src/jalview/fts/core/GFTSPanel.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21
  22 package jalview.fts.core;
  23
  24 import jalview.fts.api.FTSDataColumnI;
  25 import jalview.fts.api.GFTSPanelI;
  26 import jalview.fts.core.FTSDataColumnPreferences.PreferenceSource;
  27 import jalview.gui.Desktop;
  28 import jalview.gui.IProgressIndicator;
  29 import jalview.gui.JvSwingUtils;
  30 import jalview.gui.SequenceFetcher;
  31 import jalview.io.cache.JvCacheableInputBox;
  32 import jalview.util.MessageManager;
  33
  34 import java.awt.BorderLayout;
  35 import java.awt.CardLayout;
  36 import java.awt.Dimension;
  37 import java.awt.event.ActionEvent;
  38 import java.awt.event.ActionListener;
  39 import java.awt.event.FocusAdapter;
  40 import java.awt.event.FocusEvent;
  41 import java.awt.event.FocusListener;
  42 import java.awt.event.ItemEvent;
  43 import java.awt.event.ItemListener;
  44 import java.awt.event.KeyAdapter;
  45 import java.awt.event.KeyEvent;
  46 import java.awt.event.MouseAdapter;
  47 import java.awt.event.MouseEvent;
  48 import java.text.DecimalFormat;
  49 import java.util.ArrayList;
  50 import java.util.Arrays;
  51 import java.util.Collection;
  52 import java.util.Collections;
  53 import java.util.Comparator;
  54 import java.util.HashSet;
  55 import java.util.List;
  56
  57 import javax.swing.ImageIcon;
  58 import javax.swing.JButton;
  59 import javax.swing.JCheckBox;
  60 import javax.swing.JComboBox;
  61 import javax.swing.JFrame;
  62 import javax.swing.JInternalFrame;
  63 import javax.swing.JLabel;
  64 import javax.swing.JPanel;
  65 import javax.swing.JScrollPane;
  66 import javax.swing.JTabbedPane;
  67 import javax.swing.JTable;
  68 import javax.swing.Timer;
  69 import javax.swing.event.ChangeEvent;
  70 import javax.swing.event.ChangeListener;
  71 import javax.swing.event.DocumentEvent;
  72 import javax.swing.event.DocumentListener;
  73 import javax.swing.event.InternalFrameEvent;
  74 import javax.swing.table.DefaultTableModel;
  75 import javax.swing.table.TableColumn;
  76 import javax.swing.text.JTextComponent;
  77
  78 /**
  79  * This class provides the swing GUI layout for FTS Panel and implements most of
  80  * the contracts defined in GFSPanelI
  81  *
  82  * @author tcnofoegbu
  83  *
  84  */
  85
  86 @SuppressWarnings("serial")
  87 public abstract class GFTSPanel extends JPanel implements GFTSPanelI
  88 {
  89   protected JInternalFrame mainFrame = new JInternalFrame(
  90           getFTSFrameTitle());
  91
  92   protected IProgressIndicator progressIndicator;
  93
  94   protected JComboBox<FTSDataColumnI> cmb_searchTarget = new JComboBox<FTSDataColumnI>();
  95
  96   protected JButton btn_ok = new JButton();
  97
  98   protected JButton btn_back = new JButton();
  99
 100   protected JButton btn_cancel = new JButton();
 101
 102   protected JCheckBox btn_autosearch = new JCheckBox();
 103
 104   protected JvCacheableInputBox<String> txt_search;
 105
 106   protected SequenceFetcher seqFetcher;
 107
 108   protected Collection<FTSDataColumnI> wantedFields;
 109
 110   private String lastSearchTerm = "";
 111
 112   protected JButton btn_next_page = new JButton();
 113
 114   protected JButton btn_prev_page = new JButton();
 115
 116   protected StringBuilder errorWarning = new StringBuilder();
 117
 118   protected ImageIcon warningImage = new ImageIcon(
 119           getClass().getResource("/images/warning.gif"));
 120
 121   protected ImageIcon loadingImage = new ImageIcon(
