src/jalview/fts/core/GFTSPanel.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21
  22 package jalview.fts.core;
  23
  24 import jalview.fts.api.FTSDataColumnI;
  25 import jalview.fts.api.GFTSPanelI;
  26 import jalview.fts.core.FTSDataColumnPreferences.PreferenceSource;
  27 import jalview.gui.Desktop;
  28 import jalview.gui.IProgressIndicator;
  29 import jalview.gui.JvSwingUtils;
  30 import jalview.gui.SequenceFetcher;
  31 import jalview.io.cache.AppCache;
  32 import jalview.io.cache.CacheBoxI;
  33 import jalview.io.cache.Cacheable;
  34 import jalview.util.MessageManager;
  35
  36 import java.awt.BorderLayout;
  37 import java.awt.CardLayout;
  38 import java.awt.Dimension;
  39 import java.awt.event.ActionEvent;
  40 import java.awt.event.ActionListener;
  41 import java.awt.event.FocusAdapter;
  42 import java.awt.event.FocusEvent;
  43 import java.awt.event.FocusListener;
  44 import java.awt.event.ItemEvent;
  45 import java.awt.event.ItemListener;
  46 import java.awt.event.KeyAdapter;
  47 import java.awt.event.KeyEvent;
  48 import java.awt.event.MouseAdapter;
  49 import java.awt.event.MouseEvent;
  50 import java.text.DecimalFormat;
  51 import java.util.ArrayList;
  52 import java.util.Arrays;
  53 import java.util.Collection;
  54 import java.util.Collections;
  55 import java.util.Comparator;
  56 import java.util.HashSet;
  57 import java.util.List;
  58
  59 import javax.swing.ImageIcon;
  60 import javax.swing.JButton;
  61 import javax.swing.JComboBox;
  62 import javax.swing.JFrame;
  63 import javax.swing.JInternalFrame;
  64 import javax.swing.JLabel;
  65 import javax.swing.JPanel;
  66 import javax.swing.JScrollPane;
  67 import javax.swing.JTabbedPane;
  68 import javax.swing.JTable;
  69 import javax.swing.Timer;
  70 import javax.swing.event.ChangeEvent;
  71 import javax.swing.event.ChangeListener;
  72 import javax.swing.event.DocumentEvent;
  73 import javax.swing.event.DocumentListener;
  74 import javax.swing.event.InternalFrameEvent;
  75 import javax.swing.table.DefaultTableModel;
  76 import javax.swing.table.TableColumn;
  77 import javax.swing.text.JTextComponent;
  78
  79 /**
  80  * This class provides the swing GUI layout for FTS Panel and implements most of
  81  * the contracts defined in GFSPanelI
  82  *
  83  * @author tcnofoegbu
  84  *
  85  */
  86
  87 @SuppressWarnings("serial")
  88 public abstract class GFTSPanel extends JPanel implements GFTSPanelI, Cacheable
  89 {
  90   protected JInternalFrame mainFrame = new JInternalFrame(
  91           getFTSFrameTitle());
  92
  93   protected IProgressIndicator progressIndicator;
  94
  95   protected JComboBox<FTSDataColumnI> cmb_searchTarget = new JComboBox<FTSDataColumnI>();
  96
  97   protected JButton btn_ok = new JButton();
  98
  99   protected JButton btn_back = new JButton();
 100
 101   protected JButton btn_cancel = new JButton();
 102
 103   protected JComboBox<String> txt_search;
 104
 105   protected SequenceFetcher seqFetcher;
 106
 107   protected Collection<FTSDataColumnI> wantedFields;
 108
 109   private String lastSearchTerm = "";
 110
 111   protected JButton btn_next_page = new JButton();
 112
 113   protected JButton btn_prev_page = new JButton();
 114
 115   protected StringBuilder errorWarning = new StringBuilder();
 116
 117   protected ImageIcon warningImage = new ImageIcon(getClass().getResource(
 118           "/images/warning.gif"));
 119
