src/jalview/javascript/JsSelectionSender.java

   1 package jalview.javascript;
   2
   3 import java.net.URL;
   4 import jalview.appletgui.AlignFrame;
   5 import jalview.appletgui.AlignViewport;
   6 import jalview.bin.JalviewLite;
   7 import jalview.datamodel.ColumnSelection;
   8 import jalview.datamodel.SequenceGroup;
   9 import jalview.structure.SelectionSource;
  10 import netscape.javascript.JSObject;
  11
  12 public class JsSelectionSender extends JSFunctionExec implements
  13         jalview.structure.SelectionListener, JsCallBack
  14 {
  15
  16   AlignFrame _af;
  17
  18   String _listener;
  19
  20   public JsSelectionSender(JalviewLite jvlite, AlignFrame af,
  21           String listener)
  22   {
  23     super(jvlite);
  24     _af = af;
  25     _listener = listener;
  26   }
  27
  28   @Override
  29   public void selection(SequenceGroup seqsel, ColumnSelection colsel,
  30           SelectionSource source)
  31   {
  32     // System.err.println("Testing selection event relay to jsfunction:"+_listener);
  33     try
  34     {
  35       String setid = "";
  36       String viewid = "";
  37       AlignFrame src = _af;
  38       // filter events if necessary
  39       if (source instanceof AlignViewport)
  40       {
  41         if (_af != null
  42                 && !_af.alignPanel.av.getSequenceSetId().equals(
  43                         ((AlignViewport) source).getSequenceSetId()))
  44         {
  45           return;
  46         }
  47         jalview.appletgui.AlignmentPanel[] aps = jalview.appletgui.PaintRefresher
  48                 .getAssociatedPanels(setid = ((AlignViewport) source)
  49                         .getSequenceSetId());
  50         for (int a = 0; a < aps.length; a++)
  51         {
  52           System.out.println("Selection: testing source alignPanel : "
  53                   + aps[a].getName());
  54           if (aps[a].av == source)
  55           {
  56             src = aps[a].alignFrame;
  57           }
  58         }
  59       }
  60       else
  61       {
  62         // unhandled!
  63         System.err.println("Unhandled selection source !");
  64         return;
  65       }
  66       String[] seqs = new String[]
  67       {};
  68       String[] cols = new String[]
  69       {};
  70       int strt = 0, end = (src == null) ? -1 : src.alignPanel.av
  71               .getAlignment().getWidth();
  72       if (seqsel != null && seqsel.getSize() > 0)
  73       {
  74         seqs = new String[seqsel.getSize()];
  75         for (int i = 0; i < seqs.length; i++)
  76         {
  77           seqs[i] = seqsel.getSequenceAt(i).getName();
  78         }
  79         if (strt < seqsel.getStartRes())
  80         {
  81           strt = seqsel.getStartRes();
  82         }
  83         if (end==-1 || end > seqsel.getEndRes())
  84         {
  85           end = seqsel.getEndRes();
  86         }
  87       }
  88       if (colsel != null && colsel.size() > 0)
  89       {
  90         if (end == -1)
  91         {
  92           end = colsel.getMax() + 1;
  93         }
  94         cols = new String[colsel.getSelected().size()];
  95         int d = 0, r = -1;
  96         for (int i = 0; i < cols.length; i++)
  97         {
  98           cols[i] = ""
  99                   + (1 + ((Integer) colsel.getSelected().elementAt(i))
 100                           .intValue());
 101         }
 102       }
 103       else
 104       {
 105         if (seqsel != null && seqsel.getSize() > 0)
 106         {
 107           // send a valid range, otherwise we send the empty selection
 108           cols = new String[2];
 109           cols[0] = "" + (1 + strt) + "-" + (1 + end);
 110         }
 111         ;
 112
 113       }
 114       System.err.println("Relaying selection to jsfunction:" + _listener);
 115       executeJavascriptFunction( _listener,
 116                 new Object[]
 117                 { src, setid, jvlite.arrayToSeparatorList(seqs),
 118                     jvlite.arrayToSeparatorList(cols) });
 119     } catch (Exception ex)
 120     {
 121       System.err
 122               .println("Jalview Javascript exec error: Couldn't send selection message using function '"
 123                       + _listener + "'");
 124       ex.printStackTrace();
 125       if (ex instanceof netscape.javascript.JSException)
 126       {
 127         System.err.println("Javascript Exception: "
 128                 + ((netscape.javascript.JSException) ex).getCause()
 129                         .toString());
 130       }
 131
 132     }
 133   }
 134
 135
 136   @Override
 137   public AlignFrame getAlignFrame()
 138   {
 139     return _af;
 140   }
 141
 142   @Override
 143   public String getListenerFunction()
 144   {
 145     return _listener;
 146   }
 147
 148 }