src/jalview/gui/Preferences.java

   1 package jalview.gui;\r
   2 \r
   3 import jalview.jbgui.*;\r
   4 import jalview.schemes.*;\r
   5 import jalview.io.*;\r
   6 \r
   7 import jalview.bin.Cache;\r
   8 import javax.swing.*;\r
   9 import java.awt.event.ActionEvent;\r
  10 import java.awt.*;\r
  11 \r
  12 \r
  13 public class Preferences extends GPreferences\r
  14 {\r
  15   static boolean preferencesLoaded=false;\r
  16 \r
  17   public static boolean showFullscreen=false;\r
  18   public static boolean showFullId=true;\r
  19   public static boolean showAnnotation=true;\r
  20   public static boolean showConservation=true;\r
  21   public static boolean showQuality=true;\r
  22   public static boolean showIdentity=true;\r
  23   public static String fontName;\r
  24   public static String fontSize;\r
  25   public static String fontStyle;\r
  26   public static char gapSymbol='-';\r
  27   public static String defaultColour=null;\r
  28   public static boolean showStartupFile=true;\r
  29   public static String startupFile = "http://www.compbio.dundee.ac.uk/~andrew/jalviewTEST/fasta";\r
  30 \r
  31   JInternalFrame frame;\r
  32 \r
  33   public static void initPreferences()\r
  34   {\r
  35   String string = Cache.getProperty("SHOW_FULL_ID");\r
  36   if(string!=null)\r
  37     showFullId = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  38 \r
  39   string = Cache.getProperty("SHOW_FULLSCREEN");\r
  40   if(string!=null)\r
  41     showFullscreen = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  42 \r
  43   string = Cache.getProperty("SHOW_ANNOTATIONS");\r
  44       if(string!=null)\r
  45     showAnnotation = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  46 \r
  47   string = Cache.getProperty("SHOW_CONSERVATION");\r
  48       if(string!=null)\r
  49     showConservation = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  50   string = Cache.getProperty("SHOW_QUALITY");\r
  51       if(string!=null)\r
  52     showQuality = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  53   string = Cache.getProperty("SHOW_IDENTITY");\r
  54       if(string!=null)\r
  55     showIdentity = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  56 \r
  57   string = Cache.getProperty("GAP_SYMBOL");\r
  58       if(string!=null)\r
  59     gapSymbol = string.charAt(0);\r
  60 \r
  61   string = Cache.getProperty("SHOW_FULL_ID");\r
  62     if(string!=null)\r
  63       showFullId = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  64 \r
  65   fontName = Cache.getProperty("FONT_NAME");\r
  66   fontStyle = Cache.getProperty("FONT_STYLE");\r
  67   fontSize = Cache.getProperty("FONT_SIZE");\r
  68 \r
  69   string = Cache.getProperty("DEFAULT_COLOUR");\r
  70   if(string!=null)\r
  71       defaultColour = string;\r
  72 \r
  73   string = Cache.getProperty("STARTUP_FILE");\r
  74     if(string!=null)\r
  75       startupFile = string;\r
  76 \r
  77   string = Cache.getProperty("SHOW_STARTUP_FILE");\r
  78         if(string!=null)\r
  79       showStartupFile = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  80 \r
  81       preferencesLoaded = true;\r
  82   }\r
  83 \r
  84   public Preferences()\r
  85   {\r
  86     if(!preferencesLoaded)\r
  87       initPreferences();\r
  88 \r
  89     frame = new JInternalFrame();\r
  90     frame.setContentPane(this);\r
  91     Desktop.addInternalFrame(frame, "Preferences", 480,390 );\r
  92 \r
  93     fullID.setSelected(showFullId);\r
  94     String string = Cache.getProperty("SHOW_FULLSCREEN");\r
  95     boolean value = false;\r
  96     if(string!=null)\r
  97       value =  Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  98 \r
  99     fullScreen.setSelected(value);\r
 100     annotations.setSelected(showAnnotation);\r
 101 \r
 102     conservation.setEnabled(showAnnotation);\r
 103     quality.setEnabled(showAnnotation);\r
 104     identity.setEnabled(showAnnotation);\r
 105 \r
 106     conservation.setSelected(showConservation);\r
 107     quality.setSelected(showQuality);\r
 108     identity.setSelected(showIdentity);\r
 109 \r
 110     for(int i=0; i<12; i++)\r
 111       colour.addItem( ColourSchemeProperty.getColourName(i) );\r
 112 \r
