src/jalview/io/JalviewFileView.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  */
  18 package jalview.io;
  19
  20 import java.io.*;
  21 import java.util.*;
  22
  23 import javax.swing.*;
  24 import javax.swing.filechooser.*;
  25
  26 public class JalviewFileView extends FileView
  27 {
  28   static Hashtable alignSuffix = new Hashtable();
  29
  30   static
  31   {
  32     alignSuffix.put("fasta", "Fasta file");
  33     alignSuffix.put("fa", "Fasta file");
  34     alignSuffix.put("fastq", "Fasta file");
  35     alignSuffix.put("blc", "BLC file");
  36     alignSuffix.put("msf", "MSF file");
  37     alignSuffix.put("pfam", "PFAM file");
  38     alignSuffix.put("aln", "Clustal file");
  39     alignSuffix.put("pir", "PIR file");
  40     alignSuffix.put("jar", "Jalview file");
  41   }
  42
  43   public String getTypeDescription(File f)
  44   {
  45     String extension = getExtension(f);
  46     String type = null;
  47
  48     if (extension != null)
  49     {
  50       if (alignSuffix.containsKey(extension))
  51       {
  52         type = alignSuffix.get(extension).toString();
  53       }
  54     }
  55
  56     return type;
  57   }
  58
  59   public Icon getIcon(File f)
  60   {
  61     String extension = getExtension(f);
  62     Icon icon = null;
  63
  64     if (extension != null)
  65     {
  66       if (alignSuffix.containsKey(extension))
  67       {
  68         icon = createImageIcon("/images/file.png");
  69       }
  70     }
  71
  72     return icon;
  73   }
  74
  75   /*
  76    * Get the extension of a file.
  77    */
  78   public static String getExtension(File f)
  79   {
  80     String ext = null;
  81     String s = f.getName();
  82     int i = s.lastIndexOf('.');
  83
  84     if ((i > 0) && (i < (s.length() - 1)))
  85     {
  86       ext = s.substring(i + 1).toLowerCase();
  87     }
  88
  89     return ext;
  90   }
  91
  92   /** Returns an ImageIcon, or null if the path was invalid. */
  93   protected static ImageIcon createImageIcon(String path)
  94   {
  95     java.net.URL imgURL = JalviewFileView.class.getResource(path);
  96
  97     if (imgURL != null)
  98     {
  99       return new ImageIcon(imgURL);
 100     }
 101     else
 102     {
 103       System.err
 104               .println("JalviewFileView.createImageIcon: Couldn't find file: "
 105                       + path);
 106
 107       return null;
 108     }
 109   }
 110 }