src/jalview/fts/core/GFTSPanel.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21
  22 package jalview.fts.core;
  23
  24 import jalview.fts.api.FTSDataColumnI;
  25 import jalview.fts.api.GFTSPanelI;
  26 import jalview.fts.core.FTSDataColumnPreferences.PreferenceSource;
  27 import jalview.gui.Desktop;
  28 import jalview.gui.IProgressIndicator;
  29 import jalview.gui.JvSwingUtils;
  30 import jalview.gui.SequenceFetcher;
  31 import jalview.util.MessageManager;
  32
  33 import java.awt.BorderLayout;
  34 import java.awt.CardLayout;
  35 import java.awt.Dimension;
  36 import java.awt.event.ActionEvent;
  37 import java.awt.event.ActionListener;
  38 import java.awt.event.FocusEvent;
  39 import java.awt.event.FocusListener;
  40 import java.awt.event.KeyAdapter;
  41 import java.awt.event.KeyEvent;
  42 import java.awt.event.MouseAdapter;
  43 import java.awt.event.MouseEvent;
  44 import java.text.DecimalFormat;
  45 import java.util.ArrayList;
  46 import java.util.Arrays;
  47 import java.util.Collection;
  48 import java.util.Collections;
  49 import java.util.Comparator;
  50 import java.util.HashSet;
  51 import java.util.List;
  52
  53 import javax.swing.ImageIcon;
  54 import javax.swing.JButton;
  55 import javax.swing.JComboBox;
  56 import javax.swing.JFrame;
  57 import javax.swing.JInternalFrame;
  58 import javax.swing.JLabel;
  59 import javax.swing.JPanel;
  60 import javax.swing.JScrollPane;
  61 import javax.swing.JTabbedPane;
  62 import javax.swing.JTable;
  63 import javax.swing.JTextField;
  64 import javax.swing.Timer;
  65 import javax.swing.event.ChangeEvent;
  66 import javax.swing.event.ChangeListener;
  67 import javax.swing.event.DocumentEvent;
  68 import javax.swing.event.DocumentListener;
  69 import javax.swing.event.InternalFrameEvent;
  70 import javax.swing.table.DefaultTableModel;
  71 import javax.swing.table.TableColumn;
  72
  73 /**
  74  * This class provides the swing GUI layout for FTS Panel and implements most of
  75  * the contracts defined in GFSPanelI
  76  *
  77  * @author tcnofoegbu
  78  *
  79  */
  80
  81 @SuppressWarnings("serial")
  82 public abstract class GFTSPanel extends JPanel implements GFTSPanelI
  83 {
  84   protected JInternalFrame mainFrame = new JInternalFrame(
  85           getFTSFrameTitle());
  86
  87   protected IProgressIndicator progressIdicator;
  88
  89   protected JComboBox<FTSDataColumnI> cmb_searchTarget = new JComboBox<FTSDataColumnI>();
  90
  91   protected JButton btn_ok = new JButton();
  92
  93   protected JButton btn_back = new JButton();
  94
  95   protected JButton btn_cancel = new JButton();
  96
  97   protected JTextField txt_search = new JTextField(30);
  98
  99   protected SequenceFetcher seqFetcher;
 100
 101   protected Collection<FTSDataColumnI> wantedFields;
 102
 103   private String lastSearchTerm = "";
 104
 105   protected JButton btn_next_page = new JButton();
 106
 107   protected JButton btn_prev_page = new JButton();
 108
 109   protected StringBuilder errorWarning = new StringBuilder();
 110
 111   protected ImageIcon warningImage = new ImageIcon(getClass().getResource(
 112           "/images/warning.gif"));
 113
 114   protected ImageIcon loadingImage = new ImageIcon(getClass().getResource(
 115           "/images/loading.gif"));
 116
