src/jalview/gui/WebserviceInfo.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.gui;
  22
  23 import jalview.jbgui.GWebserviceInfo;
  24 import jalview.util.MessageManager;
  25 import jalview.ws.WSClientI;
  26
  27 import java.awt.BorderLayout;
  28 import java.awt.Color;
  29 import java.awt.Dimension;
  30 import java.awt.Graphics;
  31 import java.awt.Graphics2D;
  32 import java.awt.GridLayout;
  33 import java.awt.Image;
  34 import java.awt.MediaTracker;
  35 import java.awt.event.ActionEvent;
  36 import java.awt.image.BufferedImage;
  37 import java.util.Vector;
  38
  39 import javax.swing.JComponent;
  40 import javax.swing.JEditorPane;
  41 import javax.swing.JInternalFrame;
  42 import javax.swing.JPanel;
  43 import javax.swing.JScrollPane;
  44 import javax.swing.JTabbedPane;
  45 import javax.swing.JTextArea;
  46 import javax.swing.event.HyperlinkEvent;
  47 import javax.swing.event.HyperlinkListener;
  48 import javax.swing.text.html.HTMLEditorKit;
  49 import javax.swing.text.html.StyleSheet;
  50
  51 /**
  52  * Base class for web service client thread and gui TODO: create StAX parser to
  53  * extract html body content reliably when preparing html formatted job statuses
  54  *
  55  * @author $author$
  56  * @version $Revision$
  57  */
  58 public class WebserviceInfo extends GWebserviceInfo
  59         implements HyperlinkListener, IProgressIndicator
  60 {
  61
  62   /** Job is Queued */
  63   public static final int STATE_QUEUING = 0;
  64
  65   /** Job is Running */
  66   public static final int STATE_RUNNING = 1;
  67
  68   /** Job has finished with no errors */
  69   public static final int STATE_STOPPED_OK = 2;
  70
  71   /** Job has been cancelled with no errors */
  72   public static final int STATE_CANCELLED_OK = 3;
  73
  74   /** job has stopped because of some error */
  75   public static final int STATE_STOPPED_ERROR = 4;
  76
  77   /** job has failed because of some unavoidable service interruption */
  78   public static final int STATE_STOPPED_SERVERERROR = 5;
  79
  80   int currentStatus = STATE_QUEUING;
  81
  82   Image image;
  83
  84   int angle = 0;
  85
  86   String title = "";
  87
  88   jalview.ws.WSClientI thisService;
  89
  90   boolean serviceIsCancellable;
  91
  92   JInternalFrame frame;
  93
  94   private IProgressIndicator progressBar;
  95
  96   @Override
  97   public void setVisible(boolean aFlag)
  98   {
  99     super.setVisible(aFlag);
 100     frame.setVisible(aFlag);
 101   };
 102
 103   JTabbedPane subjobs = null;
 104
 105   java.util.Vector jobPanes = null;
 106
 107   private boolean serviceCanMergeResults = false;
 108
 109   private boolean viewResultsImmediatly = true;
 110
 111   /**
 112    * Get
 113    *
 114    * @param flag
 115    *          to indicate if results will be shown in a new window as soon as
 116    *          they are available.
 117    */
 118   public boolean isViewResultsImmediatly()
 119   {
 120     return viewResultsImmediatly;
 121   }
 122
 123   /**
 124    * Set
 125    *
 126    * @param flag
 127    *          to indicate if results will be shown in a new window as soon as
 128    *          they are available.
 129    */
 130   public void setViewResultsImmediatly(boolean viewResultsImmediatly)
 131   {
 132     this.viewResultsImmediatly = viewResultsImmediatly;
 133   }
 134
 135   private StyleSheet getStyleSheet(HTMLEditorKit editorKit)
 136   {
 137
 138     // Copied blatantly from
 139     // http://www.velocityreviews.com/forums/t132265-string-into-htmldocument.html
 140     StyleSheet myStyleSheet = new StyleSheet();
 141
 142     myStyleSheet.addStyleSheet(editorKit.getStyleSheet());
 143
 144     editorKit.setStyleSheet(myStyleSheet);
 145
 146     /*
 147      * Set the style sheet rules here by reading them from the constants
 148      * interface.
