs().put(colHeader, resizingColumn.getWidth());
 200       }
 201       resizeAndRepaint();
 202     }
 203
 204     @Override
 205     public String getToolTipText(MouseEvent evt)
 206     {
 207       String toolTipText = null;
 208       java.awt.Point pnt = evt.getPoint();
 209       int rowIndex = rowAtPoint(pnt);
 210       int colIndex = columnAtPoint(pnt);
 211
 212       try
 213       {
 214         if (getValueAt(rowIndex, colIndex) == null)
 215         {
 216           return null;
 217         }
 218         toolTipText = getValueAt(rowIndex, colIndex).toString();
 219
 220       } catch (Exception e)
 221       {
 222         e.printStackTrace();
 223       }
 224       toolTipText = (toolTipText == null ? null
 225               : (toolTipText.length() > 500 ? JvSwingUtils.wrapTooltip(
 226                       true, toolTipText.subSequence(0, 500) + "...")
 227                       : JvSwingUtils.wrapTooltip(true, toolTipText)));
 228
 229       return toolTipText;
 230     }
 231   };
 232
 233   protected JScrollPane scrl_searchResult = new JScrollPane(tbl_summary);
 234
 235   public GFTSPanel()
 236   {
 237     try
 238     {
 239       jbInit();
 240       mainFrame.addFocusListener(new FocusAdapter()
 241       {
 242         @Override
 243         public void focusGained(FocusEvent e)
 244         {
 245           txt_search.requestFocusInWindow();
 246         }
 247       });
 248       mainFrame.invalidate();
 249       mainFrame.pack();
 250     } catch (Exception e)
 251     {
 252       e.printStackTrace();
 253     }
 254   }
 255
 256   /**
 257    * Initializes the GUI default properties
 258    *
 259    * @throws Exception
 260    */
 261   private void jbInit() throws Exception
 262   {
 263
 264     txt_search = new JvCacheableInputBox<String>(getCacheKey());
 265     populateCmbSearchTargetOptions();
 266     Integer width = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.width") == null ? 800
 267             : getTempUserPrefs().get("FTSPanel.width");
 268     Integer height = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.height") == null ? 400
 269             : getTempUserPrefs().get("FTSPanel.height");
 270     lbl_warning.setVisible(false);
 271     lbl_warning.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 272     lbl_loading.setVisible(false);
 273     lbl_loading.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 274     lbl_blank.setVisible(true);
 275     lbl_blank.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 276
 277     tbl_summary.setAutoCreateRowSorter(true);
 278     tbl_summary.getTableHeader().setReorderingAllowed(false);
 279     tbl_summary.addMouseListener(new MouseAdapter()
 280     {
 281       @Override
 282       public void mouseClicked(MouseEvent e)
 283       {
 284         validateSelection();
 285       }
 286
 287       @Override
 288       public void mouseReleased(MouseEvent e)
 289       {
 290         validateSelection();
 291       }
 292     });
 293     tbl_summary.addKeyListener(new KeyAdapter()
 294     {
 295       @Override
 296       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 297       {
 298         validateSelection();
 299         switch (evt.getKeyCode())
 300         {
 301         case KeyEvent.VK_ESCAPE: // escape key
 302           btn_back_ActionPerformed();
 303           break;
 304         case KeyEvent.VK_ENTER: // enter key
 305           if (btn_ok.isEnabled())
 306           {
 307             okAction();
 308           }
 309           evt.consume();
 310           break;
 311         case KeyEvent.VK_TAB: // tab key
 312           if (evt.isShiftDown())
 313           {
 314             tabbedPane.requestFocus();
 315           }
 316           else
 317           {
 318             btn_back.requestFocus();
 319           }
 320           evt.consume();
 321           break;
 322         default:
 323           return;
 324         }
 325       }
 326     });
 327
 328     btn_back.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 329     btn_back.setText(MessageManager.getString("action.back"));
