src/jalview/fts/core/GFTSPanel.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21
  22 package jalview.fts.core;
  23
  24 import jalview.fts.api.FTSDataColumnI;
  25 import jalview.fts.api.GFTSPanelI;
  26 import jalview.fts.core.FTSDataColumnPreferences.PreferenceSource;
  27 import jalview.gui.Desktop;
  28 import jalview.gui.IProgressIndicator;
  29 import jalview.gui.JvSwingUtils;
  30 import jalview.gui.SequenceFetcher;
  31 import jalview.util.MessageManager;
  32
  33 import java.awt.BorderLayout;
  34 import java.awt.CardLayout;
  35 import java.awt.Dimension;
  36 import java.awt.event.ActionEvent;
  37 import java.awt.event.ActionListener;
  38 import java.awt.event.FocusAdapter;
  39 import java.awt.event.FocusEvent;
  40 import java.awt.event.FocusListener;
  41 import java.awt.event.KeyAdapter;
  42 import java.awt.event.KeyEvent;
  43 import java.awt.event.MouseAdapter;
  44 import java.awt.event.MouseEvent;
  45 import java.text.DecimalFormat;
  46 import java.util.ArrayList;
  47 import java.util.Arrays;
  48 import java.util.Collection;
  49 import java.util.Collections;
  50 import java.util.Comparator;
  51 import java.util.HashSet;
  52 import java.util.List;
  53
  54 import javax.swing.ImageIcon;
  55 import javax.swing.JButton;
  56 import javax.swing.JComboBox;
  57 import javax.swing.JFrame;
  58 import javax.swing.JInternalFrame;
  59 import javax.swing.JLabel;
  60 import javax.swing.JPanel;
  61 import javax.swing.JScrollPane;
  62 import javax.swing.JTabbedPane;
  63 import javax.swing.JTable;
  64 import javax.swing.JTextField;
  65 import javax.swing.Timer;
  66 import javax.swing.event.ChangeEvent;
  67 import javax.swing.event.ChangeListener;
  68 import javax.swing.event.DocumentEvent;
  69 import javax.swing.event.DocumentListener;
  70 import javax.swing.event.InternalFrameEvent;
  71 import javax.swing.table.DefaultTableModel;
  72 import javax.swing.table.TableColumn;
  73
  74 /**
  75  * This class provides the swing GUI layout for FTS Panel and implements most of
  76  * the contracts defined in GFSPanelI
  77  *
  78  * @author tcnofoegbu
  79  *
  80  */
  81
  82 @SuppressWarnings("serial")
  83 public abstract class GFTSPanel extends JPanel implements GFTSPanelI
  84 {
  85   protected JInternalFrame mainFrame = new JInternalFrame(
  86           getFTSFrameTitle());
  87
  88   protected IProgressIndicator progressIndicator;
  89
  90   protected JComboBox<FTSDataColumnI> cmb_searchTarget = new JComboBox<FTSDataColumnI>();
  91
  92   protected JButton btn_ok = new JButton();
  93
  94   protected JButton btn_back = new JButton();
  95
  96   protected JButton btn_cancel = new JButton();
  97
  98   protected JTextField txt_search = new JTextField(30);
  99
 100   protected SequenceFetcher seqFetcher;
 101
 102   protected Collection<FTSDataColumnI> wantedFields;
 103
 104   private String lastSearchTerm = "";
 105
 106   protected JButton btn_next_page = new JButton();
 107
 108   protected JButton btn_prev_page = new JButton();
 109
 110   protected StringBuilder errorWarning = new StringBuilder();
 111
 112   protected ImageIcon warningImage = new ImageIcon(getClass().getResource(
 113           "/images/warning.gif"));
 114
 115   protected ImageIcon loadingImage = new ImageIcon(getClass().getResource(
 116           "/images/loading.gif"));
