src/jalview/io/JalviewFileView.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.0b1)
   3  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
   4  *
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   6  *
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  10  *
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  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  18  */
  19 package jalview.io;
  20
  21 import java.io.*;
  22 import java.util.*;
  23
  24 import javax.swing.*;
  25 import javax.swing.filechooser.*;
  26
  27 public class JalviewFileView extends FileView
  28 {
  29   static Hashtable alignSuffix = new Hashtable();
  30
  31   static
  32   {
  33     alignSuffix.put("fasta", "Fasta file");
  34     alignSuffix.put("fa", "Fasta file");
  35     alignSuffix.put("fastq", "Fasta file");
  36     alignSuffix.put("blc", "BLC file");
  37     alignSuffix.put("msf", "MSF file");
  38     alignSuffix.put("pfam", "PFAM file");
  39     alignSuffix.put("aln", "Clustal file");
  40     alignSuffix.put("pir", "PIR file");
  41     alignSuffix.put("jar", "Jalview file");
  42   }
  43
  44   public String getTypeDescription(File f)
  45   {
  46     String extension = getExtension(f);
  47     String type = null;
  48
  49     if (extension != null)
  50     {
  51       if (alignSuffix.containsKey(extension))
  52       {
  53         type = alignSuffix.get(extension).toString();
  54       }
  55     }
  56
  57     return type;
  58   }
  59
  60   public Icon getIcon(File f)
  61   {
  62     String extension = getExtension(f);
  63     Icon icon = null;
  64
  65     if (extension != null)
  66     {
  67       if (alignSuffix.containsKey(extension))
  68       {
  69         icon = createImageIcon("/images/file.png");
  70       }
  71     }
  72
  73     return icon;
  74   }
  75
  76   /*
  77    * Get the extension of a file.
  78    */
  79   public static String getExtension(File f)
  80   {
  81     String ext = null;
  82     String s = f.getName();
  83     int i = s.lastIndexOf('.');
  84
  85     if ((i > 0) && (i < (s.length() - 1)))
  86     {
  87       ext = s.substring(i + 1).toLowerCase();
  88     }
  89
  90     return ext;
  91   }
  92
  93   /** Returns an ImageIcon, or null if the path was invalid. */
  94   protected static ImageIcon createImageIcon(String path)
  95   {
  96     java.net.URL imgURL = JalviewFileView.class.getResource(path);
  97
  98     if (imgURL != null)
  99     {
 100       return new ImageIcon(imgURL);
 101     }
 102     else
 103     {
 104       System.err
 105               .println("JalviewFileView.createImageIcon: Couldn't find file: "
 106                       + path);
 107
 108       return null;
 109     }
 110   }
 111 }