src/jalview/io/JalviewFileView.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.io;
  22
  23 import java.io.File;
  24 import java.util.Hashtable;
  25
  26 import javax.swing.Icon;
  27 import javax.swing.ImageIcon;
  28 import javax.swing.filechooser.FileView;
  29
  30 public class JalviewFileView extends FileView
  31 {
  32   static Hashtable alignSuffix = new Hashtable();
  33
  34   static
  35   {
  36     // TODO: these names should come from the FormatAdapter lists for
  37     // readable/writable extensions
  38     alignSuffix.put("amsa", "AMSA file");
  39     alignSuffix.put("fasta", "Fasta file");
  40     alignSuffix.put("fa", "Fasta file");
  41     alignSuffix.put("fastq", "Fasta file");
  42     alignSuffix.put("mfa", "Fasta file");
  43     alignSuffix.put("blc", "BLC file");
  44     alignSuffix.put("msf", "MSF file");
  45     alignSuffix.put("pfam", "PFAM file");
  46     alignSuffix.put("aln", "Clustal file");
  47     alignSuffix.put("pir", "PIR file");
  48     alignSuffix.put("jar", "Jalview Project file (old)");
  49     alignSuffix.put("jvp", "Jalview Project file");
  50     alignSuffix.put("amsa", "AMSA file");
  51     alignSuffix.put("sto", "Stockholm File");
  52     alignSuffix.put("stk", "Stockholm File");
  53     alignSuffix.put("sto", "Stockholm File");
  54   }
  55
  56   @Override
  57   public String getTypeDescription(File f)
  58   {
  59     String extension = getExtension(f);
  60     String type = null;
  61
  62     if (extension != null)
  63     {
  64       if (alignSuffix.containsKey(extension))
  65       {
  66         type = alignSuffix.get(extension).toString();
  67       }
  68     }
  69
  70     return type;
  71   }
  72
  73   @Override
  74   public Icon getIcon(File f)
  75   {
  76     String extension = getExtension(f);
  77     Icon icon = null;
  78
  79     if (extension != null)
  80     {
  81       if (alignSuffix.containsKey(extension))
  82       {
  83         icon = createImageIcon("/images/file.png");
  84       }
  85     }
  86
  87     return icon;
  88   }
  89
  90   /*
  91    * Get the extension of a file.
  92    */
  93   public static String getExtension(File f)
  94   {
  95     String ext = null;
  96     String s = f.getName();
  97     int i = s.lastIndexOf('.');
  98
  99     if ((i > 0) && (i < (s.length() - 1)))
 100     {
 101       ext = s.substring(i + 1).toLowerCase();
 102     }
 103
 104     return ext;
 105   }
 106
 107   /** Returns an ImageIcon, or null if the path was invalid. */
 108   protected static ImageIcon createImageIcon(String path)
 109   {
 110     java.net.URL imgURL = JalviewFileView.class.getResource(path);
 111
 112     if (imgURL != null)
 113     {
 114       return new ImageIcon(imgURL);
 115     }
 116     else
 117     {
 118       System.err
 119               .println("JalviewFileView.createImageIcon: Couldn't find file: "
 120                       + path);
 121
 122       return null;
 123     }
 124   }
 125 }