src/jalview/gui/Console.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.gui;
  22
  23 import java.awt.BorderLayout;
  24 import java.awt.Color;
  25 import java.awt.Dimension;
  26 import java.awt.GraphicsEnvironment;
  27 import java.awt.GridBagConstraints;
  28 import java.awt.GridBagLayout;
  29 import java.awt.Rectangle;
  30 import java.awt.Toolkit;
  31 import java.awt.datatransfer.Clipboard;
  32 import java.awt.datatransfer.StringSelection;
  33 import java.awt.event.ActionEvent;
  34 import java.awt.event.ActionListener;
  35 import java.awt.event.MouseAdapter;
  36 import java.awt.event.MouseEvent;
  37 import java.awt.event.WindowAdapter;
  38 import java.awt.event.WindowEvent;
  39 import java.awt.event.WindowListener;
  40 import java.io.IOException;
  41 import java.io.PipedInputStream;
  42 import java.io.PipedOutputStream;
  43 import java.io.PrintStream;
  44
  45 import javax.swing.BorderFactory;
  46 import javax.swing.JButton;
  47 import javax.swing.JComboBox;
  48 import javax.swing.JFrame;
  49 import javax.swing.JLabel;
  50 import javax.swing.JPanel;
  51 import javax.swing.JScrollPane;
  52 import javax.swing.JTextArea;
  53 import javax.swing.border.Border;
  54 import javax.swing.text.DefaultCaret;
  55
  56 import jalview.bin.Cache;
  57 import jalview.log.JLoggerI.LogLevel;
  58 import jalview.log.JLoggerLog4j;
  59 import jalview.log.JalviewAppender;
  60 import jalview.util.ChannelProperties;
  61 import jalview.util.MessageManager;
  62 import jalview.util.Platform;
  63
  64 /**
  65  * Simple Jalview Java Console. Version 1 - allows viewing of console output
  66  * after desktop is created. Acquired with thanks from RJHM's site
  67  * http://www.comweb.nl/java/Console/Console.html A simple Java Console for your
  68  * application (Swing version) Requires Java 1.1.5 or higher Disclaimer the use
  69  * of this source is at your own risk. Permision to use and distribute into your
  70  * own applications RJHM van den Bergh , rvdb@comweb.nl
  71  */
  72
  73 public class Console extends WindowAdapter
  74         implements WindowListener, ActionListener, Runnable
  75 {
  76   private JFrame frame;
  77
  78   private JTextArea textArea;
  79
  80   /*
  81    * unused - tally and limit for lines in console window int lines = 0;
  82    *
  83    * int lim = 1000;
  84    */
  85   int byteslim = 102400, bytescut = 76800; // 100k and 75k cut point.
  86
  87   private Thread reader, reader2, textAppender;
  88
  89   private boolean quit;
  90
  91   private final PrintStream stdout = System.out, stderr = System.err;
  92
  93   private PipedInputStream pin = new PipedInputStream();
  94
  95   private PipedInputStream pin2 = new PipedInputStream();
  96
  97   private StringBuffer displayPipe = new StringBuffer();
  98
  99   Thread errorThrower; // just for testing (Throws an Exception at this Console
 100
 101   // are we attached to some parent Desktop
 102   Desktop parent = null;
 103
 104   private int MIN_WIDTH = 300;
 105
 106   private int MIN_HEIGHT = 250;
 107
 108   private JComboBox<LogLevel> logLevelCombo = new JComboBox<LogLevel>();
 109
 110   protected LogLevel startingLogLevel = LogLevel.INFO;
 111
 112   public Console()
 113   {
 114     // create all components and add them
 115     Dimension screenSize = Toolkit.getDefaultToolkit().getScreenSize();
 116     frame = initFrame("Java Console", screenSize.width / 2,
 117             screenSize.height / 2, -1, -1);
 118     initConsole(true);
 119   }
 120
 121   private void initConsole(boolean visible)
 122   {
 123     initConsole(visible, true);
 124   }
 125
 126   /**
 127    *
 128    * @param visible
 129    *          - open the window
