src/jalview/gui/Preferences.java

   1 /*\r
   2 * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3 * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4 *\r
   5 * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6 * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7 * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8 * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9 *\r
  10 * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11 * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12 * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13 * GNU General Public License for more details.\r
  14 *\r
  15 * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16 * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17 * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18 */\r
  19 \r
  20 package jalview.gui;\r
  21 \r
  22 import jalview.jbgui.*;\r
  23 import jalview.schemes.*;\r
  24 import jalview.io.*;\r
  25 \r
  26 import jalview.bin.Cache;\r
  27 import javax.swing.*;\r
  28 import java.awt.event.ActionEvent;\r
  29 import java.awt.*;\r
  30 \r
  31 \r
  32 public class Preferences extends GPreferences\r
  33 {\r
  34   static boolean preferencesLoaded=false;\r
  35 \r
  36   public static boolean showFullscreen=false;\r
  37   public static boolean showFullId=true;\r
  38   public static boolean showAnnotation=true;\r
  39   public static boolean showConservation=true;\r
  40   public static boolean showQuality=true;\r
  41   public static boolean showIdentity=true;\r
  42   public static String fontName="SansSerif";\r
  43   public static String fontSize="10";\r
  44   public static String fontStyle=Font.PLAIN+"";\r
  45   public static char gapSymbol='-';\r
  46   public static String defaultColour=null;\r
  47   public static boolean showStartupFile=true;\r
  48   public static String startupFile = "http://www.jalview.org/examples/exampleFile.jar";\r
  49 \r
  50   JInternalFrame frame;\r
  51 \r
  52   public static void initPreferences()\r
  53   {\r
  54   String string = Cache.getProperty("SHOW_FULL_ID");\r
  55   if(string!=null)\r
  56     showFullId = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  57 \r
  58   string = Cache.getProperty("SHOW_FULLSCREEN");\r
  59   if(string!=null)\r
  60     showFullscreen = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  61 \r
  62   string = Cache.getProperty("SHOW_ANNOTATIONS");\r
  63       if(string!=null)\r
  64     showAnnotation = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  65 \r
  66   string = Cache.getProperty("SHOW_CONSERVATION");\r
  67       if(string!=null)\r
  68     showConservation = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  69   string = Cache.getProperty("SHOW_QUALITY");\r
  70       if(string!=null)\r
  71     showQuality = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  72   string = Cache.getProperty("SHOW_IDENTITY");\r
  73       if(string!=null)\r
  74     showIdentity = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  75 \r
  76   string = Cache.getProperty("GAP_SYMBOL");\r
  77       if(string!=null)\r
  78     gapSymbol = string.charAt(0);\r
  79 \r
  80   string = Cache.getProperty("SHOW_FULL_ID");\r
  81     if(string!=null)\r
  82       showFullId = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
  83 \r
  84     string = Cache.getProperty("FONT_NAME");\r
  85     if (string != null)\r
  86       fontName = string;\r
  87 \r
  88     string = Cache.getProperty("FONT_STYLE");\r
  89     if (string != null)\r
  90       fontStyle = string;\r
  91 \r
  92     string = Cache.getProperty("FONT_SIZE");\r
  93     if (string != null)\r
  94       fontSize = string;\r
  95 \r
  96 \r
  97   string = Cache.getProperty("DEFAULT_COLOUR");\r
  98   if(string!=null)\r
  99       defaultColour = string;\r
 100 \r
 101   string = Cache.getProperty("STARTUP_FILE");\r
 102     if(string!=null)\r
 103       startupFile = string;\r
 104 \r
 105   string = Cache.getProperty("SHOW_STARTUP_FILE");\r
 106         if(string!=null)\r
 107       showStartupFile = Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
 108 \r
 109       preferencesLoaded = true;\r
 110   }\r
 111 \r
 112   public Preferences()\r
 113   {\r
 114     initPreferences();\r
 115 \r
 116     frame = new JInternalFrame();\r
 117     frame.setContentPane(this);\r
 118     Desktop.addInternalFrame(frame, "Preferences", 480,390 );\r
 119 \r
 120     fullID.setSelected(showFullId);\r
 121     String string = Cache.getProperty("SHOW_FULLSCREEN");\r
 122     boolean value = false;\r
 123     if(string!=null)\r
 124       value =  Boolean.valueOf(string).booleanValue();\r
 125 \r
 126     fullScreen.setSelected(value);\r
 127     annotations.setSelected(showAnnotation);\r
 128 \r
 129     conservation.setEnabled(showAnnotation);\r
