src/jalview/gui/IdCanvas.java

   1 package jalview.gui;\r
   2 \r
   3 import java.awt.*;\r
   4 import java.awt.Graphics2D.*;\r
   5 \r
   6 import javax.swing.*;\r
   7 import jalview.datamodel.*;\r
   8 import jalview.analysis.*;\r
   9 public class IdCanvas extends JPanel\r
  10 {\r
  11   protected AlignViewport av;\r
  12 \r
  13   protected boolean showScores  = true;\r
  14 \r
  15   protected int     maxIdLength = -1;\r
  16   protected String  maxIdStr    = null;\r
  17 \r
  18   public IdCanvas(AlignViewport av)\r
  19   {\r
  20     setLayout(new BorderLayout());\r
  21     this.av         = av;\r
  22     PaintRefresher.Register(this);\r
  23   }\r
  24 \r
  25   public void drawIdString(Graphics gg,SequenceI s,int i, int starty, int ypos) {\r
  26       int charHeight = av.getCharHeight();\r
  27 \r
  28 \r
  29       if (av.getSelectionGroup()!=null && av.getSelectionGroup().sequences.contains(s)) {\r
  30           gg.setColor(Color.lightGray);\r
  31           gg.fillRect(0,AlignmentUtil.getPixelHeight(starty,i,charHeight)+ ypos,getWidth(),charHeight);\r
  32           gg.setColor(Color.white);\r
  33       } else {\r
  34           gg.setColor(s.getColor());\r
  35           gg.fillRect(0,AlignmentUtil.getPixelHeight(starty,i,charHeight)+ ypos,getWidth(),charHeight);\r
  36           gg.setColor(Color.black);\r
  37       }\r
  38 \r
  39       String string = s.getName() + "/" + s.getStart() + "-" + s.getEnd();\r
  40 \r
  41       gg.drawString(string,0,AlignmentUtil.getPixelHeight(starty,i,charHeight) + ypos + charHeight-   (charHeight/5));\r
  42 \r
  43   }\r
  44 \r
  45   public void paintComponent(Graphics gg) {\r
  46     AlignmentI al         = av.alignment;\r
  47     int        charHeight = av.charHeight;\r
  48     gg.setFont(av.getFont());\r
  49 \r
  50     //Fill in the background\r
  51     gg.setColor(Color.white);\r
  52     gg.fillRect(0,0,getWidth(),getHeight());\r
  53 \r
  54     Color currentColor     = Color.white;\r
  55     Color currentTextColor = Color.black;\r
  56 \r
  57     //Which ids are we printing\r
  58     int starty = av.getStartSeq();\r
  59     int endy   = av.endSeq;\r
  60 \r
  61     if (av.getWrapAlignment())\r
  62     {\r
  63           // Draw the rest of the panels\r
  64           int chunkHeight =  (al.getHeight() + 2)*av.charHeight;\r
  65           int row = av.getStartRes() / av.chunkWidth ;\r
  66           for(int ypos=2*av.charHeight;\r
  67               ypos <= getHeight() && row*av.chunkWidth<al.getWidth();\r
  68               ypos += chunkHeight, row++ )\r
  69           {\r
  70             for (int i = starty; i < av.alignment.getHeight(); i++)\r
  71             {\r
  72               SequenceI s = al.getSequenceAt(i);\r
  73               drawIdString(gg, s, i, 0, ypos);\r
  74             }\r
  75           }\r
  76 \r
  77 \r
  78     } else\r
  79     {\r
  80 \r
  81       //Now draw the id strings\r
  82       for (int i = starty; i < endy; i++)\r
  83       {\r
  84         // Selected sequence colours\r
  85 \r
  86         if (av.getSelectionGroup()!= null && av.getSelectionGroup().sequences.contains(al.getSequenceAt(i)))\r
  87         {\r
  88        //   if(av.alignment.findGroup(al.getSequenceAt(i)).getEndRes()==\r
  89           currentColor = Color.lightGray;\r
  90           currentTextColor = Color.black;\r
  91         }\r
  92         else\r
  93         {\r
  94           currentColor = al.getSequenceAt(i).getColor();\r
  95           currentTextColor = Color.black;\r
  96         }\r
  97 \r
  98         gg.setColor(currentColor);\r
  99 \r
 100         gg.fillRect(0,\r
 101                     AlignmentUtil.getPixelHeight(starty, i, charHeight),\r
 102                     getWidth(),\r
 103                     charHeight);\r
 104 \r
 105         gg.setColor(currentTextColor);\r
 106         String string = al.getSequenceAt(i).getDisplayId();\r
 107         gg.drawString(string, 0,\r
 108                       AlignmentUtil.getPixelHeight(starty, i, charHeight) +\r
 109                       charHeight - (charHeight / 5));\r
 110       }\r
 111     }\r
 112 \r
 113   }\r
 114 \r
 115 \r
 116   public Dimension getLabelWidth()\r
 117   {\r
 118     if(getGraphics()==null)\r
 119       return null;\r
 120 \r
 121    FontMetrics fm = this.getGraphics().getFontMetrics(av.font);\r
 122    AlignmentI al = av.getAlignment();\r
 123 \r
 124    int i   = 0;\r
 125    int idWidth = 0;\r
 126 \r
 127    while (i < al.getHeight() && al.getSequenceAt(i) != null)\r
 128    {\r
 129      SequenceI s   = al.getSequenceAt(i);\r
 130      String str   = s.getDisplayId();\r
 131      if (fm.stringWidth(str) > idWidth)\r
 132        idWidth = fm.stringWidth(str);\r
 133      i++;\r
 134    }\r
 135 \r
 136    return new Dimension(idWidth + 10,getHeight());\r
 137  }\r
 138 \r
 139  public Dimension getPreferredSize()\r
 140  {\r
 141    return getLabelWidth();\r
 142  }\r
 143 \r
 144 \r
 145 }\r