 130    * @param redirect
 131    *          - redirect std*
 132    */
 133   private void initConsole(boolean visible, boolean redirect)
 134   {
 135     // CutAndPasteTransfer cpt = new CutAndPasteTransfer();
 136     // textArea = cpt.getTextArea();
 137     textArea = new JTextArea();
 138     textArea.setEditable(false);
 139     // autoscroll
 140     DefaultCaret caret = (DefaultCaret) textArea.getCaret();
 141     caret.setUpdatePolicy(DefaultCaret.ALWAYS_UPDATE);
 142     // toggle autoscroll by clicking on the text area
 143     Border pausedBorder = BorderFactory.createMatteBorder(2, 2, 2, 2,
 144             textArea.getForeground());
 145     Border noBorder = BorderFactory.createEmptyBorder(2, 2, 2, 2);
 146     JScrollPane scrollPane = new JScrollPane(textArea);
 147     scrollPane.setBorder(noBorder);
 148     textArea.addMouseListener(new MouseAdapter()
 149     {
 150       public void mouseClicked(MouseEvent e)
 151       {
 152         if (e.getButton() == MouseEvent.BUTTON1)
 153         {
 154           if (caret.getUpdatePolicy() == DefaultCaret.ALWAYS_UPDATE)
 155           {
 156             caret.setUpdatePolicy(DefaultCaret.NEVER_UPDATE);
 157             scrollPane.setBorder(pausedBorder);
 158           }
 159           else
 160           {
 161             caret.setUpdatePolicy(DefaultCaret.ALWAYS_UPDATE);
 162             textArea.setCaretPosition(textArea.getDocument().getLength());
 163             scrollPane.setBorder(noBorder);
 164           }
 165         }
 166       }
 167     });
 168
 169     JButton clearButton = new JButton(
 170             MessageManager.getString("action.clear"));
 171     JButton copyToClipboardButton = new JButton(
 172             MessageManager.getString("label.copy_to_clipboard"));
 173     copyToClipboardButton.addActionListener(new ActionListener()
 174     {
 175       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 176       {
 177         copyConsoleTextToClipboard();
 178       }
 179     });
 180     copyToClipboardButton.addMouseListener(new MouseAdapter()
 181     {
 182       private Color bg = textArea.getBackground();
 183
 184       private Color fg = textArea.getForeground();
 185
 186       public void mousePressed(MouseEvent e)
 187       {
 188         textArea.setBackground(textArea.getSelectionColor());
 189         textArea.setForeground(textArea.getSelectedTextColor());
 190       }
 191
 192       public void mouseReleased(MouseEvent e)
 193       {
 194         textArea.setBackground(bg);
 195         textArea.setForeground(fg);
 196       }
 197
 198     });
 199     copyToClipboardButton.setToolTipText(
 200             MessageManager.getString("label.copy_to_clipboard_tooltip"));
 201
 202     JLabel logLevelLabel = new JLabel(
 203             MessageManager.getString("label.log_level") + ":");
 204
 205     // logLevelCombo.addItem(LogLevel.ALL);
 206     logLevelCombo.addItem(LogLevel.TRACE);
 207     logLevelCombo.addItem(LogLevel.DEBUG);
 208     logLevelCombo.addItem(LogLevel.INFO);
 209     logLevelCombo.addItem(LogLevel.WARN);
 210     // logLevelCombo.addItem(LogLevel.ERROR);
 211     // logLevelCombo.addItem(LogLevel.FATAL);
 212     // logLevelCombo.addItem(LogLevel.ERROR);
 213     // logLevelCombo.addItem(LogLevel.OFF);
 214     // set startingLogLevel
 215     startingLogLevel = Cache.log == null ? LogLevel.INFO
 216             : Cache.log.getLevel();
 217     setChosenLogLevelCombo();
 218     logLevelCombo.addActionListener(new ActionListener()
 219     {
 220       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 221       {
 222         if (Cache.log != null)
 223         {
 224           Cache.log.setLevel((LogLevel) logLevelCombo.getSelectedItem());
