src/jalview/gui/OptsAndParamsPage.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
   3  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.gui;
  22
  23 import jalview.util.MessageManager;
  24 import jalview.ws.params.ArgumentI;
  25 import jalview.ws.params.OptionI;
  26 import jalview.ws.params.ParameterI;
  27 import jalview.ws.params.ValueConstrainI;
  28 import jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType;
  29
  30 import java.awt.BorderLayout;
  31 import java.awt.Component;
  32 import java.awt.Dimension;
  33 import java.awt.Font;
  34 import java.awt.GridLayout;
  35 import java.awt.Rectangle;
  36 import java.awt.event.ActionEvent;
  37 import java.awt.event.ActionListener;
  38 import java.awt.event.KeyEvent;
  39 import java.awt.event.KeyListener;
  40 import java.awt.event.MouseEvent;
  41 import java.awt.event.MouseListener;
  42 import java.net.URL;
  43 import java.util.ArrayList;
  44 import java.util.Hashtable;
  45 import java.util.List;
  46 import java.util.Map;
  47
  48 import javax.swing.JButton;
  49 import javax.swing.JCheckBox;
  50 import javax.swing.JComboBox;
  51 import javax.swing.JComponent;
  52 import javax.swing.JLabel;
  53 import javax.swing.JMenuItem;
  54 import javax.swing.JPanel;
  55 import javax.swing.JPopupMenu;
  56 import javax.swing.JScrollPane;
  57 import javax.swing.JSlider;
  58 import javax.swing.JTextArea;
  59 import javax.swing.JTextField;
  60 import javax.swing.border.TitledBorder;
  61 import javax.swing.event.ChangeEvent;
  62 import javax.swing.event.ChangeListener;
  63
  64 import net.miginfocom.swing.MigLayout;
  65
  66 /**
  67  * GUI generator/manager for options and parameters. Originally abstracted from
  68  * the WsJobParameters dialog box.
  69  *
  70  * @author jprocter
  71  *
  72  */
  73 public class OptsAndParamsPage
  74 {
  75   /**
  76    * compact or verbose style parameters
  77    */
  78   boolean compact = false;
  79
  80   public class OptionBox extends JPanel implements MouseListener,
  81           ActionListener
  82   {
  83     JCheckBox enabled = new JCheckBox();
  84
  85     final URL finfo;
  86
  87     boolean hasLink = false;
  88
  89     boolean initEnabled = false;
  90
  91     String initVal = null;
  92
  93     OptionI option;
  94
  95     JLabel optlabel = new JLabel();
  96
  97     JComboBox val = new JComboBox();
  98
  99     public OptionBox(OptionI opt)
 100     {
 101       option = opt;
 102       setLayout(new BorderLayout());
 103       enabled.setSelected(opt.isRequired()); // TODO: lock required options
 104       enabled.setFont(new Font("Verdana", Font.PLAIN, 11));
 105       enabled.setText("");
 106       enabled.setText(opt.getName());
 107       enabled.addActionListener(this);
 108       finfo = option.getFurtherDetails();
 109       String desc = opt.getDescription();
 110       if (finfo != null)
 111       {
 112         hasLink = true;
 113
 114         enabled.setToolTipText(
 115              JvSwingUtils
 116                         .wrapTooltip(true, ((desc == null || desc.trim().length() == 0) ? MessageManager.getString("label.opt_and_params_further_details ")
 117                                 : desc)
 118                                 + "<br><img src=\"" + linkImageURL + "\"/>")
 119                 );
 120         enabled.addMouseListener(this);
 121       }
 122       else
 123       {
 124         if (desc != null && desc.trim().length() > 0)
 125         {
 126           enabled.setToolTipText(
 127                    JvSwingUtils.wrapTooltip(true, opt.getDescription())
 128                  );
 129         }
 130       }
 131       add(enabled, BorderLayout.NORTH);
 132       for (Object str : opt.getPossibleValues())
 133       {
 134         val.addItem((String) str);
 135       }
 136       val.setSelectedItem((String) opt.getValue());
 137       if (opt.getPossibleValues().size() > 1)
 138       {
 139         setLayout(new GridLayout(1, 2));
 140         val.addActionListener(this);
 141         add(val, BorderLayout.SOUTH);
 142       }
 143       // TODO: add actionListeners for popup (to open further info),
 144       // and to update list of parameters if an option is enabled
 145       // that takes a value. JBPNote: is this TODO still valid ?