 117
 118   protected ImageIcon balnkPlaceholderImage = new ImageIcon(getClass()
 119           .getResource("/images/blank_16x16_placeholder.png"));
 120
 121   protected JLabel lbl_warning = new JLabel(warningImage);
 122
 123   protected JLabel lbl_loading = new JLabel(loadingImage);
 124
 125   protected JLabel lbl_blank = new JLabel(balnkPlaceholderImage);
 126
 127   private JTabbedPane tabbedPane = new JTabbedPane();
 128
 129   private JPanel pnl_actions = new JPanel();
 130
 131   private JPanel pnl_results = new JPanel(new CardLayout());
 132
 133   private JPanel pnl_inputs = new JPanel();
 134
 135   private BorderLayout mainLayout = new BorderLayout();
 136
 137   protected Object[] previousWantedFields;
 138
 139   protected int resultSetCount;
 140
 141   protected int totalResultSetCount;
 142
 143   protected int offSet;
 144
 145   protected int pageLimit;
 146
 147   protected HashSet<String> paginatorCart = new HashSet<String>();
 148
 149   protected static final DecimalFormat totalNumberformatter = new DecimalFormat(
 150           "###,###");
 151
 152   private JTable tbl_summary = new JTable()
 153   {
 154     private boolean inLayout;
 155
 156     @Override
 157     public boolean getScrollableTracksViewportWidth()
 158     {
 159       return hasExcessWidth();
 160
 161     }
 162
 163     @Override
 164     public void doLayout()
 165     {
 166       if (hasExcessWidth())
 167       {
 168         autoResizeMode = AUTO_RESIZE_SUBSEQUENT_COLUMNS;
 169       }
 170       inLayout = true;
 171       super.doLayout();
 172       inLayout = false;
 173       autoResizeMode = AUTO_RESIZE_OFF;
 174     }
 175
 176     protected boolean hasExcessWidth()
 177     {
 178       return getPreferredSize().width < getParent().getWidth();
 179     }
 180
 181     @Override
 182     public void columnMarginChanged(ChangeEvent e)
 183     {
 184       if (isEditing())
 185       {
 186         removeEditor();
 187       }
 188       TableColumn resizingColumn = getTableHeader().getResizingColumn();
 189       // Need to do this here, before the parent's
 190       // layout manager calls getPreferredSize().
 191       if (resizingColumn != null && autoResizeMode == AUTO_RESIZE_OFF
 192               && !inLayout)
 193       {
 194         resizingColumn.setPreferredWidth(resizingColumn.getWidth());
 195         String colHeader = resizingColumn.getHeaderValue().toString();
 196         getTempUserPrefs().put(colHeader, resizingColumn.getWidth());
 197       }
 198       resizeAndRepaint();
 199     }
 200
 201     @Override
 202     public String getToolTipText(MouseEvent evt)
 203     {
 204       String toolTipText = null;
 205       java.awt.Point pnt = evt.getPoint();
 206       int rowIndex = rowAtPoint(pnt);
 207       int colIndex = columnAtPoint(pnt);
 208
 209       try
 210       {
 211         if (getValueAt(rowIndex, colIndex) == null)
 212         {
 213           return null;
 214         }
 215         toolTipText = getValueAt(rowIndex, colIndex).toString();
 216
 217       } catch (Exception e)
 218       {
 219         e.printStackTrace();
 220       }
 221       toolTipText = (toolTipText == null ? null
 222               : (toolTipText.length() > 500 ? JvSwingUtils.wrapTooltip(
 223                       true, toolTipText.subSequence(0, 500) + "...")