 330     btn_back.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 331     {
 332       @Override
 333       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 334       {
 335         btn_back_ActionPerformed();
 336       }
 337     });
 338     btn_back.addKeyListener(new KeyAdapter()
 339     {
 340       @Override
 341       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 342       {
 343         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 344         {
 345           btn_back_ActionPerformed();
 346         }
 347       }
 348     });
 349
 350     btn_ok.setEnabled(false);
 351     btn_ok.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 352     btn_ok.setText(MessageManager.getString("action.ok"));
 353     btn_ok.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 354     {
 355       @Override
 356       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 357       {
 358         okAction();
 359       }
 360     });
 361     btn_ok.addKeyListener(new KeyAdapter()
 362     {
 363       @Override
 364       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 365       {
 366         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 367         {
 368           okAction();
 369         }
 370       }
 371     });
 372     btn_next_page.setEnabled(false);
 373     btn_next_page.setToolTipText(MessageManager
 374             .getString("label.next_page_tooltip"));
 375     btn_next_page.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 376     btn_next_page.setText(MessageManager.getString("action.next_page"));
 377     btn_next_page.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 378     {
 379       @Override
 380       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 381       {
 382         nextPageAction();
 383       }
 384     });
 385     btn_next_page.addKeyListener(new KeyAdapter()
 386     {
 387       @Override
 388       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 389       {
 390         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 391         {
 392           nextPageAction();
 393         }
 394       }
 395     });
 396
 397     btn_prev_page.setEnabled(false);
 398     btn_prev_page.setToolTipText(MessageManager
 399             .getString("label.prev_page_tooltip"));
 400     btn_prev_page.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 401     btn_prev_page.setText(MessageManager.getString("action.prev_page"));
 402     btn_prev_page.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 403     {
 404       @Override
 405       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 406       {
 407         prevPageAction();
 408       }
 409     });
 410     btn_prev_page.addKeyListener(new KeyAdapter()
 411     {
 412       @Override
 413       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 414       {
 415         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 416         {
 417           prevPageAction();
 418         }
 419       }
 420     });
 421
 422     if (isPaginationEnabled())
 423     {
 424       btn_prev_page.setVisible(true);
 425       btn_next_page.setVisible(true);
 426     }
 427     else
 428     {
 429       btn_prev_page.setVisible(false);
 430       btn_next_page.setVisible(false);
 431     }
 432
 433     btn_cancel.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 434     btn_cancel.setText(MessageManager.getString("action.cancel"));
 435     btn_cancel.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 436     {
 437       @Override
 438       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 439       {
 440         btn_cancel_ActionPerformed();
 441       }
 442     });
 443     btn_cancel.addKeyListener(new KeyAdapter()
 444     {
 445       @Override
 446       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 447       {
 448         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 449         {
 450           btn_cancel_ActionPerformed();
 451         }
 452       }
 453     });
 454     scrl_searchResult.setPreferredSize(new Dimension(width, height));
 455