 122           getClass().getResource("/images/loading.gif"));
 123
 124   protected ImageIcon balnkPlaceholderImage = new ImageIcon(
 125           getClass().getResource("/images/blank_16x16_placeholder.png"));
 126
 127   protected JLabel lbl_warning = new JLabel(warningImage);
 128
 129   protected JLabel lbl_loading = new JLabel(loadingImage);
 130
 131   protected JLabel lbl_blank = new JLabel(balnkPlaceholderImage);
 132
 133   private JTabbedPane tabbedPane = new JTabbedPane();
 134
 135   private JPanel pnl_actions = new JPanel();
 136
 137   private JPanel pnl_results = new JPanel(new CardLayout());
 138
 139   private JPanel pnl_inputs = new JPanel();
 140
 141   private BorderLayout mainLayout = new BorderLayout();
 142
 143   protected Object[] previousWantedFields;
 144
 145   protected int resultSetCount;
 146
 147   protected int totalResultSetCount;
 148
 149   protected int offSet;
 150
 151   protected int pageLimit;
 152
 153   protected HashSet<String> paginatorCart = new HashSet<String>();
 154
 155   private static final int MIN_WIDTH = 670;
 156
 157   private static final int MIN_HEIGHT = 300;
 158
 159   protected static final DecimalFormat totalNumberformatter = new DecimalFormat(
 160           "###,###");
 161
 162   private JTable tbl_summary = new JTable()
 163   {
 164     private boolean inLayout;
 165
 166     @Override
 167     public boolean getScrollableTracksViewportWidth()
 168     {
 169       return hasExcessWidth();
 170
 171     }
 172
 173     @Override
 174     public void doLayout()
 175     {
 176       if (hasExcessWidth())
 177       {
 178         autoResizeMode = AUTO_RESIZE_SUBSEQUENT_COLUMNS;
 179       }
 180       inLayout = true;
 181       super.doLayout();
 182       inLayout = false;
 183       autoResizeMode = AUTO_RESIZE_OFF;
 184     }
 185
 186     protected boolean hasExcessWidth()
 187     {
 188       return getPreferredSize().width < getParent().getWidth();
 189     }
 190
 191     @Override
 192     public void columnMarginChanged(ChangeEvent e)
 193     {
 194       if (isEditing())
 195       {
 196         removeEditor();
 197       }
 198       TableColumn resizingColumn = getTableHeader().getResizingColumn();
 199       // Need to do this here, before the parent's
 200       // layout manager calls getPreferredSize().
 201       if (resizingColumn != null && autoResizeMode == AUTO_RESIZE_OFF
 202               && !inLayout)
 203       {
 204         resizingColumn.setPreferredWidth(resizingColumn.getWidth());
 205         String colHeader = resizingColumn.getHeaderValue().toString();
 206         getTempUserPrefs().put(colHeader, resizingColumn.getWidth());
 207       }
 208       resizeAndRepaint();
 209     }
 210
 211     @Override
 212     public String getToolTipText(MouseEvent evt)
 213     {
 214       String toolTipText = null;
 215       java.awt.Point pnt = evt.getPoint();
 216       int rowIndex = rowAtPoint(pnt);
 217       int colIndex = columnAtPoint(pnt);
 218
 219       try
 220       {
 221         if (getValueAt(rowIndex, colIndex) == null)
 222         {
 223           return null;
 224         }
 225         toolTipText = getValueAt(rowIndex, colIndex).toString();
 226
 227       } catch (Exception e)
 228       {
 229         e.printStackTrace();
 230       }
 231       toolTipText = (toolTipText == null ? null
 232               : (toolTipText.length() > 500
 233                       ? JvSwingUtils.wrapTooltip(true,
 234                               toolTipText.subSequence(0, 500) + "...")