 224                       : JvSwingUtils.wrapTooltip(true, toolTipText)));
 225
 226       return toolTipText;
 227     }
 228   };
 229
 230   protected JScrollPane scrl_searchResult = new JScrollPane(tbl_summary);
 231
 232   public GFTSPanel()
 233   {
 234     try
 235     {
 236       jbInit();
 237       mainFrame.addFocusListener(new FocusAdapter()
 238       {
 239         @Override
 240         public void focusGained(FocusEvent e)
 241         {
 242           txt_search.requestFocusInWindow();
 243         }
 244       });
 245       mainFrame.invalidate();
 246       mainFrame.pack();
 247     } catch (Exception e)
 248     {
 249       e.printStackTrace();
 250     }
 251   }
 252
 253   /**
 254    * Initializes the GUI default properties
 255    *
 256    * @throws Exception
 257    */
 258   private void jbInit() throws Exception
 259   {
 260     Integer width = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.width") == null ? 800
 261             : getTempUserPrefs().get("FTSPanel.width");
 262     Integer height = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.height") == null ? 400
 263             : getTempUserPrefs().get("FTSPanel.height");
 264     lbl_warning.setVisible(false);
 265     lbl_warning.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 266     lbl_loading.setVisible(false);
 267     lbl_loading.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 268     lbl_blank.setVisible(true);
 269     lbl_blank.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 270
 271     tbl_summary.setAutoCreateRowSorter(true);
 272     tbl_summary.getTableHeader().setReorderingAllowed(false);
 273     tbl_summary.addMouseListener(new MouseAdapter()
 274     {
 275       @Override
 276       public void mouseClicked(MouseEvent e)
 277       {
 278         validateSelection();
 279       }
 280
 281       @Override
 282       public void mouseReleased(MouseEvent e)
 283       {
 284         validateSelection();
 285       }
 286     });
 287     tbl_summary.addKeyListener(new KeyAdapter()
 288     {
 289       @Override
 290       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 291       {
 292         validateSelection();
 293         switch (evt.getKeyCode())
 294         {
 295         case KeyEvent.VK_ESCAPE: // escape key
 296           btn_back_ActionPerformed();
 297           break;
 298         case KeyEvent.VK_ENTER: // enter key
 299           if (btn_ok.isEnabled())
 300           {
 301             okAction();
 302           }
 303           evt.consume();
 304           break;
 305         case KeyEvent.VK_TAB: // tab key
 306           if (evt.isShiftDown())
 307           {
 308             tabbedPane.requestFocus();
 309           }
 310           else
 311           {
 312             btn_back.requestFocus();
 313           }
 314           evt.consume();
 315           break;
 316         default:
 317           return;
 318         }
 319       }
 320     });
 321
 322     btn_back.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 323     btn_back.setText(MessageManager.getString("action.back"));
 324     btn_back.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 325     {
 326       @Override
 327       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 328       {
 329         btn_back_ActionPerformed();
 330       }
 331     });
 332     btn_back.addKeyListener(new KeyAdapter()
 333     {
 334       @Override
 335       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 336       {
 337         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 338         {
 339           btn_back_ActionPerformed();
 340         }
 341       }
 342     });
 343
 344     btn_ok.setEnabled(false);
 345     btn_ok.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 346     btn_ok.setText(MessageManager.getString("action.ok"));
 347     btn_ok.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 348     {
 349       @Override
 350       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 351       {
 352         okAction();
 353       }
 354     });
 355     btn_ok.addKeyListener(new KeyAdapter()
 356     {
 357       @Override
 358       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 359       {
 360         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 361         {
 362           okAction();
 363         }
 364       }
 365     });
 366     btn_next_page.setEnabled(false);
 367     btn_next_page.setToolTipText(MessageManager
 368             .getString("label.next_page_tooltip"));
 369     btn_next_page.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 370     btn_next_page.setText(MessageManager.getString("action.next_page"));
 371     btn_next_page.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 372     {
 373       @Override