 456     cmb_searchTarget.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 457     cmb_searchTarget.addItemListener(new ItemListener()
 458     {
 459       @Override
 460       public void itemStateChanged(ItemEvent e)
 461       {
 462         if (e.getStateChange() == ItemEvent.SELECTED)
 463         {
 464           String tooltipText;
 465           if ("all".equalsIgnoreCase(getCmbSearchTarget().getSelectedItem()
 466                   .toString()))
 467           {
 468             tooltipText = MessageManager.getString("label.search_all");
 469           }
 470           else if ("pdb id".equalsIgnoreCase(getCmbSearchTarget()
 471                   .getSelectedItem().toString()))
 472           {
 473             tooltipText = MessageManager
 474                     .getString("label.separate_multiple_accession_ids");
 475           }
 476           else
 477           {
 478             tooltipText = MessageManager.formatMessage(
 479                     "label.separate_multiple_query_values",
 480                     new Object[] { getCmbSearchTarget().getSelectedItem()
 481                             .toString() });
 482           }
 483           txt_search.setToolTipText(JvSwingUtils.wrapTooltip(true,
 484                   tooltipText));
 485           searchAction(true);
 486         }
 487       }
 488     });
 489
 490
 491     txt_search.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 492
 493     txt_search.getEditor().getEditorComponent()
 494             .addKeyListener(new KeyAdapter()
 495     {
 496       @Override
 497       public void keyPressed(KeyEvent e)
 498       {
 499         if (e.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 500         {
 501           if (getTypedText() == null || getTypedText().isEmpty())
 502           {
 503             return;
 504           }
 505           String primaryKeyName = getFTSRestClient().getPrimaryKeyColumn()
 506                   .getName();
 507           if (primaryKeyName.equalsIgnoreCase(getCmbSearchTarget()
 508                   .getSelectedItem().toString()))
 509           {
 510             transferToSequenceFetcher(getTypedText());
 511           }
 512         }
 513       }
 514     });
 515     final DeferredTextInputListener listener = new DeferredTextInputListener(
 516             1500, new ActionListener()
 517             {
 518               @Override
 519               public void actionPerformed(ActionEvent e)
 520               {
 521                 String typed = getTypedText();
 522                 if (!typed.equalsIgnoreCase(lastSearchTerm))
 523                 {
 524                   searchAction(true);
 525                   paginatorCart.clear();
 526                   lastSearchTerm = typed;
 527                 }
 528               }
 529             }, false);
 530     ((JTextComponent) txt_search.getEditor().getEditorComponent())
 531             .getDocument().addDocumentListener(listener);
 532
 533     txt_search.addFocusListener(new FocusListener()
 534     {
 535       @Override
 536       public void focusGained(FocusEvent e)
 537       {
 538         listener.start();
 539       }
 540
 541       @Override
 542       public void focusLost(FocusEvent e)
 543       {
 544         // listener.stop();
 545       }
 546     });
 547
 548     final String searchTabTitle = MessageManager
 549             .getString("label.search_result");
 550     final String configureCols = MessageManager
 551             .getString("label.configure_displayed_columns");
 552     ChangeListener changeListener = new ChangeListener()
 553     {
 554       @Override
 555       public void stateChanged(ChangeEvent changeEvent)
 556       {
 557         JTabbedPane sourceTabbedPane = (JTabbedPane) changeEvent
 558                 .getSource();
 559         int index = sourceTabbedPane.getSelectedIndex();
 560
 561         btn_back.setVisible(true);
 562         btn_cancel.setVisible(true);
 563         btn_ok.setVisible(true);
 564         if (sourceTabbedPane.getTitleAt(index).equals(configureCols))
 565         {
 566           btn_back.setVisible(false);