 225         }
 226       }
 227
 228     });
 229
 230     // frame = cpt;
 231     frame.getContentPane().setLayout(new BorderLayout());
 232     frame.getContentPane().add(scrollPane, BorderLayout.CENTER);
 233     JPanel southPanel = new JPanel();
 234     southPanel.setLayout(new GridBagLayout());
 235
 236     JPanel logLevelPanel = new JPanel();
 237     logLevelPanel.setAlignmentX(JPanel.LEFT_ALIGNMENT);
 238     logLevelPanel.add(logLevelLabel);
 239     logLevelPanel.add(logLevelCombo);
 240     String logLevelTooltip = MessageManager.formatMessage(
 241             "label.log_level_tooltip", startingLogLevel.toString());
 242     logLevelLabel.setToolTipText(logLevelTooltip);
 243     logLevelCombo.setToolTipText(logLevelTooltip);
 244
 245     GridBagConstraints gbc = new GridBagConstraints();
 246     gbc.gridx = 0;
 247     gbc.gridy = 0;
 248     gbc.gridwidth = 1;
 249     gbc.gridheight = 1;
 250     gbc.weightx = 0.1;
 251     southPanel.add(logLevelPanel, gbc);
 252
 253     gbc.gridx++;
 254     gbc.weightx = 0.8;
 255     gbc.fill = GridBagConstraints.HORIZONTAL;
 256     southPanel.add(clearButton, gbc);
 257
 258     gbc.gridx++;
 259     gbc.weightx = 0.1;
 260     gbc.fill = GridBagConstraints.NONE;
 261     southPanel.add(copyToClipboardButton, gbc);
 262
 263     southPanel.setVisible(true);
 264     frame.getContentPane().add(southPanel, BorderLayout.SOUTH);
 265     frame.setVisible(visible);
 266     updateConsole = visible;
 267     frame.addWindowListener(this);
 268     clearButton.addActionListener(this);
 269
 270     if (redirect)
 271     {
 272       redirectStreams();
 273     }
 274     else
 275     {
 276       unredirectStreams();
 277     }
 278     quit = false; // signals the Threads that they should exit
 279
 280     // Starting two seperate threads to read from the PipedInputStreams
 281     //
 282     reader = new Thread(this);
 283     reader.setDaemon(true);
 284     reader.start();
 285     //
 286     reader2 = new Thread(this);
 287     reader2.setDaemon(true);
 288     reader2.start();
 289     // and a thread to append text to the textarea
 290     textAppender = new Thread(this);
 291     textAppender.setDaemon(true);
 292     textAppender.start();
 293
 294     // set icons
 295     frame.setIconImages(ChannelProperties.getIconList());
 296   }
 297
 298   private void setChosenLogLevelCombo()
 299   {
 300     setChosenLogLevelCombo(startingLogLevel);
 301   }
 302
 303   private void setChosenLogLevelCombo(LogLevel setLogLevel)
 304   {
 305     logLevelCombo.setSelectedItem(setLogLevel);
 306     if (!logLevelCombo.getSelectedItem().equals(setLogLevel))
 307     {
 308       // setLogLevel not (yet) in list
 309       if (setLogLevel != null && setLogLevel instanceof LogLevel)
 310       {
 311         // add new item to list (might be set via .jalview_properties)
 312         boolean added = false;
 313         for (int i = 0; i < logLevelCombo.getItemCount(); i++)
 314         {
 315           LogLevel l = (LogLevel) logLevelCombo.getItemAt(i);
 316           if (l.compareTo(setLogLevel) >= 0)
 317           {
 318             logLevelCombo.insertItemAt(setLogLevel, i);
 319             added = true;
 320             break;
 321           }
 322         }
 323         if (!added) // lower priority than others or some confusion -- add to
 324                     // end of list
 325         {
 326           logLevelCombo.addItem(setLogLevel);
 327         }
 328         logLevelCombo.setSelectedItem(setLogLevel);
 329       }
 330       else
 331       {
 332         logLevelCombo.setSelectedItem(LogLevel.INFO);
 333       }
 334     }
 335   }
 336
 337   private void copyConsoleTextToClipboard()
 338   {
