src/jalview/gui/Preferences.java

   1 package jalview.gui;\r
   2 \r
   3 import jalview.jbgui.*;\r
   4 import jalview.schemes.*;\r
   5 import jalview.io.*;\r
   6 \r
   7 import jalview.bin.Cache;\r
   8 import javax.swing.*;\r
   9 import java.awt.event.ActionEvent;\r
  10 import java.awt.*;\r
  11 \r
  12 \r
  13 public class Preferences extends GPreferences\r
  14 {\r
  15   static boolean preferencesLoaded=false;\r
  16 \r
  17   public static boolean showFullscreen=false;\r
  18   public static boolean showFullId=true;\r
  19   public static boolean showAnnotation=true;\r
  20   public static boolean showConservation=true;\r
  21   public static boolean showQuality=true;\r
  22   public static boolean showIdentity=true;\r
  23   public static String fontName="SansSerif";\r
  24   public static String fontSize="10";\r
  25   public static String fontStyle=Font.PLAIN+"";\r
  26   public static char gapSymbol='-';\r
  27   public static String defaultColour=null;\r
  28   public static boolean showStartupFile=true;\r
  29   public static String startupFile = "http://www.jalview.org/examples/exampleFile.jar";\r
  30 \r
  31   JInternalFrame frame;\r
  32 \r
  33   public static void initPreferences()\r
  34   {\r
  35   String string = Cache.getProperty("SHOW_FULL_ID");\r
  36   if(string!=null)\r
  37     showFullId = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  38 \r
  39   string = Cache.getProperty("SHOW_FULLSCREEN");\r
  40   if(string!=null)\r
  41     showFullscreen = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  42 \r
  43   string = Cache.getProperty("SHOW_ANNOTATIONS");\r
  44       if(string!=null)\r
  45     showAnnotation = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  46 \r
  47   string = Cache.getProperty("SHOW_CONSERVATION");\r
  48       if(string!=null)\r
  49     showConservation = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  50   string = Cache.getProperty("SHOW_QUALITY");\r
  51       if(string!=null)\r
  52     showQuality = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  53   string = Cache.getProperty("SHOW_IDENTITY");\r
  54       if(string!=null)\r
  55     showIdentity = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  56 \r
  57   string = Cache.getProperty("GAP_SYMBOL");\r
  58       if(string!=null)\r
  59     gapSymbol = string.charAt(0);\r
  60 \r
  61   string = Cache.getProperty("SHOW_FULL_ID");\r
  62     if(string!=null)\r
  63       showFullId = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  64 \r
  65     string = Cache.getProperty("FONT_NAME");\r
  66     if (string != null)\r
  67       fontName = string;\r
  68 \r
  69     string = Cache.getProperty("FONT_STYLE");\r
  70     if (string != null)\r
  71       fontStyle = string;\r
  72 \r
  73     string = Cache.getProperty("FONT_SIZE");\r
  74     if (string != null)\r
  75       fontSize = string;\r
  76 \r
  77 \r
  78   string = Cache.getProperty("DEFAULT_COLOUR");\r
  79   if(string!=null)\r
  80       defaultColour = string;\r
  81 \r
  82   string = Cache.getProperty("STARTUP_FILE");\r
  83     if(string!=null)\r
  84       startupFile = string;\r
  85 \r
  86   string = Cache.getProperty("SHOW_STARTUP_FILE");\r
  87         if(string!=null)\r
  88       showStartupFile = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  89 \r
  90       preferencesLoaded = true;\r
  91   }\r
  92 \r
  93   public Preferences()\r
  94   {\r
  95     initPreferences();\r
  96 \r
  97     frame = new JInternalFrame();\r
  98     frame.setContentPane(this);\r
  99     Desktop.addInternalFrame(frame, "Preferences", 480,390 );\r
 100 \r
 101     fullID.setSelected(showFullId);\r
 102     String string = Cache.getProperty("SHOW_FULLSCREEN");\r
 103     boolean value = false;\r
 104     if(string!=null)\r
 105       value =  Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
 106 \r
 107     fullScreen.setSelected(value);\r
 108     annotations.setSelected(showAnnotation);\r
 109 \r
 110     conservation.setEnabled(showAnnotation);\r
 111     quality.setEnabled(showAnnotation);\r
 112     identity.setEnabled(showAnnotation);\r
 113 \r
 114     conservation.setSelected(showConservation);\r
 115     quality.setSelected(showQuality);\r
 116     identity.setSelected(showIdentity);\r
 117 \r
 118     for(int i=0; i<12; i++)\r
 119       colour.addItem( ColourSchemeProperty.getColourName(i) );\r
 120 \r