 113     string = Cache.getProperty("DEFAULT_COLOUR");\r
 114     if(string!=null)\r
 115       colour.setSelectedItem( string );\r
 116     else\r
 117       colour.setSelectedIndex( 11 );\r
 118 \r
 119     String fonts[] = java.awt.GraphicsEnvironment.getLocalGraphicsEnvironment().getAvailableFontFamilyNames();\r
 120     for(int i=0; i<fonts.length; i++)\r
 121       fontNameCB.addItem(fonts[i]);\r
 122 \r
 123     for(int i=1; i<31; i++)\r
 124       fontSizeCB.addItem(i+"");\r
 125 \r
 126    fontStyleCB.addItem("plain");\r
 127    fontStyleCB.addItem("bold");\r
 128    fontStyleCB.addItem("italic");\r
 129 \r
 130    fontNameCB.setSelectedItem(fontName);\r
 131    fontSizeCB.setSelectedItem(fontSize);\r
 132    fontStyleCB.setSelectedItem(fontStyle);\r
 133 \r
 134    gapSymbolCB.addItem("-");\r
 135    gapSymbolCB.addItem(".");\r
 136 \r
 137    gapSymbolCB.setSelectedItem( gapSymbol+"" );\r
 138 \r
 139    startupCheckbox.setSelected(showStartupFile);\r
 140    startupFileTextfield.setText(startupFile);\r
 141 \r
 142   }\r
 143 \r
 144   public void ok_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 145   {\r
 146     showFullId =  fullID.isSelected() ;\r
 147     showFullscreen = fullScreen.isSelected();\r
 148     showAnnotation = annotations.isSelected();\r
 149     showConservation = conservation.isSelected();\r
 150     showQuality = quality.isSelected();\r
 151     showIdentity = identity.isSelected();\r
 152     defaultColour = colour.getSelectedItem().toString();\r
 153     gapSymbol = gapSymbolCB.getSelectedItem().toString().charAt(0);\r
 154     fontName = fontNameCB.getSelectedItem().toString();\r
 155     fontSize = fontSizeCB.getSelectedItem().toString();\r
 156     fontStyle = fontStyleCB.getSelectedItem().toString();\r
 157     startupFile = startupFileTextfield.getText();\r
 158     showStartupFile = startupCheckbox.isSelected();\r
 159 \r
 160     Cache.setProperty("SHOW_FULL_ID", Boolean.toString(showFullId));\r
 161     Cache.setProperty("SHOW_FULLSCREEN", Boolean.toString( showFullscreen ) );\r
 162 \r
 163     Cache.setProperty("SHOW_ANNOTATIONS", Boolean.toString( showAnnotation  ));\r
 164     Cache.setProperty("SHOW_CONSERVATION", Boolean.toString( showConservation ));\r
 165     Cache.setProperty("SHOW_QUALITY", Boolean.toString( showQuality ));\r
 166     Cache.setProperty("SHOW_IDENTITY", Boolean.toString( showIdentity ));\r
 167 \r
 168     Cache.setProperty("DEFAULT_COLOUR", defaultColour);\r
 169     Cache.setProperty("GAP_SYMBOL", gapSymbol+"");\r
 170 \r
 171     Cache.setProperty("FONT_NAME", fontName);\r
 172     Cache.setProperty("FONT_STYLE", fontStyle);\r
 173     Cache.setProperty("FONT_SIZE", fontSize);\r
 174 \r
 175     Cache.setProperty("STARTUP_FILE", startupFile);\r
 176     Cache.setProperty("SHOW_STARTUP_FILE", Boolean.toString(showStartupFile));\r
 177 \r
 178 \r
 179 \r
 180     try    {\r
 181       frame.setClosed(true);\r
 182     }    catch (Exception ex)  {}\r
 183 \r
 184   }\r
 185 \r
 186   public void startupFileTextfield_mouseClicked()\r
 187   {\r
 188     JalviewFileChooser chooser = new JalviewFileChooser(jalview.bin.Cache.getProperty("LAST_DIRECTORY"),\r
 189         new String[]{"fa, fasta, fastq", "aln",  "pfam", "msf", "pir","blc","jar"},\r
 190         new String[]{"Fasta", "Clustal", "PFAM", "MSF", "PIR", "BLC", "Jalview"}\r
 191        ,null);\r
 192    chooser.setFileView(new JalviewFileView());\r
 193    chooser.setDialogTitle("Select startup file");\r
 194    int value = chooser.showOpenDialog(this);\r
 195    if(value == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION)\r
 196    {\r
 197      startupFileTextfield.setText( chooser.getSelectedFile().getAbsolutePath() );\r
 198    }\r
 199   }\r
 200 \r
 201 \r
 202   public void cancel_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 203   {\r
 204     try{\r
 205       frame.setClosed(true);\r
 206     }catch(Exception ex){}\r
 207   }\r
 208 \r
 209   public void annotations_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 210   {\r
 211     conservation.setEnabled(annotations.isSelected());\r
 212     quality.setEnabled(annotations.isSelected());\r
 213     identity.setEnabled(annotations.isSelected());\r
 214   }\r
 215 \r
 216 }\r