 149      */
 150     /*
 151      * for (int ix=0; ix<CSS_RULES.length; ix++) {
 152      *
 153      * myStyleSheet.addRule(CSS_RULES[ix]);
 154      *
 155      * }
 156      */
 157     return myStyleSheet;
 158
 159   }
 160
 161   // tabbed or not
 162   public synchronized int addJobPane()
 163   {
 164     JScrollPane jobpane = new JScrollPane();
 165     JComponent _progressText;
 166     if (renderAsHtml)
 167     {
 168       JEditorPane progressText = new JEditorPane("text/html", "");
 169       progressText.addHyperlinkListener(this);
 170       _progressText = progressText;
 171       // progressText.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 10));
 172       // progressText.setBorder(null);
 173       progressText.setEditable(false);
 174       /*
 175        * HTMLEditorKit myEditorKit = new HTMLEditorKit();
 176        *
 177        * StyleSheet myStyleSheet = getStyleSheet(myEditorKit);
 178        *
 179        * HTMLDocument tipDocument = (HTMLDocument)
 180        * (myEditorKit.createDefaultDocument());
 181        *
 182        * progressText.setDocument(tipDocument);
 183        */progressText.setText("<html><h1>WS Job</h1></html>");
 184     }
 185     else
 186     {
 187       JTextArea progressText = new JTextArea();
 188       _progressText = progressText;
 189
 190       progressText.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 10));
 191       progressText.setBorder(null);
 192       progressText.setEditable(false);
 193       progressText.setText("WS Job");
 194       progressText.setLineWrap(true);
 195       progressText.setWrapStyleWord(true);
 196     }
 197     jobpane.setName("JobPane");
 198     jobpane.getViewport().add(_progressText, null);
 199     jobpane.setBorder(null);
 200     if (jobPanes == null)
 201     {
 202       jobPanes = new Vector();
 203     }
 204     int newpane = jobPanes.size();
 205     jobPanes.add(jobpane);
 206
 207     if (newpane == 0)
 208     {
 209       this.add(jobpane, BorderLayout.CENTER);
 210     }
 211     else
 212     {
 213       if (newpane == 1)
 214       {
 215         // revert to a tabbed pane.
 216         JScrollPane firstpane;
 217         this.remove(firstpane = (JScrollPane) jobPanes.get(0));
 218         subjobs = new JTabbedPane();
 219         this.add(subjobs, BorderLayout.CENTER);
 220         subjobs.add(firstpane);
 221         subjobs.setTitleAt(0, firstpane.getName());
 222       }
 223       subjobs.add(jobpane);
 224     }
 225     return newpane; // index for accessor methods below
 226   }
 227
 228   /**
 229    * Creates a new WebserviceInfo object.
 230    *
 231    * @param title
 232    *          short name and job type
 233    * @param info
 234    *          reference or other human readable description
 235    * @param makeVisible
 236    *          true to display the webservices window immediatly (otherwise need
 237    *          to call setVisible(true))
 238    */
 239   public WebserviceInfo(String title, String info, boolean makeVisible)
 240   {
 241     init(title, info, 520, 500, makeVisible);
 242   }
 243
 244   /**
 245    * Creates a new WebserviceInfo object.
 246    *
 247    * @param title
 248    *          DOCUMENT ME!
 249    * @param info
 250    *          DOCUMENT ME!
 251    * @param width
 252    *          DOCUMENT ME!
 253    * @param height
 254    *          DOCUMENT ME!
 255    */
 256   public WebserviceInfo(String title, String info, int width, int height,
 257           boolean makeVisible)
 258   {
 259     init(title, info, width, height, makeVisible);
 260   }
 261
 262   /**
 263    * DOCUMENT ME!
 264    *
 265    * @return DOCUMENT ME!
 266    */
 267   public jalview.ws.WSClientI getthisService()
 268   {
 269     return thisService;
 270   }
 271
 272   /**
 273    * Update state of GUI based on client capabilities (like whether the job is
 274    * cancellable, whether the 'merge results' button is shown.
 275    *
 276    * @param newservice
 277    *          service client to query for capabilities
 278    */
 279   public void setthisService(jalview.ws.WSClientI newservice)
 280   {
 281     thisService = newservice;
 282     serviceIsCancellable = newservice.isCancellable();
 283     frame.setClosable(!serviceIsCancellable);
 284     serviceCanMergeResults = newservice.canMergeResults();
 285     rebuildButtonPanel();
 286   }
 287
 288   private void rebuildButtonPanel()
 289   {
 290     if (buttonPanel != null)
 291     {
 292       buttonPanel.removeAll();
 293       if (serviceIsCancellable)
 294       {
 295         buttonPanel.add(cancel);
 296         frame.setClosable(false);
 297       }
 298       else
 299       {
 300         frame.setClosable(true);
 301       }
 302     }
 303   }
 304
 305   /**
 306    * DOCUMENT ME!