 120   protected ImageIcon loadingImage = new ImageIcon(getClass().getResource(
 121           "/images/loading.gif"));
 122
 123   protected ImageIcon balnkPlaceholderImage = new ImageIcon(getClass()
 124           .getResource("/images/blank_16x16_placeholder.png"));
 125
 126   protected JLabel lbl_warning = new JLabel(warningImage);
 127
 128   protected JLabel lbl_loading = new JLabel(loadingImage);
 129
 130   protected JLabel lbl_blank = new JLabel(balnkPlaceholderImage);
 131
 132   private JTabbedPane tabbedPane = new JTabbedPane();
 133
 134   private JPanel pnl_actions = new JPanel();
 135
 136   private JPanel pnl_results = new JPanel(new CardLayout());
 137
 138   private JPanel pnl_inputs = new JPanel();
 139
 140   private BorderLayout mainLayout = new BorderLayout();
 141
 142   protected Object[] previousWantedFields;
 143
 144   protected int resultSetCount;
 145
 146   protected int totalResultSetCount;
 147
 148   protected int offSet;
 149
 150   protected int pageLimit;
 151
 152   protected HashSet<String> paginatorCart = new HashSet<String>();
 153
 154   protected static final DecimalFormat totalNumberformatter = new DecimalFormat(
 155           "###,###");
 156
 157   private JTable tbl_summary = new JTable()
 158   {
 159     private boolean inLayout;
 160
 161     @Override
 162     public boolean getScrollableTracksViewportWidth()
 163     {
 164       return hasExcessWidth();
 165
 166     }
 167
 168     @Override
 169     public void doLayout()
 170     {
 171       if (hasExcessWidth())
 172       {
 173         autoResizeMode = AUTO_RESIZE_SUBSEQUENT_COLUMNS;
 174       }
 175       inLayout = true;
 176       super.doLayout();
 177       inLayout = false;
 178       autoResizeMode = AUTO_RESIZE_OFF;
 179     }
 180
 181     protected boolean hasExcessWidth()
 182     {
 183       return getPreferredSize().width < getParent().getWidth();
 184     }
 185
 186     @Override
 187     public void columnMarginChanged(ChangeEvent e)
 188     {
 189       if (isEditing())
 190       {
 191         removeEditor();
 192       }
 193       TableColumn resizingColumn = getTableHeader().getResizingColumn();
 194       // Need to do this here, before the parent's
 195       // layout manager calls getPreferredSize().
 196       if (resizingColumn != null && autoResizeMode == AUTO_RESIZE_OFF
 197               && !inLayout)
 198       {
 199         resizingColumn.setPreferredWidth(resizingColumn.getWidth());
 200         String colHeader = resizingColumn.getHeaderValue().toString();
 201         getTempUserPrefs().put(colHeader, resizingColumn.getWidth());
 202       }
 203       resizeAndRepaint();
 204     }
 205
 206     @Override
 207     public String getToolTipText(MouseEvent evt)
 208     {
 209       String toolTipText = null;
 210       java.awt.Point pnt = evt.getPoint();
 211       int rowIndex = rowAtPoint(pnt);
 212       int colIndex = columnAtPoint(pnt);
 213
 214       try
 215       {
 216         if (getValueAt(rowIndex, colIndex) == null)
 217         {
 218           return null;
 219         }
 220         toolTipText = getValueAt(rowIndex, colIndex).toString();
 221
 222       } catch (Exception e)
 223       {
 224         e.printStackTrace();
 225       }
 226       toolTipText = (toolTipText == null ? null
 227               : (toolTipText.length() > 500 ? JvSwingUtils.wrapTooltip(
 228                       true, toolTipText.subSequence(0, 500) + "...")