 567           btn_cancel.setVisible(false);
 568           btn_ok.setVisible(false);
 569           btn_back.setEnabled(false);
 570           btn_cancel.setEnabled(false);
 571           btn_ok.setEnabled(false);
 572           btn_next_page.setEnabled(false);
 573           btn_prev_page.setEnabled(false);
 574           txt_search.setEnabled(false);
 575           cmb_searchTarget.setEnabled(false);
 576           previousWantedFields = getFTSRestClient()
 577                   .getAllDefaultDisplayedFTSDataColumns().toArray(
 578                           new Object[0]);
 579         }
 580         if (sourceTabbedPane.getTitleAt(index).equals(searchTabTitle))
 581         {
 582           btn_back.setEnabled(true);
 583           btn_cancel.setEnabled(true);
 584           refreshPaginatorState();
 585           txt_search.setEnabled(true);
 586           cmb_searchTarget.setEnabled(true);
 587           if (wantedFieldsUpdated())
 588           {
 589             searchAction(true);
 590             paginatorCart.clear();
 591           }
 592           else
 593           {
 594             validateSelection();
 595           }
 596         }
 597       }
 598     };
 599     tabbedPane.addChangeListener(changeListener);
 600     tabbedPane.setPreferredSize(new Dimension(width, height));
 601     tabbedPane.add(searchTabTitle, scrl_searchResult);
 602     tabbedPane.add(configureCols, new FTSDataColumnPreferences(
 603             PreferenceSource.SEARCH_SUMMARY, getFTSRestClient()));
 604
 605     pnl_actions.add(btn_back);
 606     pnl_actions.add(btn_ok);
 607     pnl_actions.add(btn_cancel);
 608
 609     pnl_results.add(tabbedPane);
 610     pnl_inputs.add(cmb_searchTarget);
 611     pnl_inputs.add(txt_search);
 612     pnl_inputs.add(lbl_loading);
 613     pnl_inputs.add(lbl_warning);
 614     pnl_inputs.add(lbl_blank);
 615     pnl_inputs.add(btn_prev_page);
 616     pnl_inputs.add(btn_next_page);
 617
 618     this.setLayout(mainLayout);
 619     this.add(pnl_inputs, java.awt.BorderLayout.NORTH);
 620     this.add(pnl_results, java.awt.BorderLayout.CENTER);
 621     this.add(pnl_actions, java.awt.BorderLayout.SOUTH);
 622     mainFrame.setVisible(true);
 623     mainFrame.setContentPane(this);
 624     mainFrame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DISPOSE_ON_CLOSE);
 625     mainFrame
 626             .addInternalFrameListener(new javax.swing.event.InternalFrameAdapter()
 627             {
 628               @Override
 629               public void internalFrameClosing(InternalFrameEvent e)
 630               {
 631                 closeAction();
 632               }
 633             });
 634     mainFrame.setVisible(true);
 635     mainFrame.setContentPane(this);
 636     mainFrame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DISPOSE_ON_CLOSE);
 637     Integer x = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.x");
 638     Integer y = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.y");
 639     if (x != null && y != null)
 640     {
 641       mainFrame.setLocation(x, y);
 642     }
 643     Desktop.addInternalFrame(mainFrame, getFTSFrameTitle(), width, height);
 644   }
 645
 646   protected void closeAction()
 647   {
 648     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.width", this.getWidth());
 649     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.height", pnl_results.getHeight());
 650     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.x", mainFrame.getX());
 651     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.y", mainFrame.getY());
 652     mainFrame.dispose();
 653     txt_search.persistCache();
 654   }
 655
 656   public class DeferredTextInputListener implements DocumentListener
 657   {
 658     private final Timer swingTimer;
 659
 660     public DeferredTextInputListener(int timeOut, ActionListener listener,
 661             boolean repeats)
 662     {
 663       swingTimer = new Timer(timeOut, listener);
 664       swingTimer.setRepeats(repeats);
 665     }
 666
 667     public void start()
 668     {
 669       swingTimer.start();
 670     }
 671