 117   protected ImageIcon balnkPlaceholderImage = new ImageIcon(getClass()
 118           .getResource("/images/blank_16x16_placeholder.png"));
 119
 120   protected JLabel lbl_warning = new JLabel(warningImage);
 121
 122   protected JLabel lbl_loading = new JLabel(loadingImage);
 123
 124   protected JLabel lbl_blank = new JLabel(balnkPlaceholderImage);
 125
 126   private JTabbedPane tabbedPane = new JTabbedPane();
 127
 128   private JPanel pnl_actions = new JPanel();
 129
 130   private JPanel pnl_results = new JPanel(new CardLayout());
 131
 132   private JPanel pnl_inputs = new JPanel();
 133
 134   private BorderLayout mainLayout = new BorderLayout();
 135
 136   protected Object[] previousWantedFields;
 137
 138   protected int resultSetCount;
 139
 140   protected int totalResultSetCount;
 141
 142   protected int offSet;
 143
 144   protected int pageLimit;
 145
 146   protected HashSet<String> paginatorCart = new HashSet<String>();
 147
 148   protected static final DecimalFormat totalNumberformatter = new DecimalFormat(
 149           "###,###");
 150   private JTable tbl_summary = new JTable()
 151   {
 152     private boolean inLayout;
 153
 154     @Override
 155     public boolean getScrollableTracksViewportWidth()
 156     {
 157       return hasExcessWidth();
 158
 159     }
 160
 161     @Override
 162     public void doLayout()
 163     {
 164       if (hasExcessWidth())
 165       {
 166         autoResizeMode = AUTO_RESIZE_SUBSEQUENT_COLUMNS;
 167       }
 168       inLayout = true;
 169       super.doLayout();
 170       inLayout = false;
 171       autoResizeMode = AUTO_RESIZE_OFF;
 172     }
 173
 174     protected boolean hasExcessWidth()
 175     {
 176       return getPreferredSize().width < getParent().getWidth();
 177     }
 178
 179     @Override
 180     public void columnMarginChanged(ChangeEvent e)
 181     {
 182       if (isEditing())
 183       {
 184         removeEditor();
 185       }
 186       TableColumn resizingColumn = getTableHeader().getResizingColumn();
 187       // Need to do this here, before the parent's
 188       // layout manager calls getPreferredSize().
 189       if (resizingColumn != null && autoResizeMode == AUTO_RESIZE_OFF
 190               && !inLayout)
 191       {
 192         resizingColumn.setPreferredWidth(resizingColumn.getWidth());
 193         String colHeader = resizingColumn.getHeaderValue().toString();
 194         getTempUserPrefs().put(colHeader, resizingColumn.getWidth());
 195       }
 196       resizeAndRepaint();
 197     }
 198
 199     @Override
 200     public String getToolTipText(MouseEvent evt)
 201     {
 202       String toolTipText = null;
 203       java.awt.Point pnt = evt.getPoint();
 204       int rowIndex = rowAtPoint(pnt);
 205       int colIndex = columnAtPoint(pnt);
 206
 207       try
 208       {
 209         if (getValueAt(rowIndex, colIndex) == null)
 210         {
 211           return null;
 212         }
 213         toolTipText = getValueAt(rowIndex, colIndex).toString();
 214
 215       } catch (Exception e)
 216       {
 217         e.printStackTrace();
 218       }
 219       toolTipText = (toolTipText == null ? null
 220               : (toolTipText.length() > 500 ? JvSwingUtils.wrapTooltip(
 221                       true, toolTipText.subSequence(0, 500) + "...")
