src/jalview/io/JalviewFileView.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.io;
  22
  23 import java.io.File;
  24 import java.util.Hashtable;
  25
  26 import javax.swing.Icon;
  27 import javax.swing.ImageIcon;
  28 import javax.swing.filechooser.FileView;
  29
  30 public class JalviewFileView extends FileView
  31 {
  32   static Hashtable alignSuffix = new Hashtable();
  33
  34   static
  35   {
  36     // TODO: these names should come from the FormatAdapter lists for
  37     // readable/writable extensions
  38     alignSuffix.put("amsa", "AMSA file");
  39     alignSuffix.put("fasta", "Fasta file");
  40     alignSuffix.put("fa", "Fasta file");
  41     alignSuffix.put("fastq", "Fasta file");
  42     alignSuffix.put("mfa", "Fasta file");
  43     alignSuffix.put("blc", "BLC file");
  44     alignSuffix.put("msf", "MSF file");
  45     alignSuffix.put("pfam", "PFAM file");
  46     alignSuffix.put("aln", "Clustal file");
  47     alignSuffix.put("pir", "PIR file");
  48     alignSuffix.put("jar", "Jalview Project file (old)");
  49     alignSuffix.put("jvp", "Jalview Project file");
  50     alignSuffix.put("amsa", "AMSA file");
  51     alignSuffix.put("sto", "Stockholm File");
  52     alignSuffix.put("stk", "Stockholm File");
  53     alignSuffix.put("sto", "Stockholm File");
  54   }
  55
  56   public String getTypeDescription(File f)
  57   {
  58     String extension = getExtension(f);
  59     String type = null;
  60
  61     if (extension != null)
  62     {
  63       if (alignSuffix.containsKey(extension))
  64       {
  65         type = alignSuffix.get(extension).toString();
  66       }
  67     }
  68
  69     return type;
  70   }
  71
  72   public Icon getIcon(File f)
  73   {
  74     String extension = getExtension(f);
  75     Icon icon = null;
  76
  77     if (extension != null)
  78     {
  79       if (alignSuffix.containsKey(extension))
  80       {
  81         icon = createImageIcon("/images/file.png");
  82       }
  83     }
  84
  85     return icon;
  86   }
  87
  88   /*
  89    * Get the extension of a file.
  90    */
  91   public static String getExtension(File f)
  92   {
  93     String ext = null;
  94     String s = f.getName();
  95     int i = s.lastIndexOf('.');
  96
  97     if ((i > 0) && (i < (s.length() - 1)))
  98     {
  99       ext = s.substring(i + 1).toLowerCase();
 100     }
 101
 102     return ext;
 103   }
 104
 105   /** Returns an ImageIcon, or null if the path was invalid. */
 106   protected static ImageIcon createImageIcon(String path)
 107   {
 108     java.net.URL imgURL = JalviewFileView.class.getResource(path);
 109
 110     if (imgURL != null)
 111     {
 112       return new ImageIcon(imgURL);
 113     }
 114     else
 115     {
 116       System.err
 117               .println("JalviewFileView.createImageIcon: Couldn't find file: "
 118                       + path);
 119
 120       return null;
 121     }
 122   }
 123 }