 339     String consoleText = textArea.getText();
 340     StringSelection consoleTextSelection = new StringSelection(consoleText);
 341     Clipboard cb = Toolkit.getDefaultToolkit().getSystemClipboard();
 342     cb.setContents(consoleTextSelection, null);
 343   }
 344
 345   PipedOutputStream pout = null, perr = null;
 346
 347   public void redirectStreams()
 348   {
 349     if (pout == null)
 350     {
 351       try
 352       {
 353         pout = new PipedOutputStream(this.pin);
 354         System.setOut(new PrintStream(pout, true));
 355       } catch (java.io.IOException io)
 356       {
 357         textArea.append("Couldn't redirect STDOUT to this console\n"
 358                 + io.getMessage());
 359         io.printStackTrace(stderr);
 360       } catch (SecurityException se)
 361       {
 362         textArea.append("Couldn't redirect STDOUT to this console\n"
 363                 + se.getMessage());
 364         se.printStackTrace(stderr);
 365       }
 366
 367       try
 368       {
 369         perr = new PipedOutputStream(this.pin2);
 370         System.setErr(new PrintStream(perr, true));
 371       } catch (java.io.IOException io)
 372       {
 373         textArea.append("Couldn't redirect STDERR to this console\n"
 374                 + io.getMessage());
 375         io.printStackTrace(stderr);
 376       } catch (SecurityException se)
 377       {
 378         textArea.append("Couldn't redirect STDERR to this console\n"
 379                 + se.getMessage());
 380         se.printStackTrace(stderr);
 381       }
 382     }
 383   }
 384
 385   public void unredirectStreams()
 386   {
 387     if (pout != null)
 388     {
 389       try
 390       {
 391         System.setOut(stdout);
 392         pout.flush();
 393         pout.close();
 394         pin = new PipedInputStream();
 395         pout = null;
 396       } catch (java.io.IOException io)
 397       {
 398         textArea.append("Couldn't unredirect STDOUT to this console\n"
 399                 + io.getMessage());
 400         io.printStackTrace(stderr);
 401       } catch (SecurityException se)
 402       {
 403         textArea.append("Couldn't unredirect STDOUT to this console\n"
 404                 + se.getMessage());
 405         se.printStackTrace(stderr);
 406       }
 407
 408       try
 409       {
 410         System.setErr(stderr);
 411         perr.flush();
 412         perr.close();
 413         pin2 = new PipedInputStream();
 414         perr = null;
 415       } catch (java.io.IOException io)
 416       {
 417         textArea.append("Couldn't unredirect STDERR to this console\n"
 418                 + io.getMessage());
 419         io.printStackTrace(stderr);
 420       } catch (SecurityException se)
 421       {
 422         textArea.append("Couldn't unredirect STDERR to this console\n"
 423                 + se.getMessage());
 424         se.printStackTrace(stderr);
 425       }
 426     }
 427   }
 428
 429   public void test()
 430   {
 431     // testing part
 432     // you may omit this part for your application
 433     //
 434
 435     System.out.println("Hello World 2");
 436     System.out.println("All fonts available to Graphic2D:\n");
 437     GraphicsEnvironment ge = GraphicsEnvironment
 438             .getLocalGraphicsEnvironment();
 439     String[] fontNames = ge.getAvailableFontFamilyNames();
 440     for (int n = 0; n < fontNames.length; n++)
 441     {
 442       System.out.println(fontNames[n]);
 443     }
 444     // Testing part: simple an error thrown anywhere in this JVM will be printed
 445     // on the Console
 446     // We do it with a seperate Thread becasue we don't wan't to break a Thread
 447     // used by the Console.