 222                       : JvSwingUtils.wrapTooltip(true, toolTipText)));
 223
 224       return toolTipText;
 225     }
 226   };
 227   protected JScrollPane scrl_searchResult = new JScrollPane(tbl_summary);
 228
 229   public GFTSPanel()
 230   {
 231     try
 232     {
 233       jbInit();
 234       mainFrame.invalidate();
 235       mainFrame.pack();
 236     } catch (Exception e)
 237     {
 238       e.printStackTrace();
 239     }
 240   }
 241
 242   /**
 243    * Initializes the GUI default properties
 244    *
 245    * @throws Exception
 246    */
 247   private void jbInit() throws Exception
 248   {
 249     Integer width = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.width") == null ? 800
 250             : getTempUserPrefs().get("FTSPanel.width");
 251     Integer height = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.height") == null ? 400
 252             : getTempUserPrefs().get("FTSPanel.height");
 253     lbl_warning.setVisible(false);
 254     lbl_warning.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 255     lbl_loading.setVisible(false);
 256     lbl_loading.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 257     lbl_blank.setVisible(true);
 258     lbl_blank.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 259
 260     tbl_summary.setAutoCreateRowSorter(true);
 261     tbl_summary.getTableHeader().setReorderingAllowed(false);
 262     tbl_summary.addMouseListener(new MouseAdapter()
 263     {
 264       @Override
 265       public void mouseClicked(MouseEvent e)
 266       {
 267         validateSelection();
 268       }
 269
 270       @Override
 271       public void mouseReleased(MouseEvent e)
 272       {
 273         validateSelection();
 274       }
 275     });
 276     tbl_summary.addKeyListener(new KeyAdapter()
 277     {
 278       @Override
 279       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 280       {
 281         validateSelection();
 282         switch (evt.getKeyCode())
 283         {
 284         case KeyEvent.VK_ESCAPE: // escape key
 285           btn_back_ActionPerformed();
 286           break;
 287         case KeyEvent.VK_ENTER: // enter key
 288           if (btn_ok.isEnabled())
 289           {
 290             okAction();
 291           }
 292           evt.consume();
 293           break;
 294         case KeyEvent.VK_TAB: // tab key
 295           if (evt.isShiftDown())
 296           {
 297             tabbedPane.requestFocus();
 298           }
 299           else
 300           {
 301             btn_back.requestFocus();
 302           }
 303           evt.consume();
 304           break;
 305         default:
 306           return;
 307         }
 308       }
 309     });
 310
 311     btn_back.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 312     btn_back.setText(MessageManager.getString("action.back"));
 313     btn_back.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 314     {
 315       @Override
 316       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 317       {
 318         btn_back_ActionPerformed();
 319       }
 320     });
 321     btn_back.addKeyListener(new KeyAdapter()
 322     {
 323       @Override
 324       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 325       {
 326         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 327         {
 328           btn_back_ActionPerformed();
 329         }
 330       }
 331     });
 332
 333     btn_ok.setEnabled(false);
 334     btn_ok.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 335     btn_ok.setText(MessageManager.getString("action.ok"));
 336     btn_ok.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 337     {
 338       @Override
 339       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 340       {
 341         okAction();
 342       }
 343     });
 344     btn_ok.addKeyListener(new KeyAdapter()
 345     {
 346       @Override
 347       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 348       {
 349         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 350         {
 351           okAction();
 352         }
 353       }
 354     });
 355     btn_next_page.setEnabled(false);
 356     btn_next_page.setToolTipText(MessageManager
 357             .getString("label.next_page_tooltip"));
 358     btn_next_page.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 359     btn_next_page.setText(MessageManager.getString("action.next_page"));
 360     btn_next_page.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 361     {
 362       @Override
 363       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 364       {
 365         nextPageAction();
 366       }
 367     });
 368     btn_next_page.addKeyListener(new KeyAdapter()
 369     {
 370       @Override