 307    *
 308    * @param title
 309    *          DOCUMENT ME!
 310    * @param info
 311    *          DOCUMENT ME!
 312    * @param width
 313    *          DOCUMENT ME!
 314    * @param height
 315    *          DOCUMENT ME!
 316    */
 317   void init(String title, String info, int width, int height,
 318           boolean makeVisible)
 319   {
 320     frame = new JInternalFrame();
 321     frame.setContentPane(this);
 322     Desktop.addInternalFrame(frame, title, makeVisible, width, height);
 323     frame.setClosable(false);
 324
 325     progressBar = new ProgressBar(statusPanel, statusBar);
 326
 327     this.title = title;
 328     setInfoText(info);
 329
 330     java.net.URL url = getClass()
 331             .getResource("/images/Jalview_Logo_small.png");
 332     image = java.awt.Toolkit.getDefaultToolkit().createImage(url);
 333
 334     MediaTracker mt = new MediaTracker(this);
 335     mt.addImage(image, 0);
 336
 337     try
 338     {
 339       mt.waitForID(0);
 340     } catch (Exception ex)
 341     {
 342     }
 343
 344     AnimatedPanel ap = new AnimatedPanel();
 345     ap.setPreferredSize(new Dimension(60, 60));
 346     titlePanel.add(ap, BorderLayout.WEST);
 347     titlePanel.add(titleText, BorderLayout.CENTER);
 348
 349     Thread thread = new Thread(ap);
 350     thread.start();
 351     final WebserviceInfo thisinfo = this;
 352     frame.addInternalFrameListener(
 353             new javax.swing.event.InternalFrameAdapter()
 354             {
 355               @Override
 356                         public void internalFrameClosed(
 357                       javax.swing.event.InternalFrameEvent evt)
 358               {
 359                 // System.out.println("Shutting down webservice client");
 360                 WSClientI service = thisinfo.getthisService();
 361                 if (service != null && service.isCancellable())
 362                 {
 363                   service.cancelJob();
 364                 }
 365               };
 366             });
 367     frame.validate();
 368
 369   }
 370
 371   /**
 372    * DOCUMENT ME!
 373    *
 374    * @param status
 375    *          integer status from state constants
 376    */
 377   public void setStatus(int status)
 378   {
 379     currentStatus = status;
 380
 381     String message = null;
 382     switch (currentStatus)
 383     {
 384     case STATE_QUEUING:
 385       message = MessageManager.getString("label.state_queueing");
 386       break;
 387
 388     case STATE_RUNNING:
 389       message = MessageManager.getString("label.state_running");
 390       break;
 391
 392     case STATE_STOPPED_OK:
 393       message = MessageManager.getString("label.state_completed");
 394       break;
 395
 396     case STATE_CANCELLED_OK:
 397       message = MessageManager.getString("label.state_job_cancelled");
 398       break;
 399
 400     case STATE_STOPPED_ERROR:
 401       message = MessageManager.getString("label.state_job_error");
 402       break;
 403
 404     case STATE_STOPPED_SERVERERROR:
 405       message = MessageManager.getString("label.server_error_try_later");
 406       break;
 407     }
 408     titleText.setText(title + (message == null ? "" : " - " + message));
 409     titleText.repaint();
 410   }
 411
 412   /**
 413    * subjob status indicator
 414    *
 415    * @param jobpane
 416    * @param status
 417    */
 418   public void setStatus(int jobpane, int status)
 419   {
 420     if (jobpane < 0 || jobpane >= jobPanes.size())
 421     {
 422       throw new Error(MessageManager.formatMessage(
 423               "error.setstatus_called_non_existent_job_pane", new String[]
 424               { Integer.valueOf(jobpane).toString() }));
 425     }
 426     switch (status)
 427     {
 428     case STATE_QUEUING:
 429       setProgressName(jobpane + " - QUEUED", jobpane);
 430       break;
 431     case STATE_RUNNING:
 432       setProgressName(jobpane + " - RUNNING", jobpane);
 433       break;
 434     case STATE_STOPPED_OK:
 435       setProgressName(jobpane + " - FINISHED", jobpane);
 436       break;
 437     case STATE_CANCELLED_OK:
 438       setProgressName(jobpane + " - CANCELLED", jobpane);
 439       break;
 440     case STATE_STOPPED_ERROR:
 441       setProgressName(jobpane + " - BROKEN", jobpane);
 442       break;
 443     case STATE_STOPPED_SERVERERROR:
 444       setProgressName(jobpane + " - ALERT", jobpane);
 445       break;
 446     default:
 447       setProgressName(jobpane + " - UNKNOWN STATE", jobpane);
 448     }
 449   }
 450
 451   /**
 452    * DOCUMENT ME!
