src/jalview/gui/ColourMenuHelper.java

   1 package jalview.gui;
   2
   3 import jalview.bin.Cache;
   4 import jalview.datamodel.AnnotatedCollectionI;
   5 import jalview.schemes.ColourSchemeI;
   6 import jalview.schemes.ColourSchemeLoader;
   7 import jalview.schemes.ColourSchemes;
   8 import jalview.schemes.ResidueColourScheme;
   9 import jalview.schemes.UserColourScheme;
  10 import jalview.util.MessageManager;
  11
  12 import java.awt.Component;
  13 import java.awt.event.ActionEvent;
  14 import java.awt.event.ActionListener;
  15 import java.awt.event.MouseAdapter;
  16 import java.awt.event.MouseEvent;
  17
  18 import javax.swing.ButtonGroup;
  19 import javax.swing.JMenu;
  20 import javax.swing.JRadioButtonMenuItem;
  21
  22 public class ColourMenuHelper
  23 {
  24   public interface ColourChangeListener
  25   {
  26     /**
  27      * Change colour scheme to the selected scheme
  28      *
  29      * @param name
  30      *          the registered (unique) name of a colour scheme
  31      */
  32     void changeColour_actionPerformed(String name);
  33   }
  34
  35   /**
  36    * Adds items to the colour menu, as mutually exclusive members of a button
  37    * group. The callback handler is responsible for the action on selecting any
  38    * of these options. The callback method receives the name of the selected
  39    * colour, or "None" or "User Defined". This method returns the ButtonGroup to
  40    * which items were added.
  41    * <ul>
  42    * <li>None</li>
  43    * <li>Clustal</li>
  44    * <li>...other 'built-in' colours</li>
  45    * <li>...any user-defined colours</li>
  46    * <li>User Defined..(only for AlignFrame menu)</li>
  47    * </ul>
  48    *
  49    * @param colourMenu
  50    *          the menu to attach items to
  51    * @param client
  52    *          a callback to handle menu selection
  53    * @param coll
  54    *          the data the menu is being built for
  55    * @param simpleOnly
  56    *          if true, only simple per-residue colour schemes are included
  57    */
  58   public static ButtonGroup addMenuItems(final JMenu colourMenu,
  59           final ColourChangeListener client, AnnotatedCollectionI coll,
  60           boolean simpleOnly)
  61   {
  62     /*
  63      * ButtonGroup groups those items whose
  64      * selection is mutually exclusive
  65      */
  66     ButtonGroup colours = new ButtonGroup();
  67
  68     if (!simpleOnly)
  69     {
  70       JRadioButtonMenuItem noColourmenuItem = new JRadioButtonMenuItem(
  71               MessageManager.getString("label.none"));
  72       noColourmenuItem.setName(ResidueColourScheme.NONE);
  73       noColourmenuItem.addActionListener(new ActionListener()
  74       {
  75         @Override
  76         public void actionPerformed(ActionEvent e)
  77         {
  78           client.changeColour_actionPerformed(ResidueColourScheme.NONE);
  79         }
  80       });
  81       colourMenu.add(noColourmenuItem);
  82       colours.add(noColourmenuItem);
  83     }
  84
  85     /*
  86      * scan registered colour schemes (built-in or user-defined)
  87      * and add them to the menu (in the order they were registered)
  88      */
  89     Iterable<ColourSchemeI> colourSchemes = ColourSchemes.getInstance()
  90             .getColourSchemes();
  91     for (ColourSchemeI scheme : colourSchemes)
  92     {
  93       if (simpleOnly && !scheme.isSimple())
  94       {
  95         continue;
  96       }
  97
  98       /*
  99        * button text is i18n'd but the name is the canonical name of
 100        * the colour scheme (inspected in setColourSelected())
 101        */
 102       final String name = scheme.getSchemeName();
 103       String label = MessageManager.getStringOrReturn("label.colourScheme_"
 104               + name.toLowerCase().replace(" ", "_"), name);
 105       final JRadioButtonMenuItem radioItem = new JRadioButtonMenuItem(label);
 106       radioItem.setName(name);
 107       radioItem.setEnabled(scheme.isApplicableTo(coll));
 108       if (scheme instanceof UserColourScheme)
 109       {
 110         /*
 111          * user-defined colour scheme loaded on startup or during the
 112          * Jalview session; right-click on this offers the option to
 113          * remove it as a colour choice (unless currently selected)
 114          */
 115         radioItem.addMouseListener(new MouseAdapter()
 116         {
 117           @Override
 118           public void mousePressed(MouseEvent evt)
 119           {
 120             if (evt.isPopupTrigger() && !radioItem.isSelected()) // Mac
 121             {
 122               offerRemoval();
 123             }
 124           }
 125
 126           @Override
 127           public void mouseReleased(MouseEvent evt)
 128           {
 129             if (evt.isPopupTrigger() && !radioItem.isSelected()) // Windows
 130             {
 131               offerRemoval();
 132             }
 133           }
 134
 135           void offerRemoval()
 136           {
 137             ActionListener al = radioItem.getActionListeners()[0];
 138             radioItem.removeActionListener(al);
 139             int option = JvOptionPane.showInternalConfirmDialog(
 140                     Desktop.desktop, MessageManager