 672     public void stop()
 673     {
 674       swingTimer.stop();
 675     }
 676
 677     @Override
 678     public void insertUpdate(DocumentEvent e)
 679     {
 680       swingTimer.restart();
 681     }
 682
 683     @Override
 684     public void removeUpdate(DocumentEvent e)
 685     {
 686       swingTimer.restart();
 687     }
 688
 689     @Override
 690     public void changedUpdate(DocumentEvent e)
 691     {
 692       swingTimer.restart();
 693     }
 694
 695   }
 696
 697   public boolean wantedFieldsUpdated()
 698   {
 699     if (previousWantedFields == null)
 700     {
 701       return false;
 702     }
 703
 704     return Arrays.equals(getFTSRestClient()
 705             .getAllDefaultDisplayedFTSDataColumns().toArray(new Object[0]),
 706             previousWantedFields) ? false : true;
 707
 708   }
 709
 710   public void validateSelection()
 711   {
 712     if (tbl_summary.getSelectedRows().length > 0
 713             || !paginatorCart.isEmpty())
 714     {
 715       btn_ok.setEnabled(true);
 716     }
 717     else
 718     {
 719       btn_ok.setEnabled(false);
 720     }
 721   }
 722
 723   public JComboBox<FTSDataColumnI> getCmbSearchTarget()
 724   {
 725     return cmb_searchTarget;
 726   }
 727
 728   public JComboBox<String> getTxtSearch()
 729   {
 730     return txt_search;
 731   }
 732
 733   public JInternalFrame getMainFrame()
 734   {
 735     return mainFrame;
 736   }
 737
 738   protected void delayAndEnableActionButtons()
 739   {
 740     new Thread()
 741     {
 742       @Override
 743       public void run()
 744       {
 745         try
 746         {
 747           Thread.sleep(1500);
 748         } catch (InterruptedException e)
 749         {
 750           e.printStackTrace();
 751         }
 752         btn_ok.setEnabled(true);
 753         btn_back.setEnabled(true);
 754         btn_cancel.setEnabled(true);
 755       }
 756     }.start();
 757   }
 758
 759   protected void checkForErrors()
 760   {
 761     lbl_warning.setVisible(false);
 762     lbl_blank.setVisible(true);
 763     if (errorWarning.length() > 0)
 764     {
 765       lbl_loading.setVisible(false);
 766       lbl_blank.setVisible(false);
 767       lbl_warning.setToolTipText(JvSwingUtils.wrapTooltip(true,
 768               errorWarning.toString()));
 769       lbl_warning.setVisible(true);
 770     }
 771   }
 772
 773   protected void btn_back_ActionPerformed()
 774   {
 775     closeAction();
 776     new SequenceFetcher(progressIndicator);
 777   }
 778
 779   protected void disableActionButtons()
 780   {
 781     btn_ok.setEnabled(false);
 782     btn_back.setEnabled(false);
 783     btn_cancel.setEnabled(false);
 784   }
 785
 786   protected void btn_cancel_ActionPerformed()
 787   {
 788     closeAction();
 789   }
 790
 791   /**
 792    * Populates search target combo-box options
 793    */
 794   public void populateCmbSearchTargetOptions()
 795   {
 796     List<FTSDataColumnI> searchableTargets = new ArrayList<FTSDataColumnI>();
 797     try
 798     {
 799       Collection<FTSDataColumnI> foundFTSTargets = getFTSRestClient()
 800               .getSearchableDataColumns();
 801       searchableTargets.addAll(foundFTSTargets);
 802     } catch (Exception e)
 803     {
 804       e.printStackTrace();
 805     }
 806
 807     Collections.sort(searchableTargets, new Comparator<FTSDataColumnI>()
 808     {
 809       @Override
 810       public int compare(FTSDataColumnI o1, FTSDataColumnI o2)
 811       {
 812         return o1.getName().compareTo(o2.getName());
 813       }
 814     });
 815
 816     for (FTSDataColumnI searchTarget : searchableTargets)
 817     {
 818       cmb_searchTarget.addItem(searchTarget);
 819     }
 820   }
 821
 822   public void transferToSequenceFetcher(String ids)
 823   {
 824     seqFetcher.getTextArea().setText(ids);
 825     Thread worker = new Thread(seqFetcher);
 826     worker.start();
 827   }
 828
 829   @Override
 830   public String getTypedText()
 831   {
 832     return txt_search.getUserInput();
 833   }
 834
 835   @Override
 836   public JTable getResultTable()
 837   {
