src/jalview/javascript/JsSelectionSender.java

   1 package jalview.javascript;
   2
   3 import java.util.ArrayList;
   4 import java.util.Enumeration;
   5
   6 import jalview.appletgui.AlignFrame;
   7 import jalview.appletgui.AlignViewport;
   8 import jalview.bin.JalviewLite;
   9 import jalview.datamodel.ColumnSelection;
  10 import jalview.datamodel.SequenceGroup;
  11 import jalview.structure.SelectionSource;
  12 import netscape.javascript.JSObject;
  13
  14 public class JsSelectionSender implements
  15         jalview.structure.SelectionListener, JsCallBack
  16 {
  17   JalviewLite jvlite;
  18
  19   AlignFrame _af;
  20
  21   String _listener;
  22
  23   public JsSelectionSender(JalviewLite jvlite, AlignFrame af,
  24           String listener)
  25   {
  26     this.jvlite = jvlite;
  27     _af = af;
  28     _listener = listener;
  29   }
  30
  31   @Override
  32   public void selection(SequenceGroup seqsel, ColumnSelection colsel,
  33           SelectionSource source)
  34   {
  35     // System.err.println("Testing selection event relay to jsfunction:"+_listener);
  36     try
  37     {
  38       String setid = "";
  39       String viewid = "";
  40       AlignFrame src = _af;
  41       // filter events if necessary
  42       if (source instanceof AlignViewport)
  43       {
  44         if (_af != null
  45                 && !_af.alignPanel.av.getSequenceSetId().equals(
  46                         ((AlignViewport) source).getSequenceSetId()))
  47         {
  48           return;
  49         }
  50         jalview.appletgui.AlignmentPanel[] aps = jalview.appletgui.PaintRefresher
  51                 .getAssociatedPanels(setid = ((AlignViewport) source)
  52                         .getSequenceSetId());
  53         for (int a = 0; a < aps.length; a++)
  54         {
  55           if (aps[a].av == source)
  56           {
  57             src = aps[a].alignFrame;
  58           }
  59         }
  60       }
  61       else
  62       {
  63         // unhandled!
  64         System.err.println("Unhandled selection source !");
  65         return;
  66       }
  67       JSObject jsoWindow = JSObject.getWindow(jvlite);
  68       String[] seqs = new String[]
  69       {};
  70       String[] cols = new String[]
  71       {};
  72       int strt = 0, end = src.alignPanel.av.getAlignment().getWidth();
  73       if (seqsel != null && seqsel.getSize() > 0)
  74       {
  75         seqs = new String[seqsel.getSize()];
  76         for (int i = 0; i < seqs.length; i++)
  77         {
  78           seqs[i] = seqsel.getSequenceAt(i).getName();
  79         }
  80         if (strt < seqsel.getStartRes())
  81         {
  82           strt = seqsel.getStartRes();
  83         }
  84         if (end > seqsel.getEndRes())
  85         {
  86           end = seqsel.getEndRes();
  87         }
  88       }
  89       if (colsel != null && colsel.size() > 0)
  90       {
  91         cols = new String[colsel.getSelected().size()];
  92         int d = 0, r = -1;
  93         for (int i = 0; i < cols.length; i++)
  94         {
  95           cols[i] = ""+(1+((Integer)colsel.getSelected().elementAt(i)).intValue());
  96         }
  97       }
  98       else
  99       {
 100         if (seqsel != null && seqsel.getSize() > 0)
 101         {
 102           // send a valid range, otherwise we send the empty selection
 103           cols = new String[2];
 104           cols[0] = "" + (1 + strt) + "-" + (1 + end);
 105         }
 106         ;
 107
 108       }
 109       System.err.println("Relaying selection to jsfunction:" + _listener);
 110       jsoWindow.call(
 111               _listener,
 112               new Object[]
 113               { src, setid, jvlite.arrayToSeparatorList(seqs),
 114                   jvlite.arrayToSeparatorList(cols) });
 115     } catch (Exception ex)
 116     {
 117       System.err
 118               .println("Jalview Javascript exec error: Couldn't send selection message using function '"
 119                       + _listener + "'");
 120       ex.printStackTrace();
 121     }
 122   }
 123
 124   @Override
 125   public AlignFrame getAlignFrame()
 126   {
 127     return _af;
 128   }
 129
 130   @Override
 131   public String getListenerFunction()
 132   {
 133     return _listener;
 134   }
 135
 136 }