src/jalview/io/FileFormatI.java

   1 package jalview.io;
   2
   3 import java.io.IOException;
   4
   5 public interface FileFormatI
   6 {
   7
   8   AlignmentFileI getAlignmentFile(String inFile, DataSourceType sourceType)
   9           throws IOException;
  10
  11   AlignmentFileI getAlignmentFile(FileParse source) throws IOException;
  12
  13   AlignmentFileI getAlignmentFile();
  14
  15   boolean isComplexAlignFile();
  16
  17   String getShortDescription();
  18
  19   /**
  20    * Returns a comma-separated list of file extensions associated with the
  21    * format
  22    *
  23    * @return
  24    */
  25   String getExtensions();
  26
  27   boolean isReadable();
  28
  29   boolean isWritable();
  30 }