 838     return tbl_summary;
 839   }
 840
 841   public void reset()
 842   {
 843     lbl_loading.setVisible(false);
 844     errorWarning.setLength(0);
 845     lbl_warning.setVisible(false);
 846     lbl_blank.setVisible(true);
 847     btn_ok.setEnabled(false);
 848     mainFrame.setTitle(getFTSFrameTitle());
 849     referesh();
 850     tbl_summary.setModel(new DefaultTableModel());
 851     tbl_summary.setVisible(false);
 852   }
 853
 854   @Override
 855   public void setPrevPageButtonEnabled(boolean isEnabled)
 856   {
 857     btn_prev_page.setEnabled(isEnabled);
 858   }
 859
 860   @Override
 861   public void setNextPageButtonEnabled(boolean isEnabled)
 862   {
 863     btn_next_page.setEnabled(isEnabled);
 864   }
 865
 866   @Override
 867   public void setErrorMessage(String message)
 868   {
 869     errorWarning.append(message);
 870   }
 871
 872   @Override
 873   public void updateSearchFrameTitle(String title)
 874   {
 875     mainFrame.setTitle(title);
 876   }
 877
 878   @Override
 879   public void setSearchInProgress(Boolean isSearchInProgress)
 880   {
 881     lbl_blank.setVisible(!isSearchInProgress);
 882     lbl_loading.setVisible(isSearchInProgress);
 883     txt_search.setEditable(!isSearchInProgress);
 884   }
 885
 886   @Override
 887   public void prevPageAction()
 888   {
 889     updatePaginatorCart();
 890     if (offSet >= pageLimit)
 891     {
 892       offSet = offSet - pageLimit;
 893       searchAction(false);
 894     }
 895     else
 896     {
 897       refreshPaginatorState();
 898     }
 899   }
 900
 901   @Override
 902   public void nextPageAction()
 903   {
 904     updatePaginatorCart();
 905     offSet = offSet + pageLimit;
 906     searchAction(false);
 907   }
 908
 909   public void updatePaginatorCart()
 910   {
 911     int primaryKeyColIndex = 0;
 912     JTable resultTable = getResultTable();
 913     int totalRows = resultTable.getRowCount();
 914     try
 915     {
 916       primaryKeyColIndex = getFTSRestClient().getPrimaryKeyColumIndex(
 917               wantedFields, false);
 918     } catch (Exception e)
 919     {
 920       e.printStackTrace();
 921     }
 922
 923     for (int row = 0; row < totalRows; row++)
 924     {
 925       String id = (String) resultTable.getValueAt(row, primaryKeyColIndex);
 926       if (paginatorCart.contains(id))
 927       {
 928         paginatorCart.remove(id);
 929       }
 930     }
 931     int[] selectedRows = resultTable.getSelectedRows();
 932     for (int summaryRow : selectedRows)
 933     {
 934       String idStr = resultTable.getValueAt(summaryRow, primaryKeyColIndex)
 935               .toString();
 936       paginatorCart.add(idStr);
 937     }
 938   }
 939
 940   public void updateSummaryTableSelections()
 941   {
 942     JTable resultTable = getResultTable();
 943     if (paginatorCart.isEmpty())
 944     {
 945       return;
 946     }
 947     int primaryKeyColIndex = 0;
 948     try
 949     {
 950       primaryKeyColIndex = getFTSRestClient().getPrimaryKeyColumIndex(
 951               wantedFields, false);
 952     } catch (Exception e)
 953     {
 954       e.printStackTrace();
 955     }
 956     int totalRows = resultTable.getRowCount();
 957     for (int row = 0; row < totalRows; row++)
 958     {
 959       String id = (String) resultTable.getValueAt(row, primaryKeyColIndex);
 960       if (paginatorCart.contains(id))
 961       {
 962         resultTable.addRowSelectionInterval(row, row);
 963       }
 964     }
 965     validateSelection();
 966   }
 967
 968   public void refreshPaginatorState()
 969   {
 970     setPrevPageButtonEnabled(false);
 971     setNextPageButtonEnabled(false);
 972     if (resultSetCount == 0 && pageLimit == 0)
 973     {
 974       return;
 975     }
 976     if (resultSetCount >= pageLimit)
 977     {
 978       setNextPageButtonEnabled(true);
 979     }
 980     if (offSet >= pageLimit)
 981     {
 982       setPrevPageButtonEnabled(true);
 983     }
 984   }
 985
 986   public void referesh()
 987   {
 988     mainFrame.setTitle(getFTSFrameTitle());
 989   }
 990
 991
 992 }