 130     quality.setEnabled(showAnnotation);\r
 131     identity.setEnabled(showAnnotation);\r
 132 \r
 133     conservation.setSelected(showConservation);\r
 134     quality.setSelected(showQuality);\r
 135     identity.setSelected(showIdentity);\r
 136 \r
 137     for(int i=0; i<12; i++)\r
 138       colour.addItem( ColourSchemeProperty.getColourName(i) );\r
 139 \r
 140     string = Cache.getProperty("DEFAULT_COLOUR");\r
 141     if(string!=null)\r
 142       colour.setSelectedItem( string );\r
 143     else\r
 144       colour.setSelectedIndex( 11 );\r
 145 \r
 146     String fonts[] = java.awt.GraphicsEnvironment.getLocalGraphicsEnvironment().getAvailableFontFamilyNames();\r
 147     for(int i=0; i<fonts.length; i++)\r
 148       fontNameCB.addItem(fonts[i]);\r
 149 \r
 150     for(int i=1; i<31; i++)\r
 151       fontSizeCB.addItem(i+"");\r
 152 \r
 153    fontStyleCB.addItem("plain");\r
 154    fontStyleCB.addItem("bold");\r
 155    fontStyleCB.addItem("italic");\r
 156 \r
 157    fontNameCB.setSelectedItem(fontName);\r
 158    fontSizeCB.setSelectedItem(fontSize);\r
 159    fontStyleCB.setSelectedItem(fontStyle);\r
 160 \r
 161    gapSymbolCB.addItem("-");\r
 162    gapSymbolCB.addItem(".");\r
 163 \r
 164    gapSymbolCB.setSelectedItem( gapSymbol+"" );\r
 165 \r
 166    startupCheckbox.setSelected(showStartupFile);\r
 167    startupFileTextfield.setText(startupFile);\r
 168 \r
 169   }\r
 170 \r
 171   public void ok_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 172   {\r
 173     showFullId =  fullID.isSelected() ;\r
 174     showFullscreen = fullScreen.isSelected();\r
 175     showAnnotation = annotations.isSelected();\r
 176     showConservation = conservation.isSelected();\r
 177     showQuality = quality.isSelected();\r
 178     showIdentity = identity.isSelected();\r
 179     defaultColour = colour.getSelectedItem().toString();\r
 180     gapSymbol = gapSymbolCB.getSelectedItem().toString().charAt(0);\r
 181     fontName = fontNameCB.getSelectedItem().toString();\r
 182     fontSize = fontSizeCB.getSelectedItem().toString();\r
 183     fontStyle = fontStyleCB.getSelectedItem().toString();\r
 184     startupFile = startupFileTextfield.getText();\r
 185     showStartupFile = startupCheckbox.isSelected();\r
 186 \r
 187     Cache.setProperty("SHOW_FULL_ID", Boolean.toString(showFullId));\r
 188     Cache.setProperty("SHOW_FULLSCREEN", Boolean.toString( showFullscreen ) );\r
 189 \r
 190     Cache.setProperty("SHOW_ANNOTATIONS", Boolean.toString( showAnnotation  ));\r
 191     Cache.setProperty("SHOW_CONSERVATION", Boolean.toString( showConservation ));\r
 192     Cache.setProperty("SHOW_QUALITY", Boolean.toString( showQuality ));\r
 193     Cache.setProperty("SHOW_IDENTITY", Boolean.toString( showIdentity ));\r
 194 \r
 195     Cache.setProperty("DEFAULT_COLOUR", defaultColour);\r
 196     Cache.setProperty("GAP_SYMBOL", gapSymbol+"");\r
 197 \r
 198     Cache.setProperty("FONT_NAME", fontName);\r
 199     Cache.setProperty("FONT_STYLE", fontStyle);\r
 200     Cache.setProperty("FONT_SIZE", fontSize);\r
 201 \r
 202     Cache.setProperty("STARTUP_FILE", startupFile);\r
 203     Cache.setProperty("SHOW_STARTUP_FILE", Boolean.toString(showStartupFile));\r
 204 \r
 205 \r
 206 \r
 207     try    {\r
 208       frame.setClosed(true);\r
 209     }    catch (Exception ex)  {}\r
 210 \r
 211   }\r
 212 \r
 213   public void startupFileTextfield_mouseClicked()\r
 214   {\r
 215     JalviewFileChooser chooser = new JalviewFileChooser(jalview.bin.Cache.getProperty("LAST_DIRECTORY"),\r
 216         new String[]{"fa, fasta, fastq", "aln",  "pfam", "msf", "pir","blc","jar"},\r
 217         new String[]{"Fasta", "Clustal", "PFAM", "MSF", "PIR", "BLC", "Jalview"}\r
 218        ,jalview.bin.Cache.getProperty("DEFAULT_FILE_FORMAT"));\r
 219    chooser.setFileView(new JalviewFileView());\r
 220    chooser.setDialogTitle("Select startup file");\r
 221    int value = chooser.showOpenDialog(this);\r
 222    if(value == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION)\r
 223    {\r
 224      jalview.bin.Cache.setProperty("DEFAULT_FILE_FORMAT", chooser.getSelectedFormat());\r
 225      startupFileTextfield.setText( chooser.getSelectedFile().getAbsolutePath() );\r
 226    }\r
 227   }\r
 228 \r
 229 \r
 230   public void cancel_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 231   {\r
 232     try{\r
 233       frame.setClosed(true);\r
 234     }catch(Exception ex){}\r
 235   }\r
 236 \r
 237   public void annotations_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 238   {\r
 239     conservation.setEnabled(annotations.isSelected());\r
 240     quality.setEnabled(annotations.isSelected());\r
 241     identity.setEnabled(annotations.isSelected());\r
 242   }\r
 243 \r
 244 }\r