 146       setInitialValue();
 147     }
 148
 149     public void actionPerformed(ActionEvent e)
 150     {
 151       if (e.getSource() != enabled)
 152       {
 153         enabled.setSelected(true);
 154       }
 155       checkIfModified();
 156     }
 157
 158     private void checkIfModified()
 159     {
 160       boolean notmod = (initEnabled == enabled.isSelected());
 161       if (enabled.isSelected())
 162       {
 163         if (initVal != null)
 164         {
 165           notmod &= initVal.equals(val.getSelectedItem());
 166         }
 167         else
 168         {
 169           // compare against default service setting
 170           notmod &= option.getValue() == null
 171                   || option.getValue().equals(val.getSelectedItem());
 172         }
 173       }
 174       else
 175       {
 176         notmod &= (initVal != null) ? initVal.equals(val.getSelectedItem())
 177                 : val.getSelectedItem() != initVal;
 178       }
 179       poparent.argSetModified(this, !notmod);
 180     }
 181
 182     public OptionI getOptionIfEnabled()
 183     {
 184       if (!enabled.isSelected())
 185       {
 186         return null;
 187       }
 188       OptionI opt = option.copy();
 189       if (opt.getPossibleValues() != null
 190               && opt.getPossibleValues().size() == 1)
 191       {
 192         // Hack to make sure the default value for an enabled option with only
 193         // one value is actually returned
 194         opt.setValue(opt.getPossibleValues().get(0));
 195       }
 196       if (val.getSelectedItem() != null)
 197       {
 198         opt.setValue((String) val.getSelectedItem());
 199       }
 200       else
 201       {
 202         if (option.getValue() != null)
 203         {
 204           opt.setValue(option.getValue());
 205         }
 206       }
 207       return opt;
 208     }
 209
 210     public void mouseClicked(MouseEvent e)
 211     {
 212       if (javax.swing.SwingUtilities.isRightMouseButton(e))
 213       {
 214         showUrlPopUp(this, finfo.toString(), e.getX(), e.getY());
 215       }
 216     }
 217
 218     public void mouseEntered(MouseEvent e)
 219     {
 220       // TODO Auto-generated method stub
 221
 222     }
 223
 224     public void mouseExited(MouseEvent e)
 225     {
 226       // TODO Auto-generated method stub
 227
 228     }
 229
 230     public void mousePressed(MouseEvent e)
 231     {
 232       // TODO Auto-generated method stub
 233
 234     }
 235
 236     public void mouseReleased(MouseEvent e)
 237     {
 238       // TODO Auto-generated method stub
 239
 240     }
 241
 242     public void resetToDefault(boolean setDefaultParams)
 243     {
 244       enabled.setSelected(false);
 245       if (option.isRequired()
 246               || (setDefaultParams && option.getValue() != null))
 247       {
 248         // Apply default value
 249         selectOption(option, option.getValue());
 250       }
 251     }
 252
 253     public void setInitialValue()
 254     {
 255       initEnabled = enabled.isSelected();
 256       if (option.getPossibleValues() != null
 257               && option.getPossibleValues().size() > 1)
 258       {
 259         initVal = (String) val.getSelectedItem();
 260       }
 261       else
 262       {
 263         initVal = (initEnabled) ? (String) val.getSelectedItem() : null;
 264       }
 265     }
 266
 267   }
 268
 269   public class ParamBox extends JPanel implements ChangeListener,
 270           ActionListener, MouseListener
 271   {
 272     boolean adjusting = false;
 273
 274     boolean choice = false;
 275
 276     JComboBox choicebox;