 229                       : JvSwingUtils.wrapTooltip(true, toolTipText)));
 230
 231       return toolTipText;
 232     }
 233   };
 234
 235   protected JScrollPane scrl_searchResult = new JScrollPane(tbl_summary);
 236
 237   public GFTSPanel()
 238   {
 239     try
 240     {
 241       jbInit();
 242       mainFrame.addFocusListener(new FocusAdapter()
 243       {
 244         @Override
 245         public void focusGained(FocusEvent e)
 246         {
 247           txt_search.requestFocusInWindow();
 248         }
 249       });
 250       mainFrame.invalidate();
 251       mainFrame.pack();
 252     } catch (Exception e)
 253     {
 254       e.printStackTrace();
 255     }
 256   }
 257
 258   /**
 259    * Initializes the GUI default properties
 260    *
 261    * @throws Exception
 262    */
 263   private void jbInit() throws Exception
 264   {
 265
 266     txt_search = new JComboBox<String>();
 267     txt_search.setEditable(true);
 268     txt_search
 269             .setPrototypeDisplayValue("XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX");
 270     populateCmbSearchTargetOptions();
 271     Integer width = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.width") == null ? 800
 272             : getTempUserPrefs().get("FTSPanel.width");
 273     Integer height = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.height") == null ? 400
 274             : getTempUserPrefs().get("FTSPanel.height");
 275     lbl_warning.setVisible(false);
 276     lbl_warning.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 277     lbl_loading.setVisible(false);
 278     lbl_loading.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 279     lbl_blank.setVisible(true);
 280     lbl_blank.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 281
 282     tbl_summary.setAutoCreateRowSorter(true);
 283     tbl_summary.getTableHeader().setReorderingAllowed(false);
 284     tbl_summary.addMouseListener(new MouseAdapter()
 285     {
 286       @Override
 287       public void mouseClicked(MouseEvent e)
 288       {
 289         validateSelection();
 290       }
 291
 292       @Override
 293       public void mouseReleased(MouseEvent e)
 294       {
 295         validateSelection();
 296       }
 297     });
 298     tbl_summary.addKeyListener(new KeyAdapter()
 299     {
 300       @Override
 301       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 302       {
 303         validateSelection();
 304         switch (evt.getKeyCode())
 305         {
 306         case KeyEvent.VK_ESCAPE: // escape key
 307           btn_back_ActionPerformed();
 308           break;
 309         case KeyEvent.VK_ENTER: // enter key
 310           if (btn_ok.isEnabled())
 311           {
 312             okAction();
 313           }
 314           evt.consume();
 315           break;
 316         case KeyEvent.VK_TAB: // tab key
 317           if (evt.isShiftDown())
 318           {
 319             tabbedPane.requestFocus();
 320           }
 321           else
 322           {
 323             btn_back.requestFocus();
 324           }
 325           evt.consume();
 326           break;
 327         default:
 328           return;
 329         }
 330       }
 331     });
 332
 333     btn_back.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 334     btn_back.setText(MessageManager.getString("action.back"));
 335     btn_back.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 336     {
 337       @Override
 338       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 339       {
 340         btn_back_ActionPerformed();
 341       }
 342     });
 343     btn_back.addKeyListener(new KeyAdapter()
 344     {
 345       @Override
 346       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 347       {
 348         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 349         {
 350           btn_back_ActionPerformed();
 351         }
 352       }
 353     });
 354
 355     btn_ok.setEnabled(false);
 356     btn_ok.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 357     btn_ok.setText(MessageManager.getString("action.ok"));
 358     btn_ok.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 359     {
 360       @Override