 121     string = Cache.getProperty("DEFAULT_COLOUR");\r
 122     if(string!=null)\r
 123       colour.setSelectedItem( string );\r
 124     else\r
 125       colour.setSelectedIndex( 11 );\r
 126 \r
 127     String fonts[] = java.awt.GraphicsEnvironment.getLocalGraphicsEnvironment().getAvailableFontFamilyNames();\r
 128     for(int i=0; i<fonts.length; i++)\r
 129       fontNameCB.addItem(fonts[i]);\r
 130 \r
 131     for(int i=1; i<31; i++)\r
 132       fontSizeCB.addItem(i+"");\r
 133 \r
 134    fontStyleCB.addItem("plain");\r
 135    fontStyleCB.addItem("bold");\r
 136    fontStyleCB.addItem("italic");\r
 137 \r
 138    fontNameCB.setSelectedItem(fontName);\r
 139    fontSizeCB.setSelectedItem(fontSize);\r
 140    fontStyleCB.setSelectedItem(fontStyle);\r
 141 \r
 142    gapSymbolCB.addItem("-");\r
 143    gapSymbolCB.addItem(".");\r
 144 \r
 145    gapSymbolCB.setSelectedItem( gapSymbol+"" );\r
 146 \r
 147    startupCheckbox.setSelected(showStartupFile);\r
 148    startupFileTextfield.setText(startupFile);\r
 149 \r
 150   }\r
 151 \r
 152   public void ok_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 153   {\r
 154     showFullId =  fullID.isSelected() ;\r
 155     showFullscreen = fullScreen.isSelected();\r
 156     showAnnotation = annotations.isSelected();\r
 157     showConservation = conservation.isSelected();\r
 158     showQuality = quality.isSelected();\r
 159     showIdentity = identity.isSelected();\r
 160     defaultColour = colour.getSelectedItem().toString();\r
 161     gapSymbol = gapSymbolCB.getSelectedItem().toString().charAt(0);\r
 162     fontName = fontNameCB.getSelectedItem().toString();\r
 163     fontSize = fontSizeCB.getSelectedItem().toString();\r
 164     fontStyle = fontStyleCB.getSelectedItem().toString();\r
 165     startupFile = startupFileTextfield.getText();\r
 166     showStartupFile = startupCheckbox.isSelected();\r
 167 \r
 168     Cache.setProperty("SHOW_FULL_ID", Boolean.toString(showFullId));\r
 169     Cache.setProperty("SHOW_FULLSCREEN", Boolean.toString( showFullscreen ) );\r
 170 \r
 171     Cache.setProperty("SHOW_ANNOTATIONS", Boolean.toString( showAnnotation  ));\r
 172     Cache.setProperty("SHOW_CONSERVATION", Boolean.toString( showConservation ));\r
 173     Cache.setProperty("SHOW_QUALITY", Boolean.toString( showQuality ));\r
 174     Cache.setProperty("SHOW_IDENTITY", Boolean.toString( showIdentity ));\r
 175 \r
 176     Cache.setProperty("DEFAULT_COLOUR", defaultColour);\r
 177     Cache.setProperty("GAP_SYMBOL", gapSymbol+"");\r
 178 \r
 179     Cache.setProperty("FONT_NAME", fontName);\r
 180     Cache.setProperty("FONT_STYLE", fontStyle);\r
 181     Cache.setProperty("FONT_SIZE", fontSize);\r
 182 \r
 183     Cache.setProperty("STARTUP_FILE", startupFile);\r
 184     Cache.setProperty("SHOW_STARTUP_FILE", Boolean.toString(showStartupFile));\r
 185 \r
 186 \r
 187 \r
 188     try    {\r
 189       frame.setClosed(true);\r
 190     }    catch (Exception ex)  {}\r
 191 \r
 192   }\r
 193 \r
 194   public void startupFileTextfield_mouseClicked()\r
 195   {\r
 196     JalviewFileChooser chooser = new JalviewFileChooser(jalview.bin.Cache.getProperty("LAST_DIRECTORY"),\r
 197         new String[]{"fa, fasta, fastq", "aln",  "pfam", "msf", "pir","blc","jar"},\r
 198         new String[]{"Fasta", "Clustal", "PFAM", "MSF", "PIR", "BLC", "Jalview"}\r
 199        ,jalview.bin.Cache.getProperty("DEFAULT_FILE_FORMAT"));\r
 200    chooser.setFileView(new JalviewFileView());\r
 201    chooser.setDialogTitle("Select startup file");\r
 202    int value = chooser.showOpenDialog(this);\r
 203    if(value == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION)\r
 204    {\r
 205      jalview.bin.Cache.setProperty("DEFAULT_FILE_FORMAT", chooser.getSelectedFormat());\r
 206      startupFileTextfield.setText( chooser.getSelectedFile().getAbsolutePath() );\r
 207    }\r
 208   }\r
 209 \r
 210 \r
 211   public void cancel_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 212   {\r
 213     try{\r
 214       frame.setClosed(true);\r
 215     }catch(Exception ex){}\r
 216   }\r
 217 \r
 218   public void annotations_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 219   {\r
 220     conservation.setEnabled(annotations.isSelected());\r
 221     quality.setEnabled(annotations.isSelected());\r
 222     identity.setEnabled(annotations.isSelected());\r
 223   }\r
 224 \r
 225 }\r