src/jalview/gui/CutAndPasteTransfer.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  */
  18 package jalview.gui;
  19
  20 import java.awt.*;
  21 import java.awt.datatransfer.*;
  22 import java.awt.event.*;
  23 import javax.swing.*;
  24
  25 import jalview.datamodel.*;
  26 import jalview.io.*;
  27 import jalview.jbgui.*;
  28
  29 /**
  30  * DOCUMENT ME!
  31  *
  32  * @author $author$
  33  * @version $Revision$
  34  */
  35 public class CutAndPasteTransfer extends GCutAndPasteTransfer
  36 {
  37
  38   AlignViewport viewport;
  39
  40   public CutAndPasteTransfer()
  41   {
  42     SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()
  43     {
  44       public void run()
  45       {
  46         textarea.requestFocus();
  47       }
  48     });
  49
  50   }
  51
  52   /**
  53    * DOCUMENT ME!
  54    */
  55   public void setForInput(AlignViewport viewport)
  56   {
  57     this.viewport = viewport;
  58     if (viewport != null)
  59     {
  60       ok.setText("Add");
  61     }
  62
  63     getContentPane().add(inputButtonPanel, java.awt.BorderLayout.SOUTH);
  64   }
  65
  66   /**
  67    * DOCUMENT ME!
  68    *
  69    * @return DOCUMENT ME!
  70    */
  71   public String getText()
  72   {
  73     return textarea.getText();
  74   }
  75
  76   /**
  77    * DOCUMENT ME!
  78    *
  79    * @param text
  80    *          DOCUMENT ME!
  81    */
  82   public void setText(String text)
  83   {
  84     textarea.setText(text);
  85   }
  86
  87   public void appendText(String text)
  88   {
  89     textarea.append(text);
  90   }
  91
  92   public void save_actionPerformed(ActionEvent e)
  93   {
  94     JalviewFileChooser chooser = new JalviewFileChooser(
  95             jalview.bin.Cache.getProperty("LAST_DIRECTORY"));
  96
  97     chooser.setAcceptAllFileFilterUsed(false);
  98     chooser.setFileView(new JalviewFileView());
  99     chooser.setDialogTitle("Save Text to File");
 100     chooser.setToolTipText("Save");
 101
 102     int value = chooser.showSaveDialog(this);
 103
 104     if (value == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION)
 105     {
 106       try
 107       {
 108         java.io.PrintWriter out = new java.io.PrintWriter(
 109                 new java.io.FileWriter(chooser.getSelectedFile()));
 110
 111         out.print(getText());
 112         out.close();
 113       } catch (Exception ex)
 114       {
 115         ex.printStackTrace();
 116       }
 117
 118     }
 119   }
 120
 121   /**
 122    * DOCUMENT ME!
 123    *
 124    * @param e
 125    *          DOCUMENT ME!
 126    */
 127   public void copyItem_actionPerformed(ActionEvent e)
 128   {
 129     textarea.getSelectedText();
 130     Clipboard c = Toolkit.getDefaultToolkit().getSystemClipboard();
 131     c.setContents(new StringSelection(textarea.getSelectedText()), null);
 132   }
 133
 134   /**
 135    * DOCUMENT ME!
 136    *
 137    * @param e
 138    *          DOCUMENT ME!
 139    */
 140   public void pasteMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
 141   {
 142     Clipboard c = Toolkit.getDefaultToolkit().getSystemClipboard();
 143     Transferable contents = c.getContents(this);
 144
 145     if (contents == null)
 146     {
 147       return;
 148     }
 149
 150     try
 151     {
 152       textarea.append((String) contents
 153               .getTransferData(DataFlavor.stringFlavor));
 154     } catch (Exception ex)
 155     {
 156     }
 157   }
 158
 159   /**
 160    * DOCUMENT ME!
 161    *
 162    * @param e
 163    *          DOCUMENT ME!
 164    */
 165   public void ok_actionPerformed(ActionEvent e)
 166   {
 167     String format = new IdentifyFile().Identify(getText(), "Paste");
 168     // TODO: identify feature, annotation or tree file and parse appropriately.
 169     Alignment al = null;
 170
 171     if (FormatAdapter.isValidFormat(format))
 172     {
 173       try
 174       {
 175         al = new FormatAdapter().readFile(getText(), "Paste", format);
 176       } catch (java.io.IOException ex)
 177       {
 178         JOptionPane.showInternalMessageDialog(Desktop.desktop,
 179                 "Couldn't read the pasted text.\n" + ex.toString(),
 180                 "Error parsing text", JOptionPane.WARNING_MESSAGE);
 181       }
 182     }
 183
 184     if (al != null)
 185     {
 186       if (viewport != null)
 187       {
 188         for (int i = 0; i < al.getHeight(); i++)
 189         {
 190           viewport.getAlignment().addSequence(al.getSequenceAt(i));
 191         }
 192
 193         viewport.firePropertyChange("alignment", null, viewport
 194                 .getAlignment().getSequences());
 195       }
 196       else
 197       {
 198         AlignFrame af = new AlignFrame(al, AlignFrame.DEFAULT_WIDTH,
 199                 AlignFrame.DEFAULT_HEIGHT);
 200         af.currentFileFormat = format;
 201         Desktop.addInternalFrame(af, "Cut & Paste input - " + format,
 202                 AlignFrame.DEFAULT_WIDTH, AlignFrame.DEFAULT_HEIGHT);
 203         af.statusBar.setText("Successfully pasted alignment file");
 204
 205         try
 206         {
 207           af.setMaximum(jalview.bin.Cache.getDefault("SHOW_FULLSCREEN",
 208                   false));
 209         } catch (Exception ex)
 210         {
 211         }
 212       }
 213     }
 214   }
 215
 216   /**
 217    * DOCUMENT ME!
 218    *
 219    * @param e
 220    *          DOCUMENT ME!
 221    */
 222   public void cancel_actionPerformed(ActionEvent e)
 223   {
 224     try
 225     {
 226       this.setClosed(true);
 227     } catch (Exception ex)
 228     {
 229     }
 230   }
 231
 232   public void textarea_mousePressed(MouseEvent e)
 233   {
 234     if (SwingUtilities.isRightMouseButton(e))
 235     {
 236       JPopupMenu popup = new JPopupMenu("Edit");
 237       JMenuItem item = new JMenuItem("Copy");
 238       item.addActionListener(new ActionListener()
 239       {
 240         public void actionPerformed(ActionEvent e)
 241         {
 242           copyItem_actionPerformed(e);
 243         }
 244       });
 245       popup.add(item);
 246       item = new JMenuItem("Paste");
 247       item.addActionListener(new ActionListener()
 248       {
 249         public void actionPerformed(ActionEvent e)
 250         {
 251           pasteMenu_actionPerformed(e);
 252         }
 253       });
 254       popup.add(item);
 255       popup.show(this, e.getX() + 10, e.getY() + textarea.getY() + 40);
 256
 257     }
 258   }
 259
 260 }