 361       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 362       {
 363         okAction();
 364       }
 365     });
 366     btn_ok.addKeyListener(new KeyAdapter()
 367     {
 368       @Override
 369       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 370       {
 371         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 372         {
 373           okAction();
 374         }
 375       }
 376     });
 377     btn_next_page.setEnabled(false);
 378     btn_next_page.setToolTipText(MessageManager
 379             .getString("label.next_page_tooltip"));
 380     btn_next_page.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 381     btn_next_page.setText(MessageManager.getString("action.next_page"));
 382     btn_next_page.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 383     {
 384       @Override
 385       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 386       {
 387         nextPageAction();
 388       }
 389     });
 390     btn_next_page.addKeyListener(new KeyAdapter()
 391     {
 392       @Override
 393       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 394       {
 395         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 396         {
 397           nextPageAction();
 398         }
 399       }
 400     });
 401
 402     btn_prev_page.setEnabled(false);
 403     btn_prev_page.setToolTipText(MessageManager
 404             .getString("label.prev_page_tooltip"));
 405     btn_prev_page.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 406     btn_prev_page.setText(MessageManager.getString("action.prev_page"));
 407     btn_prev_page.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 408     {
 409       @Override
 410       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 411       {
 412         prevPageAction();
 413       }
 414     });
 415     btn_prev_page.addKeyListener(new KeyAdapter()
 416     {
 417       @Override
 418       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 419       {
 420         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 421         {
 422           prevPageAction();
 423         }
 424       }
 425     });
 426
 427     if (isPaginationEnabled())
 428     {
 429       btn_prev_page.setVisible(true);
 430       btn_next_page.setVisible(true);
 431     }
 432     else
 433     {
 434       btn_prev_page.setVisible(false);
 435       btn_next_page.setVisible(false);
 436     }
 437
 438     btn_cancel.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 439     btn_cancel.setText(MessageManager.getString("action.cancel"));
 440     btn_cancel.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 441     {
 442       @Override
 443       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 444       {
 445         btn_cancel_ActionPerformed();
 446       }
 447     });
 448     btn_cancel.addKeyListener(new KeyAdapter()
 449     {
 450       @Override
 451       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 452       {
 453         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 454         {
 455           btn_cancel_ActionPerformed();
 456         }
 457       }
 458     });
 459     scrl_searchResult.setPreferredSize(new Dimension(width, height));
 460
 461     cmb_searchTarget.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 462     cmb_searchTarget.addItemListener(new ItemListener()
 463     {
 464       @Override
 465       public void itemStateChanged(ItemEvent e)
 466       {
 467         if (e.getStateChange() == ItemEvent.SELECTED)
 468         {
 469           String tooltipText;
 470           if ("all".equalsIgnoreCase(getCmbSearchTarget().getSelectedItem()
 471                   .toString()))
 472           {
 473             tooltipText = MessageManager.getString("label.search_all");
 474           }
 475           else if ("pdb id".equalsIgnoreCase(getCmbSearchTarget()
 476                   .getSelectedItem().toString()))
 477           {
 478             tooltipText = MessageManager
 479                     .getString("label.separate_multiple_accession_ids");
 480           }
 481           else
 482           {
 483             tooltipText = MessageManager.formatMessage(
 484                     "label.separate_multiple_query_values",
