src/jalview/javascript/JsSelectionSender.java

   1 package jalview.javascript;
   2
   3 import java.net.URL;
   4 import jalview.appletgui.AlignFrame;
   5 import jalview.appletgui.AlignViewport;
   6 import jalview.bin.JalviewLite;
   7 import jalview.datamodel.ColumnSelection;
   8 import jalview.datamodel.SequenceGroup;
   9 import jalview.structure.SelectionSource;
  10 import netscape.javascript.JSObject;
  11
  12 public class JsSelectionSender extends JSFunctionExec implements
  13         jalview.structure.SelectionListener, JsCallBack
  14 {
  15
  16   AlignFrame _af;
  17
  18   String _listener;
  19
  20   public JsSelectionSender(JalviewLite jvlite, AlignFrame af,
  21           String listener)
  22   {
  23     super(jvlite);
  24     _af = af;
  25     _listener = listener;
  26   }
  27
  28   @Override
  29   public void selection(SequenceGroup seqsel, ColumnSelection colsel,
  30           SelectionSource source)
  31   {
  32     // System.err.println("Testing selection event relay to jsfunction:"+_listener);
  33     try
  34     {
  35       String setid = "";
  36       String viewid = "";
  37       AlignFrame src = _af;
  38       if (source != null)
  39       {
  40         if (source instanceof jalview.appletgui.AlignViewport
  41                 && ((jalview.appletgui.AlignViewport) source).applet.currentAlignFrame.viewport == source)
  42         {
  43           // should be valid if it just generated an event!
  44           src = ((jalview.appletgui.AlignViewport) source).applet.currentAlignFrame;
  45
  46         }
  47       }
  48       String[] seqs = new String[]
  49       {};
  50       String[] cols = new String[]
  51       {};
  52       int strt = 0, end = (src == null) ? -1 : src.alignPanel.av
  53               .getAlignment().getWidth();
  54       if (seqsel != null && seqsel.getSize() > 0)
  55       {
  56         seqs = new String[seqsel.getSize()];
  57         for (int i = 0; i < seqs.length; i++)
  58         {
  59           seqs[i] = seqsel.getSequenceAt(i).getName();
  60         }
  61         if (strt < seqsel.getStartRes())
  62         {
  63           strt = seqsel.getStartRes();
  64         }
  65         if (end==-1 || end > seqsel.getEndRes())
  66         {
  67           end = seqsel.getEndRes();
  68         }
  69       }
  70       if (colsel != null && colsel.size() > 0)
  71       {
  72         if (end == -1)
  73         {
  74           end = colsel.getMax() + 1;
  75         }
  76         cols = new String[colsel.getSelected().size()];
  77         int d = 0, r = -1;
  78         for (int i = 0; i < cols.length; i++)
  79         {
  80           cols[i] = ""
  81                   + (1 + ((Integer) colsel.getSelected().elementAt(i))
  82                           .intValue());
  83         }
  84       }
  85       else
  86       {
  87         if (seqsel != null && seqsel.getSize() > 0)
  88         {
  89           // send a valid range, otherwise we send the empty selection
  90           cols = new String[2];
  91           cols[0] = "" + (1 + strt) + "-" + (1 + end);
  92         }
  93         ;
  94
  95       }
  96       System.err.println("Relaying selection to jsfunction:" + _listener);
  97       executeJavascriptFunction( _listener,
  98                 new Object[]
  99                 { src, setid, jvlite.arrayToSeparatorList(seqs),
 100                     jvlite.arrayToSeparatorList(cols) });
 101     } catch (Exception ex)
 102     {
 103       System.err
 104               .println("Jalview Javascript exec error: Couldn't send selection message using function '"
 105                       + _listener + "'");
 106       ex.printStackTrace();
 107       if (ex instanceof netscape.javascript.JSException)
 108       {
 109         System.err.println("Javascript Exception: "
 110                 + ((netscape.javascript.JSException) ex).getCause()
 111                         .toString());
 112       }
 113
 114     }
 115   }
 116
 117
 118   @Override
 119   public AlignFrame getAlignFrame()
 120   {
 121     return _af;
 122   }
 123
 124   @Override
 125   public String getListenerFunction()
 126   {
 127     return _listener;
 128   }
 129
 130 }