src/jalview/gui/UserDefinedColours.java

   1 package jalview.gui;\r
   2 \r
   3 import jalview.jbgui.GUserDefinedColours;\r
   4 import jalview.datamodel.*;\r
   5 import jalview.io.*;\r
   6 import javax.swing.*;\r
   7 import java.awt.*;\r
   8 import java.awt.event.*;\r
   9 import javax.swing.event.*;\r
  10 import jalview.schemes.*;\r
  11 import java.io.*;\r
  12 import java.util.*;\r
  13 \r
  14 \r
  15 public class UserDefinedColours extends GUserDefinedColours implements ChangeListener\r
  16 {\r
  17 \r
  18   AlignmentPanel ap;\r
  19   SequenceGroup seqGroup;\r
  20   JButton selectedButton;\r
  21   Vector oldColours = new Vector();\r
  22   ColourSchemeI oldColourScheme;\r
  23   JInternalFrame frame;\r
  24 \r
  25 \r
  26   public UserDefinedColours(AlignmentPanel ap, SequenceGroup sg)\r
  27   {\r
  28     super();\r
  29     frame = new JInternalFrame();\r
  30     frame.setContentPane(this);\r
  31     Desktop.addInternalFrame(frame, "User Defined Colours", 450,530, false );\r
  32     if(System.getProperty("os.name").startsWith("Mac"))\r
  33       frame.setSize(450,560);\r
  34 \r
  35     if(sg!=null)\r
  36         frame.setTitle( frame.getTitle()+ " ("+sg.getName()+")");\r
  37 \r
  38     colorChooser.getSelectionModel().addChangeListener(this);\r
  39 \r
  40     this.ap = ap;\r
  41     seqGroup = sg;\r
  42 \r
  43 \r
  44       if (seqGroup != null)\r
  45         oldColourScheme = seqGroup.cs;\r
  46       else\r
  47         oldColourScheme = ap.av.getGlobalColourScheme();\r
  48 \r
  49       for (int i = 0; i < 20; i++)\r
  50         makeButton(ResidueProperties.aa2Triplet.get(ResidueProperties.aa[i]) +\r
  51                    "", ResidueProperties.aa[i]);\r
  52 \r
  53       makeButton("B", "B");\r
  54       makeButton("Z", "Z");\r
  55       makeButton("X", "X");\r
  56       makeButton("Gap", "'.','-',' '");\r
  57 \r
  58       if(jalview.bin.Cache.getProperty("USER_DEFINED_COLOUR")!=null)\r
  59       {\r
  60         loadColours(jalview.bin.Cache.getProperty("USER_DEFINED_COLOUR"));\r
  61       }\r
  62   }\r
  63 \r
  64  public void stateChanged(ChangeEvent evt)\r
  65  {\r
  66    if(selectedButton!=null)\r
  67      selectedButton.setBackground( colorChooser.getColor() );\r
  68  }\r
  69 \r
  70   public void colourButtonPressed(MouseEvent e)\r
  71   {\r
  72      selectedButton = (JButton)e.getSource();\r
  73      colorChooser.setColor(selectedButton.getBackground());\r
  74   }\r
  75 \r
  76   void makeButton(String label, String aa)\r
  77   {\r
  78     final JButton button = new JButton();\r
  79     Color col = Color.white;\r
  80 \r
  81 \r
  82     try{\r
  83       col = oldColourScheme.findColour(aa, -1);\r
  84     }catch(Exception ex){}\r
  85 \r
  86     button.setBackground(  col );\r
  87     oldColours.addElement( col );\r
  88     button.setText( label );\r
  89     button.setForeground( col.darker().darker().darker() );\r
  90     button.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 1, 10));\r
  91     button.addMouseListener(new java.awt.event.MouseAdapter()\r
  92     {\r
  93       public void mouseClicked(MouseEvent e)\r
  94       {\r
  95         colourButtonPressed(e);\r
  96       }\r
  97     });\r
  98 \r
  99     buttonPanel.add(button, null);\r
 100   }\r
 101 \r
 102 \r
 103   protected void okButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 104   {\r
 105     applyButton_actionPerformed(null);\r
 106     try{\r
 107       frame.setClosed(true);\r
 108     }catch(Exception ex){}\r
 109   }\r
 110 \r
 111   protected void applyButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 112   {\r
 113     Color [] newColours = new Color[24];\r
 114     for(int i=0; i<24; i++)\r
 115     {\r
 116           JButton button = (JButton)buttonPanel.getComponent(i);\r
 117           newColours[i] = button.getBackground();\r
 118     }\r
 119 \r
 120     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 121     ucs.setThreshold(0);\r
 122 \r
 123     if(seqGroup!=null)\r
 124     {\r
 125       seqGroup.cs = ucs;\r
 126       ap.repaint();\r
 127     }\r
 128     else\r
 129       ap.alignFrame.changeColour(ucs);\r
 130 \r
 131   }\r
 132 \r
 133   protected void loadbutton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 134   {\r
 135     JalviewFileChooser chooser = new JalviewFileChooser(\r
 136       jalview.bin.Cache.getProperty("LAST_DIRECTORY"),\r
 137         new String[]{"jc"},\r
 138         new String[]{"Jalview User Colours"},\r
 139           "Jalview User Colours");\r
 140     chooser.setFileView(new jalview.io.JalviewFileView());\r