 235                       : JvSwingUtils.wrapTooltip(true, toolTipText)));
 236
 237       return toolTipText;
 238     }
 239   };
 240
 241   protected JScrollPane scrl_searchResult = new JScrollPane(tbl_summary);
 242
 243   public GFTSPanel()
 244   {
 245     try
 246     {
 247       jbInit();
 248       mainFrame.setMinimumSize(new Dimension(MIN_WIDTH, MIN_HEIGHT));
 249       mainFrame.addFocusListener(new FocusAdapter()
 250       {
 251         @Override
 252         public void focusGained(FocusEvent e)
 253         {
 254           txt_search.requestFocusInWindow();
 255         }
 256       });
 257       mainFrame.invalidate();
 258       mainFrame.pack();
 259     } catch (Exception e)
 260     {
 261       e.printStackTrace();
 262     }
 263   }
 264
 265   /**
 266    * Initializes the GUI default properties
 267    *
 268    * @throws Exception
 269    */
 270   private void jbInit() throws Exception
 271   {
 272
 273     txt_search = new JvCacheableInputBox<String>(getCacheKey());
 274     populateCmbSearchTargetOptions();
 275     Integer width = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.width") == null ? 800
 276             : getTempUserPrefs().get("FTSPanel.width");
 277     Integer height = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.height") == null ? 400
 278             : getTempUserPrefs().get("FTSPanel.height");
 279     lbl_warning.setVisible(false);
 280     lbl_warning.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 281     lbl_loading.setVisible(false);
 282     lbl_loading.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 283     lbl_blank.setVisible(true);
 284     lbl_blank.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 285
 286     tbl_summary.setAutoCreateRowSorter(true);
 287     tbl_summary.getTableHeader().setReorderingAllowed(false);
 288     tbl_summary.addMouseListener(new MouseAdapter()
 289     {
 290       @Override
 291       public void mouseClicked(MouseEvent e)
 292       {
 293         validateSelection();
 294       }
 295
 296       @Override
 297       public void mouseReleased(MouseEvent e)
 298       {
 299         validateSelection();
 300       }
 301     });
 302     tbl_summary.addKeyListener(new KeyAdapter()
 303     {
 304       @Override
 305       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 306       {
 307         validateSelection();
 308         switch (evt.getKeyCode())
 309         {
 310         case KeyEvent.VK_ESCAPE: // escape key
 311           btn_back_ActionPerformed();
 312           break;
 313         case KeyEvent.VK_ENTER: // enter key
 314           if (btn_ok.isEnabled())
 315           {
 316             okAction();
 317           }
 318           evt.consume();
 319           break;
 320         case KeyEvent.VK_TAB: // tab key
 321           if (evt.isShiftDown())
 322           {
 323             tabbedPane.requestFocus();
 324           }
 325           else
 326           {
 327             btn_back.requestFocus();
 328           }
 329           evt.consume();
 330           break;
 331         default:
 332           return;
 333         }
 334       }
 335     });
 336
 337     btn_autosearch.setText("");
 338     btn_autosearch.setToolTipText(
 339             MessageManager.getString("option.enable_disable_autosearch"));
 340     btn_back.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 341     btn_back.setText(MessageManager.getString("action.back"));
 342     btn_back.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 343     {
 344       @Override
 345       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 346       {
 347         btn_back_ActionPerformed();
 348       }
 349     });
 350     btn_back.addKeyListener(new KeyAdapter()
 351     {
 352       @Override
 353       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 354       {
 355         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 356         {
 357           btn_back_ActionPerformed();
 358         }
 359       }
 360     });
 361
 362     btn_ok.setEnabled(false);
 363     btn_ok.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 364     btn_ok.setText(MessageManager.getString("action.ok"));
 365     btn_ok.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 366     {
 367       @Override
 368       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 369       {
 370         okAction();
 371       }
 372     });
 373     btn_ok.addKeyListener(new KeyAdapter()
 374     {
 375       @Override
 376       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 377       {
 378         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 379         {
 380           okAction();
 381         }
 382       }
 383     });
 384     btn_next_page.setEnabled(false);
 385     btn_next_page.setToolTipText(
 386             MessageManager.getString("label.next_page_tooltip"));
