src/jalview/gui/CutAndPasteTransfer.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.gui;
  22
  23 import jalview.datamodel.Alignment;
  24 import jalview.io.FileParse;
  25 import jalview.io.FormatAdapter;
  26 import jalview.io.HtmlFile;
  27 import jalview.io.IdentifyFile;
  28 import jalview.io.JSONFile;
  29 import jalview.io.JalviewFileChooser;
  30 import jalview.io.JalviewFileView;
  31 import jalview.jbgui.GCutAndPasteTransfer;
  32 import jalview.util.MessageManager;
  33
  34 import java.awt.Toolkit;
  35 import java.awt.datatransfer.Clipboard;
  36 import java.awt.datatransfer.DataFlavor;
  37 import java.awt.datatransfer.StringSelection;
  38 import java.awt.datatransfer.Transferable;
  39 import java.awt.event.ActionEvent;
  40 import java.awt.event.ActionListener;
  41 import java.awt.event.MouseEvent;
  42
  43 import javax.swing.JMenuItem;
  44 import javax.swing.JOptionPane;
  45 import javax.swing.JPopupMenu;
  46 import javax.swing.SwingUtilities;
  47
  48 /**
  49  * Cut'n'paste files into the desktop See JAL-1105
  50  *
  51  * @author $author$
  52  * @version $Revision$
  53  */
  54 public class CutAndPasteTransfer extends GCutAndPasteTransfer
  55 {
  56
  57   AlignViewport viewport;
  58
  59   FileParse source = null;
  60   public CutAndPasteTransfer()
  61   {
  62     SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()
  63     {
  64       public void run()
  65       {
  66         textarea.requestFocus();
  67       }
  68     });
  69
  70   }
  71
  72   /**
  73    * DOCUMENT ME!
  74    */
  75   public void setForInput(AlignViewport viewport)
  76   {
  77     this.viewport = viewport;
  78     if (viewport != null)
  79     {
  80       ok.setText(MessageManager.getString("action.add"));
  81     }
  82
  83     getContentPane().add(inputButtonPanel, java.awt.BorderLayout.SOUTH);
  84   }
  85
  86   /**
  87    * DOCUMENT ME!
  88    *
  89    * @return DOCUMENT ME!
  90    */
  91   public String getText()
  92   {
  93     return textarea.getText();
  94   }
  95
  96   /**
  97    * DOCUMENT ME!
  98    *
  99    * @param text
 100    *          DOCUMENT ME!
 101    */
 102   public void setText(String text)
 103   {
 104     textarea.setText(text);
 105   }
 106
 107   public void appendText(String text)
 108   {
 109     textarea.append(text);
 110   }
 111
 112   public void save_actionPerformed(ActionEvent e)
 113   {
 114     JalviewFileChooser chooser = new JalviewFileChooser(
 115             jalview.bin.Cache.getProperty("LAST_DIRECTORY"));
 116
 117     chooser.setAcceptAllFileFilterUsed(false);
 118     chooser.setFileView(new JalviewFileView());
 119     chooser.setDialogTitle(MessageManager.getString("label.save_text_to_file"));
 120     chooser.setToolTipText(MessageManager.getString("action.save"));
 121
 122     int value = chooser.showSaveDialog(this);
 123
 124     if (value == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION)
 125     {
 126       try
 127       {
 128         java.io.PrintWriter out = new java.io.PrintWriter(
 129                 new java.io.FileWriter(chooser.getSelectedFile()));
 130
 131         out.print(getText());
 132         out.close();
 133       } catch (Exception ex)
 134       {
 135         ex.printStackTrace();
 136       }
 137
 138     }
 139   }
 140
 141   /**
 142    * DOCUMENT ME!
 143    *
 144    * @param e
 145    *          DOCUMENT ME!
 146    */
 147   public void copyItem_actionPerformed(ActionEvent e)
 148   {
 149     textarea.getSelectedText();
 150     Clipboard c = Toolkit.getDefaultToolkit().getSystemClipboard();
 151     c.setContents(new StringSelection(textarea.getSelectedText()), null);
 152   }
 153
 154   /**
 155    * DOCUMENT ME!
 156    *
 157    * @param e
 158    *          DOCUMENT ME!