 371       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 372       {
 373         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 374         {
 375           nextPageAction();
 376         }
 377       }
 378     });
 379
 380     btn_prev_page.setEnabled(false);
 381     btn_prev_page.setToolTipText(MessageManager
 382             .getString("label.prev_page_tooltip"));
 383     btn_prev_page.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 384     btn_prev_page.setText(MessageManager.getString("action.prev_page"));
 385     btn_prev_page.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 386     {
 387       @Override
 388       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 389       {
 390         prevPageAction();
 391       }
 392     });
 393     btn_prev_page.addKeyListener(new KeyAdapter()
 394     {
 395       @Override
 396       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 397       {
 398         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 399         {
 400           prevPageAction();
 401         }
 402       }
 403     });
 404
 405     if (isPaginationEnabled())
 406     {
 407       btn_prev_page.setVisible(true);
 408       btn_next_page.setVisible(true);
 409     }
 410     else
 411     {
 412       btn_prev_page.setVisible(false);
 413       btn_next_page.setVisible(false);
 414     }
 415
 416     btn_cancel.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 417     btn_cancel.setText(MessageManager.getString("action.cancel"));
 418     btn_cancel.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 419     {
 420       @Override
 421       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 422       {
 423         btn_cancel_ActionPerformed();
 424       }
 425     });
 426     btn_cancel.addKeyListener(new KeyAdapter()
 427     {
 428       @Override
 429       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 430       {
 431         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 432         {
 433           btn_cancel_ActionPerformed();
 434         }
 435       }
 436     });
 437     scrl_searchResult.setPreferredSize(new Dimension(width, height));
 438
 439     cmb_searchTarget.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 440     cmb_searchTarget.addActionListener(new ActionListener()
 441     {
 442       @Override
 443       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 444       {
 445         String tooltipText;
 446         if ("all".equalsIgnoreCase(getCmbSearchTarget().getSelectedItem()
 447                 .toString()))
 448         {
 449           tooltipText = MessageManager.getString("label.search_all");
 450         }
 451         else if ("pdb id".equalsIgnoreCase(getCmbSearchTarget()
 452                 .getSelectedItem().toString()))
 453         {
 454           tooltipText = MessageManager
 455                   .getString("label.separate_multiple_accession_ids");
 456         }
 457         else
 458         {
 459           tooltipText = MessageManager.formatMessage(
 460                   "label.separate_multiple_query_values",
 461                   new Object[] { getCmbSearchTarget().getSelectedItem()
 462                           .toString() });
 463         }
 464         txt_search.setToolTipText(JvSwingUtils.wrapTooltip(true,
 465                 tooltipText));
 466         searchAction(true);
 467       }
 468     });
 469
 470     populateCmbSearchTargetOptions();
 471
 472     txt_search.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 473
 474     txt_search.addKeyListener(new KeyAdapter()
 475     {
 476       @Override
 477       public void keyPressed(KeyEvent e)
 478       {
 479         if (e.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 480         {
 481           if (txt_search.getText() == null
 482                   || txt_search.getText().isEmpty())
 483           {
 484             return;
 485           }
 486           String primaryKeyName = getFTSRestClient().getPrimaryKeyColumn()
 487                   .getName();
 488           if (primaryKeyName.equalsIgnoreCase(getCmbSearchTarget()
 489                   .getSelectedItem().toString()))
 490           {
 491             transferToSequenceFetcher(txt_search.getText());
 492           }
 493         }
 494       }
 495     });
 496
 497     final DeferredTextInputListener listener = new DeferredTextInputListener(
 498             1500,
 499             new ActionListener()
 500             {
 501               @Override
 502               public void actionPerformed(ActionEvent e)
 503               {
 504                 if (!getTypedText().equalsIgnoreCase(lastSearchTerm))
 505                 {
 506                   searchAction(true);
 507                   paginatorCart.clear();