 374       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 375       {
 376         nextPageAction();
 377       }
 378     });
 379     btn_next_page.addKeyListener(new KeyAdapter()
 380     {
 381       @Override
 382       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 383       {
 384         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 385         {
 386           nextPageAction();
 387         }
 388       }
 389     });
 390
 391     btn_prev_page.setEnabled(false);
 392     btn_prev_page.setToolTipText(MessageManager
 393             .getString("label.prev_page_tooltip"));
 394     btn_prev_page.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 395     btn_prev_page.setText(MessageManager.getString("action.prev_page"));
 396     btn_prev_page.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 397     {
 398       @Override
 399       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 400       {
 401         prevPageAction();
 402       }
 403     });
 404     btn_prev_page.addKeyListener(new KeyAdapter()
 405     {
 406       @Override
 407       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 408       {
 409         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 410         {
 411           prevPageAction();
 412         }
 413       }
 414     });
 415
 416     if (isPaginationEnabled())
 417     {
 418       btn_prev_page.setVisible(true);
 419       btn_next_page.setVisible(true);
 420     }
 421     else
 422     {
 423       btn_prev_page.setVisible(false);
 424       btn_next_page.setVisible(false);
 425     }
 426
 427     btn_cancel.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 428     btn_cancel.setText(MessageManager.getString("action.cancel"));
 429     btn_cancel.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 430     {
 431       @Override
 432       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 433       {
 434         btn_cancel_ActionPerformed();
 435       }
 436     });
 437     btn_cancel.addKeyListener(new KeyAdapter()
 438     {
 439       @Override
 440       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 441       {
 442         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 443         {
 444           btn_cancel_ActionPerformed();
 445         }
 446       }
 447     });
 448     scrl_searchResult.setPreferredSize(new Dimension(width, height));
 449
 450     cmb_searchTarget.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 451     cmb_searchTarget.addActionListener(new ActionListener()
 452     {
 453       @Override
 454       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 455       {
 456         String tooltipText;
 457         if ("all".equalsIgnoreCase(getCmbSearchTarget().getSelectedItem()
 458                 .toString()))
 459         {
 460           tooltipText = MessageManager.getString("label.search_all");
 461         }
 462         else if ("pdb id".equalsIgnoreCase(getCmbSearchTarget()
 463                 .getSelectedItem().toString()))
 464         {
 465           tooltipText = MessageManager
 466                   .getString("label.separate_multiple_accession_ids");
 467         }
 468         else
 469         {
 470           tooltipText = MessageManager.formatMessage(
 471                   "label.separate_multiple_query_values",
 472                   new Object[] { getCmbSearchTarget().getSelectedItem()
 473                           .toString() });
 474         }
 475         txt_search.setToolTipText(JvSwingUtils.wrapTooltip(true,
 476                 tooltipText));
 477         searchAction(true);
 478       }
 479     });
 480
 481     populateCmbSearchTargetOptions();
 482
 483     txt_search.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 484
 485     txt_search.addKeyListener(new KeyAdapter()
 486     {
 487       @Override
 488       public void keyPressed(KeyEvent e)
 489       {
 490         if (e.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 491         {
 492           if (txt_search.getText() == null
 493                   || txt_search.getText().isEmpty())
 494           {
 495             return;
 496           }
 497           String primaryKeyName = getFTSRestClient().getPrimaryKeyColumn()
 498                   .getName();
 499           if (primaryKeyName.equalsIgnoreCase(getCmbSearchTarget()
 500                   .getSelectedItem().toString()))
 501           {
 502             transferToSequenceFetcher(txt_search.getText());
 503           }
 504         }
 505       }
 506     });
 507
 508     final DeferredTextInputListener listener = new DeferredTextInputListener(
 509             1500, new ActionListener()
 510             {
 511               @Override
 512               public void actionPerformed(ActionEvent e)
 513               {
 514                 if (!getTypedText().equalsIgnoreCase(lastSearchTerm))
