src/jalview/javascript/JsSelectionSender.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.0b1)
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  15  *
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  17  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  18  */
  19 package jalview.javascript;
  20
  21 import jalview.appletgui.AlignFrame;
  22 import jalview.bin.JalviewLite;
  23 import jalview.datamodel.ColumnSelection;
  24 import jalview.datamodel.SequenceGroup;
  25 import jalview.structure.SelectionSource;
  26
  27 public class JsSelectionSender extends JSFunctionExec implements
  28         jalview.structure.SelectionListener, JsCallBack
  29 {
  30
  31   AlignFrame _af;
  32
  33   String _listener;
  34
  35   public JsSelectionSender(JalviewLite jvlite, AlignFrame af,
  36           String listener)
  37   {
  38     super(jvlite);
  39     _af = af;
  40     _listener = listener;
  41   }
  42
  43   @Override
  44   public void selection(SequenceGroup seqsel, ColumnSelection colsel,
  45           SelectionSource source)
  46   {
  47     // System.err.println("Testing selection event relay to jsfunction:"+_listener);
  48     try
  49     {
  50       String setid = "";
  51       String viewid = "";
  52       AlignFrame src = _af;
  53       if (source != null)
  54       {
  55         if (source instanceof jalview.appletgui.AlignViewport
  56                 && ((jalview.appletgui.AlignViewport) source).applet.currentAlignFrame.viewport == source)
  57         {
  58           // should be valid if it just generated an event!
  59           src = ((jalview.appletgui.AlignViewport) source).applet.currentAlignFrame;
  60
  61         }
  62       }
  63       String[] seqs = new String[]
  64       {};
  65       String[] cols = new String[]
  66       {};
  67       int strt = 0, end = (src == null) ? -1 : src.alignPanel.av
  68               .getAlignment().getWidth();
  69       if (seqsel != null && seqsel.getSize() > 0)
  70       {
  71         seqs = new String[seqsel.getSize()];
  72         for (int i = 0; i < seqs.length; i++)
  73         {
  74           seqs[i] = seqsel.getSequenceAt(i).getName();
  75         }
  76         if (strt < seqsel.getStartRes())
  77         {
  78           strt = seqsel.getStartRes();
  79         }
  80         if (end == -1 || end > seqsel.getEndRes())
  81         {
  82           end = seqsel.getEndRes();
  83         }
  84       }
  85       if (colsel != null && colsel.size() > 0)
  86       {
  87         if (end == -1)
  88         {
  89           end = colsel.getMax() + 1;
  90         }
  91         cols = new String[colsel.getSelected().size()];
  92         int d = 0, r = -1;
  93         for (int i = 0; i < cols.length; i++)
  94         {
  95           cols[i] = ""
  96                   + (1 + ((Integer) colsel.getSelected().elementAt(i))
  97                           .intValue());
  98         }
  99       }
 100       else
 101       {
 102         if (seqsel != null && seqsel.getSize() > 0)
 103         {
 104           // send a valid range, otherwise we send the empty selection
 105           cols = new String[2];
 106           cols[0] = "" + (1 + strt) + "-" + (1 + end);
 107         }
 108         ;
 109
 110       }
 111       System.err.println("Relaying selection to jsfunction:" + _listener);
 112       executeJavascriptFunction(
 113               _listener,
 114               new Object[]
 115               { src, setid, jvlite.arrayToSeparatorList(seqs),
 116                   jvlite.arrayToSeparatorList(cols) });
 117     } catch (Exception ex)
 118     {
 119       System.err
 120               .println("Jalview Javascript exec error: Couldn't send selection message using function '"
 121                       + _listener + "'");
 122       ex.printStackTrace();
 123       if (ex instanceof netscape.javascript.JSException)
 124       {
 125         System.err.println("Javascript Exception: "
 126                 + ((netscape.javascript.JSException) ex).getCause()
 127                         .toString());
 128       }
 129
 130     }
 131   }
 132
 133   @Override
 134   public AlignFrame getAlignFrame()
 135   {
 136     return _af;
 137   }
 138
 139   @Override
 140   public String getListenerFunction()
 141   {
 142     return _listener;
 143   }
 144
 145 }