src/jalview/io/DBRefFile.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)\r
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This file is part of Jalview.\r
   6  * \r
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
  10  * \r
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
  15  * \r
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
  17  */\r
  18 package jalview.io;\r
  19 \r
  20 import java.io.IOException;\r
  21 \r
  22 /**\r
  23  * jalview flatfile for io of sequence ID mapping data\r
  24  * DATABASE\t<nickname>\t<name>\t<version>... properties?jdbc, url, handler\r
  25  * DBREF\r
  26  * <seqID>\tDBID\taccno\t|seqstart,seqend,start,end...|\t|dbstart,dbend,...|\r
  27  * \r
  28  */\r
  29 public class DBRefFile extends AlignFile\r
  30 {\r
  31 \r
  32   public void parse() throws IOException\r
  33   {\r
  34     // TODO Auto-generated method stub\r
  35 \r
  36   }\r
  37 \r
  38   public String print()\r
  39   {\r
  40     // TODO Auto-generated method stub\r
  41     return null;\r
  42   }\r
  43 \r
  44 }\r