 387     btn_next_page.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 388     btn_next_page.setText(MessageManager.getString("action.next_page"));
 389     btn_next_page.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 390     {
 391       @Override
 392       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 393       {
 394         nextPageAction();
 395       }
 396     });
 397     btn_next_page.addKeyListener(new KeyAdapter()
 398     {
 399       @Override
 400       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 401       {
 402         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 403         {
 404           nextPageAction();
 405         }
 406       }
 407     });
 408
 409     btn_prev_page.setEnabled(false);
 410     btn_prev_page.setToolTipText(
 411             MessageManager.getString("label.prev_page_tooltip"));
 412     btn_prev_page.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 413     btn_prev_page.setText(MessageManager.getString("action.prev_page"));
 414     btn_prev_page.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 415     {
 416       @Override
 417       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 418       {
 419         prevPageAction();
 420       }
 421     });
 422     btn_prev_page.addKeyListener(new KeyAdapter()
 423     {
 424       @Override
 425       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 426       {
 427         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 428         {
 429           prevPageAction();
 430         }
 431       }
 432     });
 433
 434     if (isPaginationEnabled())
 435     {
 436       btn_prev_page.setVisible(true);
 437       btn_next_page.setVisible(true);
 438     }
 439     else
 440     {
 441       btn_prev_page.setVisible(false);
 442       btn_next_page.setVisible(false);
 443     }
 444
 445     btn_cancel.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 446     btn_cancel.setText(MessageManager.getString("action.cancel"));
 447     btn_cancel.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
 448     {
 449       @Override
 450       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 451       {
 452         btn_cancel_ActionPerformed();
 453       }
 454     });
 455     btn_cancel.addKeyListener(new KeyAdapter()
 456     {
 457       @Override
 458       public void keyPressed(KeyEvent evt)
 459       {
 460         if (evt.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 461         {
 462           btn_cancel_ActionPerformed();
 463         }
 464       }
 465     });
 466     scrl_searchResult.setPreferredSize(new Dimension(width, height));
 467
 468     cmb_searchTarget.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 469     cmb_searchTarget.addItemListener(new ItemListener()
 470     {
 471       @Override
 472       public void itemStateChanged(ItemEvent e)
 473       {
 474         if (e.getStateChange() == ItemEvent.SELECTED)
 475         {
 476           String tooltipText;
 477           if ("all".equalsIgnoreCase(
 478                   getCmbSearchTarget().getSelectedItem().toString()))
 479           {
 480             tooltipText = MessageManager.getString("label.search_all");
 481           }
 482           else if ("pdb id".equalsIgnoreCase(
 483                   getCmbSearchTarget().getSelectedItem().toString()))
 484           {
 485             tooltipText = MessageManager
 486                     .getString("label.separate_multiple_accession_ids");
 487           }
 488           else
 489           {
 490             tooltipText = MessageManager.formatMessage(
 491                     "label.separate_multiple_query_values", new Object[]
 492                     { getCmbSearchTarget().getSelectedItem().toString() });
 493           }
 494           txt_search.setToolTipText(
 495                   JvSwingUtils.wrapTooltip(true, tooltipText));
 496           searchAction(true);
 497         }
 498       }
 499     });
 500
 501     txt_search.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
 502
 503     txt_search.getEditor().getEditorComponent()
 504             .addKeyListener(new KeyAdapter()
 505             {
 506               @Override
 507               public void keyPressed(KeyEvent e)
 508               {
 509                 if (e.getKeyCode() == KeyEvent.VK_ENTER)
 510                 {
 511                   if (getTypedText() == null || getTypedText().isEmpty())
 512                   {
 513                     return;
 514                   }
 515                   String primaryKeyName = getFTSRestClient()
 516                           .getPrimaryKeyColumn().getName();
 517                   if (primaryKeyName.equalsIgnoreCase(getCmbSearchTarget()
 518                           .getSelectedItem().toString()))
 519                   {
 520                     // TODO: nicer to show the list in the result set before
 521                     // viewing in Jalview perhaps ?
