src/jalview/gui/CutAndPasteTransfer.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.0b1)
   3  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  18  */
  19 package jalview.gui;
  20
  21 import java.awt.*;
  22 import java.awt.datatransfer.*;
  23 import java.awt.event.*;
  24 import javax.swing.*;
  25
  26 import jalview.datamodel.*;
  27 import jalview.io.*;
  28 import jalview.jbgui.*;
  29
  30 /**
  31  * Cut'n'paste files into the desktop See JAL-1105
  32  *
  33  * @author $author$
  34  * @version $Revision$
  35  */
  36 public class CutAndPasteTransfer extends GCutAndPasteTransfer
  37 {
  38
  39   AlignViewport viewport;
  40
  41   public CutAndPasteTransfer()
  42   {
  43     SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()
  44     {
  45       public void run()
  46       {
  47         textarea.requestFocus();
  48       }
  49     });
  50
  51   }
  52
  53   /**
  54    * DOCUMENT ME!
  55    */
  56   public void setForInput(AlignViewport viewport)
  57   {
  58     this.viewport = viewport;
  59     if (viewport != null)
  60     {
  61       ok.setText("Add");
  62     }
  63
  64     getContentPane().add(inputButtonPanel, java.awt.BorderLayout.SOUTH);
  65   }
  66
  67   /**
  68    * DOCUMENT ME!
  69    *
  70    * @return DOCUMENT ME!
  71    */
  72   public String getText()
  73   {
  74     return textarea.getText();
  75   }
  76
  77   /**
  78    * DOCUMENT ME!
  79    *
  80    * @param text
  81    *          DOCUMENT ME!
  82    */
  83   public void setText(String text)
  84   {
  85     textarea.setText(text);
  86   }
  87
  88   public void appendText(String text)
  89   {
  90     textarea.append(text);
  91   }
  92
  93   public void save_actionPerformed(ActionEvent e)
  94   {
  95     JalviewFileChooser chooser = new JalviewFileChooser(
  96             jalview.bin.Cache.getProperty("LAST_DIRECTORY"));
  97
  98     chooser.setAcceptAllFileFilterUsed(false);
  99     chooser.setFileView(new JalviewFileView());
 100     chooser.setDialogTitle("Save Text to File");
 101     chooser.setToolTipText("Save");
 102
 103     int value = chooser.showSaveDialog(this);
 104
 105     if (value == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION)
 106     {
 107       try
 108       {
 109         java.io.PrintWriter out = new java.io.PrintWriter(
 110                 new java.io.FileWriter(chooser.getSelectedFile()));
 111
 112         out.print(getText());
 113         out.close();
 114       } catch (Exception ex)
 115       {
 116         ex.printStackTrace();
 117       }
 118
 119     }
 120   }
 121
 122   /**
 123    * DOCUMENT ME!
 124    *
 125    * @param e
 126    *          DOCUMENT ME!
 127    */
 128   public void copyItem_actionPerformed(ActionEvent e)
 129   {
 130     textarea.getSelectedText();
 131     Clipboard c = Toolkit.getDefaultToolkit().getSystemClipboard();
 132     c.setContents(new StringSelection(textarea.getSelectedText()), null);
 133   }
 134
 135   /**
 136    * DOCUMENT ME!
 137    *
 138    * @param e
 139    *          DOCUMENT ME!
 140    */
 141   public void pasteMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
 142   {
 143     Clipboard c = Toolkit.getDefaultToolkit().getSystemClipboard();
 144     Transferable contents = c.getContents(this);
 145
 146     if (contents == null)
 147     {
 148       return;
 149     }
 150
 151     try
 152     {
 153       textarea.append((String) contents
 154               .getTransferData(DataFlavor.stringFlavor));
 155     } catch (Exception ex)
 156     {
 157     }
 158   }
 159
 160   /**
 161    * DOCUMENT ME!
 162    *
 163    * @param e
 164    *          DOCUMENT ME!
 165    */
 166   public void ok_actionPerformed(ActionEvent e)
 167   {
 168     String format = new IdentifyFile().Identify(getText(), "Paste");
 169     // TODO: identify feature, annotation or tree file and parse appropriately.
 170     Alignment al = null;
 171
 172     if (FormatAdapter.isValidFormat(format))
 173     {
 174       try
 175       {
 176         al = new FormatAdapter().readFile(getText(), "Paste", format);
 177       } catch (java.io.IOException ex)
 178       {
 179         JOptionPane.showInternalMessageDialog(Desktop.desktop,
 180                 "Couldn't read the pasted text.\n" + ex.toString(),
 181                 "Error parsing text", JOptionPane.WARNING_MESSAGE);
 182       }
 183     }
 184
 185     if (al != null)
 186     {
 187       if (viewport != null)
 188       {
 189         for (int i = 0; i < al.getHeight(); i++)
 190         {
 191           viewport.getAlignment().addSequence(al.getSequenceAt(i));
 192         }
 193
 194         viewport.firePropertyChange("alignment", null, viewport
 195                 .getAlignment().getSequences());
 196       }
 197       else
 198       {
 199         AlignFrame af = new AlignFrame(al, AlignFrame.DEFAULT_WIDTH,
 200                 AlignFrame.DEFAULT_HEIGHT);
 201         af.currentFileFormat = format;
 202         Desktop.addInternalFrame(af, "Cut & Paste input - " + format,
 203                 AlignFrame.DEFAULT_WIDTH, AlignFrame.DEFAULT_HEIGHT);
 204         af.statusBar.setText("Successfully pasted alignment file");
 205
 206         try
 207         {
 208           af.setMaximum(jalview.bin.Cache.getDefault("SHOW_FULLSCREEN",
 209                   false));
 210         } catch (Exception ex)
 211         {
 212         }
 213       }
 214     }
 215   }
 216
 217   /**
 218    * DOCUMENT ME!
 219    *
 220    * @param e
 221    *          DOCUMENT ME!
 222    */
 223   public void cancel_actionPerformed(ActionEvent e)
 224   {
 225     try
 226     {
 227       this.setClosed(true);
 228     } catch (Exception ex)
 229     {
 230     }
 231   }
 232
 233   public void textarea_mousePressed(MouseEvent e)
 234   {
 235     if (SwingUtilities.isRightMouseButton(e))
 236     {
 237       JPopupMenu popup = new JPopupMenu("Edit");
 238       JMenuItem item = new JMenuItem("Copy");
 239       item.addActionListener(new ActionListener()
 240       {
 241         public void actionPerformed(ActionEvent e)
 242         {
 243           copyItem_actionPerformed(e);
 244         }
 245       });
 246       popup.add(item);
 247       item = new JMenuItem("Paste");
 248       item.addActionListener(new ActionListener()
 249       {
 250         public void actionPerformed(ActionEvent e)
 251         {
 252           pasteMenu_actionPerformed(e);
 253         }
 254       });
 255       popup.add(item);
 256       popup.show(this, e.getX() + 10, e.getY() + textarea.getY() + 40);
 257
 258     }
 259   }
 260
 261 }