src/jalview/io/MatrixFile.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)\r
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This file is part of Jalview.\r
   6  * \r
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
  10  * \r
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
  15  * \r
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
  17  */\r
  18 package jalview.io;\r
  19 \r
  20 import java.io.IOException;\r
  21 \r
  22 /**\r
  23  * IO for asymmetric matrix with arbitrary dimension with labels, as displayed\r
  24  * by PCA viewer. Form is: tab separated entity defs header line TITLE\ttitle\r
  25  * DESC\tdesc PROPERTY\t<id or empty for whole matrix>\tname\ttype\tvalue\r
  26  * ROW\tRow i label (ID)/tPrinciple text/tprinciple description/t...\r
  27  * COLUMN\t(similar, optional).. .. <float>\t<float>...(column-wise data for row\r
  28  * i)\r
  29  */\r
  30 \r
  31 public class MatrixFile extends FileParse\r
  32 {\r
  33 \r
  34 }\r