 522                     transferToSequenceFetcher(getTypedText());
 523                   }
 524                   else
 525                   {
 526                     performSearchAction();
 527                   }
 528                 }
 529               }
 530             });
 531     final DeferredTextInputListener listener = new DeferredTextInputListener(
 532             1500, new ActionListener()
 533             {
 534               @Override
 535               public void actionPerformed(ActionEvent e)
 536               {
 537                 if (btn_autosearch.isSelected()
 538                         || txt_search.wasEnterPressed())
 539                 {
 540                   performSearchAction();
 541                 }
 542               }
 543             }, false);
 544     ((JTextComponent) txt_search.getEditor().getEditorComponent())
 545             .getDocument().addDocumentListener(listener);
 546
 547     txt_search.addFocusListener(new FocusListener()
 548     {
 549       @Override
 550       public void focusGained(FocusEvent e)
 551       {
 552         listener.start();
 553       }
 554
 555       @Override
 556       public void focusLost(FocusEvent e)
 557       {
 558         // listener.stop();
 559       }
 560     });
 561
 562     txt_search.addActionListener(new ActionListener()
 563     {
 564
 565       @Override
 566       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 567       {
 568         performSearchAction();
 569       }
 570     });
 571     final String searchTabTitle = MessageManager
 572             .getString("label.search_result");
 573     final String configureCols = MessageManager
 574             .getString("label.configure_displayed_columns");
 575     ChangeListener changeListener = new ChangeListener()
 576     {
 577       @Override
 578       public void stateChanged(ChangeEvent changeEvent)
 579       {
 580         JTabbedPane sourceTabbedPane = (JTabbedPane) changeEvent
 581                 .getSource();
 582         int index = sourceTabbedPane.getSelectedIndex();
 583
 584         btn_back.setVisible(true);
 585         btn_cancel.setVisible(true);
 586         btn_ok.setVisible(true);
 587         if (sourceTabbedPane.getTitleAt(index).equals(configureCols))
 588         {
 589           btn_back.setVisible(false);
 590           btn_cancel.setVisible(false);
 591           btn_ok.setVisible(false);
 592           btn_back.setEnabled(false);
 593           btn_cancel.setEnabled(false);
 594           btn_ok.setEnabled(false);
 595           btn_next_page.setEnabled(false);
 596           btn_prev_page.setEnabled(false);
 597           txt_search.setEnabled(false);
 598           cmb_searchTarget.setEnabled(false);
 599           previousWantedFields = getFTSRestClient()
 600                   .getAllDefaultDisplayedFTSDataColumns()
 601                   .toArray(new Object[0]);
 602         }
 603         if (sourceTabbedPane.getTitleAt(index).equals(searchTabTitle))
 604         {
 605           btn_back.setEnabled(true);
 606           btn_cancel.setEnabled(true);
 607           refreshPaginatorState();
 608           txt_search.setEnabled(true);
 609           cmb_searchTarget.setEnabled(true);
 610           if (wantedFieldsUpdated())
 611           {
 612             searchAction(true);
 613             paginatorCart.clear();
 614           }
 615           else
 616           {
 617             validateSelection();
 618           }
 619         }
 620       }
 621     };
 622     tabbedPane.addChangeListener(changeListener);
 623     tabbedPane.setPreferredSize(new Dimension(width, height));
 624     tabbedPane.add(searchTabTitle, scrl_searchResult);
 625     tabbedPane.add(configureCols, new FTSDataColumnPreferences(