 448     System.out.println("\nLets throw an error on this console");
 449     errorThrower = new Thread(this);
 450     errorThrower.setDaemon(true);
 451     errorThrower.start();
 452   }
 453
 454   private JFrame initFrame(String string, int i, int j, int x, int y)
 455   {
 456     JFrame frame = new JFrame(string);
 457     frame.setName(string);
 458     if (x == -1)
 459     {
 460       x = i / 2;
 461     }
 462     if (y == -1)
 463     {
 464       y = j / 2;
 465     }
 466     frame.setBounds(x, y, i, j);
 467     return frame;
 468   }
 469
 470   /**
 471    * attach a console to the desktop - the desktop will open it if requested.
 472    *
 473    * @param desktop
 474    */
 475   public Console(Desktop desktop)
 476   {
 477     this(desktop, true);
 478   }
 479
 480   /**
 481    * attach a console to the desktop - the desktop will open it if requested.
 482    *
 483    * @param desktop
 484    * @param showjconsole
 485    *          - if true, then redirect stdout immediately
 486    */
 487   public Console(Desktop desktop, boolean showjconsole)
 488   {
 489     parent = desktop;
 490     // window name - get x,y,width, height possibly scaled
 491     Rectangle bounds = desktop.getLastKnownDimensions("JAVA_CONSOLE_");
 492     if (bounds == null)
 493     {
 494       frame = initFrame(
 495               ChannelProperties.getProperty("app_name") + " Java Console",
 496               desktop.getWidth() / 2, desktop.getHeight() / 4,
 497               desktop.getX(), desktop.getY());
 498     }
 499     else
 500     {
 501       frame = initFrame(
 502               ChannelProperties.getProperty("app_name") + " Java Console",
 503               bounds.width, bounds.height, bounds.x, bounds.y);
 504     }
 505     frame.setMinimumSize(new Dimension(MIN_WIDTH, MIN_HEIGHT));
 506     // desktop.add(frame);
 507     initConsole(false);
 508     LogLevel level = (LogLevel) logLevelCombo.getSelectedItem();
 509     if (!Platform.isJS())
 510     {
 511       JalviewAppender jappender = new JalviewAppender(level);
 512       JalviewAppender.setTextArea(textArea);
 513       jappender.start();
 514       if (Cache.log != null && Cache.log instanceof JLoggerLog4j)
 515       {
 516         JLoggerLog4j.addAppender(Cache.log, jappender);
 517       }
 518     }
 519   }
 520
 521   public synchronized void stopConsole()
 522   {
 523     quit = true;
 524     this.notifyAll();
 525     /*
 526      * reader.notify(); reader2.notify(); if (errorThrower!=null)
 527      * errorThrower.notify(); // stop all threads if (textAppender!=null)
 528      * textAppender.notify();
 529      */
 530     if (pout != null)
 531     {
 532       try
 533       {
 534         reader.join(10);
 535         pin.close();
 536       } catch (Exception e)
 537       {
 538       }
 539       try
 540       {
 541         reader2.join(10);
 542         pin2.close();
 543       } catch (Exception e)
 544       {
 545       }
 546       try
 547       {
 548         textAppender.join(10);
 549       } catch (Exception e)
 550       {
 551       }
 552     }
 553     if (!frame.isVisible())
 554     {
 555       frame.dispose();
 556     }
 557     // System.exit(0);
 558   }
 559
 560   @Override
 561   public synchronized void windowClosed(WindowEvent evt)
 562   {
 563     frame.setVisible(false);
 564     closeConsoleGui();
 565   }
 566
 567   private void closeConsoleGui()
 568   {
 569     updateConsole = false;
 570     if (parent == null)
 571     {
 572
 573       stopConsole();
 574     }
 575     else
 576     {
 577       parent.showConsole(false);
 578     }
 579   }
 580
 581   @Override
 582   public synchronized void windowClosing(WindowEvent evt)
 583   {
 584     frame.setVisible(false); // default behaviour of JFrame
 585     closeConsoleGui();
 586
 587     // frame.dispose();
 588   }
 589
 590   @Override