 277
 278     JPanel controlPanel = new JPanel();
 279
 280     boolean descisvisible = false;
 281
 282     JScrollPane descPanel = new JScrollPane();
 283
 284     final URL finfo;
 285
 286     boolean integ = false;
 287
 288     Object lastVal;
 289
 290     ParameterI parameter;
 291
 292     final OptsParametersContainerI pmdialogbox;
 293
 294     JPanel settingPanel = new JPanel();
 295
 296     JButton showDesc = new JButton();
 297
 298     JSlider slider = null;
 299
 300     JTextArea string = new JTextArea();
 301
 302     ValueConstrainI validator = null;
 303
 304     JTextField valueField = null;
 305
 306     public ParamBox(final OptsParametersContainerI pmlayout, ParameterI parm)
 307     {
 308       pmdialogbox = pmlayout;
 309       finfo = parm.getFurtherDetails();
 310       validator = parm.getValidValue();
 311       parameter = parm;
 312       if (validator != null)
 313       {
 314         integ = validator.getType() == ValueType.Integer;
 315       }
 316       else
 317       {
 318         if (parameter.getPossibleValues() != null)
 319         {
 320           choice = true;
 321         }
 322       }
 323
 324       if (!compact)
 325       {
 326         makeExpanderParam(parm);
 327       }
 328       else
 329       {
 330         makeCompactParam(parm);
 331
 332       }
 333     }
 334
 335     private void makeCompactParam(ParameterI parm)
 336     {
 337       setLayout(new MigLayout("", "[][grow]"));
 338
 339       String ttipText = null;
 340
 341       controlPanel.setLayout(new BorderLayout());
 342
 343       if (parm.getDescription() != null
 344               && parm.getDescription().trim().length() > 0)
 345       {
 346         // Only create description boxes if there actually is a description.
 347         ttipText = (JvSwingUtils
 348                         .wrapTooltip(true, parm.getDescription()
 349                                 + (finfo != null ? "<br><img src=\""
 350                                         + linkImageURL
 351                                         + "\"/>"+MessageManager.getString("label.opt_and_params_further_detail")
 352                                         : "")));
 353       }
 354
 355       JvSwingUtils.mgAddtoLayout(this, ttipText,
 356               new JLabel(parm.getName()), controlPanel, "");
 357       updateControls(parm);
 358       validate();
 359     }
 360
 361     private void makeExpanderParam(ParameterI parm)
 362     {
 363       setPreferredSize(new Dimension(PARAM_WIDTH, PARAM_CLOSEDHEIGHT));
 364       setBorder(new TitledBorder(parm.getName()));
 365       setLayout(null);
 366       showDesc.setFont(new Font("Verdana", Font.PLAIN, 6));
 367       showDesc.setText("+");
 368       string.setFont(new Font("Verdana", Font.PLAIN, 11));
 369       string.setBackground(getBackground());
 370
 371       string.setEditable(false);
 372       descPanel.getViewport().setView(string);
 373
 374       descPanel.setVisible(false);
 375
 376       JPanel firstrow = new JPanel();
 377       firstrow.setLayout(null);
 378       controlPanel.setLayout(new BorderLayout());
 379       controlPanel.setBounds(new Rectangle(39, 10, PARAM_WIDTH - 70,
 380               PARAM_CLOSEDHEIGHT - 50));
 381       firstrow.add(controlPanel);
 382       firstrow.setBounds(new Rectangle(10, 20, PARAM_WIDTH - 30,
 383               PARAM_CLOSEDHEIGHT - 30));
 384
 385       final ParamBox me = this;
 386
 387       if (parm.getDescription() != null
 388               && parm.getDescription().trim().length() > 0)
 389       {
 390         // Only create description boxes if there actually is a description.