 626             PreferenceSource.SEARCH_SUMMARY, getFTSRestClient()));
 627
 628     pnl_actions.add(btn_back);
 629     pnl_actions.add(btn_ok);
 630     pnl_actions.add(btn_cancel);
 631
 632     pnl_results.add(tabbedPane);
 633     pnl_inputs.add(cmb_searchTarget);
 634     pnl_inputs.add(txt_search);
 635     pnl_inputs.add(btn_autosearch);
 636     pnl_inputs.add(lbl_loading);
 637     pnl_inputs.add(lbl_warning);
 638     pnl_inputs.add(lbl_blank);
 639     pnl_inputs.add(btn_prev_page);
 640     pnl_inputs.add(btn_next_page);
 641
 642     this.setLayout(mainLayout);
 643     this.add(pnl_inputs, java.awt.BorderLayout.NORTH);
 644     this.add(pnl_results, java.awt.BorderLayout.CENTER);
 645     this.add(pnl_actions, java.awt.BorderLayout.SOUTH);
 646     mainFrame.setVisible(true);
 647     mainFrame.setContentPane(this);
 648     mainFrame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DISPOSE_ON_CLOSE);
 649     mainFrame.addInternalFrameListener(
 650             new javax.swing.event.InternalFrameAdapter()
 651             {
 652               @Override
 653               public void internalFrameClosing(InternalFrameEvent e)
 654               {
 655                 closeAction();
 656               }
 657             });
 658     mainFrame.setVisible(true);
 659     mainFrame.setContentPane(this);
 660     mainFrame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DISPOSE_ON_CLOSE);
 661     Integer x = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.x");
 662     Integer y = getTempUserPrefs().get("FTSPanel.y");
 663     if (x != null && y != null)
 664     {
 665       mainFrame.setLocation(x, y);
 666     }
 667     Desktop.addInternalFrame(mainFrame, getFTSFrameTitle(), width, height);
 668   }
 669
 670   protected void closeAction()
 671   {
 672     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.width", this.getWidth());
 673     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.height", pnl_results.getHeight());
 674     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.x", mainFrame.getX());
 675     getTempUserPrefs().put("FTSPanel.y", mainFrame.getY());
 676     mainFrame.dispose();
 677     txt_search.persistCache();
 678   }
 679
 680   public class DeferredTextInputListener implements DocumentListener
 681   {
 682     private final Timer swingTimer;
 683
 684     public DeferredTextInputListener(int timeOut, ActionListener listener,
 685             boolean repeats)
 686     {
 687       swingTimer = new Timer(timeOut, listener);
 688       swingTimer.setRepeats(repeats);
 689     }
 690
 691     public void start()
 692     {
 693       swingTimer.start();
 694     }
 695
 696     public void stop()
 697     {
 698       swingTimer.stop();
 699     }
 700
 701     @Override
 702     public void insertUpdate(DocumentEvent e)
 703     {
 704       swingTimer.restart();
 705     }
 706
 707     @Override
 708     public void removeUpdate(DocumentEvent e)
 709     {
 710       swingTimer.restart();
 711     }
 712
 713     @Override
 714     public void changedUpdate(DocumentEvent e)
 715     {
 716       swingTimer.restart();
 717     }
 718
 719   }
 720
 721   void performSearchAction()
 722   {
 723     String typed = getTypedText();
 724     if (typed != null && typed.length() > 0
 725             && !typed.equalsIgnoreCase(lastSearchTerm))
 726     {
 727       searchAction(true);
 728       paginatorCart.clear();
 729       lastSearchTerm = typed;
 730     }
 731   }
 732
 733   public boolean wantedFieldsUpdated()
 734   {
 735     if (previousWantedFields == null)
 736     {
 737       return false;
 738     }
 739
 740     return Arrays.equals(getFTSRestClient()
 741             .getAllDefaultDisplayedFTSDataColumns().toArray(new Object[0]),
