src/jalview/io/FileParse.java

   1 /*\r
   2 * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3 * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4 *\r
   5 * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6 * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7 * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8 * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9 *\r
  10 * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11 * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12 * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13 * GNU General Public License for more details.\r
  14 *\r
  15 * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16 * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17 * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18 */\r
  19 \r
  20 package jalview.io;\r
  21 \r
  22 import java.io.*;\r
  23 import java.net.*;\r
  24 \r
  25 public class FileParse {\r
  26 \r
  27   public File   inFile;\r
  28   public int    fileSize;\r
  29   public int    noLines;\r
  30 \r
  31   protected String          type;\r
  32   protected BufferedReader dataIn;\r
  33 \r
  34   public FileParse() {}\r
  35 \r
  36   public FileParse(String fileStr, String type) throws MalformedURLException, IOException\r
  37   {\r
  38 \r
  39     this.type = type;\r
  40 \r
  41     if (type.equals("File")) {\r
  42       this.inFile = new File(fileStr);\r
  43       this.fileSize = (int)inFile.length();\r
  44 \r
  45       dataIn = new BufferedReader(new FileReader( fileStr ));\r
  46 \r
  47     } else if (type.equals("URL")) {\r
  48       URL url = new URL(fileStr);\r
  49       this.fileSize = 0;\r
  50       dataIn = new BufferedReader(new InputStreamReader( url.openStream() ));\r
  51     } else if(type.equals("Paste"))\r
  52     {\r
  53       dataIn = new BufferedReader(new StringReader(fileStr));\r
  54     }\r
  55   }\r
  56 \r
  57   public String nextLine() throws IOException {\r
  58     String next = dataIn.readLine();\r
  59     if (next != null) {\r
  60       noLines++;\r
  61     }\r
  62     return next;\r
  63   }\r
  64 \r
  65 }\r