 391         if (finfo != null)
 392         {
 393           showDesc.setToolTipText(JvSwingUtils.wrapTooltip(true, MessageManager.formatMessage("label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link", new String[]{linkImageURL.toExternalForm()})));
 394           showDesc.addMouseListener(this);
 395         }
 396         else
 397         {
 398           showDesc.setToolTipText(JvSwingUtils.wrapTooltip(true, MessageManager.getString("label.opt_and_params_show_brief_desc")));
 399         }
 400         showDesc.addActionListener(new ActionListener()
 401         {
 402
 403           public void actionPerformed(ActionEvent e)
 404           {
 405             descisvisible = !descisvisible;
 406             descPanel.setVisible(descisvisible);
 407             descPanel.getVerticalScrollBar().setValue(0);
 408             me.setPreferredSize(new Dimension(PARAM_WIDTH,
 409                     (descisvisible) ? PARAM_HEIGHT : PARAM_CLOSEDHEIGHT));
 410             me.validate();
 411             pmdialogbox.refreshParamLayout();
 412           }
 413         });
 414         string.setWrapStyleWord(true);
 415         string.setLineWrap(true);
 416         string.setColumns(32);
 417         string.setText(parm.getDescription());
 418         showDesc.setBounds(new Rectangle(10, 10, 16, 16));
 419         firstrow.add(showDesc);
 420       }
 421       add(firstrow);
 422       validator = parm.getValidValue();
 423       parameter = parm;
 424       if (validator != null)
 425       {
 426         integ = validator.getType() == ValueType.Integer;
 427       }
 428       else
 429       {
 430         if (parameter.getPossibleValues() != null)
 431         {
 432           choice = true;
 433         }
 434       }
 435       updateControls(parm);
 436       descPanel.setBounds(new Rectangle(10, PARAM_CLOSEDHEIGHT,
 437               PARAM_WIDTH - 20, PARAM_HEIGHT - PARAM_CLOSEDHEIGHT - 5));
 438       add(descPanel);
 439       validate();
 440     }
 441
 442     public void actionPerformed(ActionEvent e)
 443     {
 444       if (adjusting)
 445       {
 446         return;
 447       }
 448       if (!choice)
 449       {
 450         updateSliderFromValueField();
 451       }
 452       checkIfModified();
 453     }
 454
 455     private void checkIfModified()
 456     {
 457       Object cstate = updateSliderFromValueField();
 458       boolean notmod = false;
 459       if (cstate.getClass() == lastVal.getClass())
 460       {
 461         if (cstate instanceof int[])
 462         {
 463           notmod = (((int[]) cstate)[0] == ((int[]) lastVal)[0]);
 464         }
 465         else if (cstate instanceof float[])
 466         {
 467           notmod = (((float[]) cstate)[0] == ((float[]) lastVal)[0]);
 468         }
 469         else if (cstate instanceof String[])
 470         {
 471           notmod = (((String[]) cstate)[0].equals(((String[]) lastVal)[0]));
 472         }
 473       }
 474       pmdialogbox.argSetModified(this, !notmod);
 475     }
 476
 477     @Override
 478     public int getBaseline(int width, int height)
 479     {
 480       return 0;
 481     }
 482
 483     // from
 484     // http://stackoverflow.com/questions/2743177/top-alignment-for-flowlayout
 485     // helpful hint of using the Java 1.6 alignBaseLine property of FlowLayout
 486     @Override
 487     public Component.BaselineResizeBehavior getBaselineResizeBehavior()
 488     {
 489       return Component.BaselineResizeBehavior.CONSTANT_ASCENT;
 490     }
 491
 492     public int getBoxHeight()
 493     {
 494       return (descisvisible ? PARAM_HEIGHT : PARAM_CLOSEDHEIGHT);
 495     }
 496
 497     public ParameterI getParameter()
 498     {
 499       ParameterI prm = parameter.copy();
 500       if (choice)
 501       {
 502         prm.setValue((String) choicebox.getSelectedItem());
 503       }
 504       else
 505       {
 506         prm.setValue(valueField.getText());
 507       }
 508       return prm;
 509     }
 510
 511     public void init()
 512     {
 513       // reset the widget's initial value.