 485                     new Object[] { getCmbSearchTarget().getSelectedItem()
 486                             .toString() });
 487           }
 488           txt_search.setToolTipText(JvSwingUtils.wrapTooltip(true,
 489                   tooltipText));
 490           searchAction(true);
 491         }
 492       }
 493     });
 494
 495
 496
 497     txt_search.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 498
 499     txt_search.getEditor().getEditorComponent()
 500             .addKeyListener(new KeyAdapter()
 501     {
 502       @Override
 503       public void keyPressed(KeyEvent e)
 504       {
 505         if (e.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 506         {
 507           if (getTypedText() == null || getTypedText().isEmpty())
 508           {
 509             return;
 510           }
 511           String primaryKeyName = getFTSRestClient().getPrimaryKeyColumn()
 512                   .getName();
 513           if (primaryKeyName.equalsIgnoreCase(getCmbSearchTarget()
 514                   .getSelectedItem().toString()))
 515           {
 516             transferToSequenceFetcher(getTypedText());
 517           }
 518         }
 519       }
 520     });
 521
 522     final DeferredTextInputListener listener = new DeferredTextInputListener(
 523             1500, new ActionListener()
 524             {
 525               @Override
 526               public void actionPerformed(ActionEvent e)
 527               {
 528                 if (!getTypedText().equalsIgnoreCase(lastSearchTerm))
 529                 {
 530                   searchAction(true);
 531                   paginatorCart.clear();
 532                   lastSearchTerm = getTypedText();
 533                 }
 534               }
 535             }, false);
 536     ((JTextComponent) txt_search.getEditor().getEditorComponent())
 537             .getDocument().addDocumentListener(listener);
 538
 539     txt_search.addFocusListener(new FocusListener()
 540     {
 541       @Override
 542       public void focusGained(FocusEvent e)
 543       {
 544         listener.start();
 545       }
 546
 547       @Override
 548       public void focusLost(FocusEvent e)
 549       {
 550         // listener.stop();
 551       }
 552     });
 553
 554     final String searchTabTitle = MessageManager
 555             .getString("label.search_result");
 556     final String configureCols = MessageManager
 557             .getString("label.configure_displayed_columns");
 558     ChangeListener changeListener = new ChangeListener()
 559     {
 560       @Override
 561       public void stateChanged(ChangeEvent changeEvent)
 562       {
 563         JTabbedPane sourceTabbedPane = (JTabbedPane) changeEvent
 564                 .getSource();
 565         int index = sourceTabbedPane.getSelectedIndex();
 566
 567         btn_back.setVisible(true);
 568         btn_cancel.setVisible(true);
 569         btn_ok.setVisible(true);
 570         if (sourceTabbedPane.getTitleAt(index).equals(configureCols))
 571         {
 572           btn_back.setVisible(false);
 573           btn_cancel.setVisible(false);
 574           btn_ok.setVisible(false);
 575           btn_back.setEnabled(false);
 576           btn_cancel.setEnabled(false);
 577           btn_ok.setEnabled(false);
 578           btn_next_page.setEnabled(false);
 579           btn_prev_page.setEnabled(false);
 580           txt_search.setEnabled(false);
 581           cmb_searchTarget.setEnabled(false);
 582           previousWantedFields = getFTSRestClient()
 583                   .getAllDefaultDisplayedFTSDataColumns().toArray(
 584                           new Object[0]);
 585         }
 586         if (sourceTabbedPane.getTitleAt(index).equals(searchTabTitle))
 587         {
 588           btn_back.setEnabled(true);
 589           btn_cancel.setEnabled(true);
 590           refreshPaginatorState();
 591           txt_search.setEnabled(true);
 592           cmb_searchTarget.setEnabled(true);
 593           if (wantedFieldsUpdated())
 594           {
 595             searchAction(true);
 596             paginatorCart.clear();
 597           }
 598           else
 599           {
 600             validateSelection();
 601           }
 602         }