 141     chooser.setDialogTitle("Load colour scheme");\r
 142     chooser.setToolTipText("Load");\r
 143     int value = chooser.showOpenDialog(this);\r
 144     if (value == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION)\r
 145     {\r
 146       File choice = chooser.getSelectedFile();\r
 147       jalview.bin.Cache.setProperty("LAST_DIRECTORY",  choice.getParent());\r
 148       jalview.bin.Cache.setProperty("USER_DEFINED_COLOUR", choice.getPath());\r
 149       Color[] colors = loadColours(choice.getAbsolutePath());\r
 150       for (int i = 0; i < colors.length; i++)\r
 151       {\r
 152         JButton button = (JButton) buttonPanel.getComponent(i);\r
 153         button.setBackground(colors[i]);\r
 154       }\r
 155 \r
 156     }\r
 157   }\r
 158 \r
 159   public static UserColourScheme loadDefaultColours()\r
 160   {\r
 161     if(jalview.bin.Cache.getProperty("USER_DEFINED_COLOUR")!=null)\r
 162       return loadDefaultColours(jalview.bin.Cache.getProperty("USER_DEFINED_COLOUR"));\r
 163     else\r
 164       return null;\r
 165   }\r
 166 \r
 167   public static UserColourScheme loadDefaultColours(String file)\r
 168   {\r
 169       UserColourScheme ucs = null;\r
 170       Color cols[] = loadColours(file);\r
 171       if(cols!=null)\r
 172       {\r
 173         ucs = new UserColourScheme(cols);\r
 174         ucs.setThreshold(0);\r
 175       }\r
 176       return ucs;\r
 177   }\r
 178 \r
 179   static Color [] loadColours(String file)\r
 180   {\r
 181     Color [] newColours=null;\r
 182     try\r
 183     {\r
 184       InputStreamReader in = new InputStreamReader(\r
 185           new FileInputStream(file), "UTF-8");\r
 186 \r
 187       jalview.binding.JalviewUserColours ucs = new jalview.binding.JalviewUserColours();\r
 188       ucs = (jalview.binding.JalviewUserColours)ucs.unmarshal(in);\r
 189 \r
 190       newColours = new Color[ucs.getColourCount()];\r
 191       for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 192         newColours[i] = new Color(Integer.parseInt(ucs.getColour(i).getRGB(), 16));\r
 193 \r
 194     }\r
 195     catch (Exception ex)\r
 196     {System.out.println("Error loading UserColourFile "+file);}\r
 197 \r
 198     return newColours;\r
 199   }\r
 200 \r
 201   protected void savebutton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 202   {\r
 203     JalviewFileChooser chooser = new JalviewFileChooser(\r
 204     jalview.bin.Cache.getProperty("LAST_DIRECTORY"),\r
 205     new String[]{"jc"},\r
 206     new String[]{"Jalview User Colours"},\r
 207       "Jalview User Colours");\r
 208 \r
 209     chooser.setFileView(new jalview.io.JalviewFileView());\r
 210     chooser.setDialogTitle("Save colour scheme");\r
 211     chooser.setToolTipText("Save");\r
 212     int value = chooser.showSaveDialog(this);\r
 213     if (value == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION)\r
 214     {\r
 215       String choice = chooser.getSelectedFile().getPath();\r
 216       jalview.bin.Cache.setProperty("USER_DEFINED_COLOUR", choice);\r
 217       jalview.binding.JalviewUserColours ucs = new jalview.binding.JalviewUserColours();\r
 218 \r
 219       try{\r
 220         PrintWriter out = new PrintWriter(new OutputStreamWriter(\r
 221                                      new FileOutputStream(choice), "UTF-8"));\r
 222         for(int i=0; i<24; i++)\r
 223         {\r
 224          JButton button = (JButton)buttonPanel.getComponent(i);\r
 225          jalview.binding.Colour col = new jalview.binding.Colour();\r
 226          col.setName(button.getText());\r
 227          col.setRGB( jalview.util.Format.getHexString( button.getBackground() ));\r
 228          ucs.addColour(col);\r
 229         }\r
 230 \r
 231         ucs.marshal(out);\r
 232         out.close();\r
 233       }\r
 234       catch(Exception ex)\r
 235       {ex.printStackTrace();}\r
 236     }\r
 237 \r
 238   }\r
 239 \r
 240   protected void cancelButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 241   {\r
 242 \r
 243     Color [] newColours = new Color[24];\r
 244     for(int i=0; i<24; i++)\r
 245     {\r
 246           newColours[i] = (Color)oldColours.elementAt(i);\r
 247           buttonPanel.getComponent(i).setBackground(newColours[i]);\r
 248     }\r
 249 \r
 250     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme( newColours );\r
 251 \r
 252     if (seqGroup != null)\r
 253       seqGroup.cs = ucs;\r
 254     else\r
 255       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 256 \r
 257     ap.repaint();\r
 258 \r
 259     try{\r
 260       frame.setClosed(true);\r
 261     }catch(Exception ex){}\r
 262   }\r
 263 \r
 264 \r
 265 }\r