 514       lastVal = null;
 515     }
 516
 517     public void mouseClicked(MouseEvent e)
 518     {
 519       if (javax.swing.SwingUtilities.isRightMouseButton(e))
 520       {
 521         showUrlPopUp(this, finfo.toString(), e.getX(), e.getY());
 522       }
 523     }
 524
 525     public void mouseEntered(MouseEvent e)
 526     {
 527       // TODO Auto-generated method stub
 528
 529     }
 530
 531     public void mouseExited(MouseEvent e)
 532     {
 533       // TODO Auto-generated method stub
 534
 535     }
 536
 537     public void mousePressed(MouseEvent e)
 538     {
 539       // TODO Auto-generated method stub
 540
 541     }
 542
 543     public void mouseReleased(MouseEvent e)
 544     {
 545       // TODO Auto-generated method stub
 546
 547     }
 548
 549     public void stateChanged(ChangeEvent e)
 550     {
 551       if (!adjusting)
 552       {
 553         valueField.setText(""
 554                 + ((integ) ? ("" + (int) slider.getValue())
 555                         : ("" + (float) (slider.getValue() / 1000f))));
 556         checkIfModified();
 557       }
 558
 559     }
 560
 561     public void updateControls(ParameterI parm)
 562     {
 563       adjusting = true;
 564       boolean init = (choicebox == null && valueField == null);
 565       if (init)
 566       {
 567         if (choice)
 568         {
 569           choicebox = new JComboBox();
 570           choicebox.addActionListener(this);
 571           controlPanel.add(choicebox, BorderLayout.CENTER);
 572         }
 573         else
 574         {
 575           slider = new JSlider();
 576           slider.addChangeListener(this);
 577           valueField = new JTextField();
 578           valueField.addActionListener(this);
 579           valueField.addKeyListener(new KeyListener()
 580           {
 581
 582             @Override
 583             public void keyTyped(KeyEvent e)
 584             {
 585             }
 586
 587             @Override
 588             public void keyReleased(KeyEvent e)
 589             {
 590               if (e.isActionKey())
 591               {
 592                 if (valueField.getText().trim().length() > 0)
 593                 {
 594                   actionPerformed(null);
 595                 }
 596               }
 597             }
 598
 599             @Override
 600             public void keyPressed(KeyEvent e)
 601             {
 602             }
 603           });
 604           valueField.setPreferredSize(new Dimension(60, 25));
 605           controlPanel.add(slider, BorderLayout.WEST);
 606           controlPanel.add(valueField, BorderLayout.EAST);
 607
 608         }
 609       }
 610
 611       if (parm != null)
 612       {
 613         if (choice)
 614         {
 615           if (init)
 616           {
 617             List vals = parm.getPossibleValues();
 618             for (Object val : vals)
 619             {
 620               choicebox.addItem(val);
 621             }
 622           }
 623
 624           if (parm.getValue() != null)
 625           {
 626             choicebox.setSelectedItem(parm.getValue());
 627           }
 628         }
 629         else
 630         {
 631           valueField.setText(parm.getValue());
 632         }
 633       }
 634       lastVal = updateSliderFromValueField();
 635       adjusting = false;
 636     }
 637
 638     public Object updateSliderFromValueField()
 639     {
 640       int iVal;
 641       float fVal;
 642       if (validator != null)
 643       {
 644         if (integ)
 645         {
 646           iVal = 0;
 647           try
 648           {
 649             valueField.setText(valueField.getText().trim());
 650             iVal = Integer.valueOf(valueField.getText());
 651             if (validator.getMin() != null
 652                     && validator.getMin().intValue() > iVal)
 653             {
 654               iVal = validator.getMin().intValue();
 655               // TODO: provide visual indication that hard limit was reached for
 656               // this parameter
 657             }
 658             if (validator.getMax() != null
 659                     && validator.getMax().intValue() < iVal)
 660             {
 661               iVal = validator.getMax().intValue();
 662               // TODO: provide visual indication that hard limit was reached for
 663               // this parameter
 664             }
 665           } catch (Exception e)
 666           {
 667           }
 668           ;
 669           // update value field to reflect any bound checking we performed.