 603       }
 604     };
 605     tabbedPane.addChangeListener(changeListener);
 606     tabbedPane.setPreferredSize(new Dimension(width, height));
 607     tabbedPane.add(searchTabTitle, scrl_searchResult);
 608     tabbedPane.add(configureCols, new FTSDataColumnPreferences(
 609             PreferenceSource.SEARCH_SUMMARY, getFTSRestClient()));
 610
 611     pnl_actions.add(btn_back);
 612     pnl_actions.add(btn_ok);
 613     pnl_actions.add(btn_cancel);
 614
 615     pnl_results.add(tabbedPane);
 616     pnl_inputs.add(cmb_searchTarget);
 617     pnl_inputs.add(txt_search);
 618     pnl_inputs.add(lbl_loading);
 619     pnl_inputs.add(lbl_warning);
 620     pnl_inputs.add(lbl_blank);
 621     pnl_inputs.add(btn_prev_page);
 622     pnl_inputs.add(btn_next_page);
 623
 624     this.setLayout(mainLayout);
 625     this.add(pnl_inputs, java.awt.BorderLayout.NORTH);
 626     this.add(pnl_results, java.awt.BorderLayout.CENTER);
 627     this.add(pnl_actions, java.awt.BorderLayout.SOUTH);
 628     mainFrame.setVisible(true);
 629     mainFrame.setContentPane(this);
 630     mainFrame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DISPOSE_ON_CLOSE);
 631     mainFrame
 632             .addInternalFrameListener(new javax.swing.event.InternalFrameAdapter()
 633             {
 634               @Override
 635               public void internalFrameClosing(InternalFrameEvent e)
 636               {
 637                 closeAction();
 638               }
 639             });
 640     mainFrame.setVisible(true);
 641     mainFrame.setContentPane(this);
 642     mainFrame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DISPOSE_ON_CLOSE);
 643     Integer x = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.x");
 644     Integer y = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.y");
 645     if (x != null && y != null)
 646     {
 647       mainFrame.setLocation(x, y);
 648     }
 649     Desktop.addInternalFrame(mainFrame, getFTSFrameTitle(), width, height);
 650   }
 651
 652   protected void closeAction()
 653   {
 654     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.width", this.getWidth());
 655     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.height", pnl_results.getHeight());
 656     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.x", mainFrame.getX());
 657     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.y", mainFrame.getY());
 658     mainFrame.dispose();
 659   }
 660
 661   public class DeferredTextInputListener implements DocumentListener
 662   {
 663     private final Timer swingTimer;
 664
 665     public DeferredTextInputListener(int timeOut, ActionListener listener,
 666             boolean repeats)
 667     {
 668       swingTimer = new Timer(timeOut, listener);
 669       swingTimer.setRepeats(repeats);
 670     }
 671
 672     public void start()
 673     {
 674       swingTimer.start();
 675     }
 676
 677     public void stop()
 678     {
 679       swingTimer.stop();
 680     }
 681
 682     @Override
 683     public void insertUpdate(DocumentEvent e)
 684     {
 685       swingTimer.restart();
 686     }
 687
 688     @Override
 689     public void removeUpdate(DocumentEvent e)
 690     {
 691       swingTimer.restart();
 692     }
 693
 694     @Override
 695     public void changedUpdate(DocumentEvent e)
 696     {
 697       swingTimer.restart();
 698     }
 699
 700   }
 701
 702   public boolean wantedFieldsUpdated()
 703   {
 704     if (previousWantedFields == null)
 705     {
 706       return false;
 707     }
 708
 709     return Arrays.equals(getFTSRestClient()
 710             .getAllDefaultDisplayedFTSDataColumns().toArray(new Object[0]),
 711             previousWantedFields) ? false : true;
 712
 713   }
 714
 715   public void validateSelection()
 716   {
 717     if (tbl_summary.getSelectedRows().length > 0
 718             || !paginatorCart.isEmpty())
 719     {
 720       btn_ok.setEnabled(true);
 721     }
 722     else
 723     {
 724       btn_ok.setEnabled(false);
 725     }
 726   }
 727
 728   public JComboBox<FTSDataColumnI> getCmbSearchTarget()
 729   {
 730     return cmb_searchTarget;
 731   }
 732
 733   public JComboBox<String> getTxtSearch()
 734   {
 735     return txt_search;