 591   public synchronized void actionPerformed(ActionEvent evt)
 592   {
 593     trimBuffer(true);
 594     // textArea.setText("");
 595   }
 596
 597   @Override
 598   public synchronized void run()
 599   {
 600     try
 601     {
 602       while (Thread.currentThread() == reader)
 603       {
 604         if (pin == null || pin.available() == 0)
 605         {
 606           try
 607           {
 608             this.wait(100);
 609             if (pin.available() == 0)
 610             {
 611               trimBuffer(false);
 612             }
 613           } catch (InterruptedException ie)
 614           {
 615           }
 616         }
 617
 618         while (pin.available() != 0)
 619         {
 620           String input = this.readLine(pin);
 621           stdout.print(input);
 622           long time = System.nanoTime();
 623           appendToTextArea(input);
 624           // stderr.println("Time taken to stdout append:\t"
 625           // + (System.nanoTime() - time) + " ns");
 626           // lines++;
 627         }
 628         if (quit)
 629         {
 630           return;
 631         }
 632       }
 633
 634       while (Thread.currentThread() == reader2)
 635       {
 636         if (pin2.available() == 0)
 637         {
 638           try
 639           {
 640             this.wait(100);
 641             if (pin2.available() == 0)
 642             {
 643               trimBuffer(false);
 644             }
 645           } catch (InterruptedException ie)
 646           {
 647           }
 648         }
 649         while (pin2.available() != 0)
 650         {
 651           String input = this.readLine(pin2);
 652           stderr.print(input);
 653           long time = System.nanoTime();
 654           appendToTextArea(input);
 655           // stderr.println("Time taken to stderr append:\t"
 656           // + (System.nanoTime() - time) + " ns");
 657           // lines++;
 658         }
 659         if (quit)
 660         {
 661           return;
 662         }
 663       }
 664       while (Thread.currentThread() == textAppender)
 665       {
 666         if (updateConsole)
 667         {
 668           // check string buffer - if greater than console, clear console and
 669           // replace with last segment of content, otherwise, append all to
 670           // content.
 671           long count;
 672           while (displayPipe.length() > 0)
 673           {
 674             count = 0;
 675             StringBuffer tmp = new StringBuffer(), replace;
 676             synchronized (displayPipe)
 677             {
 678               replace = displayPipe;
 679               displayPipe = tmp;
 680             }
 681             // simply append whole buffer
 682             textArea.append(replace.toString());
 683             count += replace.length();
 684             if (count > byteslim)
 685             {
 686               trimBuffer(false);
 687             }
 688           }
 689           if (displayPipe.length() == 0)
 690           {
 691             try
 692             {
 693               this.wait(100);
 694               if (displayPipe.length() == 0)
 695               {
 696                 trimBuffer(false);
 697               }
 698             } catch (InterruptedException e)
 699             {
 700             }
 701           }
 702         }
 703         else
 704         {
 705           try
 706           {
 707             this.wait(100);
 708           } catch (InterruptedException e)
 709           {
 710
 711           }
 712         }
 713         if (quit)
 714         {
 715           return;
 716         }
 717
 718       }
 719     } catch (Exception e)
 720     {
 721       textArea.append("\nConsole reports an Internal error.");
 722       textArea.append("The error is: " + e.getMessage());
 723       // Need to uncomment this to ensure that line tally is synched.