 508                   lastSearchTerm = getTypedText();
 509                 }
 510               }
 511             }, false);
 512     txt_search.getDocument().addDocumentListener(listener);
 513     txt_search.addFocusListener(new FocusListener()
 514     {
 515       @Override
 516       public void focusGained(FocusEvent e)
 517       {
 518         listener.start();
 519       }
 520
 521       @Override
 522       public void focusLost(FocusEvent e)
 523       {
 524 //        listener.stop();
 525       }
 526     });
 527
 528     final String searchTabTitle = MessageManager
 529             .getString("label.search_result");
 530     final String configureCols = MessageManager
 531             .getString("label.configure_displayed_columns");
 532     ChangeListener changeListener = new ChangeListener()
 533     {
 534       @Override
 535       public void stateChanged(ChangeEvent changeEvent)
 536       {
 537         JTabbedPane sourceTabbedPane = (JTabbedPane) changeEvent
 538                 .getSource();
 539         int index = sourceTabbedPane.getSelectedIndex();
 540
 541         btn_back.setVisible(true);
 542         btn_cancel.setVisible(true);
 543         btn_ok.setVisible(true);
 544         if (sourceTabbedPane.getTitleAt(index).equals(configureCols))
 545         {
 546           btn_back.setVisible(false);
 547           btn_cancel.setVisible(false);
 548           btn_ok.setVisible(false);
 549           btn_back.setEnabled(false);
 550           btn_cancel.setEnabled(false);
 551           btn_ok.setEnabled(false);
 552           btn_next_page.setEnabled(false);
 553           btn_prev_page.setEnabled(false);
 554           txt_search.setEnabled(false);
 555           cmb_searchTarget.setEnabled(false);
 556           previousWantedFields = getFTSRestClient()
 557                   .getAllDefaultDisplayedFTSDataColumns()
 558                   .toArray(new Object[0]);
 559         }
 560         if (sourceTabbedPane.getTitleAt(index).equals(searchTabTitle))
 561         {
 562           btn_back.setEnabled(true);
 563           btn_cancel.setEnabled(true);
 564           refreshPaginatorState();
 565           txt_search.setEnabled(true);
 566           cmb_searchTarget.setEnabled(true);
 567           if (wantedFieldsUpdated())
 568           {
 569             searchAction(true);
 570             paginatorCart.clear();
 571           }
 572           else
 573           {
 574             validateSelection();
 575           }
 576         }
 577       }
 578     };
 579     tabbedPane.addChangeListener(changeListener);
 580     tabbedPane.setPreferredSize(new Dimension(width, height));
 581     tabbedPane.add(searchTabTitle, scrl_searchResult);
 582     tabbedPane.add(configureCols, new FTSDataColumnPreferences(
 583             PreferenceSource.SEARCH_SUMMARY, getFTSRestClient()));
 584
 585     pnl_actions.add(btn_back);
 586     pnl_actions.add(btn_ok);
 587     pnl_actions.add(btn_cancel);
 588
 589     pnl_results.add(tabbedPane);
 590     pnl_inputs.add(cmb_searchTarget);
 591     pnl_inputs.add(txt_search);
 592     pnl_inputs.add(lbl_loading);
 593     pnl_inputs.add(lbl_warning);
 594     pnl_inputs.add(lbl_blank);
 595     pnl_inputs.add(btn_prev_page);
 596     pnl_inputs.add(btn_next_page);
 597
 598     this.setLayout(mainLayout);
 599     this.add(pnl_inputs, java.awt.BorderLayout.NORTH);
 600     this.add(pnl_results, java.awt.BorderLayout.CENTER);
 601     this.add(pnl_actions, java.awt.BorderLayout.SOUTH);
 602     mainFrame.setVisible(true);
 603     mainFrame.setContentPane(this);
 604     mainFrame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DISPOSE_ON_CLOSE);
 605     mainFrame
 606             .addInternalFrameListener(new javax.swing.event.InternalFrameAdapter()
 607             {
 608               @Override
 609               public void internalFrameClosing(InternalFrameEvent e)
 610               {
 611                 closeAction();
 612               }
 613             });
 614     mainFrame.setVisible(true);
 615     mainFrame.setContentPane(this);
 616     mainFrame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DISPOSE_ON_CLOSE);
 617     Integer x = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.x");
 618     Integer y = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.y");
 619     if (x != null && y != null)
 620     {
 621       mainFrame.setLocation(x, y);
 622     }
 623     Desktop.addInternalFrame(mainFrame, getFTSFrameTitle(), width, height);
 624   }
 625
 626   protected void closeAction()
 627   {
 628     // System.out.println(">>>>>>>>>> closing internal frame!!!");
 629     // System.out.println("width : " + this.getWidth());
 630     // System.out.println("heigh : " + this.getHeight());