 141                             .getString("label.remove_from_default_list"),
 142                     MessageManager
 143                             .getString("label.remove_user_defined_colour"),
 144                     JvOptionPane.YES_NO_OPTION);
 145             if (option == JvOptionPane.YES_OPTION)
 146             {
 147               ColourSchemes.getInstance().removeColourScheme(
 148                       radioItem.getName());
 149               colourMenu.remove(radioItem);
 150               updatePreferences();
 151             }
 152             else
 153             {
 154               radioItem.addActionListener(al);
 155             }
 156           }
 157         });
 158       }
 159       radioItem.addActionListener(new ActionListener()
 160       {
 161         @Override
 162         public void actionPerformed(ActionEvent evt)
 163         {
 164           client.changeColour_actionPerformed(name);
 165         }
 166       });
 167       colourMenu.add(radioItem);
 168       colours.add(radioItem);
 169     }
 170
 171     /*
 172      * only add the option to load/configure a user-defined colour
 173      * to the AlignFrame colour menu
 174      */
 175     if (client instanceof AlignFrame)
 176     {
 177       final String label = MessageManager.getString("action.user_defined");
 178       JRadioButtonMenuItem userDefinedColour = new JRadioButtonMenuItem(
 179               label);
 180       userDefinedColour.setName(ResidueColourScheme.USER_DEFINED_MENU);
 181       userDefinedColour.addActionListener(new ActionListener()
 182       {
 183         @Override
 184         public void actionPerformed(ActionEvent e)
 185         {
 186           client.changeColour_actionPerformed(ResidueColourScheme.USER_DEFINED_MENU);
 187         }
 188       });
 189       colourMenu.add(userDefinedColour);
 190       colours.add(userDefinedColour);
 191     }
 192
 193     return colours;
 194   }
 195
 196   /**
 197    * Marks as selected the colour menu item matching the given colour scheme, or
 198    * the first item ('None') if no match is found. If the colour scheme is a
 199    * user defined scheme, but not in the menu (this arises if a new scheme is
 200    * defined and applied but not saved to file), then menu option
 201    * "User Defined.." is selected.
 202    *
 203    * @param colourMenu
 204    * @param cs
 205    */
 206   public static void setColourSelected(JMenu colourMenu, ColourSchemeI cs)
 207   {
 208     String colourName = cs == null ? ResidueColourScheme.NONE : cs
 209             .getSchemeName();
 210
 211     JRadioButtonMenuItem none = null;
 212     JRadioButtonMenuItem userDefined = null;
 213
 214     /*
 215      * select the radio button whose name matches the colour name
 216      * (not the button text, as it may be internationalised)
 217      */
 218     for (Component menuItem : colourMenu.getMenuComponents())
 219     {
 220       if (menuItem instanceof JRadioButtonMenuItem)
 221       {
 222         JRadioButtonMenuItem radioButton = (JRadioButtonMenuItem) menuItem;
 223         String buttonName = radioButton.getName();
 224         if (buttonName.equals(colourName))
 225         {
 226           radioButton.setSelected(true);
 227           return;
 228         }
 229         if (ResidueColourScheme.NONE.equals(buttonName))
 230         {
 231           none = radioButton;
 232         }
 233         if (ResidueColourScheme.USER_DEFINED_MENU.equals(buttonName))
 234         {
 235           userDefined = radioButton;
 236         }
 237       }
 238     }
 239
 240     /*
 241      * no match by name; select User Defined.. if current scheme is a
 242      * user defined one, else select None
 243      */
 244     if (cs instanceof UserColourScheme && userDefined != null)
 245     {
 246       userDefined.setSelected(true);
 247     }
 248     else if (none != null)
 249     {
 250       none.setSelected(true);
 251     }
 252   }
 253
 254   /**
 255    * Updates the USER_DEFINE_COLOURS preference to remove any de-registered
 256    * colour scheme
 257    */
 258   static void updatePreferences()
 259   {
 260     StringBuilder coloursFound = new StringBuilder();
 261     String[] files = Cache.getProperty("USER_DEFINED_COLOURS").split("\\|");
 262
 263     /*
 264      * the property does not include the scheme name, it is in the file;
 265      * so just load the colour schemes and discard any whose name is not
 266      * registered
 267      */
 268     for (String file : files)
 269     {
 270       try
 271       {
 272         UserColourScheme ucs = ColourSchemeLoader.loadColourScheme(file);
 273         if (ucs != null
 274                 && ColourSchemes.getInstance().nameExists(ucs.getName()))
 275         {
 276           if (coloursFound.length() > 0)
 277           {
 278             coloursFound.append("|");
 279           }
 280           coloursFound.append(file);
 281         }
 282       } catch (Exception ex)
 283       {
 284         System.out.println("Error loading User ColourFile\n" + ex);
 285       }
 286     }
 287
 288     if (coloursFound.toString().length() > 1)
 289     {
 290       Cache.setProperty("USER_DEFINED_COLOURS", coloursFound.toString());
 291     }
 292     else
 293     {
 294       Cache.applicationProperties.remove("USER_DEFINED_COLOURS");
 295     }
 296   }
 297 }