 724       // lines += 2;
 725       stderr.println(
 726               "Console reports an Internal error.\nThe error is: " + e);
 727     }
 728
 729     // just for testing (Throw a Nullpointer after 1 second)
 730     if (Thread.currentThread() == errorThrower)
 731     {
 732       try
 733       {
 734         this.wait(1000);
 735       } catch (InterruptedException ie)
 736       {
 737       }
 738       throw new NullPointerException(
 739               MessageManager.getString("exception.application_test_npe"));
 740     }
 741   }
 742
 743   private void appendToTextArea(final String input)
 744   {
 745     if (updateConsole == false)
 746     {
 747       // do nothing;
 748       return;
 749     }
 750     long time = System.nanoTime();
 751     javax.swing.SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()
 752     {
 753       @Override
 754       public void run()
 755       {
 756         displayPipe.append(input); // change to stringBuffer
 757         // displayPipe.flush();
 758
 759       }
 760     });
 761     // stderr.println("Time taken to Spawnappend:\t" + (System.nanoTime() -
 762     // time)
 763     // + " ns");
 764   }
 765
 766   private String header = null;
 767
 768   private boolean updateConsole = false;
 769
 770   private synchronized void trimBuffer(boolean clear)
 771   {
 772     if (header == null && textArea.getLineCount() > 5)
 773     {
 774       try
 775       {
 776         header = textArea.getText(0, textArea.getLineStartOffset(5))
 777                 + "\nTruncated...\n";
 778       } catch (Exception e)
 779       {
 780         e.printStackTrace();
 781       }
 782     }
 783     // trim the buffer
 784     int tlength = textArea.getDocument().getLength();
 785     if (header != null)
 786     {
 787       if (clear || (tlength > byteslim))
 788       {
 789         try
 790         {
 791           if (!clear)
 792           {
 793             long time = System.nanoTime();
 794             textArea.replaceRange(header, 0, tlength - bytescut);
 795             // stderr.println("Time taken to cut:\t"
 796             // + (System.nanoTime() - time) + " ns");
 797           }
 798           else
 799           {
 800             textArea.setText(header);
 801           }
 802         } catch (Exception e)
 803         {
 804           e.printStackTrace();
 805         }
 806         // lines = textArea.getLineCount();
 807       }
 808     }
 809
 810   }
 811
 812   public synchronized String readLine(PipedInputStream in)
 813           throws IOException
 814   {
 815     String input = "";
 816     int lp = -1;
 817     do
 818     {
 819       int available = in.available();
 820       if (available == 0)
 821       {
 822         break;
 823       }
 824       byte b[] = new byte[available];
 825       in.read(b);
 826       input = input + new String(b, 0, b.length);
 827       // counts lines - we don't do this for speed.
 828       // while ((lp = input.indexOf("\n", lp + 1)) > -1)
 829       // {
 830       // lines++;
 831       // }
 832     } while (!input.endsWith("\n") && !input.endsWith("\r\n") && !quit);
 833     return input;
 834   }
 835
 836   /**
 837    * @j2sIgnore
 838    * @param arg
 839    */
 840   public static void main(String[] arg)
 841   {
 842     new Console().test(); // create console with not reference
 843
 844   }
 845
 846   public void setVisible(boolean selected)
 847   {
 848     frame.setVisible(selected);
 849     if (selected == true)
 850     {
 851       setChosenLogLevelCombo();
 852       redirectStreams();
 853       updateConsole = true;
 854       frame.toFront();
 855     }
 856     else
 857     {
 858       // reset log level to what it was before
 859       if (Cache.log != null)
 860       {
 861         Cache.log.setLevel(startingLogLevel);
 862       }
 863
 864       unredirectStreams();
 865       updateConsole = false;
 866     }
 867   }
 868
 869   public Rectangle getBounds()
 870   {
 871     if (frame != null)
 872     {
 873       return frame.getBounds();
 874     }
 875     return null;
 876   }
 877
 878   /**
 879    * set the banner that appears at the top of the console output
 880    *
 881    * @param string
 882    */
 883   public void setHeader(String string)
 884   {
 885     header = string;
 886     if (header.charAt(header.length() - 1) != '\n')
 887     {
 888       header += "\n";
 889     }
 890     textArea.insert(header, 0);
 891   }
 892
 893   /**
 894    * get the banner
 895    *
 896    * @return
 897    */
 898   public String getHeader()
 899   {
 900     return header;
 901   }
 902 }