 453    *
 454    * @return DOCUMENT ME!
 455    */
 456   public String getInfoText()
 457   {
 458     return infoText.getText();
 459   }
 460
 461   /**
 462    * DOCUMENT ME!
 463    *
 464    * @param text
 465    *          DOCUMENT ME!
 466    */
 467   public void setInfoText(String text)
 468   {
 469     infoText.setText(text);
 470   }
 471
 472   /**
 473    * DOCUMENT ME!
 474    *
 475    * @param text
 476    *          DOCUMENT ME!
 477    */
 478   public void appendInfoText(String text)
 479   {
 480     infoText.append(text);
 481   }
 482
 483   /**
 484    * DOCUMENT ME!
 485    *
 486    * @return DOCUMENT ME!
 487    */
 488   public String getProgressText(int which)
 489   {
 490     if (jobPanes == null)
 491     {
 492       addJobPane();
 493     }
 494     if (renderAsHtml)
 495     {
 496       return ((JEditorPane) ((JScrollPane) jobPanes.get(which))
 497               .getViewport().getComponent(0)).getText();
 498     }
 499     else
 500     {
 501       return ((JTextArea) ((JScrollPane) jobPanes.get(which)).getViewport()
 502               .getComponent(0)).getText();
 503     }
 504   }
 505
 506   /**
 507    * DOCUMENT ME!
 508    *
 509    * @param text
 510    *          DOCUMENT ME!
 511    */
 512   public void setProgressText(int which, String text)
 513   {
 514     if (jobPanes == null)
 515     {
 516       addJobPane();
 517     }
 518     if (renderAsHtml)
 519     {
 520       ((JEditorPane) ((JScrollPane) jobPanes.get(which)).getViewport()
 521               .getComponent(0)).setText(ensureHtmlTagged(text));
 522     }
 523     else
 524     {
 525       ((JTextArea) ((JScrollPane) jobPanes.get(which)).getViewport()
 526               .getComponent(0)).setText(text);
 527     }
 528   }
 529
 530   /**
 531    * extract content from &lt;body&gt; content &lt;/body&gt;
 532    *
 533    * @param text
 534    * @param leaveFirst
 535    *          - set to leave the initial html tag intact
 536    * @param leaveLast
 537    *          - set to leave the final html tag intact
 538    * @return
 539    */
 540   private String getHtmlFragment(String text, boolean leaveFirst,
 541           boolean leaveLast)
 542   {
 543     if (text == null)
 544     {
 545       return null;
 546     }
 547     String lowertxt = text.toLowerCase();
 548     int htmlpos = leaveFirst ? -1 : lowertxt.indexOf("<body");
 549
 550     int htmlend = leaveLast ? -1 : lowertxt.indexOf("</body");
 551     int htmlpose = lowertxt.indexOf(">", htmlpos),
 552             htmlende = lowertxt.indexOf(">", htmlend);
 553     if (htmlend == -1 && htmlpos == -1)
 554     {
 555       return text;
 556     }
 557     if (htmlend > -1)
 558     {
 559       return text.substring((htmlpos == -1 ? 0 : htmlpose + 1), htmlend);
 560     }
 561     return text.substring(htmlpos == -1 ? 0 : htmlpose + 1);
 562   }
 563
 564   /**
 565    * very simple routine for adding/ensuring html tags are present in text.