 670           valueField.setText("" + iVal);
 671           if (validator.getMin() != null && validator.getMax() != null)
 672           {
 673             slider.getModel().setRangeProperties(iVal, 1,
 674                     validator.getMin().intValue(),
 675                     validator.getMax().intValue() + 1, true);
 676           }
 677           else
 678           {
 679             slider.setVisible(false);
 680           }
 681           return new int[]
 682           { iVal };
 683         }
 684         else
 685         {
 686           fVal = 0f;
 687           try
 688           {
 689             valueField.setText(valueField.getText().trim());
 690             fVal = Float.valueOf(valueField.getText());
 691             if (validator.getMin() != null
 692                     && validator.getMin().floatValue() > fVal)
 693             {
 694               fVal = validator.getMin().floatValue();
 695               // TODO: provide visual indication that hard limit was reached for
 696               // this parameter
 697               // update value field to reflect any bound checking we performed.
 698               valueField.setText("" + fVal);
 699             }
 700             if (validator.getMax() != null
 701                     && validator.getMax().floatValue() < fVal)
 702             {
 703               fVal = validator.getMax().floatValue();
 704               // TODO: provide visual indication that hard limit was reached for
 705               // this parameter
 706               // update value field to reflect any bound checking we performed.
 707               valueField.setText("" + fVal);
 708             }
 709           } catch (Exception e)
 710           {
 711           }
 712           ;
 713           if (validator.getMin() != null && validator.getMax() != null)
 714           {
 715             slider.getModel().setRangeProperties((int) (fVal * 1000f), 1,
 716                     (int) (validator.getMin().floatValue() * 1000f),
 717                     1 + (int) (validator.getMax().floatValue() * 1000f),
 718                     true);
 719           }
 720           else
 721           {
 722             slider.setVisible(false);
 723           }
 724           return new float[]
 725           { fVal };
 726         }
 727       }
 728       else
 729       {
 730         if (!choice)
 731         {
 732           slider.setVisible(false);
 733           return new String[]
 734           { valueField.getText().trim() };
 735         }
 736         else
 737         {
 738           return new String[]
 739           { (String) choicebox.getSelectedItem() };
 740         }
 741       }
 742
 743     }
 744   }
 745
 746   public static final int PARAM_WIDTH = 340;
 747
 748   public static final int PARAM_HEIGHT = 150;
 749
 750   public static final int PARAM_CLOSEDHEIGHT = 80;
 751
 752   public OptsAndParamsPage(OptsParametersContainerI paramContainer)
 753   {
 754     this(paramContainer, false);
 755   }
 756
 757   public OptsAndParamsPage(OptsParametersContainerI paramContainer,
 758           boolean compact)
 759   {
 760     poparent = paramContainer;
 761     this.compact = compact;
 762   }
 763
 764   public static void showUrlPopUp(JComponent invoker, final String finfo,
 765           int x, int y)
 766   {
 767
 768     JPopupMenu mnu = new JPopupMenu();
 769     JMenuItem mitem = new JMenuItem(MessageManager.formatMessage(
 770             "label.view_params", new String[]
 771             { finfo }));
 772     mitem.addActionListener(new ActionListener()