 515                 {
 516                   searchAction(true);
 517                   paginatorCart.clear();
 518                   lastSearchTerm = getTypedText();
 519                 }
 520               }
 521             }, false);
 522     txt_search.getDocument().addDocumentListener(listener);
 523     txt_search.addFocusListener(new FocusListener()
 524     {
 525       @Override
 526       public void focusGained(FocusEvent e)
 527       {
 528         listener.start();
 529       }
 530
 531       @Override
 532       public void focusLost(FocusEvent e)
 533       {
 534         // listener.stop();
 535       }
 536     });
 537
 538     final String searchTabTitle = MessageManager
 539             .getString("label.search_result");
 540     final String configureCols = MessageManager
 541             .getString("label.configure_displayed_columns");
 542     ChangeListener changeListener = new ChangeListener()
 543     {
 544       @Override
 545       public void stateChanged(ChangeEvent changeEvent)
 546       {
 547         JTabbedPane sourceTabbedPane = (JTabbedPane) changeEvent
 548                 .getSource();
 549         int index = sourceTabbedPane.getSelectedIndex();
 550
 551         btn_back.setVisible(true);
 552         btn_cancel.setVisible(true);
 553         btn_ok.setVisible(true);
 554         if (sourceTabbedPane.getTitleAt(index).equals(configureCols))
 555         {
 556           btn_back.setVisible(false);
 557           btn_cancel.setVisible(false);
 558           btn_ok.setVisible(false);
 559           btn_back.setEnabled(false);
 560           btn_cancel.setEnabled(false);
 561           btn_ok.setEnabled(false);
 562           btn_next_page.setEnabled(false);
 563           btn_prev_page.setEnabled(false);
 564           txt_search.setEnabled(false);
 565           cmb_searchTarget.setEnabled(false);
 566           previousWantedFields = getFTSRestClient()
 567                   .getAllDefaultDisplayedFTSDataColumns().toArray(
 568                           new Object[0]);
 569         }
 570         if (sourceTabbedPane.getTitleAt(index).equals(searchTabTitle))
 571         {
 572           btn_back.setEnabled(true);
 573           btn_cancel.setEnabled(true);
 574           refreshPaginatorState();
 575           txt_search.setEnabled(true);
 576           cmb_searchTarget.setEnabled(true);
 577           if (wantedFieldsUpdated())
 578           {
 579             searchAction(true);
 580             paginatorCart.clear();
 581           }
 582           else
 583           {
 584             validateSelection();
 585           }
 586         }
 587       }
 588     };
 589     tabbedPane.addChangeListener(changeListener);
 590     tabbedPane.setPreferredSize(new Dimension(width, height));
 591     tabbedPane.add(searchTabTitle, scrl_searchResult);
 592     tabbedPane.add(configureCols, new FTSDataColumnPreferences(
 593             PreferenceSource.SEARCH_SUMMARY, getFTSRestClient()));
 594
 595     pnl_actions.add(btn_back);
 596     pnl_actions.add(btn_ok);
 597     pnl_actions.add(btn_cancel);
 598
 599     pnl_results.add(tabbedPane);
 600     pnl_inputs.add(cmb_searchTarget);
 601     pnl_inputs.add(txt_search);
 602     pnl_inputs.add(lbl_loading);
 603     pnl_inputs.add(lbl_warning);
 604     pnl_inputs.add(lbl_blank);
 605     pnl_inputs.add(btn_prev_page);
 606     pnl_inputs.add(btn_next_page);
 607
 608     this.setLayout(mainLayout);
 609     this.add(pnl_inputs, java.awt.BorderLayout.NORTH);
 610     this.add(pnl_results, java.awt.BorderLayout.CENTER);
 611     this.add(pnl_actions, java.awt.BorderLayout.SOUTH);
 612     mainFrame.setVisible(true);
 613     mainFrame.setContentPane(this);
 614     mainFrame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DISPOSE_ON_CLOSE);
 615     mainFrame
 616             .addInternalFrameListener(new javax.swing.event.InternalFrameAdapter()
 617             {
 618               @Override
 619               public void internalFrameClosing(InternalFrameEvent e)
 620               {
 621                 closeAction();
 622               }
 623             });
 624     mainFrame.setVisible(true);
 625     mainFrame.setContentPane(this);
 626     mainFrame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DISPOSE_ON_CLOSE);
 627     Integer x = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.x");
 628     Integer y = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.y");
 629     if (x != null && y != null)
 630     {
 631       mainFrame.setLocation(x, y);
 632     }
 633     Desktop.addInternalFrame(mainFrame, getFTSFrameTitle(), width, height);
 634   }
 635
 636   protected void closeAction()
 637   {
 638     // System.out.println(">>>>>>>>>> closing internal frame!!!");
 639     // System.out.println("width : " + this.getWidth());
