src/jalview/gui/CutAndPasteTransfer.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.gui;\r
  20 \r
  21 import jalview.datamodel.*;\r
  22 \r
  23 import jalview.io.*;\r
  24 \r
  25 import jalview.jbgui.*;\r
  26 \r
  27 import java.awt.*;\r
  28 import java.awt.datatransfer.*;\r
  29 import java.awt.event.*;\r
  30 \r
  31 import javax.swing.*;\r
  32 \r
  33 \r
  34 /**\r
  35  * DOCUMENT ME!\r
  36  *\r
  37  * @author $author$\r
  38  * @version $Revision$\r
  39  */\r
  40 public class CutAndPasteTransfer extends GCutAndPasteTransfer\r
  41 {\r
  42 \r
  43   AlignViewport viewport;\r
  44 \r
  45   public CutAndPasteTransfer()\r
  46   {\r
  47     SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()\r
  48     {\r
  49       public void run()\r
  50       {\r
  51         textarea.requestFocus();\r
  52       }\r
  53     });\r
  54 \r
  55   }\r
  56 \r
  57     /**\r
  58      * DOCUMENT ME!\r
  59      */\r
  60     public void setForInput(AlignViewport viewport)\r
  61     {\r
  62       this.viewport = viewport;\r
  63       getContentPane().add(inputButtonPanel, java.awt.BorderLayout.SOUTH);\r
  64     }\r
  65 \r
  66     /**\r
  67      * DOCUMENT ME!\r
  68      *\r
  69      * @return DOCUMENT ME!\r
  70      */\r
  71     public String getText()\r
  72     {\r
  73         return textarea.getText();\r
  74     }\r
  75 \r
  76     /**\r
  77      * DOCUMENT ME!\r
  78      *\r
  79      * @param text DOCUMENT ME!\r
  80      */\r
  81     public void setText(String text)\r
  82     {\r
  83         textarea.setText(text);\r
  84     }\r
  85 \r
  86     public void appendText(String text)\r
  87     {\r
  88       textarea.append(text);\r
  89     }\r
  90 \r
  91     /**\r
  92      * DOCUMENT ME!\r
  93      *\r
  94      * @param e DOCUMENT ME!\r
  95      */\r
  96     public void copyItem_actionPerformed(ActionEvent e)\r
  97     {\r
  98         textarea.getSelectedText();\r
  99         Clipboard c = Toolkit.getDefaultToolkit().getSystemClipboard();\r
 100         c.setContents(new StringSelection(textarea.getSelectedText()), null);\r
 101     }\r
 102 \r
 103     /**\r
 104      * DOCUMENT ME!\r
 105      *\r
 106      * @param e DOCUMENT ME!\r
 107      */\r
 108     public void pasteMenu_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 109     {\r
 110         Clipboard c = Toolkit.getDefaultToolkit().getSystemClipboard();\r
 111         Transferable contents = c.getContents(this);\r
 112 \r
 113         if (contents == null)\r
 114         {\r
 115             return;\r
 116         }\r
 117 \r
 118         try\r
 119         {\r
 120             textarea.append((String) contents.getTransferData(\r
 121                     DataFlavor.stringFlavor));\r
 122         }\r
 123         catch (Exception ex)\r
 124         {\r
 125         }\r
 126     }\r
 127 \r
 128     /**\r
 129      * DOCUMENT ME!\r
 130      *\r
 131      * @param e DOCUMENT ME!\r
 132      */\r
 133     public void ok_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 134     {\r
 135         String format = new IdentifyFile().Identify(getText(), "Paste");\r
 136         SequenceI[] sequences = null;\r
 137 \r
 138         if (FormatAdapter.formats.contains(format))\r
 139         {\r
 140           try{\r
 141             sequences = new FormatAdapter().readFile(getText(), "Paste", format);\r
 142           }catch(java.io.IOException ex)\r
 143           {\r
 144             JOptionPane.showInternalMessageDialog(Desktop.desktop,\r
 145                                                   "Couldn't read the pasted text.\n" +ex.toString(),\r
 146                                                   "Error parsing text",\r
 147                                                   JOptionPane.WARNING_MESSAGE);\r
 148           }\r
 149         }\r
 150 \r
 151         if (sequences != null)\r
 152         {\r
 153           if(viewport!=null)\r
 154           {\r
 155             for(int i=0; i<sequences.length; i++)\r
 156               viewport.getAlignment().addSequence(sequences[i]);\r
 157 \r
 158             viewport.firePropertyChange("alignment", null, viewport.getAlignment().getSequences());\r
 159           }\r
 160           else\r
 161           {\r
 162             AlignFrame af = new AlignFrame(new Alignment(sequences));\r
 163             af.currentFileFormat = format;\r
 164             Desktop.addInternalFrame(af, "Cut & Paste input - " + format,\r
 165                                      AlignFrame.NEW_WINDOW_WIDTH,\r
 166                                      AlignFrame.NEW_WINDOW_HEIGHT);\r
 167             af.statusBar.setText("Successfully pasted alignment file");\r
 168 \r
 169             try\r
 170             {\r
 171               af.setMaximum(jalview.bin.Cache.getDefault("SHOW_FULLSCREEN", false));\r
 172             }\r
 173             catch (Exception ex)\r
 174             {\r
 175             }\r
 176 \r
 177           }\r
 178             try\r
 179             {\r
 180                 this.setClosed(true);\r
 181             }\r
 182             catch (Exception ex)\r
 183             {\r
 184             }\r
 185         }\r
 186     }\r
 187 \r
 188     /**\r
 189      * DOCUMENT ME!\r
 190      *\r
 191      * @param e DOCUMENT ME!\r
 192      */\r
 193     public void cancel_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 194     {\r
 195         try\r
 196         {\r
 197             this.setClosed(true);\r
 198         }\r
 199         catch (Exception ex)\r
 200         {\r
 201         }\r
 202     }\r
 203 \r
 204     public void textarea_mousePressed(MouseEvent e)\r
 205     {\r
 206       if(SwingUtilities.isRightMouseButton(e))\r
 207       {\r
 208         JPopupMenu popup = new JPopupMenu("Edit");\r
 209         JMenuItem item = new JMenuItem("Copy");\r
 210         item.addActionListener(new ActionListener()\r
 211             {public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 212                   {\r
 213                     copyItem_actionPerformed(e);\r
 214                   }\r
 215             });\r
 216         popup.add(item);\r
 217         item = new JMenuItem("Paste");\r
 218         item.addActionListener(new ActionListener()\r
 219             {public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 220                   {\r
 221                     pasteMenu_actionPerformed(e);\r
 222                   }\r
 223             });\r
 224         popup.add(item);\r
 225         popup.show(this, e.getX()+10, e.getY()+textarea.getY()+40);\r
 226 \r
 227       }\r
 228     }\r
 229 \r
 230 }\r