 736   }
 737
 738   public JInternalFrame getMainFrame()
 739   {
 740     return mainFrame;
 741   }
 742
 743   protected void delayAndEnableActionButtons()
 744   {
 745     new Thread()
 746     {
 747       @Override
 748       public void run()
 749       {
 750         try
 751         {
 752           Thread.sleep(1500);
 753         } catch (InterruptedException e)
 754         {
 755           e.printStackTrace();
 756         }
 757         btn_ok.setEnabled(true);
 758         btn_back.setEnabled(true);
 759         btn_cancel.setEnabled(true);
 760       }
 761     }.start();
 762   }
 763
 764   protected void checkForErrors()
 765   {
 766     lbl_warning.setVisible(false);
 767     lbl_blank.setVisible(true);
 768     if (errorWarning.length() > 0)
 769     {
 770       lbl_loading.setVisible(false);
 771       lbl_blank.setVisible(false);
 772       lbl_warning.setToolTipText(JvSwingUtils.wrapTooltip(true,
 773               errorWarning.toString()));
 774       lbl_warning.setVisible(true);
 775     }
 776   }
 777
 778   protected void btn_back_ActionPerformed()
 779   {
 780     closeAction();
 781     new SequenceFetcher(progressIndicator);
 782   }
 783
 784   protected void disableActionButtons()
 785   {
 786     btn_ok.setEnabled(false);
 787     btn_back.setEnabled(false);
 788     btn_cancel.setEnabled(false);
 789   }
 790
 791   protected void btn_cancel_ActionPerformed()
 792   {
 793     closeAction();
 794   }
 795
 796   /**
 797    * Populates search target combo-box options
 798    */
 799   public void populateCmbSearchTargetOptions()
 800   {
 801     List<FTSDataColumnI> searchableTargets = new ArrayList<FTSDataColumnI>();
 802     try
 803     {
 804       Collection<FTSDataColumnI> foundFTSTargets = getFTSRestClient()
 805               .getSearchableDataColumns();
 806       searchableTargets.addAll(foundFTSTargets);
 807     } catch (Exception e)
 808     {
 809       e.printStackTrace();
 810     }
 811
 812     Collections.sort(searchableTargets, new Comparator<FTSDataColumnI>()
 813     {
 814       @Override
 815       public int compare(FTSDataColumnI o1, FTSDataColumnI o2)
 816       {
 817         return o1.getName().compareTo(o2.getName());
 818       }
 819     });
 820
 821     for (FTSDataColumnI searchTarget : searchableTargets)
 822     {
 823       cmb_searchTarget.addItem(searchTarget);
 824     }
 825   }
 826
 827   public void transferToSequenceFetcher(String ids)
 828   {
 829     seqFetcher.getTextArea().setText(ids);
 830     Thread worker = new Thread(seqFetcher);
 831     worker.start();
 832   }
 833
 834   @Override
 835   public String getTypedText()
 836   {
 837     return txt_search.getEditor().getItem() == null ? "" : txt_search
 838             .getEditor().getItem().toString().trim();
 839   }
 840
 841   @Override
 842   public JTable getResultTable()
 843   {
 844     return tbl_summary;
 845   }
 846
 847   public void reset()
 848   {
 849     lbl_loading.setVisible(false);
 850     errorWarning.setLength(0);
 851     lbl_warning.setVisible(false);
 852     lbl_blank.setVisible(true);
 853     btn_ok.setEnabled(false);
 854     mainFrame.setTitle(getFTSFrameTitle());
 855     referesh();
 856     tbl_summary.setModel(new DefaultTableModel());
 857     tbl_summary.setVisible(false);
 858   }
 859
 860   @Override
 861   public void setPrevPageButtonEnabled(boolean isEnabled)
 862   {
 863     btn_prev_page.setEnabled(isEnabled);
 864   }
 865
 866   @Override
 867   public void setNextPageButtonEnabled(boolean isEnabled)
 868   {
 869     btn_next_page.setEnabled(isEnabled);
 870   }
 871
 872   @Override
 873   public void setErrorMessage(String message)
 874   {
 875     errorWarning.append(message);
 876   }
 877
 878   @Override
 879   public void updateSearchFrameTitle(String title)
 880   {
 881     mainFrame.setTitle(title);
 882   }
 883
 884   @Override
 885   public void setSearchInProgress(Boolean isSearchInProgress)
 886   {
 887     lbl_blank.setVisible(!isSearchInProgress);
 888     lbl_loading.setVisible(isSearchInProgress);
 889   }
 890
 891   @Override
 892   public void prevPageAction()
 893   {
 894     updatePaginatorCart();
 895     if (offSet >= pageLimit)
 896     {