 742             previousWantedFields) ? false : true;
 743
 744   }
 745
 746   public void validateSelection()
 747   {
 748     if (tbl_summary.getSelectedRows().length > 0
 749             || !paginatorCart.isEmpty())
 750     {
 751       btn_ok.setEnabled(true);
 752     }
 753     else
 754     {
 755       btn_ok.setEnabled(false);
 756     }
 757   }
 758
 759   public JComboBox<FTSDataColumnI> getCmbSearchTarget()
 760   {
 761     return cmb_searchTarget;
 762   }
 763
 764   public JComboBox<String> getTxtSearch()
 765   {
 766     return txt_search;
 767   }
 768
 769   public JInternalFrame getMainFrame()
 770   {
 771     return mainFrame;
 772   }
 773
 774   protected void delayAndEnableActionButtons()
 775   {
 776     new Thread()
 777     {
 778       @Override
 779       public void run()
 780       {
 781         try
 782         {
 783           Thread.sleep(1500);
 784         } catch (InterruptedException e)
 785         {
 786           e.printStackTrace();
 787         }
 788         btn_ok.setEnabled(true);
 789         btn_back.setEnabled(true);
 790         btn_cancel.setEnabled(true);
 791       }
 792     }.start();
 793   }
 794
 795   protected void checkForErrors()
 796   {
 797     lbl_warning.setVisible(false);
 798     lbl_blank.setVisible(true);
 799     if (errorWarning.length() > 0)
 800     {
 801       lbl_loading.setVisible(false);
 802       lbl_blank.setVisible(false);
 803       lbl_warning.setToolTipText(
 804               JvSwingUtils.wrapTooltip(true, errorWarning.toString()));
 805       lbl_warning.setVisible(true);
 806     }
 807   }
 808
 809   protected void btn_back_ActionPerformed()
 810   {
 811     closeAction();
 812     new SequenceFetcher(progressIndicator);
 813   }
 814
 815   protected void disableActionButtons()
 816   {
 817     btn_ok.setEnabled(false);
 818     btn_back.setEnabled(false);
 819     btn_cancel.setEnabled(false);
 820   }
 821
 822   protected void btn_cancel_ActionPerformed()
 823   {
 824     closeAction();
 825   }
 826
 827   /**
 828    * Populates search target combo-box options
 829    */
 830   public void populateCmbSearchTargetOptions()
 831   {
 832     List<FTSDataColumnI> searchableTargets = new ArrayList<FTSDataColumnI>();
 833     try
 834     {
 835       Collection<FTSDataColumnI> foundFTSTargets = getFTSRestClient()
 836               .getSearchableDataColumns();
 837       searchableTargets.addAll(foundFTSTargets);
 838     } catch (Exception e)
 839     {
 840       e.printStackTrace();
 841     }
 842
 843     Collections.sort(searchableTargets, new Comparator<FTSDataColumnI>()
 844     {
 845       @Override
 846       public int compare(FTSDataColumnI o1, FTSDataColumnI o2)
 847       {
 848         return o1.getName().compareTo(o2.getName());
 849       }
 850     });
 851
 852     for (FTSDataColumnI searchTarget : searchableTargets)
 853     {
 854       cmb_searchTarget.addItem(searchTarget);
 855     }
 856   }
 857
 858   public void transferToSequenceFetcher(String ids)
 859   {
 860     seqFetcher.getTextArea().setText(ids);
 861     Thread worker = new Thread(seqFetcher);
 862     worker.start();
 863   }
 864
 865   @Override
 866   public String getTypedText()
 867   {
 868     return txt_search.getUserInput();
 869   }
 870
 871   @Override
 872   public JTable getResultTable()
 873   {
 874     return tbl_summary;
 875   }
 876
 877   public void reset()
 878   {
 879     lbl_loading.setVisible(false);
 880     errorWarning.setLength(0);
 881     lbl_warning.setVisible(false);
 882     lbl_blank.setVisible(true);
 883     btn_ok.setEnabled(false);
 884     mainFrame.setTitle(getFTSFrameTitle());
 885     referesh();