 773     {
 774
 775       @Override
 776       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 777       {
 778         Desktop.showUrl(finfo);
 779
 780       }
 781     });
 782     mnu.add(mitem);
 783     mnu.show(invoker, x, y);
 784   }
 785
 786   URL linkImageURL = getClass().getResource("/images/link.gif");
 787
 788   Map<String, OptionBox> optSet = new java.util.LinkedHashMap<String, OptionBox>();
 789
 790   Map<String, ParamBox> paramSet = new java.util.LinkedHashMap<String, ParamBox>();
 791
 792   public Map<String, OptionBox> getOptSet()
 793   {
 794     return optSet;
 795   }
 796
 797   public void setOptSet(Map<String, OptionBox> optSet)
 798   {
 799     this.optSet = optSet;
 800   }
 801
 802   public Map<String, ParamBox> getParamSet()
 803   {
 804     return paramSet;
 805   }
 806
 807   public void setParamSet(Map<String, ParamBox> paramSet)
 808   {
 809     this.paramSet = paramSet;
 810   }
 811
 812   OptsParametersContainerI poparent;
 813
 814   OptionBox addOption(OptionI opt)
 815   {
 816     OptionBox cb = optSet.get(opt.getName());
 817     if (cb == null)
 818     {
 819       cb = new OptionBox(opt);
 820       optSet.put(opt.getName(), cb);
 821       // jobOptions.add(cb, FlowLayout.LEFT);
 822     }
 823     return cb;
 824   }
 825
 826   ParamBox addParameter(ParameterI arg)
 827   {
 828     ParamBox pb = paramSet.get(arg.getName());
 829     if (pb == null)
 830     {
 831       pb = new ParamBox(poparent, arg);
 832       paramSet.put(arg.getName(), pb);
 833       // paramList.add(pb);
 834     }
 835     pb.init();
 836     // take the defaults from the parameter
 837     pb.updateControls(arg);
 838     return pb;
 839   }
 840
 841   void selectOption(OptionI option, String string)
 842   {
 843     OptionBox cb = optSet.get(option.getName());
 844     if (cb == null)
 845     {
 846       cb = addOption(option);
 847     }
 848     cb.enabled.setSelected(string != null); // initial state for an option.
 849     if (string != null)
 850     {
 851       if (option.getPossibleValues().contains(string))
 852       {
 853         cb.val.setSelectedItem(string);
 854       }
 855       else
 856       {
 857         throw new Error(MessageManager.formatMessage("error.invalid_value_for_option", new String[]{string,option.getName()}));
 858       }
 859
 860     }
 861     if (option.isRequired() && !cb.enabled.isSelected())
 862     {
 863       // TODO: indicate paramset is not valid.. option needs to be selected!
 864     }
 865     cb.setInitialValue();
 866   }
 867
 868   void setParameter(ParameterI arg)
 869   {
 870     ParamBox pb = paramSet.get(arg.getName());
 871     if (pb == null)
 872     {
 873       addParameter(arg);
 874     }
 875     else
 876     {
 877       pb.updateControls(arg);
 878     }
 879
 880   }
 881
 882   /**
 883    * recover options and parameters from GUI
 884    *
 885    * @return
 886    */
 887   public List<ArgumentI> getCurrentSettings()
 888   {
 889     List<ArgumentI> argSet = new ArrayList<ArgumentI>();
 890     for (OptionBox opts : getOptSet().values())
 891     {
 892       OptionI opt = opts.getOptionIfEnabled();
 893       if (opt != null)
 894       {
 895         argSet.add(opt);
 896       }
 897     }
 898     for (ParamBox parambox : getParamSet().values())
 899     {
 900       ParameterI parm = parambox.getParameter();
 901       if (parm != null)
 902       {
 903         argSet.add(parm);
 904       }
 905     }
 906
 907     return argSet;
 908   }
 909
 910 }