 640     // System.out.println("heigh : " + this.getHeight());
 641     // System.out.println("x : " + mainFrame.getX());
 642     // System.out.println("y : " + mainFrame.getY());
 643     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.width", this.getWidth());
 644     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.height", pnl_results.getHeight());
 645     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.x", mainFrame.getX());
 646     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.y", mainFrame.getY());
 647     mainFrame.dispose();
 648   }
 649
 650   public class DeferredTextInputListener implements DocumentListener
 651   {
 652     private final Timer swingTimer;
 653
 654     public DeferredTextInputListener(int timeOut, ActionListener listener,
 655             boolean repeats)
 656     {
 657       swingTimer = new Timer(timeOut, listener);
 658       swingTimer.setRepeats(repeats);
 659     }
 660
 661     public void start()
 662     {
 663       swingTimer.start();
 664     }
 665
 666     public void stop()
 667     {
 668       swingTimer.stop();
 669     }
 670
 671     @Override
 672     public void insertUpdate(DocumentEvent e)
 673     {
 674       swingTimer.restart();
 675     }
 676
 677     @Override
 678     public void removeUpdate(DocumentEvent e)
 679     {
 680       swingTimer.restart();
 681     }
 682
 683     @Override
 684     public void changedUpdate(DocumentEvent e)
 685     {
 686       swingTimer.restart();
 687     }
 688
 689   }
 690
 691   public boolean wantedFieldsUpdated()
 692   {
 693     if (previousWantedFields == null)
 694     {
 695       return true;
 696     }
 697
 698     return Arrays.equals(getFTSRestClient()
 699             .getAllDefaultDisplayedFTSDataColumns().toArray(new Object[0]),
 700             previousWantedFields) ? false : true;
 701
 702   }
 703
 704   public void validateSelection()
 705   {
 706     if (tbl_summary.getSelectedRows().length > 0
 707             || !paginatorCart.isEmpty())
 708     {
 709       btn_ok.setEnabled(true);
 710     }
 711     else
 712     {
 713       btn_ok.setEnabled(false);
 714     }
 715   }
 716
 717   public JComboBox<FTSDataColumnI> getCmbSearchTarget()
 718   {
 719     return cmb_searchTarget;
 720   }
 721
 722   public JTextField getTxtSearch()
 723   {
 724     return txt_search;
 725   }
 726
 727   public JInternalFrame getMainFrame()
 728   {
 729     return mainFrame;
 730   }
 731
 732   protected void delayAndEnableActionButtons()
 733   {
 734     new Thread()
 735     {
 736       @Override
 737       public void run()
 738       {
 739         try
 740         {
 741           Thread.sleep(1500);
 742         } catch (InterruptedException e)
 743         {
 744           e.printStackTrace();
 745         }
 746         btn_ok.setEnabled(true);
 747         btn_back.setEnabled(true);
 748         btn_cancel.setEnabled(true);
 749       }
 750     }.start();
 751   }
 752
 753   protected void checkForErrors()
 754   {
 755     lbl_warning.setVisible(false);
 756     lbl_blank.setVisible(true);
 757     if (errorWarning.length() > 0)
 758     {
 759       lbl_loading.setVisible(false);
 760       lbl_blank.setVisible(false);
 761       lbl_warning.setToolTipText(JvSwingUtils.wrapTooltip(true,
 762               errorWarning.toString()));
 763       lbl_warning.setVisible(true);
 764     }
 765   }
 766
 767   protected void btn_back_ActionPerformed()
 768   {
 769     closeAction();
 770     new SequenceFetcher(progressIndicator);
 771   }
 772
 773   protected void disableActionButtons()
 774   {
 775     btn_ok.setEnabled(false);
 776     btn_back.setEnabled(false);
 777     btn_cancel.setEnabled(false);
 778   }
 779
 780   protected void btn_cancel_ActionPerformed()
 781   {
 782     closeAction();
 783   }
 784
 785   /**
 786    * Populates search target combo-box options
 787    */
 788   public void populateCmbSearchTargetOptions()
 789   {
 790     List<FTSDataColumnI> searchableTargets = new ArrayList<FTSDataColumnI>();
 791     try
 792     {
 793       Collection<FTSDataColumnI> foundFTSTargets = getFTSRestClient()
 794               .getSearchableDataColumns();
 795       searchableTargets.addAll(foundFTSTargets);
 796     } catch (Exception e)
 797     {
 798       e.printStackTrace();
 799     }
 800
 801     Collections.sort(searchableTargets, new Comparator<FTSDataColumnI>()
 802     {
 803       @Override
 804       public int compare(FTSDataColumnI o1, FTSDataColumnI o2)
 805       {
 806         return o1.getName().compareTo(o2.getName());
 807       }
 808     });
 809
 810     for (FTSDataColumnI searchTarget : searchableTargets)
 811     {
 812       cmb_searchTarget.addItem(searchTarget);
 813     }
 814   }
 815
 816   public void transferToSequenceFetcher(String ids)