 631     // System.out.println("x : " + mainFrame.getX());
 632     // System.out.println("y : " + mainFrame.getY());
 633     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.width", this.getWidth());
 634     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.height", pnl_results.getHeight());
 635     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.x", mainFrame.getX());
 636     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.y", mainFrame.getY());
 637     mainFrame.dispose();
 638   }
 639   public class DeferredTextInputListener implements DocumentListener
 640   {
 641     private final Timer swingTimer;
 642
 643     public DeferredTextInputListener(int timeOut, ActionListener listener,
 644             boolean repeats)
 645     {
 646       swingTimer = new Timer(timeOut, listener);
 647       swingTimer.setRepeats(repeats);
 648     }
 649
 650     public void start()
 651     {
 652       swingTimer.start();
 653     }
 654
 655     public void stop()
 656     {
 657       swingTimer.stop();
 658     }
 659
 660     @Override
 661     public void insertUpdate(DocumentEvent e)
 662     {
 663       swingTimer.restart();
 664     }
 665
 666     @Override
 667     public void removeUpdate(DocumentEvent e)
 668     {
 669       swingTimer.restart();
 670     }
 671
 672     @Override
 673     public void changedUpdate(DocumentEvent e)
 674     {
 675       swingTimer.restart();
 676     }
 677
 678   }
 679
 680   public boolean wantedFieldsUpdated()
 681   {
 682     if (previousWantedFields == null)
 683     {
 684       return true;
 685     }
 686
 687     return Arrays.equals(getFTSRestClient()
 688             .getAllDefaultDisplayedFTSDataColumns()
 689             .toArray(new Object[0]), previousWantedFields) ? false
 690             : true;
 691
 692   }
 693
 694   public void validateSelection()
 695   {
 696     if (tbl_summary.getSelectedRows().length > 0
 697             || !paginatorCart.isEmpty())
 698     {
 699       btn_ok.setEnabled(true);
 700     }
 701     else
 702     {
 703       btn_ok.setEnabled(false);
 704     }
 705   }
 706
 707   public JComboBox<FTSDataColumnI> getCmbSearchTarget()
 708   {
 709     return cmb_searchTarget;
 710   }
 711
 712   public JTextField getTxtSearch()
 713   {
 714     return txt_search;
 715   }
 716
 717   public JInternalFrame getMainFrame()
 718   {
 719     return mainFrame;
 720   }
 721
 722   protected void delayAndEnableActionButtons()
 723   {
 724     new Thread()
 725     {
 726       @Override
 727       public void run()
 728       {
 729         try
 730         {
 731           Thread.sleep(1500);
 732         } catch (InterruptedException e)
 733         {
 734           e.printStackTrace();
 735         }
 736         btn_ok.setEnabled(true);
 737         btn_back.setEnabled(true);
 738         btn_cancel.setEnabled(true);
 739       }
 740     }.start();
 741   }
 742
 743   protected void checkForErrors()
 744   {
 745     lbl_warning.setVisible(false);
 746     lbl_blank.setVisible(true);
 747     if (errorWarning.length() > 0)
 748     {
 749       lbl_loading.setVisible(false);
 750       lbl_blank.setVisible(false);
 751       lbl_warning.setToolTipText(JvSwingUtils.wrapTooltip(true,
 752               errorWarning.toString()));
 753       lbl_warning.setVisible(true);
 754     }
 755   }
 756
 757   protected void btn_back_ActionPerformed()
 758   {
 759     closeAction();
 760     new SequenceFetcher(progressIdicator);
 761   }
 762
 763   protected void disableActionButtons()
 764   {
 765     btn_ok.setEnabled(false);
 766     btn_back.setEnabled(false);
 767     btn_cancel.setEnabled(false);
 768   }
 769
 770   protected void btn_cancel_ActionPerformed()
 771   {
 772     closeAction();
 773   }
 774
 775   /**
 776    * Populates search target combo-box options
 777    */
 778   public void populateCmbSearchTargetOptions()
 779   {
 780     List<FTSDataColumnI> searchableTargets = new ArrayList<FTSDataColumnI>();
 781     try
 782     {
 783       Collection<FTSDataColumnI> foundFTSTargets = getFTSRestClient()
 784               .getSearchableDataColumns();
 785       searchableTargets.addAll(foundFTSTargets);
 786     } catch (Exception e)
 787     {
 788       e.printStackTrace();
 789     }
 790
 791     Collections.sort(searchableTargets, new Comparator<FTSDataColumnI>()
 792     {
 793       @Override
 794       public int compare(FTSDataColumnI o1, FTSDataColumnI o2)
 795       {
 796         return o1.getName().compareTo(o2.getName());
 797       }
 798     });
 799
 800     for (FTSDataColumnI searchTarget : searchableTargets)
 801     {
 802       cmb_searchTarget.addItem(searchTarget);
 803     }
 804   }
 805
 806
 807   public void transferToSequenceFetcher(String ids)
 808   {