 897       offSet = offSet - pageLimit;
 898       searchAction(false);
 899     }
 900     else
 901     {
 902       refreshPaginatorState();
 903     }
 904   }
 905
 906   @Override
 907   public void nextPageAction()
 908   {
 909     updatePaginatorCart();
 910     offSet = offSet + pageLimit;
 911     searchAction(false);
 912   }
 913
 914   public void updatePaginatorCart()
 915   {
 916     int primaryKeyColIndex = 0;
 917     JTable resultTable = getResultTable();
 918     int totalRows = resultTable.getRowCount();
 919     try
 920     {
 921       primaryKeyColIndex = getFTSRestClient().getPrimaryKeyColumIndex(
 922               wantedFields, false);
 923     } catch (Exception e)
 924     {
 925       e.printStackTrace();
 926     }
 927
 928     for (int row = 0; row < totalRows; row++)
 929     {
 930       String id = (String) resultTable.getValueAt(row, primaryKeyColIndex);
 931       if (paginatorCart.contains(id))
 932       {
 933         paginatorCart.remove(id);
 934       }
 935     }
 936     int[] selectedRows = resultTable.getSelectedRows();
 937     for (int summaryRow : selectedRows)
 938     {
 939       String idStr = resultTable.getValueAt(summaryRow, primaryKeyColIndex)
 940               .toString();
 941       paginatorCart.add(idStr);
 942     }
 943   }
 944
 945   public void updateSummaryTableSelections()
 946   {
 947     JTable resultTable = getResultTable();
 948     if (paginatorCart.isEmpty())
 949     {
 950       return;
 951     }
 952     int primaryKeyColIndex = 0;
 953     try
 954     {
 955       primaryKeyColIndex = getFTSRestClient().getPrimaryKeyColumIndex(
 956               wantedFields, false);
 957     } catch (Exception e)
 958     {
 959       e.printStackTrace();
 960     }
 961     int totalRows = resultTable.getRowCount();
 962     for (int row = 0; row < totalRows; row++)
 963     {
 964       String id = (String) resultTable.getValueAt(row, primaryKeyColIndex);
 965       if (paginatorCart.contains(id))
 966       {
 967         resultTable.addRowSelectionInterval(row, row);
 968       }
 969     }
 970     validateSelection();
 971   }
 972
 973   public void refreshPaginatorState()
 974   {
 975     setPrevPageButtonEnabled(false);
 976     setNextPageButtonEnabled(false);
 977     if (resultSetCount == 0 && pageLimit == 0)
 978     {
 979       return;
 980     }
 981     if (resultSetCount >= pageLimit)
 982     {
 983       setNextPageButtonEnabled(true);
 984     }
 985     if (offSet >= pageLimit)
 986     {
 987       setPrevPageButtonEnabled(true);
 988     }
 989   }
 990
 991   public void referesh()
 992   {
 993     mainFrame.setTitle(getFTSFrameTitle());
 994   }
 995
 996
 997   protected void fireCache()
 998   {
 999     AppCache.getInstance().updateCache(this);
1000   }
1001
1002   @Override
1003   public void init()
1004   {
1005     // reset();
1006   }
1007
1008
1009   @Override
1010   public String getCacheKey()
1011   {
1012     return getCacheKey();
1013   }
1014
1015   @Override
1016   public CacheBoxI<String> getCacheComboBox()
1017   {
1018     return new CacheBoxI<String>()
1019     {
1020
1021       @Override
1022       public void setSelectedItem(Object anObject)
1023       {
1024         txt_search.setSelectedItem(anObject);
1025       }
1026
1027       @Override
1028       public void requestFocus()
1029       {
1030         txt_search.requestFocusInWindow();
1031       }
1032
1033       @Override
1034       public void looseFocus()
1035       {
1036         mainFrame.requestFocusInWindow();
1037       }
1038
1039       @Override
1040       public void addItem(String item)
1041       {
1042         txt_search.addItem(item);
1043       }
1044
1045       @Override
1046       public void removeAllItems()
1047       {
1048         txt_search.removeAllItems();
1049       }
1050
1051       @Override
1052       public int getItemCount()
1053       {
1054         return txt_search.getItemCount();
1055       }
1056
1057       @Override
1058       public String getUserInput()
1059       {
1060         return txt_search.getEditor().getItem() == null ? "" : txt_search
1061                 .getEditor().getItem().toString().trim();
1062       }
1063     };
1064   }
1065
1066
1067
1068 }