 566    *
 567    * @param text
 568    * @return properly html tag enclosed text
 569    */
 570   private String ensureHtmlTagged(String text)
 571   {
 572     if (text == null)
 573     {
 574       return "";
 575     }
 576     String lowertxt = text.toLowerCase();
 577     int htmlpos = lowertxt.indexOf("<body");
 578     int htmlend = lowertxt.indexOf("</body");
 579     int doctype = lowertxt.indexOf("<!doctype");
 580     int xmltype = lowertxt.indexOf("<?xml");
 581     if (htmlend == -1)
 582     {
 583       text = text + "</body></html>";
 584     }
 585     if (htmlpos > -1)
 586     {
 587       if ((doctype > -1 && htmlpos > doctype)
 588               || (xmltype > -1 && htmlpos > xmltype))
 589       {
 590         text = "<html><head></head><body>\n" + text.substring(htmlpos - 1);
 591       }
 592     }
 593     else
 594     {
 595       text = "<html><head></head><body>\n" + text;
 596     }
 597     if (text.indexOf("<meta") > -1)
 598     {
 599       System.err
 600               .println("HTML COntent: \n" + text + "<< END HTML CONTENT\n");
 601
 602     }
 603     return text;
 604   }
 605
 606   /**
 607    * DOCUMENT ME!
 608    *
 609    * @param text
 610    *          DOCUMENT ME!
 611    */
 612   public void appendProgressText(int which, String text)
 613   {
 614     if (jobPanes == null)
 615     {
 616       addJobPane();
 617     }
 618     if (renderAsHtml)
 619     {
 620       String txt = getHtmlFragment(
 621               ((JEditorPane) ((JScrollPane) jobPanes.get(which))
 622                       .getViewport().getComponent(0)).getText(),
 623               true, false);
 624       ((JEditorPane) ((JScrollPane) jobPanes.get(which)).getViewport()
 625               .getComponent(0))
 626                       .setText(ensureHtmlTagged(
 627                               txt + getHtmlFragment(text, false, true)));
 628     }
 629     else
 630     {
 631       ((JTextArea) ((JScrollPane) jobPanes.get(which)).getViewport()
 632               .getComponent(0)).append(text);
 633     }
 634   }
 635
 636   /**
 637    * setProgressText(0, text)
 638    */
 639   public void setProgressText(String text)
 640   {
 641     setProgressText(0, text);
 642   }
 643
 644   /**
 645    * appendProgressText(0, text)
 646    */
 647   public void appendProgressText(String text)
 648   {
 649     appendProgressText(0, text);
 650   }
 651
 652   /**
 653    * getProgressText(0)
 654    */
 655   public String getProgressText()
 656   {
 657     return getProgressText(0);
 658   }
 659
 660   /**
 661    * get the tab title for a subjob
 662    *
 663    * @param which
 664    *          int
 665    * @return String
 666    */
 667   public String getProgressName(int which)
 668   {
 669     if (jobPanes == null)
 670     {
 671       addJobPane();
 672     }
 673     if (subjobs != null)
 674     {
 675       return subjobs.getTitleAt(which);
 676     }
 677     else
 678     {
 679       return ((JScrollPane) jobPanes.get(which)).getViewport()
 680               .getComponent(0).getName();
 681     }
 682   }
 683
 684   /**
 685    * set the tab title for a subjob
 686    *
 687    * @param name
 688    *          String
 689    * @param which
 690    *          int
 691    */
 692   public void setProgressName(String name, int which)
 693   {
 694     if (subjobs != null)
 695     {
 696       subjobs.setTitleAt(which, name);
 697       subjobs.revalidate();
 698       subjobs.repaint();
 699     }
 700     JScrollPane c = (JScrollPane) jobPanes.get(which);
 701     c.getViewport().getComponent(0).setName(name);
 702     c.repaint();
 703   }
 704
 705   /**
 706    * Gui action for cancelling the current job, if possible.
 707    *
 708    * @param e
 709    *          DOCUMENT ME!
 710    */
 711   @Override
 712 protected void cancel_actionPerformed(ActionEvent e)
 713   {
 714     if (!serviceIsCancellable)
 715     {
 716       // JBPNote : TODO: We should REALLY just tell the WSClientI to cancel
 717       // anyhow - it has to stop threads and clean up
 718       // JBPNote : TODO: Instead of a warning, we should have an optional 'Are
 719       // you sure?' prompt
 720       warnUser(
 721               MessageManager.getString(
 722                       "warn.job_cannot_be_cancelled_close_window"),
 723               MessageManager.getString("action.cancel_job"));
 724     }
 725     else
 726     {
 727       thisService.cancelJob();
 728     }
 729     frame.setClosable(true);
 730   }
 731
 732   /**
 733    * Spawns a thread that pops up a warning dialog box with the given message
 734    * and title.