 809     // mainFrame.dispose();
 810     seqFetcher.getTextArea().setText(ids);
 811     Thread worker = new Thread(seqFetcher);
 812     worker.start();
 813   }
 814
 815   @Override
 816   public String getTypedText()
 817   {
 818     return txt_search.getText().trim();
 819   }
 820
 821   @Override
 822   public JTable getResultTable()
 823   {
 824     return tbl_summary;
 825   }
 826
 827   public void reset()
 828   {
 829     lbl_loading.setVisible(false);
 830     errorWarning.setLength(0);
 831     lbl_warning.setVisible(false);
 832     lbl_blank.setVisible(true);
 833     btn_ok.setEnabled(false);
 834     mainFrame.setTitle(getFTSFrameTitle());
 835     referesh();
 836     tbl_summary.setModel(new DefaultTableModel());
 837     tbl_summary.setVisible(false);
 838   }
 839
 840   @Override
 841   public void setPrevPageButtonEnabled(boolean isEnabled)
 842   {
 843     btn_prev_page.setEnabled(isEnabled);
 844   }
 845
 846   @Override
 847   public void setNextPageButtonEnabled(boolean isEnabled)
 848   {
 849     btn_next_page.setEnabled(isEnabled);
 850   }
 851
 852   @Override
 853   public void setErrorMessage(String message)
 854   {
 855     errorWarning.append(message);
 856   }
 857
 858   @Override
 859   public void updateSearchFrameTitle(String title)
 860   {
 861     mainFrame.setTitle(title);
 862   }
 863
 864   @Override
 865   public void setSearchInProgress(Boolean isSearchInProgress)
 866   {
 867     lbl_blank.setVisible(!isSearchInProgress);
 868     lbl_loading.setVisible(isSearchInProgress);
 869   }
 870
 871   @Override
 872   public void prevPageAction()
 873   {
 874     updatePaginatorCart();
 875     if (offSet >= pageLimit)
 876     {
 877       offSet = offSet - pageLimit;
 878       searchAction(false);
 879     }
 880     else
 881     {
 882       refreshPaginatorState();
 883     }
 884   }
 885
 886   @Override
 887   public void nextPageAction()
 888   {
 889     updatePaginatorCart();
 890     offSet = offSet + pageLimit;
 891     searchAction(false);
 892   }
 893
 894   public void updatePaginatorCart()
 895   {
 896     int primaryKeyColIndex = 0;
 897     JTable resultTable = getResultTable();
 898     int totalRows = resultTable.getRowCount();
 899     try
 900     {
 901       primaryKeyColIndex = getFTSRestClient().getPrimaryKeyColumIndex(
 902               wantedFields, false);
 903     } catch (Exception e)
 904     {
 905       e.printStackTrace();
 906     }
 907
 908     for (int row = 0; row < totalRows; row++)
 909     {
 910       String id = (String) resultTable.getValueAt(row, primaryKeyColIndex);
 911       if (paginatorCart.contains(id))
 912       {
 913         paginatorCart.remove(id);
 914       }
 915     }
 916     int[] selectedRows = resultTable.getSelectedRows();
 917     for (int summaryRow : selectedRows)
 918     {
 919       String idStr = resultTable.getValueAt(summaryRow,
 920               primaryKeyColIndex).toString();
 921       paginatorCart.add(idStr);
 922     }
 923     // System.out.println("Paginator shopping cart size : "
 924     // + paginatorCart.size());
 925   }
 926
 927   public void updateSummaryTableSelections()
 928   {
 929     JTable resultTable = getResultTable();
 930     if (paginatorCart.isEmpty())
 931     {
 932       return;
 933     }
 934     int primaryKeyColIndex = 0;
 935     try
 936     {
 937       primaryKeyColIndex = getFTSRestClient().getPrimaryKeyColumIndex(
 938               wantedFields, false);
 939     } catch (Exception e)
 940     {
 941       e.printStackTrace();
 942     }
 943     // System.out.println(">>>>>> got here : 1");
 944     int totalRows = resultTable.getRowCount();
 945     // resultTable.clearSelection();
 946     for (int row = 0; row < totalRows; row++)
 947     {
 948       String id = (String) resultTable.getValueAt(row, primaryKeyColIndex);
 949       if (paginatorCart.contains(id))
 950       {
 951         resultTable.addRowSelectionInterval(row, row);
 952       }
 953     }
 954     validateSelection();
 955   }
 956   public void refreshPaginatorState()
 957   {
 958     // System.out.println("resultSet count : " + resultSetCount);
 959     // System.out.println("offSet : " + offSet);
 960     // System.out.println("page limit : " + pageLimit);
 961     setPrevPageButtonEnabled(false);
 962     setNextPageButtonEnabled(false);
 963     if (resultSetCount == 0 && pageLimit == 0)
 964     {
 965       return;
 966     }
 967     if (resultSetCount >= pageLimit)
 968     {
 969       setNextPageButtonEnabled(true);
 970     }
 971     if (offSet >= pageLimit)
 972     {
 973       setPrevPageButtonEnabled(true);
 974     }
 975   }
 976   public void referesh()
 977   {
 978     mainFrame.setTitle(getFTSFrameTitle());
 979   }
 980
 981 }