 159    */
 160   public void pasteMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
 161   {
 162     Clipboard c = Toolkit.getDefaultToolkit().getSystemClipboard();
 163     Transferable contents = c.getContents(this);
 164
 165     if (contents == null)
 166     {
 167       return;
 168     }
 169
 170     try
 171     {
 172       textarea.append((String) contents
 173               .getTransferData(DataFlavor.stringFlavor));
 174     } catch (Exception ex)
 175     {
 176     }
 177   }
 178
 179   /**
 180    * DOCUMENT ME!
 181    *
 182    * @param e
 183    *          DOCUMENT ME!
 184    */
 185   public void ok_actionPerformed(ActionEvent e)
 186   {
 187     String format = new IdentifyFile().Identify(getText(), "Paste");
 188     // TODO: identify feature, annotation or tree file and parse appropriately.
 189     Alignment al = null;
 190
 191     if (FormatAdapter.isValidFormat(format))
 192     {
 193       try
 194       {
 195         FormatAdapter fa = new FormatAdapter(viewport);
 196         al = fa.readFile(getText(), "Paste", format);
 197         source = fa.getAlignFile();
 198
 199       } catch (java.io.IOException ex)
 200       {
 201         JOptionPane.showInternalMessageDialog(Desktop.desktop,
 202                 MessageManager.formatMessage(
 203                         "label.couldnt_read_pasted_text", new String[]
 204                         { ex.toString() }), MessageManager
 205                         .getString("label.error_parsing_text"),
 206                 JOptionPane.WARNING_MESSAGE);
 207       }
 208     }
 209
 210     if (al != null)
 211     {
 212       String title = MessageManager.formatMessage(
 213               "label.input_cut_paste_params", new String[]
 214               { format });
 215       if (viewport != null)
 216       {
 217         viewport.addAlignment(al, title);
 218       }
 219       else
 220       {
 221         AlignFrame af = new AlignFrame(al, AlignFrame.DEFAULT_WIDTH,
 222                 AlignFrame.DEFAULT_HEIGHT);
 223         af.currentFileFormat = format;
 224         Desktop.addInternalFrame(af, title, AlignFrame.DEFAULT_WIDTH,
 225                 AlignFrame.DEFAULT_HEIGHT);
 226         af.statusBar.setText(MessageManager
 227                 .getString("label.successfully_pasted_alignment_file"));
 228
 229         if (source instanceof HtmlFile)
 230         {
 231           ((HtmlFile) source).applySettingsToAlignmentView(af);
 232         }
 233         else if (source instanceof JSONFile)
 234         {
 235           ((JSONFile) source).applySettingsToAlignmentView(af);
 236         }
 237
 238
 239         try
 240         {
 241           af.setMaximum(jalview.bin.Cache.getDefault("SHOW_FULLSCREEN",
 242                   false));
 243         } catch (Exception ex)
 244         {
 245         }
 246       }
 247     }
 248   }
 249
 250
 251   /**
 252    * DOCUMENT ME!
 253    *
 254    * @param e
 255    *          DOCUMENT ME!
 256    */
 257   public void cancel_actionPerformed(ActionEvent e)
 258   {
 259     try
 260     {
 261       this.setClosed(true);
 262     } catch (Exception ex)
 263     {
 264     }
 265   }
 266
 267   public void textarea_mousePressed(MouseEvent e)
 268   {
 269     if (SwingUtilities.isRightMouseButton(e))
 270     {
 271       JPopupMenu popup = new JPopupMenu(
 272               MessageManager.getString("action.edit"));
 273       JMenuItem item = new JMenuItem(
 274               MessageManager.getString("action.copy"));
 275       item.addActionListener(new ActionListener()
 276       {
 277         public void actionPerformed(ActionEvent e)
 278         {
 279           copyItem_actionPerformed(e);
 280         }
 281       });
 282       popup.add(item);
 283       item = new JMenuItem(MessageManager.getString("action.paste"));
 284       item.addActionListener(new ActionListener()
 285       {
 286         public void actionPerformed(ActionEvent e)
 287         {
 288           pasteMenu_actionPerformed(e);
 289         }
 290       });
 291       popup.add(item);
 292       popup.show(this, e.getX() + 10, e.getY() + textarea.getY() + 40);
 293
 294     }
 295   }
 296
 297 }