 886     tbl_summary.setModel(new DefaultTableModel());
 887     tbl_summary.setVisible(false);
 888   }
 889
 890   @Override
 891   public void setPrevPageButtonEnabled(boolean isEnabled)
 892   {
 893     btn_prev_page.setEnabled(isEnabled);
 894   }
 895
 896   @Override
 897   public void setNextPageButtonEnabled(boolean isEnabled)
 898   {
 899     btn_next_page.setEnabled(isEnabled);
 900   }
 901
 902   @Override
 903   public void setErrorMessage(String message)
 904   {
 905     errorWarning.append(message);
 906   }
 907
 908   @Override
 909   public void updateSearchFrameTitle(String title)
 910   {
 911     mainFrame.setTitle(title);
 912   }
 913
 914   @Override
 915   public void setSearchInProgress(Boolean isSearchInProgress)
 916   {
 917     lbl_blank.setVisible(!isSearchInProgress);
 918     lbl_loading.setVisible(isSearchInProgress);
 919     txt_search.setEditable(!isSearchInProgress);
 920   }
 921
 922   @Override
 923   public void prevPageAction()
 924   {
 925     updatePaginatorCart();
 926     if (offSet >= pageLimit)
 927     {
 928       offSet = offSet - pageLimit;
 929       searchAction(false);
 930     }
 931     else
 932     {
 933       refreshPaginatorState();
 934     }
 935   }
 936
 937   @Override
 938   public void nextPageAction()
 939   {
 940     updatePaginatorCart();
 941     offSet = offSet + pageLimit;
 942     searchAction(false);
 943   }
 944
 945   public void updatePaginatorCart()
 946   {
 947     int primaryKeyColIndex = 0;
 948     JTable resultTable = getResultTable();
 949     int totalRows = resultTable.getRowCount();
 950     try
 951     {
 952       primaryKeyColIndex = getFTSRestClient()
 953               .getPrimaryKeyColumIndex(wantedFields, false);
 954     } catch (Exception e)
 955     {
 956       e.printStackTrace();
 957     }
 958
 959     for (int row = 0; row < totalRows; row++)
 960     {
 961       String id = (String) resultTable.getValueAt(row, primaryKeyColIndex);
 962       if (paginatorCart.contains(id))
 963       {
 964         paginatorCart.remove(id);
 965       }
 966     }
 967     int[] selectedRows = resultTable.getSelectedRows();
 968     for (int summaryRow : selectedRows)
 969     {
 970       String idStr = resultTable.getValueAt(summaryRow, primaryKeyColIndex)
 971               .toString();
 972       paginatorCart.add(idStr);
 973     }
 974   }
 975
 976   public void updateSummaryTableSelections()
 977   {
 978     JTable resultTable = getResultTable();
 979     if (paginatorCart.isEmpty())
 980     {
 981       return;
 982     }
 983     int primaryKeyColIndex = 0;
 984     try
 985     {
 986       primaryKeyColIndex = getFTSRestClient()
 987               .getPrimaryKeyColumIndex(wantedFields, false);
 988     } catch (Exception e)
 989     {
 990       e.printStackTrace();
 991     }
 992     int totalRows = resultTable.getRowCount();
 993     for (int row = 0; row < totalRows; row++)
 994     {
 995       String id = (String) resultTable.getValueAt(row, primaryKeyColIndex);
 996       if (paginatorCart.contains(id))
 997       {
 998         resultTable.addRowSelectionInterval(row, row);
 999       }
1000     }
1001     validateSelection();
1002   }
1003
1004   public void refreshPaginatorState()
1005   {
1006     setPrevPageButtonEnabled(false);
1007     setNextPageButtonEnabled(false);
1008     if (resultSetCount == 0 && pageLimit == 0)
1009     {
1010       return;
1011     }
1012     if (resultSetCount >= pageLimit)
1013     {
1014       setNextPageButtonEnabled(true);
1015     }
1016     if (offSet >= pageLimit)
1017     {
1018       setPrevPageButtonEnabled(true);
1019     }
1020   }
1021
1022   public void referesh()
1023   {
1024     mainFrame.setTitle(getFTSFrameTitle());
1025   }
1026
1027 }