 735    *
 736    * @param message
 737    * @param title
 738    */
 739   public void warnUser(final String message, final String title)
 740   {
 741     javax.swing.SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()
 742     {
 743       @Override
 744         public void run()
 745       {
 746         JvOptionPane.showInternalMessageDialog(Desktop.desktop, message,
 747                 title, JvOptionPane.WARNING_MESSAGE);
 748
 749       }
 750     });
 751   }
 752
 753   /**
 754    * Set up GUI for user to get at results - and possibly automatically display
 755    * them if viewResultsImmediatly is set.
 756    */
 757   public void setResultsReady()
 758   {
 759     frame.setClosable(true);
 760     buttonPanel.remove(cancel);
 761     buttonPanel.add(showResultsNewFrame);
 762     if (serviceCanMergeResults)
 763     {
 764       buttonPanel.add(mergeResults);
 765       buttonPanel.setLayout(new GridLayout(2, 1, 5, 5));
 766     }
 767     buttonPanel.validate();
 768     validate();
 769     if (viewResultsImmediatly)
 770     {
 771       showResultsNewFrame.doClick();
 772     }
 773   }
 774
 775   /**
 776    * called when job has finished but no result objects can be passed back to
 777    * user
 778    */
 779   public void setFinishedNoResults()
 780   {
 781     frame.setClosable(true);
 782     buttonPanel.remove(cancel);
 783     buttonPanel.validate();
 784     validate();
 785   }
 786
 787   class AnimatedPanel extends JPanel implements Runnable
 788   {
 789     long startTime = 0;
 790
 791     BufferedImage offscreen;
 792
 793     @Override
 794         public void run()
 795     {
 796       startTime = System.currentTimeMillis();
 797
 798       while (currentStatus < STATE_STOPPED_OK)
 799       {
 800         try
 801         {
 802           Thread.sleep(50);
 803
 804           int units = (int) ((System.currentTimeMillis() - startTime)
 805                   / 10f);
 806           angle += units;
 807           angle %= 360;
 808           startTime = System.currentTimeMillis();
 809
 810           if (currentStatus >= STATE_STOPPED_OK)
 811           {
 812             angle = 0;
 813           }
 814
 815           repaint();
 816         } catch (Exception ex)
 817         {
 818         }
 819       }
 820
 821       cancel.setEnabled(false);
 822     }
 823
 824     void drawPanel()
 825     {
 826       if (offscreen == null || offscreen.getWidth(this) != getWidth()
 827               || offscreen.getHeight(this) != getHeight())
 828       {
 829         offscreen = new BufferedImage(getWidth(), getHeight(),
 830                 BufferedImage.TYPE_INT_ARGB);
 831       }
 832
 833       Graphics2D g = (Graphics2D) offscreen.getGraphics();
 834
 835       g.setColor(Color.white);
 836       g.fillRect(0, 0, getWidth(), getHeight());
 837
 838       if (image != null)
 839       {
 840         int x = image.getWidth(this) / 2, y = image.getHeight(this) / 2;
 841         g.rotate(Math.toRadians(angle), 10 + x, 10 + y);
 842         g.drawImage(image, 10, 10, this);
 843         g.rotate(-Math.toRadians(angle), 10 + x, 10 + y);
 844       }
 845     }
 846
 847     @Override
 848         public void paintComponent(Graphics g1)
 849     {
 850       drawPanel();
 851
 852       g1.drawImage(offscreen, 0, 0, this);
 853     }
 854   }
 855
 856   boolean renderAsHtml = false;
 857
 858   public void setRenderAsHtml(boolean b)
 859   {
 860     renderAsHtml = b;
 861   }
 862
 863   @Override
 864 public void hyperlinkUpdate(HyperlinkEvent e)
 865   {
 866     Desktop.hyperlinkUpdate(e);
 867   }
 868
 869   /*
 870    * (non-Javadoc)
 871    *
 872    * @see jalview.gui.IProgressIndicator#setProgressBar(java.lang.String, long)
 873    */
 874   @Override
 875   public void setProgressBar(String message, long id)
 876   {
 877     progressBar.setProgressBar(message, id);
 878   }
 879
 880   @Override
 881   public void registerHandler(final long id,
 882           final IProgressIndicatorHandler handler)
 883   {
 884     progressBar.registerHandler(id, handler);
 885   }
 886
 887   /**
 888    *
 889    * @return true if any progress bars are still active
 890    */
 891   @Override
 892   public boolean operationInProgress()
 893   {
 894     return progressBar.operationInProgress();
 895   }
 896 }