 817   {
 818     // mainFrame.dispose();
 819     seqFetcher.getTextArea().setText(ids);
 820     Thread worker = new Thread(seqFetcher);
 821     worker.start();
 822   }
 823
 824   @Override
 825   public String getTypedText()
 826   {
 827     return txt_search.getText().trim();
 828   }
 829
 830   @Override
 831   public JTable getResultTable()
 832   {
 833     return tbl_summary;
 834   }
 835
 836   public void reset()
 837   {
 838     lbl_loading.setVisible(false);
 839     errorWarning.setLength(0);
 840     lbl_warning.setVisible(false);
 841     lbl_blank.setVisible(true);
 842     btn_ok.setEnabled(false);
 843     mainFrame.setTitle(getFTSFrameTitle());
 844     referesh();
 845     tbl_summary.setModel(new DefaultTableModel());
 846     tbl_summary.setVisible(false);
 847   }
 848
 849   @Override
 850   public void setPrevPageButtonEnabled(boolean isEnabled)
 851   {
 852     btn_prev_page.setEnabled(isEnabled);
 853   }
 854
 855   @Override
 856   public void setNextPageButtonEnabled(boolean isEnabled)
 857   {
 858     btn_next_page.setEnabled(isEnabled);
 859   }
 860
 861   @Override
 862   public void setErrorMessage(String message)
 863   {
 864     errorWarning.append(message);
 865   }
 866
 867   @Override
 868   public void updateSearchFrameTitle(String title)
 869   {
 870     mainFrame.setTitle(title);
 871   }
 872
 873   @Override
 874   public void setSearchInProgress(Boolean isSearchInProgress)
 875   {
 876     lbl_blank.setVisible(!isSearchInProgress);
 877     lbl_loading.setVisible(isSearchInProgress);
 878   }
 879
 880   @Override
 881   public void prevPageAction()
 882   {
 883     updatePaginatorCart();
 884     if (offSet >= pageLimit)
 885     {
 886       offSet = offSet - pageLimit;
 887       searchAction(false);
 888     }
 889     else
 890     {
 891       refreshPaginatorState();
 892     }
 893   }
 894
 895   @Override
 896   public void nextPageAction()
 897   {
 898     updatePaginatorCart();
 899     offSet = offSet + pageLimit;
 900     searchAction(false);
 901   }
 902
 903   public void updatePaginatorCart()
 904   {
 905     int primaryKeyColIndex = 0;
 906     JTable resultTable = getResultTable();
 907     int totalRows = resultTable.getRowCount();
 908     try
 909     {
 910       primaryKeyColIndex = getFTSRestClient().getPrimaryKeyColumIndex(
 911               wantedFields, false);
 912     } catch (Exception e)
 913     {
 914       e.printStackTrace();
 915     }
 916
 917     for (int row = 0; row < totalRows; row++)
 918     {
 919       String id = (String) resultTable.getValueAt(row, primaryKeyColIndex);
 920       if (paginatorCart.contains(id))
 921       {
 922         paginatorCart.remove(id);
 923       }
 924     }
 925     int[] selectedRows = resultTable.getSelectedRows();
 926     for (int summaryRow : selectedRows)
 927     {
 928       String idStr = resultTable.getValueAt(summaryRow, primaryKeyColIndex)
 929               .toString();
 930       paginatorCart.add(idStr);
 931     }
 932     // System.out.println("Paginator shopping cart size : "
 933     // + paginatorCart.size());
 934   }
 935
 936   public void updateSummaryTableSelections()
 937   {
 938     JTable resultTable = getResultTable();
 939     if (paginatorCart.isEmpty())
 940     {
 941       return;
 942     }
 943     int primaryKeyColIndex = 0;
 944     try
 945     {
 946       primaryKeyColIndex = getFTSRestClient().getPrimaryKeyColumIndex(
 947               wantedFields, false);
 948     } catch (Exception e)
 949     {
 950       e.printStackTrace();
 951     }
 952     // System.out.println(">>>>>> got here : 1");
 953     int totalRows = resultTable.getRowCount();
 954     // resultTable.clearSelection();
 955     for (int row = 0; row < totalRows; row++)
 956     {
 957       String id = (String) resultTable.getValueAt(row, primaryKeyColIndex);
 958       if (paginatorCart.contains(id))
 959       {
 960         resultTable.addRowSelectionInterval(row, row);
 961       }
 962     }
 963     validateSelection();
 964   }
 965
 966   public void refreshPaginatorState()
 967   {
 968     // System.out.println("resultSet count : " + resultSetCount);
 969     // System.out.println("offSet : " + offSet);
 970     // System.out.println("page limit : " + pageLimit);
 971     setPrevPageButtonEnabled(false);
 972     setNextPageButtonEnabled(false);
 973     if (resultSetCount == 0 && pageLimit == 0)
 974     {
 975       return;
 976     }
 977     if (resultSetCount >= pageLimit)
 978     {
 979       setNextPageButtonEnabled(true);
 980     }
 981     if (offSet >= pageLimit)
 982     {
 983       setPrevPageButtonEnabled(true);
 984     }
 985   }
 986
 987   public void referesh()
 988   {
 989     mainFrame.setTitle(getFTSFrameTitle());
 990   }
 991
 992 }